一种辣椒PMMoV抗性基因L3紧密连锁的SNP位点、KASP分子标记及应用制造技术

本发明专利技术涉及植物分子遗传育种技术领域，具体涉及一种辣椒PMMoV抗性基因L3紧密连锁的SNP位点、KASP分子标记及应用。所述辣椒PMMoV抗性基因L3其紧密连锁的KASP标记为Pep(L3)

【技术实现步骤摘要】
一种辣椒PMMoV抗性基因L3紧密连锁的SNP位点、KASP分子标记及应用


[0001]本专利技术涉及植物分子遗传育种
，特别涉及一种辣椒PMMoV抗性基因L3紧密连锁的SNP位点、KASP分子标记及应用。

技术介绍

[0002]辣椒轻斑驳病毒(Pepper mild mottle virus，PMMoV)属于烟草花叶病毒属，近年来，PMMoV在我国多地辣椒主产区检测发现，且检出比例不断增高，严重威胁辣椒产业的发展。PMMoV侵染植株早期症状表现不明显多为叶片轻度褪绿。在后期表现明显，可引起叶片皱缩，变形，斑驳或黄绿相间的花叶症状，引起果实变小、畸形、凸凹斑驳甚至坏死、易脱落，严重影响辣椒的产量和品质。该病毒通过带毒种子、感病植株和感病土壤均可传播，在干燥的植物病残体上病毒可存活25年，防治极为困难。
[0003]抗病育种是防治该病毒病最有效方式之一。这主要依赖于抗性资源的挖掘和利用。传统农作物育种的效率低、工作量大、耗时长，分子标记辅助育种基于基因型筛选种质资源，避免或降低表型选择的误差，能大大提高育种效率。目前，针对PMMoV本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种辣椒PMMoV抗性基因L3紧密连锁的SNP位点，其特征在于：所述SNP位点的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示；其中SEQ ID NO.1所示序列的第92位碱基为C或A。2.一种辣椒PMMoV抗性基因L3紧密连锁的KASP分子标记，其特征在于：基于权利要求1所述的SNP位点差异设计高通量KASP分子标记Pep
‑
(L3)
‑
k92，所述KASP分子标记Pep
‑
(L3)
‑
k92包括前引物A1、A2和后引物C；所述前引物A1的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示；所述前引物A2的核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示；所述后引物C的核苷酸序列如SEQ ID NO.4所示。3.根据权利要求2所述的一种辣椒PMMoV抗性基因L3紧密连锁的KASP分子标记，其特征在于：所述前引物A1的5
′
端添加FAM荧光标签序列，所述前引物A2的5
′
端添加HEX荧光标签序列；所述FAM荧光标签序列如SEQ ID NO.5所示；所述HEX荧光标签序列如SEQ ID NO.6所示。4.如权利要求1所述的辣椒PMMoV抗性基因L3紧密连锁的SNP位点在辣椒PMMoV抗病辣椒品种选育中的应用。5.如权利要求2或3所述的KASP分子标记在鉴定辣椒PMMoV抗病辣椒品种中的应用。6.根据权利要求5所述的KASP分子标记在鉴定辣椒PMMoV抗病辣椒品种上的应用，其特征在于：辣椒PMMoV抗病辣椒品种的鉴定方法如下：步骤一：检测：采用KASP标记Pep
‑
(L3)
‑
k92的引物，对待测辣椒后代群体材料的基因组DNA进行PCR扩增和基因分型；步骤二：结果判断：分型结果中若待测辣椒的扩增产物的荧光信号数据在所得分型聚类图中聚集在X轴，呈现蓝色，则所述待测辣椒含有抗病基因L3，SNP分型为C:C纯合基因型，辣椒的PMMoV病抗病性表型为“抗病”；若所述待测辣椒的扩增产物的荧光信号数据在所得分型聚类图中呈现绿色，则所述待测辣椒不含有抗病基因L3，SNP分型为A:A纯合基因型，辣椒的PMMoV病抗病...

【专利技术属性】
技术研发人员：于海龙，王立浩，张正海，曹亚从，冯锡刚，吴华茂，
申请(专利权)人：中国农业科学院蔬菜花卉研究所，
类型：发明
国别省市：