ADGRV1基因突变体及其应用制造技术

本发明专利技术涉及分离的核酸、基因突变、分离的蛋白质及其在制备试剂盒中的用途、生物模型在筛选药物中的用途、用于治疗常染色体隐性综合征型耳聋的药物、筛选患有常染色体隐性综合征型耳聋的生物样品的系统和试剂盒、构建体和重组细胞。其中，与SEQ ID NO：1所示的核苷酸序列相比，所述分离的核酸具有选自下列突变：c.2017

【技术实现步骤摘要】
ADGRV1基因突变体及其应用


[0001]本专利技术涉及生物领域。具体地，本专利技术涉及ADGRV1基因突变体及其应用.

技术介绍

[0002]耳聋(hearing loss,HL)是最常见的感官功能障碍类疾病，相当一部分的耳聋患者的发病与遗传因素有关。通过基因检测手段确定耳聋发病的分子机制，从而进一步采取产前基因诊断和干预措施，是降低耳聋发生率的有效手段，也是耳聋防治的根本途径之一。根据是否有并发的其他临床表型，遗传性耳聋可分为综合征型耳聋(syndromic hearing loss,SHL)和非综合征型耳聋(non
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syndromic hearing loss,NSHL)。
[0003]综合征型耳聋在先天性遗传性耳聋中占比30％左右，由不同致病基因导致的综合征型耳聋在发病年龄和听力损失程度方面存在明显差异。确定耳聋发病的致病基因有助于为患者选取合适的听力干预手段，更好地提高耳聋患者的生活质量。虽然目前已发现一些综合征型耳聋的致病基因，但仍存在着相当一部分未知致病基因位点。
[0004]因而，目前对综合征型耳聋的研究仍有待深入。

