一种预测胶质瘤预后的标志物及其应用制造技术

本发明专利技术涉及一种预测胶质瘤预后的标志物及其应用。所述标志物由基因MEOX2、IBSP、GFRA1、NOG和EPHB1组成。本发明专利技术还公开了预测胶质瘤预后的试剂盒，以及一种预测胶质瘤预后的方法。本发明专利技术通过生物信息学的技术找到与胶质瘤进展相关标志物MEOX2、IBSP、GFRA1、NOG和EPHB1，然后根据这5个基因构建的风险模型，进而获得风险评分，通过风险评分能预测胶质瘤的预后；并且进一步结合年龄、患者分期构建胶质瘤生存率预测模型，能够有效预测胶质瘤患者1年，3年，5年的生存率，为分析胶质瘤患者的预后评估提供了可靠的方法。评估提供了可靠的方法。

【技术实现步骤摘要】
一种预测胶质瘤预后的标志物及其应用


[0001]本专利技术涉及一种预测胶质瘤预后的标志物及其应用，属于生物医学


技术介绍

[0002]胶质瘤(Glioma)是中枢神经系统最常见的原发性肿瘤。由于其高度异质性，分子特征差别较大，胶质瘤的治疗效果差异显著。准确的分类和预后评估是选择治疗措施的关键。随着对胶质瘤分子特征研究的深入，WHO提出的最新分型综合了肿瘤的组织病理学特征、恶性程度分级和分子信息，但由于分子诊断水平的区域性差异，此分型在临床实施中存在挑战。因此，探索出具有临床价值的分子分型对胶质瘤患者的预后评估进行指导迫在眉睫。
[0003]泛凋亡(PANoptosis)是细胞程序性死亡(PCD)途径之一，它整合多种PCD通路的组成成分，受泛凋亡复合物(PANoptosome)的调控，是一种独特的先天性免疫介导的炎性通路。已有大量研究表明在机体受到细菌、病毒等病原体感染时，泛凋亡途径发挥重要作用，诱导炎症细胞死亡。也有越来越多的证据证实，泛凋亡在肿瘤中同样起着重要作用。如果其他程序性细胞死亡途径被抑制或者产生突变，泛凋亡可以通过激活免疫系统，增强抗肿瘤免疫，杀死肿瘤细胞，克服治疗过程中耐药性的问题。
[0004]目前，国内外研究发现一些肿瘤的分子标志物的表达水平，例如PTEN基因，可以作为一项独立的因子来影响胶质瘤患者的预后生存时间，但是像这样能够独立影响胶质瘤患者预后生存时间的分子标志物还比较少，因此需要发现更多的影响胶质瘤患者预后生存时间的分子标志物。尤其综合预后分类与经典分子生物标志物还需要进一步研究。

