一种用于检测Tg737基因的LAMP引物组和方法技术

技术编号:38352345 阅读:13 留言:0更新日期:2023-08-05 17:25
本发明专利技术提供了一种用于检测Tg737基因的LAMP引物组和方法,根据Tg737基因设计一组环介导等温扩增引物(SEQ ID NO.1

【技术实现步骤摘要】
一种用于检测Tg737基因的LAMP引物组和方法


[0001]本专利技术涉及基因检测
,具体涉及一种用于检测Tg737基因的LAMP引物组和方法。

技术介绍

[0002]慢加急性肝衰竭(acute

on

chronic liver failure,ACLF)致病机理复杂、病死率高,是在慢性肝病基础上出现的急性肝功能失代偿。间充质干细胞(mesenchymal stem cell,MSC),具有在体外多向分化、增殖、低免疫原性的特点,作为有效的治疗手段应用于ACLF。通过一定手段来监测,则可对其治疗的疗效、临床实用价值等进行评估。Tg737基因在藻类中发现位于13号染色体q12.11是一蛋白质编码基因,编码的极性蛋白与选择性自噬、软骨内成骨与细胞驱动有关,与色素性视网膜炎和多囊肾病疾病相关。研究发现Tg737基因与细胞增殖与凋亡、低氧条件下的转移与侵袭相关,ACLF 的重要病理过程是肝细胞受损,干细胞治疗ACLF 过程中,Tg737 基因表达是呈升高趋势。
[0003]自Kary Mullis专利技术了PCR技术以来,随着酶工业的发展,基于恒温扩增的等温扩增(isothermal amplification technology,ITA)核酸检测技术以依赖核酸序列的扩增(nucleic acid sequence

based amplification,NASBA)、环介导等温扩增(loop

mediated isothermal amplification,LAMP)、交叉引物扩增(crossing primingamplification,CPA)、链替代扩增(strand displacement amplification,SDA)、重组酶聚合酶扩增(recombinase polymerase amplification,RPA)、滚环扩增(rolling circleamplification,RCA)和依赖解旋酶的扩增(helicase

dependent amplification,HDA)等多种形式广泛应用于农业、医疗等领域。侧流免疫层析分析(lateralflow immunochromatography assay,LFIA)是一种基于抗原、抗体免疫反应的经典快速检测技术,结合两者之优点,LAMP

LFIA核酸检测技术在可视化基础上增强敏感度。

技术实现思路

[0004]本专利技术的目的是提供一种用于检测Tg737基因的LAMP引物组和方法,是一种基于LAMP

侧流免疫层析技术生物传感检测方法。
[0005]本专利技术构思如下:开发一种Tg737基因快速且敏感发检测方法。建立基于环介导等温扩增反应(LAMP)和侧流免疫层析分析生物传感器。在LAMP反应中,使用荧光素(FAM)修饰的和生物素(Bio)修饰的引物,检测Tg737基因。标记颗粒(金颗粒、乳胶颗粒或荧光颗粒)的免疫层析试纸条放大检测信号,通过目视或相应阅读仪进行结果判断、判读或定量,为简易便利检测Tg737基因提供有效方法,应用于评估ACLF接受干细胞移植治疗评估疗效判断。
[0006]为了实现本专利技术目的,本专利技术提供用于检测Tg737的LAMP引物组,包括反向外引物B3、正向外引物F3、正向内引物FIP、反向内引物BIP、正向环引物LF和反向环引物LB;各引物序列如SEQ ID No.1

6所示:B3:5
’‑
AAATGCAGAGCCTCTCAA
‑3’

F3:5
’‑
AGACCTCCAATAACTGCTAA
‑3’
;FIP:5
’‑
TCCTATTGATGATGCCAGAGATGTCCACGGCAGTTACTAGACCTA
‑3’
;BIP:5
’‑
GACAGGGGCTATTCAGGATGGTGCTTTGGTAAAACCAGCT
‑3’
;LF:5
’‑
TTGGACCCATATCCAGTAGC
‑3’
;LB:5
’‑
AGTTACTAGACCCATGACAGC
‑3’
;其中,引物FIP的5

端标记荧光素FAM,引物BIP的5

端标记生物素Biotin。
[0007]本专利技术基于LAMP

侧流免疫层析技术检测Tg737基因的方法,其特征在于:包括以下步骤:(1)提取待测样品的RNA并逆转录合成cDNA,以cDNA为模板,利用权利要求1所述LAMP引物组进行LAMP

