抗SARS-COV-2-刺突蛋白抗体和抗原结合片段制造技术

本发明专利技术涉及与野生型SARS

【技术实现步骤摘要】
抗SARS
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COV
‑2‑
刺突蛋白抗体和抗原结合片段
专利

[0001]本专利技术涉及与野生型SARS
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CoV
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2的刺突蛋白结合的分离抗体及其变体，例如α(B.1.1.7)、β(B.1.351)、γ(P.1))、delta(B.1.617.2)和omicron(BA.1或BA.2)。

技术介绍

[0002]SARS
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CoV
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2属于巢状病毒科冠状病毒科的冠状病毒属，在人类已知的所有RNA病毒中具有最大的基因组，长度为27至32kb。SARS
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CoV
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2至少有四种主要结构蛋白，包括刺突蛋白(S蛋白)、膜蛋白(M蛋白)、包膜蛋白(E蛋白)和核衣壳蛋白(N蛋白)。病毒进入细胞取决于S蛋白和S蛋白的受体结合域(RBD)。S蛋白有两个亚基S1和S2，RBD位于S1亚基上。RBD的功能是识别宿主细胞表面受体并介导与宿主细胞的融合。N蛋白是一种碱性磷蛋白，其中心区域与病毒基因组RNA结合形成卷曲的核衣壳螺旋，是包膜病毒遗传物质的核心结构，是感染细胞中表达最高的病毒蛋白之一.
[0003]本领域需要RBD结构域刺突蛋白SARS
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CoV
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2中和抗体，特别是在体内具有延长的半衰期的抗体。

