谷子刚毛长短相关的分子标记及相关生物材料和应用制造技术

本发明专利技术公开了谷子刚毛长分子标记及相关生物材料和应用。本申请要解决的技术问题是如何提供一种谷子刚毛长短相关的分子标记。本申请提供了检测所述InDel分子标记的物质在鉴定或辅助鉴定谷子刚毛长短或制备鉴定或辅助鉴定谷子刚毛长短的产品或谷子育种或制备谷子育种产品中的应用。通过鉴定InDel分子标记基因待检植株InDel分子标记基因位点单倍型或基因型的情况来鉴定或辅助鉴定谷子刚毛长短。因型的情况来鉴定或辅助鉴定谷子刚毛长短。因型的情况来鉴定或辅助鉴定谷子刚毛长短。

【技术实现步骤摘要】
谷子刚毛长短相关的分子标记及相关生物材料和应用


[0001]本申请具体涉及谷子刚毛长短相关的分子标记及相关生物材料和应用。

技术介绍

[0002]作物育种一直是作物学家工作的重中之重，但是随着社会发展与人类文明的进步与需求，新的育种要求不断被提出，例如产量、品质、抗逆、田间表现等。其中很多优异农艺性状需要在作物生长后期才可以被直接鉴定，这就增加了相关育种工作周期，耗费更多时间和物资成本，不符合现代作物育种的基本理念及需求。通过田间表型鉴定费时耗力，同时表型易受环境因素不同程度的影响，而某些优异农艺性状往往与遗传片段紧密连锁。所以，开发、利用相关分子标记具有重要应用价值。
[0003]相对于表型鉴定，分子标记具有更好的稳定性和遗传性。目前主要分子标记可分为三大类，第一类：以分子杂交为基础的DNA标记技术，如限制性片段长度多态性(Restriction fragment length poly
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morphism,RFLP)；第二类：以聚合酶链式反应为基础的各种DNA指纹技术；第三类：新型分子标记，如单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphism,SNP)、单碱基的颠换、转换、插入/缺失等。利用分子标记辅助育种技术在诸多作物中已经取得了一系列成果，如利用分子标记辅助培育出抗白枯叶病水稻，优质高产抗病杂交稻国稻1号，抗白粉病小麦郑麦835、郑麦863，构建新的光敏型饲草高粱新品种选育体系,选育提高棉花纤维强度品系。利用分子标记辅助育种大大缩短育种周期、提高育种效率、克服传统育种过程中的诸多困难、推动分子精准育种进程，加快育种产业发展。除此之外，新的育种要求不仅体现在对作物产量、抗病、品质、株型及田间表现方面，同时也对作物遗传背景丰度提出了前所未有的关注。
[0004]谷子耕作伴随着我国黄河流域人类文明的发展，其曾经很长时期作为我们的主粮作物，当时谷子的种植进入鼎盛期。谷子品种的选育起始于其耕作文明的诞生，尤其是优异品种的培育往往需经历漫长的过程。在此期间，人类针对性的育种选择造成谷子品种的遗传背景越来越窄，这不符合未来育种的发展需求。利用相关分子标记可以直接筛选亲本，丰富遗传多样性，缓解遗传背景变窄压力。分子标记也可以对间接相关性状进行筛选，辅助选择关注的优良性状。但是，利用这些遗传资源的同时，也会伴随不符合目前育种要求的性状。例如，刚毛长短不是影响谷子产量的主要因素，但是其增加了穗部附属物和收获、加工处理的工作量。尤其作为穗部性状影响谷子田间美观性，客观反映了谷子育种水平。
[0005]刚毛在谷子驯化及培育过程中明显变短，尤其是近代育种表现出对短刚毛强烈选择。刚毛变短极大提高了谷子品种的田间美观性，体现出谷子育种水平的极大进步。但是，刚毛作为穗部发育结构，表现在谷子生育期晚期，延长了短刚毛优异品种的培育周期。因此，开发、利用、鉴定刚毛长/短的分子标记，可以大大缩短具有短刚毛优异品种的培育周期、降低培育成本。

