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【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及核酸检测,具体涉及一种草莓毛形病毒4的快速检测方法。
技术介绍
1、草莓毛形病毒4(strawberry crinivirus 4,scrv4)隶属长线形病毒科毛形病毒属,种分类尚未确定。其基因组为正单链rna,尚未报道其基因组全长。2016年,为了鉴定罹病草莓植株携带的病毒种类,通过高通量测序分析,加拿大地区首次报道了scrv4。2018年,国内福建地区首次报道了病毒scrv4的存在。2022年的报道中,首次在伊朗地区的草莓上检测到病毒scrv4。可见,该病毒的分布是世界性的。研究中该病毒存在于出现病害的草莓植株中,与草莓病害相关,对草莓的健康生长造成危险。
2、日本学者notomi在2000年提出了环介导等温扩增(loop-mediated isothermalamplification,lamp)技术,具有特异性强、操作简单及扩增高效等优点。基于lamp技术的逆转录环介导等温扩增(reverse transcription loop-mediated isothermalamplification,rt-lamp)是在反应体系中加入逆转录酶实现对rna模板的一步扩增。该技术已被广泛应用到其它病毒的检测中,目前,尚未见rt-lamp技术检测scrv4的报道。病毒scrv4的发现主要是通过高通量测序分析及rt-pcr扩增等方法。这些方法耗时久、仪器昂贵,通常无法通过裸眼直观判定。因此,开发操作简便、耗时短,且能够裸眼直观判定的检测方法十分必要。
技术实现思路
...【技术保护点】
1.一种草莓毛形病毒4的快速检测方法,其特征在于,所述检测方法以草莓毛形病毒4的多聚蛋白1a编码基因为靶标序列设计引物,利用所述引物进行逆转录环介导等温扩增鉴定草莓毛形病毒4。
2.如权利要求1所述的草莓毛形病毒4的快速检测方法,其特征在于,所述引物包括SCrV4-F3引物、SCrV4-B3引物、SCrV4-FIP引物、SCrV4-BIP引物和SCrV4-LF引物,其具体序列如下:
3.如权利要求2所述的草莓毛形病毒4的快速检测方法,其特征在于,所述检测方法包括以下步骤:
4.如权利要求3所述的草莓毛形病毒4的快速检测方法,其特征在于,在步骤S3中,所述鉴定采用下述1)或2)所述的方法:
5.如权利要求1所述的草莓毛形病毒4的快速检测方法,其特征在于,所述逆转录环介导等温扩增采用的反应体系为2.5μL 10×Isothermal Amplification Buffer、6mmol/LMg2+、1mmol/L dNTPs、1.2μmol/L SCrV4-FIP和SCrV4-BIP,0.1μmol/L SCrV4-F3和SCrV4-B
6.如权利要求1所述的草莓毛形病毒4的快速检测方法,其特征在于,所述逆转录环介导等温扩增采用的反应程序为60℃40min,80℃10min。
...【技术特征摘要】
1.一种草莓毛形病毒4的快速检测方法,其特征在于,所述检测方法以草莓毛形病毒4的多聚蛋白1a编码基因为靶标序列设计引物,利用所述引物进行逆转录环介导等温扩增鉴定草莓毛形病毒4。
2.如权利要求1所述的草莓毛形病毒4的快速检测方法,其特征在于,所述引物包括scrv4-f3引物、scrv4-b3引物、scrv4-fip引物、scrv4-bip引物和scrv4-lf引物,其具体序列如下:
3.如权利要求2所述的草莓毛形病毒4的快速检测方法,其特征在于,所述检测方法包括以下步骤:
4.如权利要求3所述的草莓毛形病毒4的快速检测方法,其特征在于,在步骤s3中,所述鉴定采用下述1)或2)所述的方法:
5.如权利要求1所述的草莓毛形病毒4的快速检测方法,其特征在于,所述逆...
【专利技术属性】
技术研发人员:韩永超,王涌,曾祥国,肖桂林,邓江丽,
申请(专利权)人:湖北省农业科学院经济作物研究所,
类型:发明
国别省市:
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