技术实现思路

[0004]一方面，本专利技术提供了分离的单克隆抗体，其结合包含SEQIDNO:106或SEQIDNO:108或SEQIDNO:110所示氨基酸序列的SARS
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CoV
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2刺突蛋白，其中所述分离的抗体包含：一个免疫球蛋白恒定区，三个轻链互补决定区(CDR)(LCDR1、LCDR2和LCDR3)包含在一个轻链可变区(LVR)中，该轻链可变区(LVR)包含LCDR1：SEQIDNO：10、LCDR2：SEQIDNO：11和LCDR3：SEQIDNO:12，以及包含在包含HCDR1:SEQIDNO:13、HCDR2:SEQIDNO:14的重链可变区(HVR)内的三个重链互补决定区(CDR)(HCDR1、HCDR2和HCDR3)和HCDR3：SEQIDNO：15；一个免疫球蛋白恒定区，三个轻链互补决定区(CDR)(LCDR1、LCDR2和LCDR3)包含在一个轻链可变区(LVR)中，该轻链可变区(LVR)包含LCDR1：SEQIDNO：20、LCDR2：SEQIDNO：21和LCDR3:SEQIDNO:22，和三个重链互补决定区(CDR)(HCDR1、HCDR2和HCDR3)包含在包含HCDR1:SEQIDNO:23、HCDR2:SEQIDNO:24的重链可变区(HVR)内和HCDR3：SEQIDNO：25；一个免疫球蛋白恒定区，三个轻链互补决定区(CDR)(LCDR1、LCDR2和LCDR3)包含在一个轻链可变区(LVR)中，包括LCDR1：SEQIDNO：30、LCDR2：SEQIDNO：31和LCDR3:SEQIDNO:32，以及包含在包含HCDR1:SEQIDNO:33、HCDR2:SEQIDNO:34的重链可变区(HVR)内的三个重链互补决定区(CDR)(HCDR1、HCDR2和HCDR3)和HCDR3：SEQIDNO：35；一个免疫球蛋白恒定区，三个轻链互补决定区(CDR)(LCDR1、LCDR2和LCDR3)包含在一个轻链可变区(LVR)中，包括LCDR1:SEQIDNO:40、LCDR2:SEQIDNO:41和LCDR3:SEQIDNO:42，和三个重链互补决定区(CDR)(HCDR1、HCDR2和HCDR3)包含在包含HCDR1:SEQID
NO:43、 HCDR2:SEQ ID NO:44的重链可变区(HVR)内和HCDR3：SEQ ID NO： 45。
[0005]本专利技术还提供了上述SARS
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CoV
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2RBD特异性单克隆抗体在检测或诊断或中和 SARS
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CoV
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2的试剂或疫苗或药物中的应用，其中药物包括SARS
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CoV
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2RBD特异性单克隆抗体和药学上可接受的赋形剂、稀释剂或载体；本专利技术还提供了编码上述 SARS
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CoV
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2RBD特异性单克隆抗体的核酸和含有上述核酸的表达盒、重组载体、重组细菌或转基因细胞系。本专利技术还提供了表达盒、重组载体、重组细菌或转基因细胞系在产品制备中的应用。
[0006]在各种实施例中，可以组合以上或本文所讨论的实施例的任何特征或组件，并且这样的组合包含在本公开的范围内。上述或本文讨论的任何特定值可以与上述或本文讨论的另一个相关值组合以列举一个范围，该范围的值表示该范围的上限和下限，并且这样的范围包含在本公开的范围内。
附图说明
[0007]图1抗体活性B.a通过ELIS测量，抗体B对不同RBD的检测。b抗体B中和假型SARS
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CoV
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2WT和不同变体。通过扫描荧光斑计算感染抑制率。c评估抗体B 对活SARS
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CoV
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2WT以及Delta和Omicron变体的中和活性。d抗体的结合区B. RBDs rom WT SRS
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CoV
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2与Alpha、Beta、Gamma、Delta和Omicron变体对齐。红线表示抗体的结合区域B.e结合到SRS
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CoV
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2RBD上的抗体B Fab复合物的结构。在左侧，RD的二级结构元件和抗体B Fab的重链和轻链分别为绿色、青色和紫色。 RBD的表面是绿色的。Delta变体的突变残基为蓝色(中)，而来自Omicron的突变残基为红色(右)。
具体实施方式
[0008]为了可以更完整地理解本申请，以下阐述了几个定义。此类定义旨在涵盖语法等价物。
[0009]与参考数值有关的术语“约”可以包括数值本身和从该数值加减10％的值范围。例如，“约10”的数量包括10和从9到11的任何数量。例如，与参考数值有关的术语“约”还可以包括正负10％、9％、8％、7％、6％、5％、4％、3％、2的值范围。％，或该值的1％。
[0010]在权利要求中使用“由
……
组成”或“基本上由
……
组成”的语言可以进一步限制在此公开的特定实施例。当在权利要求中使用时，无论是提交的还是根据修改添加的，过渡术语“由...组成”不包括未在权利要求中指定的任何元素、步骤或成分。过渡术语“基本上由
……