PCR扩增反应;LAMP

PCR扩增反应的体系为:2μLFIP,2μLBIP,0.5μLF3,0.5μLB3,1.0μLLF,1.0μLLB;12.5μLLAMPmasterMix缓冲液,其中Mg
2+
浓度为6.0uM,dNTPMix10.0uM;1μL模板;0.5μLBstDNA聚合酶;0.5μL参比荧光染料ROX,0.25μL荧光染料100
×
EvaGreen,补足无菌水至25μL。LAMP

PCR扩增反应条件为:65℃1min,共45个循环。
[0008](2)取200倍稀释LAMP

PCR扩增产物60

80μL加到侧流免疫层析试纸条的检测孔内,静置5

10分钟,通过目视进行结果判断,阴性反应:质控线显色,检测线不显色;阳性反应:质控线、检测线均显色;反应失效:质控线不显色,示检测失败或试纸条失效。
[0009]上述侧流免疫层析试纸条,有效结合了层析技术的分离能力和免疫分析的高度特异性,侧流免疫层析试纸条为金颗粒免疫层析试纸条,该试纸条包括标记颗粒的制备及免疫层析试纸条的组装。金颗粒免疫层析试纸条的制备方法,包括以下步骤: 1)金颗粒的制备:洁净干燥三角烧瓶置磁力搅拌器上,将1mMHAuCl4溶液100mL加入烧瓶中,快速搅拌回流加热后,缓慢加入5mL80mM的C6H5Na3O7溶液在室温进行充分反应,溶液经由无色、浅黄色至红色,反应时间为15

20分钟,反应完成后停止搅拌,溶液冷却后置于4℃保存。
[0010]2)免疫金颗粒的制备:

将金颗粒分别与鼠抗人IgG(0.5mg/mL)和生物素抗体(0.5mg/mL)作用。取上述5mL金纳米颗粒溶液,将其pH值调至弱碱性(pH=8.5),然后加入生物素抗体10μL,之后再漩涡混合器上充分反应,2小时后,加1%BSA500μL封闭,室温下放置24小时。再10000rpm转速下离心30分钟,弃上清,沉淀重溶于1ml水溶液中,获得生物素抗体修饰的金颗粒。相同步骤处理鼠抗人IgG,获得本文档来自技高网
...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种用于检测Tg737基因的LAMP引物组,其特征在于:包括反向外引物B3、正向外引物F3、正向内引物FIP、反向内引物BIP、正向环引物LF和反向环引物LB;各引物序列具体如下:B3:5
’‑
AAATGCAGAGCCTCTCAA
‑3’
;F3:5
’‑
AGACCTCCAATAACTGCTAA
‑3’
;FIP:5
’‑
TCCTATTGATGATGCCAGAGATGTCCACGGCAGTTACTAGACCTA
‑3’
;BIP:5
’‑
GACAGGGGCTATTCAGGATGGTGCTTTGGTAAAACCAGCT
‑3’
;LF:5
’‑
TTGGACCCATATCCAGTAGC
‑3’
;LB:5
’‑
AGTTACTAGACCCATGACAGC
‑3’
;其中,引物FIP的5

端标记荧光素FAM,引物BIP的5

端标记生物素Biotin。2.一种基于LAMP

侧流免疫层析技术检测Tg737基因的方法,其特征在于:包括以下步骤:(1)提取待测样品的RNA并逆转录合成cDNA,以cDNA为模板,利用权利要求1所述LAMP引物组进行LAMP

PCR扩增反应;(2)取LAMP

PCR扩增产物进行200倍稀释后,取60

80μL加到侧流免疫层析试纸条的检测孔内,静置5

10分钟,通过目视进行结果判断,阴性反应:质控线显色,检测线不显色;阳性反应:质控线、检测线均显色;反应失效:质控线不显色,则检测失败或试纸条失效。3.根据权利要求1所述的基于LAMP

侧流免疫层析技术检测Tg737基因的方法,其特征在于:LAMP

PCR扩增反应的体系为:2μLFIP,2μLBIP,0.5μLF3,0.5μLB3,1.0μLLF,1.0μL...

【专利技术属性】
技术研发人员:蔡辉陈小梅张磊升曲涛马海忠徐向红
申请(专利权)人:甘肃省人民医院
类型:发明
国别省市:

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