评估患病风险的方法技术

本公开涉及用于评估人类受试者患诸如冠状动脉疾病、心房纤颤或2型糖尿病的疾病的风险的方法和系统。这些方法可以与所述受试者临床风险组合，以改善风险分析。此类方法可以用于帮助作出关于合适的治疗和监测方案的决定。于帮助作出关于合适的治疗和监测方案的决定。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】评估患病风险的方法


[0001]本公开涉及用于评估人类受试者患诸如冠状动脉疾病、心房纤颤或2型糖尿病的疾病的风险的方法和系统。这些方法可以与受试者临床风险组合，以改善风险分析。此类方法可以用于帮助作出关于合适的治疗和监测方案的决定。

技术介绍

[0002]最常见的心血管疾病是冠状动脉疾病(CAD)，其涉及由于心脏动脉中斑块(动脉粥样硬化)的累积而导致流向心肌的血液减少。临床风险因素包括高血压、吸烟、糖尿病、缺乏运动、肥胖、高血胆固醇、饮食不良、抑郁和过度饮酒。许多测试可以有助于诊断，包括：心电图、心脏压力测试、冠状动脉计算机断层扫描血管造影和冠状动脉血管造影。
[0003]心房纤颤(AF)是一种异常的心律(心律不齐)，其特征在于心脏的心房腔的快速和不规则的跳动。AF通常以短周期的异常搏动开始，其随时间变得更长或连续。它也可以作为其它形式的心律不齐开始，诸如心房扑动，然后转变为AF。高血压和心脏瓣膜病是AF最常见的可变风险因素。其它与心脏相关的风险因素包括心力衰竭、冠状动脉疾病、心肌病和先天性心脏病。
[0004]2型糖尿病(T2D)，也称为成人发作型糖尿病，是以高血糖、胰岛素抗性和相对缺乏胰岛素为特征的糖尿病形式。高血糖引起的长期并发症包括心脏病、中风、可以导致失明的糖尿病性视网膜病、肾衰竭，和可以导致截肢的四肢血流不良。2型糖尿病主要由于肥胖和缺乏运动而发生。
[0005]弗明汉(Framingham)风险评分是用于估计个体10年CAD风险的特定性别算法。它还用于评估发展其它疾病诸如AF和T2D的风险。最初基于弗明汉心脏研究获得的数据开发弗明汉风险评分，以估计10年内患冠心病的风险(Wilson等人,1998)。为了评估10年心血管疾病风险，在冠心病之上随后添加了脑血管事件、外周动脉疾病和心力衰竭作为2008弗明汉风险评分的疾病结果(D'Agonstino等人,2008)。
[0006]需要评估个体患冠状动脉疾病、心房纤颤或2型糖尿病的风险的改进方法。