组成”将权利要求的范围限制为指定的材料或步骤，以及那些不实质影响基本和新颖特性的材料或步骤。如此要求保护的本公开的实施例在本文中固有地或明确地描述和启用。
[0011]除非另有说明，否则在描述本公开的上下文中(特别是在以下权利要求的上下文中)使用的术语“一个”、“本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种分离的单克隆抗体，其结合包含SEQ ID NO:106或SEQ ID NO:108或SEQ ID NO:110所示氨基酸序列的SARS
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CoV
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2刺突蛋白，其中所述分离的抗体包含：一个免疫球蛋白恒定区，三个轻链互补决定区(CDR)(LCDR1、LCDR2和LCDR3)包含在一个轻链可变区(LVR)中，该轻链可变区(LVR)包含LCDR1：SEQ ID NO：10、LCDR2：SEQ ID NO：11和LCDR3:SEQ ID NO:12，以及包含在包含HCDR1:SEQ ID NO:13、HCDR2:SEQ ID NO:14的重链可变区(HVR)内的三个重链互补决定区(CDR)(HCDR1、HCDR2和HCDR3)和HCDR3：SEQ ID NO：15；一个免疫球蛋白恒定区，三个轻链互补决定区(CDR)(LCDR1、LCDR2和LCDR3)包含在一个轻链可变区(LVR)中，该轻链可变区(LVR)包含LCDR1：SEQ ID NO：20、LCDR2：SEQ ID NO：21和LCDR3:SEQ ID NO:22，和三个重链互补决定区(CDR)(HCDR1、HCDR2和HCDR3)包含在包含HCDR1:SEQ ID NO:23、HCDR2:SEQ ID NO:24的重链可变区(HVR)内和HCDR3：SEQ ID NO：25；一个免疫球蛋白恒定区，三个轻链互补决定区(CDR)(LCDR1、LCDR2和LCDR3)包含在一个轻链可变区(LVR)中，包括LCDR1：SEQ ID NO：30、LCDR2：SEQ ID NO：31和LCDR3:SEQ ID NO:32，以及包含在包含HCDR1:SEQ ID NO:33、HCDR2:SEQ ID NO:34的重链可变区(HVR)内的三个重链互补决定区(CDR)(HCDR1、HCDR2和HCDR3)和HCDR3：SEQ ID NO：35；一个免疫球蛋白恒定区，三个轻链互补决定区(CDR)(LCDR1、LCDR2和LCDR3)包含在一个轻链可变区(LVR)中，包括LCDR1:SEQ ID NO:40、LCDR2:SEQ ID NO:41和LCDR3:SEQ ID NO:42，和三个重链互补决定区(CDR)(HCDR1、HCDR2和HCDR3)包含在包含HCDR1:SEQ ID NO:43、HCDR2:SEQ ID NO:44的重链可变区(HVR)内和HCDR3：SEQ ID NO：45。2.如权利要求1所述的分离的抗体，其中轻链可变区(LVR)包含SEQ ID NO:16所示的氨基酸序列，重链可变区(HVR)包含SEQ ID NO:18所示的氨基酸序列；轻链可变区(LVR)包含SEQ ID NO：26所示的氨基酸序列，重链可变区(HVR)包含SEQ ID NO：28所示的氨基酸序列；轻链可变区(LVR)包含SEQ ID NO:36所示的氨基酸序列，重链可变区(HVR)包含SEQ ID NO:38所示的氨基酸序列；轻链可变区(LVR)包含SEQ ID NO:46所示的氨基酸序列，重链可变区(HVR)包含SEQ ID NO:48所示的氨基酸序列；或者轻链可变区(LVR)包含SEQ ID NO:50所示的氨基酸序列，重链可变区(HVR)包含SEQ ID NO:52所示的氨基酸序列。3.权利要求1的分离抗体，其中所述免疫球蛋白恒定区是IgG1恒定区。4.如权利要求1所述的分离抗体，其为重组抗体。5.根据权利要求1所述的分离抗体，其特征在于，所述分离抗体结合SARS
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CoV
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2刺突蛋白的RBD结构域，所述RBD结构域包含SEQ ID NO:107或SEQ ID NO:109所示的氨基酸序列或SEQ ID NO:111。6.权利要求1的分离的抗体，其中所述分离的抗体具有至少一种本文所述的免疫球蛋白恒定区取代。7.权利要求1的分离抗体，其中所述分离抗体在免疫球蛋白恒定区中具有LALA取代。
8.一种药物组合物，包含前述权利要求的分离的抗体和药学上可接受的载体或稀释剂。9.一种与冠状病毒刺突蛋白(CoV
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S)特异性结合的分离重组抗体，其中分离抗体具有以下一种或多种特征：(a)与CoV
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S结合，EC50小于约10
‑9米；(b)与未进行所述给药的可比较的冠状病毒感染动物相比，在向所述感染冠状病毒的动物给药后，证明感染冠状病毒的动物的存活率增加；和/或(c)包含三个重链互补决定区(CDR)(HCDR1、HCDR2和HCDR3)，该重链可变区(HVR)包含与表1的HVR具有至少约90％序列同一性的氨基酸序列；以及包含在轻链可变区(LVR)内的三个轻链CDR(LCDR1、LCDR2和LCDR3)，其包含与表1的LVR具有至少约90％序列同一性的氨基酸序列。10.权利要求9的分离的抗体，其中所述分离的抗体具有至少一种本文所述的免疫球蛋白恒定区取代。11.一种分离的重组抗体，可特异性结合冠状病毒刺突蛋白(RBD
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CoV
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S)上的RBD结构域，其中该抗体具有以下一项或多项特征：(a)与RBD
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CoV
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S结合，EC50小于约10
‑9米；(b)与未进行所述给药的可比较的冠状病毒感染动物相比，在向所述感染冠状病毒的动物给药后，证明感染冠状病毒的动物的存活率增加；和/或(c)包含三个重链互补决定区(CDR)(HCDR1、HCDR2和HCDR3)，该...

【专利技术属性】
技术研发人员：黄爱龙，程国锋，杨成勇，金艾顺，李婷婷，韩晓建，王应明，胡超，罗飞扬，陆冰霞，林翠翠，罗书慧，陆婷婷，
申请(专利权)人：重庆明道浩悦生物科技有限公司，
类型：发明
国别省市：