一种高通量测序实验室管理系统技术方案

本申请公开了一种高通量测序实验室管理系统。本申请的高通量测序实验室管理系统，包括前端和后端分离的开发架构；其中，前端包括静态资源页面；后端包括若干管理和分析模块组合，用于提供测序服务和实验室管理；前端和后端通过Nginx反向代理软件集成。本申请的高通量测序实验室管理系统，大幅度提高工作效率，简化操作流程，降低人力成本，提高用户体验。同时，本申请的高通量测序实验室管理系统根据高通量测序实验室的需求进行深度定制化的开发，更专业，更契合用户在实验室中实际使用的场景。景。景。

【技术实现步骤摘要】
一种高通量测序实验室管理系统


[0001]本申请涉及软件管理系统
，特别是涉及一种高通量测序实验室管理系统。

技术介绍

[0002]高通量测序又称“下一代”测序技术(“Next
‑
generation”sequencing technology，NGS)，能够一次并行对大量核酸分子进行平行测序，是目前比较成熟的测序技术。随着科技进步和发展，高通量测序的成本逐渐降低，高通量测序也越来越普及，大量的测序样本和测序数据对高通量测序实验室的管理水平要求也越来越高。
[0003]目前，并没有专门针对高通量测序实验室的信息化管理系统。现有的高通量测序实验室主要通过一些大型的ERP系统修改兼容或实验室线下记录数据来实现信息管理，存在效率较低，所需人手较多，用户使用不便，功能与实际需求不符等问题。
[0004]因此，如何解决现有的高通量测序实验室管理方法效率低、人工成本高、使用不便、功能不全等技术问题，是所有高通量测序实验室都亟待解决的难题，也是限制高通量测序实验室进一步发展的重要因素。

