FAM111B在胶质瘤的诊断或预后中的应用及相关的计算机可读介质制造技术

本发明专利技术公开了用于检测FAM111B的表达水平的试剂在制备用于对象的胶质瘤的诊断和/或预后的试剂盒中的应用。本发明专利技术还公开了用于胶质瘤的诊断和/或预后的试剂盒、方法和计算机可读介质。本发明专利技术通过检测FAM111B来高效、准确地提供胶质瘤的诊断和/或预后。提供胶质瘤的诊断和/或预后。

【技术实现步骤摘要】
FAM111B在胶质瘤的诊断或预后中的应用及相关的计算机可读介质


[0001]本专利技术涉及用于胶质瘤的诊断和/或预后的试剂盒、方法和计算机可读介质，更具体地，涉及通过检测FAM111B表达来提供胶质瘤的诊断和/或预后。

技术介绍

[0002]胶质瘤是一种发生在大脑和脊髓中的肿瘤，约占所有原发性脑肿瘤的30％和所有恶性脑肿瘤的80％。胶质瘤的临床特点是发病率高、术后复发率高、治愈率低。
[0003]根据肿瘤细胞与正常脑胶质细胞在形态上的相似程度，胶质瘤可分为星形细胞瘤(星形胶质细胞)、少突胶质细胞瘤(少突胶质细胞)、室管膜瘤(室管膜细胞)和混合型胶质瘤(例如少突胶质细胞瘤和星形细胞瘤，包括混合型胶质细胞)。根据肿瘤分子病理学特征及生物学行为，胶质瘤恶性程度从低到高可分为WHO I～IV级。I级胶质瘤通常是良性的。II级的平均生存期约为7年。II级胶质瘤可以进展为III级(高级别胶质瘤)，最终是IV级(继发性胶质母细胞瘤)，其中IV级胶质母细胞瘤占比超过50％，恶性程度最高，预后效果极差。III级和IV级的胶质瘤统称为高级别胶质瘤(High
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grade Glioma，HGG)，包括间变性星形细胞瘤、间变性少突胶质细胞瘤、以及恶性程度最高的胶质母细胞瘤(Glioblastoma，GBM)。HGG是最为常见的一种侵袭性颅内原发性肿瘤，临床上常联合应用手术以及放化疗进行综合治疗，但治疗效果仍不理想，并且极易出现复发的情况。
[0004]目前胶质瘤的辅助诊断分子标志物有IDH、MGMT、EGFR、P53、PTEN等。通常检查IDH1/2的体细胞突变、EGFR的基因组扩增以及染色体臂1p和19q的共缺失来进行准确诊断。IDH1/2突变常见于低级别胶质瘤和继发性胶质母细胞瘤，众所周知，它对胶质瘤患者的延长生存期产生深远影响。此外，约50％的胶质母细胞瘤显示EGFR的局灶性扩增。再者，已知EGFR基因扩增促进细胞增殖，因此，EGFR抑制剂的临床试验经常用于癌症治疗。
[0005]在此背景下，为了有效诊断胶质瘤，通常使用免疫组织化学(IHC)和荧光原位杂交(FISH)对被认为是胶质瘤增殖的必需基因IDH1的目标突变和EGFR的局灶性扩增进行病理诊断。然而，越来越需要以更简单的方式有效诊断胶质瘤。
[0006]FAM111B(family with sequence similarity 111member B，序列相似性家族111成员B)，也称为CANP或POIKTMP，是在人类染色体11q12.1上的仅16kb的基因。该基因编码的蛋白质在C末端具有胰蛋白酶样半胱氨酸/丝氨酸肽酶结构域。FAM111B在NCBI中的基因ID为374393，编码的蛋白在UniProt的参考号为Q6SJ93。
[0007]通常认为，FAM111B的突变与常染色体显性遗传性纤维性皮炎(HFP)有关。最近有研究表明，人类FAM111B基因突变与一种罕见的遗传性多系统纤维化疾病POIKTMP有关。并且，FAM111B在胰腺癌组织中高度表达，并与胰腺癌的不良预后密切相关。其他研究表明，FAM111B在宫颈癌、前列腺癌和肺癌中具有重要作用。
[0008]然而，FAM111B的表达和功能在胶质瘤细胞中从未被报道过。目前尚未见研究和报道FAM111B在胶质瘤诊断和/或预后中的应用。

