本发明专利技术公开了一种与花生油酸和亚油酸显著关联的PARMS分子标记及应用，涉及分子标记的技术领域，其技术方案要点是该PARMS分子标记，位于花生的Chr09:114966251，其多态性形式为AA/GG；当所述SNP的多态性位点的基因型为GG时，对应花生油酸含量高，亚油酸含量低；当所述SNP的多态性位点的基因型为AA时，对应花生油酸含量低，亚油酸含量高。亚油酸含量高。
【技术实现步骤摘要】
一种与花生油酸和亚油酸显著关联的PARMS分子标记及应用
[0001]本专利技术涉及分子标记
，更具体地说，它涉及一种与花生油酸和亚油酸显著关联的PARMS分子标记及应用。
技术介绍
[0002]栽培种花生(Arachis hypogaea L.)是我国重要的油料和经济作物。我国是花生的主要生产国家，约占世界花生总产量的40％。在国内花生产量占全国油料总产量的一半左右，居油料作物首位。因此，花生拥有巨大的经济价值和广阔的市场前景。花生富含油脂和蛋白质，同时也是维生素和矿物质的良好来源。其中，花生脂肪酸含量及组成是营养价值以及加工特性重要品质指标。花生中的油酸和亚油酸含量占脂肪酸含量可高达80％以上。油酸是单不饱和脂肪酸，稳定性高、抗氧化性和高温能力强，不容易酸败，是决定花生及其衍生品稳定性的主要脂肪酸。所以高油酸花生及其制品具有长期储藏效果较好、货架期长的优点，有利于人体健康。
[0003]油酸和亚油酸组成作为数量性状，受到多个基因和环境的共同影响。一方面，基于分离群体的连锁分析(linkage analysis)挖掘油酸和亚油酸相关QTLs。另一方面，基于连锁不平衡的关联分析(association analysis)鉴定与花生品质性状关联的遗传变异候选区域。花生油酸和亚油酸合成途径研究指出，脂肪酸去饱和酶(fatty acid desaturase 2，FAD2)是在调控花生油酸、亚油酸含量和油酸/亚油酸的比值起关键作用。美国育种专家首次在1987年育种材料中发现花生高油酸突变体F435，其油酸含量高达80％，油亚比(O/L)超过35。而控制油酸向亚油酸转化的关键基因是脂肪酸脱氢酶基因(AhFAD2)。花生的A、B两个亚基因组分别存在一个AhFAD2A和一个AhFAD2B基因。研究发现AhFAD2A在正常和高油酸花生种子中均有表达，但在高油酸花生品种中，AhFAD2B转录物的稳态水平严重降低。花生中的FAD2基因家族成员相对较多，不同的FAD2可能在不同的组织，不同时期起到的作用不同。目前已经培育出多个高油酸品种，利用FAD2基因开发的各种分子标记的开发可加快高油酸育种的进程。
[0004]但是，目前尚未报道其它与油酸、亚油酸相关的其它高效分子标记。这是由于，花生属于异源四倍体(AABB，2n＝4x＝40)，是野生物种经自然杂交和染色体加倍的结果。栽培种花生含有了两个祖先种(A.duranensis和A.ipaensis)各自独立的基因组。A和B基因组高度同源，并且同源和非同源基因组之间的交换现象比较普遍。这种基因组的复杂性使得在尚未见其它有效的分子标记。
技术实现思路
[0005]针对现有技术存在的不足，本专利技术的在于提供与花生油酸和亚油酸显著关联的PARMS分子标记及应用。
[0006]本专利技术提供了如下技术方案：一种与花生油酸和亚油酸显著关联的PARMS分子标记，位于花生的Chr09:114966251，其多态性形式为AA/GG；上述信息基于数据库https://
peanutbase.org/peanut_genome的花生基因组版本：Arachis hypogaea cv.Tifrunner version 1。
[0007]当所述SNP的多态性位点的基因型为GG时，对应花生油酸含量高，亚油酸含量低；当所述SNP的多态性位点的基因型为AA时，对应花生油酸含量低，亚油酸含量高。
[0008]还提供了用于扩增所述PARMS分子标记的引物，包括：
[0009][0010]还提供了含有所述引物的试剂或试剂盒。
[0011]还提供了所述分子标记、引物、含有引物的试剂或试剂盒的应用，包括但不限于：
[0012](1)筛选或鉴定关于花生油酸和亚油酸含量性状的表型；