技术实现思路

[0005]本申请的目的是提供一种新的高通量测序实验室管理系统。
[0006]为了实现上述目的，本申请采用了以下技术方案：
[0007]本申请公开了一种高通量测序实验室管理系统，包括前端和后端分离的开发架构；其中，前端包括静态资源页面；后端包括若干管理和分析模块组合，用于提供测序服务和实验室管理；前端和后端通过Nginx反向代理软件集成。
[0008]本申请的一种实现方式中，管理和分析模块组合包括报表管理模块、出入库管理模块、物料管理模块、样本管理模块、实验管理模块、信息分析模块、报告解读模块、报告管理模块、科研项目管理模块、解读数据库管理模块、基础数据库管理模块和系统管理模块；报表管理模块，用于对高通量测序实验室管理系统中的各类数据进行统计和可视化展示，包括周任务量统计、周样本量统计、样本类型统计、异常类型统计；出入库管理模块，用于对高通量测序实验室的样本出库入库的信息进行管理，包括容器管理、样本查询、出入库申请、出入库管理、出入库异常管理、返样管理；物料管理模块，用于对高通量测序实验室的物料库存的信息进行管理，包括物料库存管理、物料申请管理、物料发放管理；样本管理模块，用于对样本信息和患者信息进行管理，包括样本到样确认、样本信息管理、样本签收管理、样例异常管理；实验管理模块，用于高通量测序实验全流程的管理，包括实验数据电子化和任务派遣，任务派遣包括任务下达、任务处理、异常处理、任务管理；信息分析模块，用于对信息分析任务进行管理，包括下机质控管理、信息分析任务下达、信息分析状态查询；报告解读模块，用于检测报告的解读或自动解读，包括分析质控管理、报告解读、解读任务排单；报告管理模块，用于实现检测报告的审核和报告发放，包括报告审核、报告发放、已发报告
查询；科研项目管理模块，用于科研项目管理，包括科研任务派遣和管理、科研进度查询和管理、科研结果查看和管理、项目异常管理；解读数据库管理模块，用于管理和存储报告解读时使用的数据库，并存储检测结果的解析；基础数据库管理模块，用于对高通量测序实验室管理系统的基础配置进行管理，包括客户管理、产品管理、异常分类管理、工序管理、报告模板管理、项目管理；系统管理模块，用于对高通量测序实验室管理系统的系统用户进行管理，包括系统账号和权限的管理。
[0009]其中，出入库管理模块中的“出入库异常管理”，例如选择异常样本，填写异常信息，然后在系统上由相关人员对异常进行分类标记，并给出异常处理意见，在规则明确的情况下进行自动操作，或者，操作员在接收到相关处理意见后进行相关操作，包括销毁、退回、暂存、让步检测、重新检测等。样本管理模块中的“样例异常管理”和实验管理模块中的“异常处理”与“出入库异常管理”类似，在此不累述。常见的样本异常包括，溶血凝血、到样时破损、样本污染、质控不合格、样本量不足、浓度不足等。科研项目管理模块中的“项目异常管理”，例如系统会自动根据规则判断项目是否存在异常，如项目是否延期、项目是否到达检测样本数的上限、项目下的样本是否存在异常、项目下的样本是否延期等。如果样本存在异常则参考样本异常的处理方式。
[0010]基础数据库管理模块中，“客户管理”是指测序委托方的信息，用于确认样本的归属，在样本信息中会要求选择客户信息，以此将“客户”和“样本”进行关联，所选择的客户信息要首先在“客户管理”中创建完成才能被系统识别。“产品管理”是指不同的测序服务、不同样本类型、不同检测范围、不同检测技术分别对应不同的“产品”，用于确认样本该进行什么类型的检测，在样本信息中会要求选择产品信息，以此将“产品”和“样本”进行关联，所选择的产品信息要首先在“产品管理”中创建完成才能被系统识别。“工序管理”是指不同的实验流程，委托方购买不同的“产品”其对应的实验流程可能各不相同，系统管理员需要提前在“工序管理”模块中创建好对应的实验流程，并将实验流程与“产品”关联，“产品”再关联“样本”，样本才会在系统中按照指定的实验流程进行数据传递，从而实现实验流程的信息化管理。“工序管理”的最小维度是“实验步骤”，多个实验步骤有序组合而成实验流程，即“工序”。“异常分类管理”属于系统的基础配置项，在前面提到的各类异常管理中，登记异常后系统会自动或人工给异常进行分类，可用的分类项及对应的处理方案，可以提前在该模块预制好，以供选择。“报告模板管理”是用于管理不同“产品”最终产出的检测报告模板，例如word模板，由于不同的委托方以及不同的产品均会对检测报告有不同的要求，所以导致报告模板类型多种多样，需要有一个统一的模块进行管理和配置，避免线下管理的混乱。另外，由于报告也是系统自动生成，所以也需要将所有的模板线上化，并建立“客户
‑
产品
‑
模板”的关联关系，这样系统才能自动识别这例样本最终的检测报告该用哪份模板。而报告管理模块是用来人工修改报告、审核报告的模块，与“报告模板管理”不同。“项目管理”是管理所有项目的基本信息，包括客户、单位、合同信息等，以及整体情况，包括样本数量、样本检测结果、样本检测进度。科研项目管理模块是在实验管理模块中给实验员操作下达检测任务单以及回填实验结果的模块。
[0011]需要说明的是，本申请的高通量测序实验室管理系统，通过各模块的合理设计和有机整合，有效的简化了整个高通量测序实验室管理的操作流程，通过系统的在线管理，不仅能够大幅度提高工作效率，而且有效的降低了人力成本。同时，本申请的高通量测序实验
室管理系统，能够根据高通量测序实验室的需求进行深度定制化的开发，更专业，更契合用户在实验室中实际使用的场景；系统流程设计同高通量测序实验室实际应用场景完全契合，并进行了专业、深度的定制开发；具有很好的用户体验感。
[0012]本申请的一种实现方式中，高通量测序实验室管理系统采用微服务框架，可通过浏览器或手机访问高通量测序实验室管理系统，并通过Nginx路由到前端的静态资源页面或者是后端本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种高通量测序实验室管理系统，其特征在于：所述高通量测序实验室管理系统包括前端和后端分离的开发架构；所述前端包括静态资源页面，所述静态资源页面包括样本孔位图、检测流程图、实验步骤的结果图，所述实验步骤的结果图包括电泳图、胶图；所述后端包括若干管理和分析模块组合，用于提供测序服务和实验室管理；所述前端和后端通过Nginx反向代理软件集成。2.根据权利要求1所述的高通量测序实验室管理系统，其特征在于：所述管理和分析模块组合包括报表管理模块、出入库管理模块、物料管理模块、样本管理模块、实验管理模块、信息分析模块、报告解读模块、报告管理模块、科研项目管理模块、解读数据库管理模块、基础数据库管理模块和系统管理模块；所述报表管理模块，用于对所述高通量测序实验室管理系统中的各类数据进行统计和可视化展示，包括周任务量统计、周样本量统计、样本类型统计、异常类型统计；所述出入库管理模块，用于对高通量测序实验室的样本出库入库的信息进行管理，包括容器管理、样本查询、出入库申请、出入库管理、出入库异常管理、返样管理；所述物料管理模块，用于对高通量测序实验室的物料库存的信息进行管理，包括物料库存管理、物料申请管理、物料发放管理；所述样本管理模块，用于对样本信息和患者信息进行管理，包括样本到样确认、样本信息管理、样本签收管理、样例异常管理；所述实验管理模块，用于高通量测序实验全流程的管理，包括实验数据电子化和任务派遣，所述任务派遣包括任务下达、任务处理、异常处理、任务管理；所述信息分析模块，用于对信息分析任务进行管理，包括下机质控管理、信息分析任务下达、信息分析状态查询；所述报告解读模块，用于检测报告的解读或自动解读，包括分析质控管理、报告解读、解读任务排单；所述报告管理模块，用于实现检测报告的审核和报告发放，包括报告审核、报告发放、已发报告查询；所述科研项目管理模块，用于科研项目管理，包括科研任务派遣和管理、科研进度查询和管理、科研结果查看和管理、项目异常管理；所述解读数据库管理模块，用于管理和存储报告解读时使用的数据库，并存储检测结果的解析；所述基础数据库管理模块，用于对高通量测序实验室管理系统的基础配置进行管理，包括客户管理、产品管理、异常分类管理、工序管理、报告模板管理、项目管理；所述系统管理模块，用于对高通量测序实验室管理系统的系统用户进行管理，包括系统账号和权限的管理...

【专利技术属性】
技术研发人员：陈永胜，易鑫，杨玲，张宏超，伍忠维，伍小妹，刘昌强，张楚苓，
申请(专利权)人：深圳吉因加信息科技有限公司，
类型：发明
国别省市：