技术实现思路

[0005]针对现有技术的不足，本专利技术提供一种预测胶质瘤预后的标志物及其应用。
[0006]本专利技术的技术方案如下：
[0007]一种预测胶质瘤预后的标志物，所述标志物由基因MEOX2、IBSP、GFRA1、NOG和EPHB1组成。
[0008]本专利技术中预测胶质瘤预后的标志物的应用采用如下技术方案：如上所述的标志物在预测胶质瘤预后中的应用；所述应用包括但不限于评价或预测预后情况、预测生存率、构建预测胶质瘤预后风险的模型、构建预测胶质瘤生存率的模型、制备用于预测胶质瘤预后风险的检测试剂或装置、制备预测胶质瘤生存率的检测试剂或装置中的任意一种或几种的组合。
[0009]一种预测胶质瘤预后的试剂盒，所述试剂盒包含有上述标志物的检测试剂和一个风险模型，所述风险模型包括风险评分计算公式，所述风险评分计算公式如下：风险评分＝(0.170008438280127
×
MEOX2的表达水平)+(0.196870811688214
×
IBSP的表达水平)+(
‑
0.431404278334841
×
GFRA1的表达水平)+(
‑
0.34193718212311
×
NOG的表达水平)+(0.292158077431546
×
EPHB1的表达水平)。所述表达水平指的是：是指特定的mRNA序列从
其基因组基因座被转录的程度，即mRNA在一个或多个被分析血清中的浓度。
[0010]根据本专利技术优选的，所述检测试剂包括SYBR Green试剂、ddH2O和风险模型中5种基因的引物。
[0011]进一步优选的，所述引物序列如下：
[0012]MEOX2
‑
F：5
’‑
GCGATACGAGATAGCAGTGAATC
‑3’
；
[0013]MEOX2
‑
R：5
’‑
GCTGTCCACCCTTTACCCTC
‑3’
；
[0014]IBSP
‑
F：5
’‑
CCCCACCTTTTGGGAAAACCA
‑3’
；
[0015]IBSP
‑
R：5
’‑
TCCCCGTTCTCACTTTCATAGAT
‑3’
；
[0016]GFRA1
‑
F：5
’‑
CCAAGCACAGCTACGGAATG
‑3’
；
[0017]GFRA1
‑
R：5
’‑
CAGGCACGATGGTCTGTCG
‑3’
；
[0018]NOG
‑
F：5
’‑
CCATGCCGAGCGAGATCAAA
‑3’
；
[0019]NOG
‑
R：5
’‑
TCGGAAATGATGGGGTACTGG
‑
3；
[0020]EPHB1
‑
F：5
’‑
ATGCGCTTCACTGTGAGAGAC
‑3’
；
[0021]EPHB1
‑
R：5
’‑
ATTCCGAGTAAGAGGCCCAAA
‑3’
。
[0022]一种使用上述试剂盒预测胶质瘤预后的方法，所述方法的步骤如下：
[0023](1)检测胶质瘤患者样本中基因MEOX2、IBSP、GFRA1、NOG和EPHB1的表达水平；
[0024](2)将步骤(1)所得的表达水平代入风险评分计算公式中，计算出风险评分；当风险评分高于cut
‑
off值时，该胶质瘤患者属于高风险组，提示该胶质瘤患者预后不良，生存期短：当风险评分低于cut
‑
off值时，该胶质瘤患者属于低风险组，提示该胶质瘤患者预后良好，生存期长。
[0025]进一步优选的，步骤(1)中，所述样本包括但不限于组织、体液。在本专利技术的具体实施方案中，所述样本是体液，体液具体是血液。
[0026]进一步优选的，步骤(2)中，所述cut
‑
off值是0.3658584，该值是GEO数据集的中位数。
[0027]一种胶质瘤生存率预测模型，所述预测模型根据上述风险模型得出的风险评分结合年龄和患者分期构建列线图得到。
[0028]进一步优选的，所述预测模型可以预测患有胶质瘤后1年、3年、5年的生存率。
[0029]本专利技术上述5个基因的表达水平的测定遵循本领域熟知的已建立的标准程序(Sambrook，J.et al.(1989)Molecular Cloning：A Laboratory Manual.2nd Ed.，Cold SpringHarbor Laboratory Press，Cold Spring Harbor，NY；Ausubel，F.M.et al.(2001)Current Protocolsin Molecular Biology.Wiley&Sons，Hoboken，NJ)。所述的测本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种预测胶质瘤预后的标志物，其特征在于，所述标志物由基因MEOX2、IBSP、GFRA1、NOG和EPHB1组成。2.权利要求1所述预测胶质瘤预后的标志物的应用，其特征在于，所述应用包括但不限于评价或预测预后情况、预测生存率、构建预测胶质瘤预后风险的模型、构建预测胶质瘤生存率的模型、制备用于预测胶质瘤预后风险的检测试剂或装置、制备预测胶质瘤生存率的检测试剂或装置中的任意一种或几种的组合。3.一种预测胶质瘤预后的试剂盒，其特征在于，所述试剂盒包含有权利要求1所述的标志物的检测试剂和一个风险模型，所述风险模型包括风险评分计算公式，所述风险评分计算公式如下：风险评分＝(0.170008438280127
×
MEOX2的表达水平)+(0.196870811688214
×
IBSP的表达水平)+(
‑
0.431404278334841
×
GFRA1的表达水平)+(
‑
0.34193718212311
×
NOG的表达水平)+(0.292158077431546
×
EPHB1的表达水平)。4.如权利要求3所述的预测胶质瘤预后的试剂盒，其特征在于，所述检测试剂包括SYBR Green试剂、ddH2O和权利要求3所述风险模型中5种基因的引物。5.如权利要求4所述的预测胶质瘤预后的试剂盒，其特征在于，所述引物序列如下：MEOX2
‑
F：5
’‑
GCGATACGAGATAGCAGTGAATC
‑3’
；MEOX2
‑
R：5
’‑
GCTGTCCACCCTTTACCCTC
‑3’
；IBSP
‑
F：5
’‑
CCCCACCTTTTGGGAAAACCA
‑3’
；IBSP
‑
R：5
’‑
TCCCCGTTCTCACTTTCATAGAT
‑3’...

【专利技术属性】
技术研发人员：林晓英，付悦，宋婧婧，徐泽昆，范清晨，孙衍飞，
申请(专利权)人：山东大学第二医院，
类型：发明
国别省市：