技术实现思路

[0007]在第一方面，本专利技术提供了用于评估人类受试者患冠状动脉疾病的风险的方法，该方法包含对人类受试者进行遗传风险评估，其中该遗传风险评估涉及在衍生自该人类受试者的生物样本中检测与患冠状动脉疾病的风险相关联的至少一种多态性的存在，其中该至少一种多态性选自表1和/或表2，或与其一种或多种连锁不平衡的单核苷酸多态性。
[0008]在以上方面的实施例中，该方法包含检测表1中提供的至少2种、至少3种、至少4种、至少5种、至少6种、至少7种、至少8种、至少9种、至少10种、至少20种、至少50种、至少100种、至少150种、至少200种、至少250种、至少300种、至少350种、至少400种、至少450种、至少500种、至少550种、至少600种、至少650种、至少700种、至少750种、至少800种、至少825种、至少850种或所有多态性，或与其一种或多种连锁不平衡的单核苷酸多态性的存在。
[0009]在以上方面的实施例中，该方法包含检测表1和2中提供的至少2种、至少3种、至少4种、至少5种、至少6种、至少7种、至少8种、至少9种、至少10种、至少20种、至少50种、至少100种、至少150种、至少200种、至少250种、至少300种、至少350种、至少400种、至少450种、至少500种、至少550种、至少600种、至少650种、至少700种、至少750种、至少800种、至少850种、至少900种、至少950种、至少1,000种或所有多态性，或与其一种或多种连锁不平衡的单核苷酸多态性的存在。
[0010]在以上方面的实施例中，该方法包含检测表1中提供的多态性中的每一种。在一个实施例中，方法进一步包含检测表2中提供的多态性中的每一种。
[0011]在另一方面，本专利技术提供了用于评估人类受试者患心房纤颤的风险的方法，该方法包含对人类受试者进行遗传风险评估，其中该遗传风险评估涉及在衍生自该人类受试者的生物样本中检测与患心房纤颤的风险相关联的至少一种多态性的存在，其中该至少一种多态性选自表3，或与其一种或多种连锁不平衡的单核苷酸多态性。
[0012]在以上方面的实施例中，该方法包含检测表3中提供的至少2种、至少3种、至少4种、至少5种、至少6种、至少7种、至少8种、至少9种、至少10种、至少20种、至少50种、至少100种、至少125种、至少150种、至少175种、至少200种、至少225种、至少250种或所有多态性，或与其一种或多种连锁不平衡的单核苷酸多态性的存在。
[0013]在以上方面包含检测表3中提供的多态性中的每一种。
[0014]在又一方面，本专利技术提供了用于评估人类受试者患2型糖尿病的风险的方法，该方法包含对人类受试者进行遗传风险评估，其中该遗传风险评估涉及在衍生自该人类受试者的生物样本中检测与患2型糖尿病的风险相关联的至少一种多态性的存在，其中该至少一种多态性选自表4，或与其一种或多种连锁不平衡的单核苷酸多态性。
[0015]在以上方面的实施例中，该方法包含检测表4中提供的至少2种、至少3种、至少4种、至少5种、至少6种、至少7种、至少8种、至少9种、至少10种、至少20种、至少30种、至少40种、至少50种、至少60种、至少70种、至少80种、至少85种或所有多态性，或与其一种或多种连锁不平衡的单核苷酸多态性的存在。
[0016]在以上方面的实施例中，该方法包含检测表4中提供的多态性中的每一种。
[0017]在实施例中，该方法进一步包含
[0018]对人类受试者进行临床风险评估；以及
[0019]组合临床风险评估和遗传风险评估，以获得人类受试者患冠状动脉疾病、心房纤颤或2型糖尿病的风险。
[0020]在实施例中，临床风险评估包括但不限于从受试者获得关于以下一项或多项或所有的信息：年龄、性别、HDL
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胆固醇水平(mmol/L)、LDL
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胆固醇水平(mmol/L)、总胆固醇水平、血压(收缩压和/或舒张压(mm Hg))、吸烟状态、患有或曾患有糖尿病、正在服用高血压药物、c反应蛋白水平、受试者的母亲或父亲是否患有心脏病发作(诸如到60岁)、体质指数、种族、剥夺措施、家族史、患有或曾患有慢性肾病，以及患有或曾患有类风湿性关节炎。
[0021]在实施例中，临床风险评估包括从受试者获得关于以下一项或多项或所有的信息：年龄、性别、HDL
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胆固醇水平(mmol/L)、LDL
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胆固醇水平(mmol/L)、总胆固醇水平、血压(收缩压和/或舒张压(mm Hg))、吸烟状态、患有或曾患有糖尿病以及正在服用高血压药物。
[0022]在实施例中，临床风险评估是弗明汉评分。
[0023]在实施例中，当该疾病是冠状动脉疾病时，该临床风险评估是美国心脏病专家学院汇总队列方程(PCE)。
[0024]在实施例中，组合临床风险评估和遗传风险评估包含将风险评估相本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】1.一种用于评估人类受试者患冠状动脉疾病的风险的方法，所述方法包含对所述人类受试者进行遗传风险评估，其中所述遗传风险评估涉及在衍生自所述人类受试者的生物样本中检测与患冠状动脉疾病的风险相关联的至少一种多态性的存在，其中所述至少一种多态性选自表1和/或表2，或与其一种或多种连锁不平衡的单核苷酸多态性。2.根据权利要求1所述的方法，其包含检测表1和/或表2中提供的至少2种、至少3种、至少4种、至少5种、至少6种、至少7种、至少8种、至少9种、至少10种、至少20种、至少50种、至少100种、至少150种、至少200种、至少250种、至少300种、至少350种、至少400种、至少450种、至少500种、至少550种、至少600种、至少650种、至少700种、至少750种、至少800种、至少825种、至少850种或所有所述多态性，或与其一种或多种连锁不平衡的单核苷酸多态性的存在。