[0013](2)花生种质资源鉴定、改良或分子标记辅助育种；
[0014](3)花生油酸和亚油酸含量显著相关的基因分型；
[0015](4)花生油酸和亚油酸含量性状早期预测。
[0016]还提供了鉴定花生油酸和亚油酸含量性状表型的方法，包括：
[0017]S1、样本处理
[0018]选取花生叶片为材料，提取DNA作为后续PCR扩增的模板。
[0019]S2、PCR扩增
[0020]使用上述引物进行PCR扩增，得扩增产物。
[0021]S3、基因分型
[0022]PCR完成后，使用TECAN infinite M1000酶标仪读取荧光信号，然后利用在线软件snpdecoder(http://www.snpway.com/snpdecoder/)解析转换荧光信号，得到清晰直观的分型图，并根据颜色不同，输出基因型结果。
[0023]S4、t检验及判断
[0024]分析PCR扩增产物中SNP分子标记的基因型，并结合油酸含量数据进行t检验以判定待检测花生的油酸和亚油酸含量高低。
[0025]进一步地，判断方法为：若分子标记SNP多态性位点基因型为GG时，对应花生油酸含量高，亚油酸含量低；当所述SNP的多态性位点的基因型为AA时，对应花生油酸含量低，亚油酸含量高。
[0026]综上所述，本专利技术具有以下有益效果：本专利技术提供的与花生油酸和亚油酸显著关联的PARMS分子标记及判断方法，与常规化学检测方法检测油酸和亚油酸含量成本高、样本量大相比，本专利技术的方法简单、成本低，判断标准稳定；用于花生早期基因型鉴定，减少育种成本和工作量，提高筛选效率。
附图说明
[0027]图1是本专利技术160份花生样本中油酸和亚油酸表型性状频率直方图；
[0028]图2是本实施例3的油酸和亚油酸关联分析的曼哈顿图和QQ图，其中，A为油酸性
状；B为亚油酸性状；
[0029]图3是本实施例3的两种单倍型花生籽仁油酸和亚油酸含量分布图，其中，A:Arahy.42CZAS(FAD2)；B:Arahy.JYC97M；
[0030]图4是本专利技术实施例4的花生籽仁不同发育时期的基因相对表达量图。
具体实施方式
[0031]以下结合实施例对本专利技术作进一步详细说明。
[0032]下述实施例中所用试剂或材料，若无特殊说明，均可通过商业途径获得。
[0033]实施例1花生样本性状分析
[0034]本实施例中，160份中国花生地方品种骨干种质群体分别收收获于山东省花生研究所莱西试验田基地(36
°
52
’
N，120
°
31
’
E)、山东省东营市黄河三角洲现代农业试验示范基地(37
°
46
’
N，118
°
49
’
E)和山东省菏泽农科院院试验基地(35
°
14
’
N，115
°
26
’
E)3个试验环境中(以下简称LX、DY、HZ)。新鲜采摘的花生晾晒完成后，每个本文档来自技高网...
【技术保护点】
【技术特征摘要】
1.一种与花生油酸和亚油酸显著关联的PARMS分子标记，其特征在于，位于花生的Chr09:114966251，其多态性形式为AA/GG；上述信息基于数据库https://peanutbase.org/peanut_genome的花生基因组版本：Arachis hypogaeacv.Tifrunner version 1。2.根据权利要求1所述的PARMS分子标记，其特征在于，当所述SNP的多态性位点的基因型为GG时，对应花生油酸含量高，亚油酸含量低；当所述SNP的多态性位点的基因型为AA时，对应花生油酸含量低，亚油酸含量高。3.用于扩增如权利要求1或2所述PARMS分子标记的引物，其特征在于，包括：4.含有权利要求3所述引物的试剂或试剂盒。5.根据权利要求4所述的试剂或试剂盒的应用，其特征在于，包括但不限于：(1)筛选或鉴定关于花生油酸和亚油酸含量性状的表型；(2)花生种质资源鉴定、改良或分子标记辅助育种；(3)花生油酸和亚油酸含量显著相关的基因分型；(4)...
【专利技术属性】
技术研发人员：王娟，闫彩霞，李春娟，孙全喜，牟艺菲，单世华，
申请(专利权)人：山东省花生研究所，
类型：发明
国别省市：
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