技术实现思路

[0006]本申请解决的技术问题是如何鉴定或辅助鉴定谷子刚毛长度。
[0007]为了解决上述问题，本申请提供了下述应用；
[0008]InDel分子标记或检测所述InDel分子标记的物质的下述任一种的应用，所示InDel分子标记是核苷酸序列为序列1的第764位
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872位的DNA片段：
[0009]A1)鉴定或辅助鉴定谷子刚毛长短中的应用；
[0010]A2)制备鉴定或辅助鉴定谷子刚毛长短的产品中的应用；
[0011]A3)谷子育种中的应用；
[0012]A4)制备谷子育种产品中的应用。
[0013]本申请中，所述刚毛为果穗刚毛。
[0014]上述应用中，所述检测所述InDel分子标记的物质为P1或P2；
[0015]所述P1为下述任一种：
[0016]A1)检测基因组中SEQ ID No.2第821位
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822位之间是否存在AGCT四碱基的插入的物质；
[0017]A2)检测转录组中序列为SEQ ID No.3所示的转录产物第424
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425位核苷酸之间是否存在AGCU四碱基的插入的物质；
[0018]所述P2为检测单倍型的物质，所述单倍型是谷子一条染色体上A1)所述的InDel。
[0019]序列2(SEQ ID No.2)具体如下：
[0020]ATGGAGGAGCAGCTGAGCCCGCTGGCGGTGACGCACCTGCTGCAGCACACGCTGCGCAGCCTCTGCGGCCACGACGACGCGCAGTGGGTGTACGCCGTCTTCTGGCGGATCCTCCCCAGGAACTACCCGCCCCCCAAGTGAGTCGTCGTCGTCGTCGTTCGCATGCGATCTGCGCTTGGTTCTTGCTTCTTCTCGTCGTCCTCGATCGACGCTGCGTCTTGTTTGGGTTCTCGTGCTGATTTGTTTGTTTATCTCTATATCCCCTGTGTGTTCAGATGGGATCTCCAGGGCGGCATCTACGACCGGACCAGAGGGAACAGGAGGAACTGGTACGGCCTGAGACAAGTTATTCTTATTCCTCTTCAATTTCTTAGGGGTTAATTTGCGTTTGTTTGCACGTGATCCCTTTCGGGGGTGCAACCGATTCCAGGATCCTGGCATGGGAGGATGGGTTCTGCAACTTCGCGGCCTCTGCTTGTGACCACGAGGGCGCAGCTGCCCCTGCCGCCGCCGCCGCCTACACGGAGTGTGCCGCCGCGCAGGAGGCCAAGCAGGGCCTGCAGCCCGAGCTCTTCTTCAAGATGTCCCACGACATCTACAACTACGGCGAAGGGTAGGACACGACACCATGCTTGCTGCGGCTATTAGCTAGTCCATCAGTCGTGTCGCAACCTAATCGCAGCTTTCATTATAAACGGCTTTGATTTCATGCTAATCATCAAGCTTAACTTATCGCGGTCCCGTTGGTGATGCATTTGTTTCGCGTTGCAGGTTGATAGGGAAAGTGGCAGCCGACCACAGCCACAAATGGGTGTTCCAGGAGGCCCAGCAGCAGCAGGAGAACGAGATCAACCTCGTCTCATCCTGGAGCAACCCTGCCGATTCTGTAAGCGTCTCCTTTTAGCCAACACATTAACATGTCACCCAACGCTTAGTTACATAACTGGTGAACACCGGTGCTTCTTTGTCTGTGTGCGGTTGGTTTGCAGCATCCGAGGACATGGGAGGCGCAGTTCCAGTCTGGTATCAAGGTAGAGCCCGTAGCTAAAACATGAAGAGTACCATTTGATGACTGAAAAATAGGAGCT本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.InDel分子标记或检测所述InDel分子标记的物质的下述任一种的应用，所示InDel分子标记是核苷酸序列为序列1的第763位
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872位的DNA片段：A1)鉴定或辅助鉴定谷子刚毛长短中的应用；A2)制备鉴定或辅助鉴定谷子刚毛长短的产品中的应用；A3)谷子育种中的应用；A4)制备谷子育种产品中的应用。2.如权利要求1所述的应用，其特征在于，所述检测所述InDel分子标记的物质为P1或P2；所述P1为下述任一种：A1)检测基因组中SEQ ID No.2第821位
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822位之间是否存在AGCT四碱基的插入的物质；A2)检测转录组中序列为SEQ ID No.3所示的转录产物第424
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425位核苷酸之间是否存在AGCU四碱基的插入的物质；所述P2为检测单倍型的物质，所述单倍型是谷子一条染色体上A1)所述的InDel。3.产品，其特征在于，所述产品为P1或P2；所述P1为含有权利要求1或2所述检测所述InDel分子标记的物质，且可为下述G1)
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G3)中的任一种：G1)检测所述InDel分子标记的产品；G2)鉴定或辅助鉴定谷子刚毛长短的产品；G3)用于谷子育种的产品；所述P2为含有权利要求2中所述检测单倍型的物质，或所述检测单倍型的物质，且可为下述J1)
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J3)中的任一种：J1)检测谷子刚毛长短相关的InDel分子标记的产品；J2)鉴定或辅助鉴定谷子刚毛长短的产品；J3)用于谷子育种的产品。4.鉴定或辅助鉴定谷子刚毛长短的方法，其特征在于，所述方法为鉴定或辅助鉴定谷子刚毛长短的方法，包括检测待测谷子中权利要求1或2中所述InDel分子标记的基因型，根据待测谷子的所述基因型鉴定或辅助鉴定谷子刚毛长短：所述基因型为SEQ ID No.2第821位
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822位之间存在AGCT四碱基的插入的纯合型的谷子刚毛长度短于或候选短于所述基因型为SEQ ID No.2第821位
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822位之间不存在AGCT四碱基的插入的纯合型的谷子刚毛长度。5.鉴定或辅助鉴定谷子刚毛长短的方法，其特征在于，所述方法为A或B：所述方法A为鉴定或辅助鉴定谷子刚毛长度的方法，包括检测待测谷子中权利要求2中所述单倍型，根据所述待测谷子的单倍型鉴定...

【专利技术属性】
技术研发人员：贾冠清，刁现民，孟强，智慧，汤沙，
申请(专利权)人：中国农业科学院作物科学研究所，
类型：发明
国别省市：