技术实现思路

[0009]本申请的专利技术人意外地发现相对于正常组织，胶质瘤组织中FAM111B显著高表达，并且FAM111B高表达与胶质瘤肿瘤分级及不良预后显著相关。专利技术人利用能够与FAM111B的表达产物结合的试剂检测脑组织中FAM111B的存在和/或水平，从而高效、准确地提供胶质瘤的诊断和/或预后。
[0010]在第一方面，本专利技术提供一种用于对象的胶质瘤的诊断和/或预后的试剂盒，所述试剂盒包括用于检测FAM111B的表达水平的试剂。
[0011]在第二方面，本专利技术提供用于检测FAM111B的表达水平的试剂在制备用于对象的胶质瘤的诊断和/或预后的试剂盒中的应用。
[0012]在第三方面，本专利技术提供用于FAM111B的表达水平的试剂用于对象的胶质瘤的诊断和/或预后。
[0013]在第四方面，本专利技术提供一种用于对象的胶质瘤的诊断和/或预后的方法，所述方法包括检测来自所述对象的样品中的FAM111B的表达水平。在一些实施方式中，所述方法包括将能够与FAM111B的表达产物结合的试剂与来自所述对象的样品接触；检测接触后所述试剂与样品中FAM111B的表达产物形成的复合物的存在和/或水平；以及基于所述复合物的存在和/或水平来提供所述对象的胶质瘤的诊断和/或预后。
[0014]在第五方面，本专利技术提供一种计算机可读存储介质，其上存储有供计算机读取和执行的计算机指令，所述计算机指令被执行以进行用于对象的胶质瘤的诊断和/或预后的方法，所述方法包括：(a)将来自所述对象的样品与能够与FAM111B的表达产物结合的试剂接触；(b)检测并读取接触后的样品的信号，以确定所述试剂是否与样品中的FAM111B的表达产物形成复合物；以及(c)判断所述信号是否超过预定阈值，并且当所述信号超过预定阈值时，提供所述对象的胶质瘤的诊断和/或预后。
[0015]在第六方面，本专利技术提供一种治疗对象的胶质瘤的方法，所述方法包括：(a)将来自所述对象的样品与能够与FAM111B的表达产物结合的试剂接触；(b)检测并读取接触后的样品的信号，以确定所述试剂是否与样品中的FAM111B的表达产物形成复合物；以及(c)判断所述信号是否超过预定阈值，并且当所述信号超过预定阈值时，提供所述对象的胶质瘤的诊断和/或预后；以及(d)向被确定患有胶质瘤的对象施用抗肿瘤疗法。在优选的实施方式中，所述抗肿瘤疗法是替莫唑胺。
[0016]在上述任一方面，来自所述对象的样品中的FAM111B的水平与对照样品水平或对照值的差异提供所述对象的胶质瘤的诊断和/或预后。在一些实施方式中，来自所述对象的样品中的FAM111B的水平高于未患疾病的对照的水平表示所述对象患有胶质瘤。在一些实施方式中，来自所述对象的样品中的FAM111B的更高的表达水平表示所述对象的胶质瘤的更高级别。在一些实施方式中，来自所述对象的样品中的FAM111B的更高的表达水平表示所述对象的胶质瘤的不良预后。在一些实施方式中，来自所述对象的样品中的FAM111B的更高的表达水平表示所述对象的胶质瘤的更高纯度。
[0017]在上述任一方面，所述用于检测FAM111B的表达水平的试剂包括能够与FAM111B的表达产物结合的试剂，以检测所述样品中的FAM111B的表达水平。在一些实施方式中，所述能够与FAM111B的表达产物结合的试剂包括蛋白质、核酸或小分子化合物。在一些实施方式中，所述能够与FAM111B的表达产物结合的试剂是抗FAM111B单克隆抗体或其抗原结合片
段，或是抗FAM111B多克隆抗体。
[0018]在一些实施方式中，所述能够与FAM111B的表达产物结合的试剂被可检本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.用于检测FAM111B的表达水平的试剂在制备用于对象的胶质瘤的诊断和/或预后的试剂盒中的应用。2.根据权利要求1所述的应用，其中来自所述对象的样品中的FAM111B的水平高于未患疾病的对照的水平表示所述对象患有胶质瘤。3.根据权利要求1所述的应用，其中来自所述对象的样品中的FAM111B的更高的表达水平表示所述对象的胶质瘤的更高级别。4.根据权利要求1所述的应用，其中来自所述对象的样品中的FAM111B的更高的表达水平表示所述对象的胶质瘤的不良预后。5.根据权利要求1所述的应用，其中来自所述对象的样品中的FAM111B的更高的表达水平表示所述对象的胶质瘤的更高纯度。6.根据权利要求1至5中任一项所述的应用，其中所述用于检测FAM111B的表达水平的试剂包括能够与FAM111B的表达产物结合的试剂，以检测所述样品中的FAM111B的表达水平。7.根据权利要求6所述的应用，其...

【专利技术属性】
技术研发人员：聂颖，李军旗，李哲，彭裕，张建，
申请(专利权)人：致远医疗投资广州有限责任公司，
类型：发明
国别省市：