一种将数量遗传主效位点单基因化的方法技术

技术编号:38737074 阅读:7 留言:0更新日期:2023-09-08 23:23
本发明专利技术提供一种将数量遗传主效位点单基因化的方法。该方法包括如下步骤:针对呈连续分布的植物数量遗传性状,采用具有两种极端表型的自交系植株进行杂交,得F1群体;F1群体自交,得F2分离群体;选取F2分离群体中的两种极端表型植株,分别提取DNA/RNA,构建两个混池进行BSA/BSR

【技术实现步骤摘要】
一种将数量遗传主效位点单基因化的方法


[0001]本专利技术涉及基因定位
,具体涉及一种将数量遗传主效位点单基因化的方法。

技术介绍

[0002]数量性状(Quantitative trait)指某一性状在群体中变异呈连续性正态分布,无法明确分组,这类性状无法通过表型来推断其基因型,易受环境影响和遗传背景影响。数量性状是指个体间表现的差异只能用数量来区别,变异呈连续性的性状,其主要特征有:
[0003]①
个体间差异很难描述,需要度量;
[0004]②
在一个群体中,变异呈连续性;
[0005]③
数量性状常受多基因控制;
[0006]④
数量性状对环境影响敏感。
[0007]数量性状由一组效应大小不等、数量不同的基因所控制,甚至可以由个别主基因控制。数量性状基因座(Quantitative trait locus,QTL)是指控制数量性状的基因在基因组中的位置。一般把能控制数量性状的位点就叫做QTL。
[0008]数量性状的遗传规律复杂,一般由多个基因控制。数量性状位点的传统鉴定方法须使用特殊高级世代群体,如高世代重组自交系(RILs)、近等基因系(NILs)等进行“降维”处理,再使用单基因化后的分离群体进行基因的鉴定与分析。以上过程耗时耗力,无法在较短时间内实现数量性状遗传主效位点的单基因化。

技术实现思路

[0009]基于此,有必要提供一种将数量遗传主效位点单基因化的方法,能够相对快速实现对数量性状遗传主效位点单基因化,减少工作量和研究成本。
[0010]本专利技术采用如下技术方案:
[0011]本专利技术提供一种将数量性状遗传主效位点单基因化的方法,包括如下步骤:
[0012]S1,选取呈连续分布的数量性状的植株,采用两种极端表型自交系植株进行杂交,得F1群体;
[0013]S2,F1群体自交,得F2分离群体;
[0014]S3,选取F2分离群体中的两种极端表型植株,构建两个混池进行BSA

seq,确定数量性状位点基因的覆盖区间;
[0015]S4,判断所述覆盖区间的基因分型,结合F2群体表型,挑选单位点杂合同时后代能出现性状分离的植株进行自交,构建F
2:3
家系;
[0016]S5,选取F
2:3
家系中两种极端表型植株,构建两个混池进行BSA

seq/BSR

seq,结果呈现单峰值,即实现对数量性状遗传主效位点单基因化。
[0017]与现有技术相比,本专利技术的核心优势在于:
[0018]本专利技术将数量遗传主效位点单基因化的方法是通过BSA技术结合跨区域双分子标
记技术,实现对数量性状遗传主效位点单基因化,能够相对快速实现对数量性状遗传主效位点单基因化,减少工作量和研究成本。
[0019]1)技术效率高:可在一个自然世代(F
2:3
家系)内完成数量性状主效位点的单基因化工作;
[0020]2)技术降低工作量:可同时对两个及以上的数量性状主效位点进行单基因化,针对每个位点约采用5个左右家系便可完成单基因化工作,大大减少了单基因化工作的工作量;
[0021]3)技术成本降低:本技术整合BSA

seq技术与跨区域分子标记开发技术,样品检测以及开发成本目前可控制在5000元以内,极大的减少了数量性状研究的成本。
附图说明
[0022]图1为本专利技术将数量性状遗传主效位点单基因化的方法的流程示意图。
[0023]图2为实施例1中萝卜F2分离群体所构建的两个极端性状混池BSR

