鉴定丹参栽培种的分子标记及其应用制造技术

本发明专利技术公开了鉴定丹参栽培种的分子标记及其应用，属于植物分子鉴定技术领域。本发明专利技术分子标记包括SM

【技术实现步骤摘要】
鉴定丹参栽培种的分子标记及其应用


[0001]本专利技术属于植物分子鉴定
，具体涉及鉴定丹参栽培种的分子标记及其应用。

技术介绍

[0002]丹参是唇形科鼠尾草属的一种传统药用植物，其干燥的根茎为主要的药用部位。丹参中药理活性成分主要包含亲水性的酚酸成分和亲酯性的二萜类化合物；其中，丹参酮作为最主要的药理活性成分，被世界范围内广泛用于心脑血管疾病的预防和保护。到目前为止，尽管很多的栽培种已经进行了全面的组学研究，但是关于丹参的种内遗传变异和鉴定的研究仍未见报道。
[0003]因此，挖掘丹参的种内遗传变异和鉴定不同的丹参栽培种是本领域亟待解决的问题。

技术实现思路

[0004]本专利技术公开了鉴定丹参栽培种的分子标记，将其用于丹参栽培种的鉴定，可有效区分成2个亚组。
[0005]为了实现上述目的，本专利技术采用如下技术方案：
[0006]鉴定丹参栽培种的分子标记，包括SM
‑
M1，SM
‑
M2，SM
‑
M3，SM
‑
M4，SM
‑
M5和SM
‑
M6，
[0007]SM
‑
M1包括SEQ ID NO：1所示核苷酸序列中第57位SNP位点，
[0008]SEQ ID NO：1为：GAGTTTTTCTTAATTATTTTTTGAAAAGAAAAAAATAATGCCTTTTTTTTTWWWWTWTT，其中第51位核苷酸为T或缺失；
[0009]SM
‑
M2包括SEQ ID NO：2所示核苷酸序列中第10位SNP位点，
[0010]SEQ ID NO：2为ATTGAATTTKATTTTGAGCACGGATTTTGTCGGTAAAAAAAAAAA；
[0011]SM
‑
M3包括SEQ ID NO：3所示核苷酸序列中第8位SNP位点，
[0012]SEQ ID NO：3为TCTATTAWTATCTATTATTATATATATAA；
[0013]SM
‑
M4包括SEQ ID NO：4所示核苷酸序列中第41
‑
46位Indel位点，
[0014]SEQ ID NO：4为AATTAATCTAGTTCTTAATCTATTTCCCTTCAAATACCCCCCCAAAAAAA；
[0015]SM
‑
M5包括SEQ ID NO：5所示核苷酸序列中第10位SNP位点，
[0016]SEQ ID NO：5为AAATATAAARTAATTTTTTTAATATGCTAAAGGATTGGGTATAGCTAGTCATGATGGTGTAGTGAGTCTATCCACTCTTTTTTCCCCTTCCTACCCCCCC；
[0017]SM
‑
M6包括SEQ ID NO：6所示核苷酸序列中第17位SNP位点，
[0018]SEQ ID NO：6为ACATGTCCTAAAAAAAKAAAATAGATCCTATAATGAATAATAATGAATTCAATTTCGGATTTCGATTTTATAATTAAGGAACTTTTTTTT。
[0019]上述分子标记在丹参栽培种鉴定中的应用：
[0020]根据分子标记将丹参栽培种分为两个亚组；
[0021]组1中，SM
‑
M1第57位SNP位点为T，SM
‑
M2第10位SNP位点为T，SM
‑
M3第8位SNP位点为
T，SM
‑
M4第41
‑
46位缺失，SM
‑
M5第10位SNP位点为A，SM
‑
M6第17位SNP位点为T；
[0022]组2中，SM
‑
M1第57位SNP位点为A，SM
‑
M2第10位SNP位点为G，SM
‑
M3第8位SNP位点为A，SM
‑
M4第41
‑
46位为CCCAA，SM
‑
M5第10位SNP位点为G，SM
‑
M6第17位SNP位点为G。
[0023]鉴定丹参栽培种的引物：
[0024]引物组1为：
[0025]上游引物：5
’‑
ATTCGACTAATTCACCCGCC
‑3’
，SEQ ID NO：7；
[0026]下游引物：5
’‑
ATTGGCATGTTGGGAGTGATG
‑3’
，SEQ ID NO：8；
[0027]引物组2为：
[0028]上游引物：5
’‑
ACAAGGAAAATGGTTCGTGGT
‑3’
，SEQ ID NO：9；
[0029]下游引物：5
’‑