技术实现思路

[0005]本专利技术旨在至少在一定程度上解决现有技术中存在的技术问题至少之一。
[0006]需要说明的是，本专利技术是基于专利技术人的下列发现而完成的：
[0007]全外显子测序(Whole
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exome sequencing，WES)是应用频率最高的基因组测序方法。外显子是人基因组的蛋白域，利用序列捕获技术可以将其DNA捕获并且富集。虽然外显子区域仅占全基因组1％左右，却包含了85％的致病突变。相比全基因组测序，全外显子测序更加经济、高效。外显子组测序主要用于识别和研究与疾病、种群进化相关的及UTR区域内的突变。结合大量的公共数据库提供的外显子数据，有利于更好地解释所得突变与疾病的关系。
[0008]因而，专利技术人针对自行收集的一例耳聋Trio家系(父母+先证者)，通过全外显子测序、家系分析联合Sanger测序验证的方法进行致病变异检测和验证。最终，根据各项检测结果，专利技术人确定了ADGRV1基因上2个新的致病突变位点c.2017
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1G>A和c.8566+2T>C，从而通过检测该核酸突变在生物样本中是否存在，可以有效地检测生物样品是否患有常染色体隐性综合征型耳聋。
[0009]为此，在本专利技术的第一个方面，本专利技术提出了一种分离的核酸。根据本专利技术的实施例，与SEQ ID NO：1所示的核苷酸序列相比，所述分离的核酸具有选自下列突变：c.2017
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1G>A；和/或与SEQ ID NO：2所示的核苷酸序列相比，所述分离的核酸具有选自下列突变：c.8566+2T>C。专利技术人发现，ADGRV1基因的上述两个突变与常染色体隐性综合征型耳聋的发病密切相关，从而通过检测该核酸在生物样本中是否存在，可以有效地检测生物样品是否患有常染色体隐性综合征型耳聋。
[0010]根据本专利技术的实施例，所述分离的核酸为DNA。
[0011]在本专利技术的第二方面，本专利技术提出了一种基因突变。根据本专利技术的实施例，与SEQ ID NO：1所示的核苷酸序列相比，所述分离的核酸具有选自下列突变：c.2017
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1G>A；和/或与SEQ ID NO：2所示的核苷酸序列相比，所述分离的核酸具有选自下列突变：c.8566+2T>C。专利技术人发现，ADGRV1基因具有突变位点c.2017
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1G>A和/或c.8566+2T>C，该突变与常染色体隐性综合征型耳聋的发病密切相关，从而通过检测该核酸在生物样本中是否存在，可以有效地检测生物样品是否患有常染色体隐性综合征型耳聋。
[0012]在本专利技术的第三方面，本专利技术提出了一种分离的蛋白质。根据本专利技术的实施例，所述分离的蛋白质由前面所述分离的核酸编码获得。专利技术人发现，ADGRV1基因具有突变位点c.2017
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1G>A和/或c.8566+2T>C，该突变与常染色体隐性综合征型耳聋的发病密切相关，从而通过检测该核酸在生物样本中是否存在，可以有效地检测生物样品是否患有常染色体隐性综合征型耳聋。
[0013]在本专利技术的第四方面，本专利技术提出了检测前面所述的分离的核酸或前面所述的基因突变或前面所述的分离的蛋白质的试剂在制备试剂盒中的用途。根据本专利技术的实施例，所述试剂盒用于诊断患有常染色体隐性综合征型耳聋。由此，通过检测该核酸或者蛋白质在生物样本中是否存在，可以有效地诊断是否患有常染色体隐性综合征型耳聋。
[0014]根据本专利技术的实施例，所述试剂包括抗体、探针以及引物的至少之一。
[0015]根据本专利技术的实施例，所述探针或引物具有如SEQ ID NO：3
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6所示的核苷酸序列。
[0016]在本专利技术的第五方面，本专利技术提出了一种生物模型在筛选药物中的用途。根据本专利技术的实施例，所述生物模型携带前面所述的分离的核酸和/或前面所述的基因突变和/或表达前面所述的分离的蛋白质。由此，利用本专利技术的生物模型能够准确地筛选出治疗常染色体隐性综合征型耳聋的药物。
[0017]根据本专利技术的实施例，所述生物模型为细胞模型或者动物模型。
[0018]在本专利技术的第六方面，本专利技术提出了一种用于治疗常染色体隐性综合征型耳聋的药物。根据本专利技术的实施例，所述药物含有：特异性改变前面所述的分离的核酸或者前面所述的基因突变或者前面所述分离的蛋白质的试剂。由此，利用本专利技术的药物能够有效地治疗常染色体隐性综合征型耳聋。
[0019]在本专利技术的第七方面，本专利技术提出了一种筛选患有常染色体隐性综合征型耳聋的生物样品的系统。根据本专利技术的实施例，所述系统包括：核酸提取装置，所述核酸提取装置用于从所述生物样品提取核酸样本；核酸序列确定装置，所述核酸序列确定装置与所述核酸提取装置相连，用于对所述核酸样本进行分析，以便确定所述核酸样本的核酸序列；判断装置，所述判断装置与所述核酸序列确定装置相连，以便基于所述核酸样本的核酸序列或其互补序列与SEQ ID NO：1所示的核苷酸序列相比，是否具有选自下列突变：c.2017
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1G>A突变，和/或基于所述核酸样本的核酸序列或其互补序列与SEQ ID NO：2所示的核苷酸序列相比，是否具有选自下列突变：c.8566+2T>C突变，判断所述生物样品是否患有常染色体隐性综合征型耳聋。通过本专利技术筛选常染色体隐性综合征型耳聋的生物样品的系统，可以有效地筛选出患有常染色体隐性综合征型耳聋的生物样品。
[0020]根据本专利技术的实施例，所述核酸提取装置进一步包括：RNA提取单元，所述RNA提取单元用于从所述生物样品中提取RNA样本；以及反转录单元，所述反转录单元与所述RNA提取单元相连，用于对所述RNA样本本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种分离的核酸，其特征在于，与SEQ ID NO：1所示的核苷酸序列相比，所述分离的核酸具有选自下列突变：c.2017
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1G>A；和/或与SEQ ID NO：2所示的核苷酸序列相比，所述分离的核酸具有选自下列突变：c.8566+2T>C；任选地，所述第一核酸和第二核酸为DNA。2.一种基因突变，其特征在于，与SEQ ID NO：1所示的核苷酸序列相比，所述分离的核酸具有选自下列突变：c.2017
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1G>A；和/或与SEQ ID NO：2所示的核苷酸序列相比，所述分离的核酸具有选自下列突变：c.8566+2T>C。3.一种分离的蛋白质，其特征在于，所述分离的蛋白质由权利要求1所述分离的核酸编码获得。4.检测权利要求1所述的分离的核酸、权利要求2所述的基因突变或权利要求3所述的分离的蛋白质的试剂在制备试剂盒中的用途，其特征在于，所述试剂盒用于诊断常染色体隐性综合征型耳聋；任选地，所述试剂包括抗体、探针以及引物的至少之一；任选地，所述探针或引物具有如SEQ ID NO：3
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6所示的核苷酸序列。5.生物模型在筛选药物中的用途，其特征在于，所述生物模型携带权利要求1所述的分离的核酸、权利要求2所述的基因突变和/或权利要求3所述的分离的蛋白质；任选地，所述生物模型为细胞模型或者动物模型。6.一种用于治疗常染色体隐性综合征型耳聋的药物，其特征在于，所述药物含有：特异性改变权利要求1所述的分离的核酸、权利要求2所述的基因突变或者权利要求3所述的分离的蛋白质的试剂。7.一种筛选常染色体隐性综合征型耳聋的生物样品的系统，其特征在于，包括：核酸提取装置，所述核酸提取装置用于从所述生物样品提取核酸样本；核酸序列确定装置，所述核酸序列确定装置与所述核酸提取装置相连，用于对所述核酸样本进行分析，以便确定所述核酸样本的核酸序列；判断装置，所述判断装置与所述核酸序列确定装置相连，以便基于所述核酸样本的核酸序列或其互补序列与SEQ...

【专利技术属性】
技术研发人员：宋娜娜，刘灵，孙祥忠，张红云，向嘉乐，杨璟，周锐，彭智宇，彭欢欢，
申请(专利权)人：郑州大学第三附属医院，
类型：发明
国别省市：