seq的分析结果图。
[0024]图3为实施例1中萝卜单基因化群体的两个极端性状混池BSR

seq的分析结果图。
[0025]图4为实施例2中莴苣F2分离群体所构建的两个极端性状混池BSR

seq的分析结果图
[0026]图5为实施例2中莴苣单基因化群体的两个极端性状混池BSR

seq的分析结果图。
具体实施方式
[0027]本专利技术的技术构思在于提供一种将数量性状遗传主效位点单基因化的方法,能够相对快速实现对数量性状遗传主效位点单基因化,减少工作量和研究成本。
[0028]如图1所示,本专利技术提供一种将数量遗传主效位点单基因化的方法,流程步骤为:
[0029](A)选取呈连续分布的数量性状的植株,采用两种极端表型自交系植株进行杂交,得F1群体。
[0030]F1群体自交,得F2分离群体。
[0031](B)选取F2分离群体中的两种极端表型植株,例如各20个,构建两个混池进行BSA/BSR

seq,确定数量性状位点的覆盖区间。
[0032](C)判断覆盖区间的基因分型,结合F2群体表型,挑选单位点杂合同时后代能出现性状分离的植株进行自交,构建F
2:3
家系。
[0033]本步骤中,基因分型采用BSA/BSR

seq与跨区域双分子标记技术:1)通过分析BSA的结果,在数量性状的遗传位点两端设计引物;2)通过PCR扩增以及电泳检测对该群体进行基因分型。
[0034](D)选取F
2:3
家系中两种极端表型植株,构建两个混池进行BSA/BSR

seq,结果呈现单峰值,即实现对数量性状遗传主效位点单基因化,获得单基因分离群体,可以进一步用于后续的遗传定位。
[0035]下面结合具体实施例对本专利技术作进一步的详细说明,以使本领域的技术人员更加清楚地理解本专利技术。以下各实施例,仅用于说明本专利技术,但不止用来限制本专利技术的范围。基于本专利技术中的具体实施例,本领域普通技术人员在没有做出创造性劳动的情况下,所获得
的其他所有实施例,都属于本专利技术的保护范围。在本专利技术实施例中,若无特殊说明,所有原料组分均为本领域技术人员熟知的市售产品;在本专利技术实施例中,若未具体指明,所用的技术手段均为本领域技术人员所熟知的常规手段。
[0036]实施例1
[0037]本实施例提供一种将萝卜绿皮数量性状遗传主效位点单基因化的方法,包括如下步骤:
[0038](1)萝卜绿皮表型的遗传分析
[0039]本研究对萝卜的皮色(绿色与白色)进行遗传分析。本研究使用绿皮萝卜“QZ

16”和白皮萝卜“55”(来源于湖北省经济作物种质资源库)杂交得到杂交F1群体。F1群体的皮色为浅绿色。
[0040]将F1群体自交后得到F2分离群体。在F2分离群体的皮色性状调查过程中发现,F2分离群体同时出现了白色、浅绿、绿色、深绿四种连续的皮色性状分布,说明了萝卜的皮色表型呈现数量性状。
[0041](2)单基因群体的构建
[0042]在F2群体中挑选白色皮萝卜和深绿本文档来自技高网
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【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种将数量遗传主效位点单基因化的方法,其特征在于,所述数量遗传主效位点单基因化的流程包括:选取呈连续分布的数量性状的植株,采用两种极端表型自交系植株杂交获得F1群体,并自交获得F2分离群体,在F2分离群体中选取两种极端表型植株,构建两个混池进行BSA/BSR

seq,确定数量性状位点的覆盖区间;根据目的位点覆盖区间的基因分型,结合F2群体表型,挑选单个位点杂合而其它位点隐性纯合植株自交,构建F
2:3
家系;观察针对目标性状出现了孟德尔分离的F
2:3
家系,选取具有极端表型的植株,构建两个混池进行BSA/BSR

seq,获得目的性状的覆盖区间图;若结果呈现单峰值,则完成对数量性状遗传主效位点的单基因化,获得单基因分离群体。2.根据权利要求1所述的将数量遗传主效位点单基因化的方法,其特征在于,采...

【专利技术属性】
技术研发人员:严承欢李逍瑶矫振彪邱正明黄燕袁国丽杨文杰朱凤娟张书婷胡震
申请(专利权)人:湖北省农业科学院经济作物研究所
类型:发明
国别省市:

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