TGCCCCACCGATGTATTAGA
‑3’
，SEQ ID NO：10；
[0030]引物组3为：
[0031]上游引物：5
’‑
AGATCACTCCCGGCTTTAGG
‑3’
，SEQ ID NO：11；
[0032]下游引物：5
’‑
TAATATGGGCCCGCTTAGCT
‑3’
，SEQ ID NO：12；
[0033]引物组4为：
[0034]上游引物：5
’‑
GCTATGTCGCAGGGTTAAAAC
‑3’
，SEQ ID NO：13；
[0035]下游引物：5
’‑
CCCCGCGAATTGAGACAATT
‑3’
，SEQ ID NO：14；
[0036]引物组5为：
[0037]上游引物：5
’‑
TCTGGCCTGATACTGCACAA
‑3’
，SEQ ID NO：15；
[0038]下游引物：5
’‑
GACTTCTTCTCTTCAGCGCG
‑3’
，SEQ ID NO：16；
[0039]引物组6为：
[0040]上游引物：5
’‑
GGTCAAGACAAGCCGCTATG
‑3’
，SEQ ID NO：17；
[0041]下游引物：5
’‑
AGAATTGAAACAGTCGCAAAAGA
‑3’
，SEQ ID NO：18。
[0042]上述引物在鉴定丹参栽培种中的应用。
[0043]鉴定丹参栽培种的试剂盒，包括上述引物。
[0044]鉴定丹参栽培种的方法，包括如下步骤：
[0045](1)取待检测样品叶片，提取DN本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.鉴定丹参栽培种的分子标记，其特征在于，所述分子标记包括SM
‑
M1，SM
‑
M2，SM
‑
M3，SM
‑
M4，SM
‑
M5和SM
‑
M6，所述SM
‑
M1包括SEQ ID NO：1所示核苷酸序列中第57位SNP位点，SEQ ID NO：1为：GAGTTTTTCTTAATTATTTTTTGAAAAGAAAAAAATAATGCCTTTTTTTTTWWWWTWTT，其中第51位核苷酸为T或缺失；所述SM
‑
M2包括SEQ ID NO：2所示核苷酸序列中第10位SNP位点，SEQ ID NO：2为ATTGAATTTKATTTTGAGCACGGATTTTGTCGGTAAAAAAAAAAA；所述SM
‑
M3包括SEQ ID NO：3所示核苷酸序列中第8位SNP位点，SEQ ID NO：3为TCTATTAWTATCTATTATTATATATATAA；所述SM
‑
M4包括SEQ ID NO：4所示核苷酸序列中第41
‑
46位Indel位点，SEQ ID NO：4为AATTAATCTAGTTCTTAATCTATTTCCCTTCAAATACCCCCCCAAAAAAA；所述SM
‑
M5包括SEQ ID NO：5所示核苷酸序列中第10位SNP位点，SEQ ID NO：5为AAATATAAARTAATTTTTTTAATATGCTAAAGGATTGGGTATAGCTAGTCATGATGGTGTAGTGAGTCTATCCACTCTTTTTTCCCCTTCCTACCCCCCC；所述SM
‑
M6包括SEQ ID NO：6所示核苷酸序列中第17位SNP位点，SEQ ID NO：6为ACATGTCCTAAAAAAAKAAAATAGATCCTATAATGAATAATAATGAATTCAATTTCGGATTTCGATTTTATAATTAAGGAACTTTTTTTT。2.权利要求1所述鉴定丹参栽培种的分子标记在丹参栽培种鉴定中的应用，其特征在于，根据所述分子标记将丹参栽培种分为两个亚组；组1中，SM
‑
M1第57位SNP位点为T，SM
‑
M2第10位SNP位点为T，SM
‑
M3第8位SNP位点为T，SM
‑
M4第41
‑
46位缺失，SM
‑
M5第10位SNP位点为A，SM
‑
M6第17位SNP位点为T；组2中，SM
‑
M1第57位SNP位点为A，SM
‑
M2第10位SNP位点为G，SM
‑
M3第8位SNP位点为A，SM
‑
M4第41
‑
46位为CCCAA，SM
‑
M5第10位SNP位点为G，SM
‑
M6第17位SNP位点...

【专利技术属性】
技术研发人员：刘昶，杨合宇，姜梅，
申请(专利权)人：中国医学科学院药用植物研究所，
类型：发明
国别省市：