3.根据权利要求1所述的方法，其包含检测表1中提供的所述多态性中的每一种。4.根据权利要求3所述的方法，其进一步包含检测表2中提供的所述多态性中的每一种。5.一种用于评估人类受试者患心房纤颤的风险的方法，所述方法包含对所述人类受试者进行遗传风险评估，其中所述遗传风险评估涉及在衍生自所述人类受试者的生物样本中检测与患心房纤颤的风险相关联的至少一种多态性的存在，其中所述至少一种多态性选自表3，或与其一种或多种连锁不平衡的单核苷酸多态性。6.根据权利要求5所述的方法，其包含检测表3中提供的至少2种、至少3种、至少4种、至少5种、至少6种、至少7种、至少8种、至少9种、至少10种、至少20种、至少50种、至少100种、至少125种、至少150种、至少175种、至少200种、至少225种、至少250种或所有所述多态性，或与其一种或多种连锁不平衡的单核苷酸多态性的存在。7.根据权利要求5所述的方法，其包含检测表3中提供的所述多态性中的每一种。8.一种用于评估人类受试者患2型糖尿病的风险的方法，所述方法包含对所述人类受试者进行遗传风险评估，其中所述遗传风险评估涉及在衍生自所述人类受试者的生物样本中检测与患2型糖尿病的风险相关联的至少一种多态性的存在，其中所述至少一种多态性选自表4，或与其一种或多种连锁不平衡的单核苷酸多态性。9.根据权利要求8所述的方法，其包含检测表4中提供的至少2种、至少3种、至少4种、至少5种、至少6种、至少7种、至少8种、至少9种、至少10种、至少20种、至少30种、至少40种、至少50种、至少60种、至少70种、至少80种、至少85种或所有所述多态性，或与其一种或多种连锁不平衡的单核苷酸多态性的存在。10.根据权利要求8所述的方法，其包含检测表4中提供的所述多态性中的每一种。11.根据权利要求1至10中任一项所述的方法，其进一步包含：对所述人类受试者进行临床风险评估；以及组合所述临床风险评估和所述遗传风险评估，以获得人类受试者患冠状动脉疾病、心房纤颤或2型糖尿病的所述风险。12.根据权利要求11所述的方法，其中所述临床风险评估包括从所述受试者获得关于以下一项或多项或所有的信息：年龄、性别、HDL
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胆固醇水平(mmol/L)、LDL
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胆固醇水平(mmol/L)、总胆固醇水平、血压(收缩压和/或舒张压(mm Hg))、吸烟状态、患有或曾患有糖尿病、正在服用高血压药物、c反应蛋白水平、所述受试者的母亲或父亲是否患有心脏病发
作(诸如到60岁)、体质指数、种族、剥夺措施、家族史、患有或曾患有慢性肾病，以及患有或曾患有类风湿性关节炎。13.根据根据权利要求11或权利要求12所述的方法，其中所述临床风险评估包括从所述受试者获得关于以下一项或多项或所有的信息：年龄、性别、HDL
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胆固醇水平(mmol/L)、LDL
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胆固醇水平(mmol/L)、总胆固醇水平、血压(收缩压和/或舒张压(mm Hg))、吸烟状态、患有或曾患有糖尿病以及正在服用高血压药物。14.根据权利要求13所述的方法，其中所述临床风险评估是弗明汉(Framingham)评分。15.根据权利要求1至4或11至14中任一项所述的方法，其中所述临床风险评估是美国心脏病专家学院汇总队列方程(PCE)。16.根据权利要求11至15中任一项所述的方法，其中组合所述临床风险评估和所述遗传风险评估包含将所述风险评估相加或相乘。17.一种确定选自由需要评估患冠状动脉疾病的风险的人类组成的受试者的组中的人类受试者中少于100,000种多态性的等位基因的同一性，以产生所述受试者的多态性图谱的方法，其包含：(i)选择表1和/或表2中提供的至少一种多态性或与其一种或多种连锁不平衡的单核苷酸多态性用于等位基因同一性分析，(ii)在衍生自所述人类受试者的生物样本中检测所述多态性，以及(iii)基于步骤(ii)中分析的所述等位基因的所述同一性产生所述受试者筛选的所述多态性图谱，其中在步骤(i)中选择少于100,000种多态性用于等位基因同一性分析，并且在步骤(ii)中分析同样少于100,000种多态性。18.一种确定选自由需要评估患心房纤颤的风险的人类组成的受试者的组中的人类受试者中少于100,000种多态性的等位基因的同一性，以产生所述受试者的多态性图谱的方法，其包含：(i)选择表3中提供的至少一种多态性或与其一种或多种连锁不平衡的单核苷酸多态性用于等位基因同一性分析，(ii)在衍生自所述人类受试者的生物样本中检测所述多态性，以及(iii)基于步骤(ii)中分析的所述等位基因的所述同一性产生所述受试者筛选的所述多态性图谱，其中在步骤(i)中选择少于100,000种多态性用于等位基因同一性分析，并且在步骤(ii)中分析同样少于100,000种多态性。19.一种确定选自由需要评估患2型糖尿病的风险的人类组成的受试者的组中的人类受试者中少于100,000种多态性的等位基因的同一性，以产生所述受试者的多态性图谱的方法，其包含：(i)选择表4中提供的至少一种多态性或与其一种或多种连锁不平衡的单核苷酸多态性用于等位基因同一性分析，(ii)在衍生自所述人类受试者的生物样本中检测所述多态性，以及(iii)基于步骤(ii)中分析的所述等位基因的所述同一性产生所述受试者筛选的所述多态性图谱，其中在步骤(i)中选择少于100,000种多态性用于等位基因同一性分析，并且在步骤(ii)中分析同样少于100,000种多态性。20.根据权利要求1至19中任一项所述的方法，其中连锁不平衡的所述多态性具有高于
0.9的连锁不平衡。21.根据权利要求1至20中任一项所述的方法，其中连锁不平衡的所述多态性具有为1的连锁不平衡。22.根据权利要求1至21中任一项所述的方法，其中所述风险评估产生分数，并且所述...

【专利技术属性】
技术研发人员：K，
申请(专利权)人：遗传技术有限公司，
类型：发明
国别省市：