【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】用于用抗体药物偶联物(ADC)治疗癌症的方法中的标志物
[0001]相关申请的交叉引用
[0002]本申请要求于2020年6月19日提交的美国临时专利申请第63/041,636号的优先权的权益,所述临时申请的公开内容在此通过引用方式以其整体并入本文。
[0003]序列表
[0004]本说明书与序列表的计算机可读形式(CRF)副本一起提交。该CRF名为“14369
‑
256
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228_SEQ_LISTING.txt”,其创建于2021年6月8日,大小为39,661字节,并且通过引用方式以其整体并入本文。
1.
[0005]本文提供了用于用抗体药物偶联物(ADC)治疗癌症的方法中的标志物。
[0006]2.专利技术背景
[0007]癌症是美国35至65岁人群的主要死因,也是全球第二大死因。据估计,2019年美国将有约170万新癌症病例,约61万人死于癌症(美国国家癌症研究所,2019年,Cancer Stat Facts:Cancer of Any Site.se ...
【技术保护点】
【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】1.一种用于治疗有需要的受试者的癌症的方法,其包括:(1)向所述受试者施用包含通过接头与一个或多个单元的细胞毒性剂偶联的抗体或其抗原结合片段的抗体药物偶联物(ADC),(2)确定所述受试者中一种或多种ADC第I组标记基因的表达增加,以及(3)(a)如果所述受试者中所述一种或多种ADC第I组标记基因的所述表达与施用所述ADC之前所述受试者中所述一种或多种ADC第I组标记基因的表达相比增加,则继续施用所述ADC,或者(b)如果所述受试者中所述一种或多种ADC第I组标记基因的表达与施用所述ADC之前所述受试者中所述一种或多种ADC第I组标记基因的表达相比未增加,则停止施用所述ADC,其中所述一种或多种ADC第I组标记基因包括一种或多种主要组织相容性复合物(MHC)特征基因、一种或多种toll样受体(TLR)家族基因、一种或多种白细胞介素受体家族基因、一种或多种免疫检查点受体基因、一种或多种受体酪氨酸激酶基因、一种或多种IFN受体家族基因、一种或多种TNF家族受体基因、一种或多种抑制性免疫受体基因和/或一种或多种代谢酶基因。2.一种用于治疗有需要的受试者的癌症的方法,其包括:(1)向所述受试者施用第一剂量包含通过接头与一个或多个单元的细胞毒性剂偶联的抗体或其抗原结合片段的ADC,(2)确定所述受试者中一种或多种ADC第I组标记基因的表达增加,以及(3)(a)如果所述受试者中所述一种或多种ADC第I组标记基因的表达与施用所述ADC之前所述受试者中所述一种或多种ADC第I组标记基因的表达相比增加,则以与所述第一剂量相同或更低的量施用第二剂量的所述ADC,或者(b)如果所述受试者中所述一种或多种ADC第I组标记基因的表达与施用所述ADC之前所述受试者中所述一种或多种ADC第I组标记基因的表达相比未增加,则以高于所述第一剂量的量施用第二剂量的所述ADC,其中所述一种或多种ADC第I组标记基因包括一种或多种MHC特征基因、一种或多种TLR家族基因、一种或多种白细胞介素受体家族基因、一种或多种免疫检查点受体基因、一种或多种受体酪氨酸激酶基因、一种或多种IFN受体家族基因、一种或多种TNF家族受体基因、一种或多种抑制性免疫受体基因和/或一种或多种代谢酶基因。3.一种用于治疗有需要的受试者的癌症的方法,其包括:(1)向所述受试者施用第一剂量包含通过接头与一个或多个单元的细胞毒性剂偶联的抗体或其抗原结合片段的ADC,(2)确定所述受试者中一种或多种ADC第I组标记基因的表达增加,以及(3)(a)如果所述受试者中所述一种或多种ADC第I组标记基因的表达与施用所述ADC之前所述受试者中所述一种或多种ADC第I组标记基因的表达相比增加,则与第二剂量的所述ADC的施用联合施用免疫检查点抑制剂,或者(b)如果所述受试者中所述一种或多种ADC第I组标记基因的表达与施用所述ADC之前所述受试者中所述一种或多种ADC第I组标记基因的表达相比未增加,则施用第二剂量的所述ADC而不施用所述免疫检查点抑制剂,其中所述一种或多种ADC第I组标记基因包括一种或多种MHC特征基因、一种或多种TLR
家族基因、一种或多种白细胞介素受体家族基因、一种或多种免疫检查点受体基因、一种或多种受体酪氨酸激酶基因、一种或多种IFN受体家族基因、一种或多种TNF家族受体基因、一种或多种抑制性免疫受体基因和/或一种或多种代谢酶基因。4.一种用于治疗有需要的受试者的癌症的方法,其包括:(1)向所述受试者施用第一剂量包含通过接头与一个或多个单元的细胞毒性剂偶联的抗体或其抗原结合片段的ADC,(2)确定所述受试者中一种或多种ADC第I组标记基因的表达增加,以及(3)(a)如果所述受试者中所述一种或多种ADC第I组标记基因的表达与施用所述ADC之前所述受试者中所述一种或多种ADC第I组标记基因的表达相比增加,则向所述受试者施用免疫检查点抑制剂,或者(b)如果所述受试者中所述一种或多种ADC第I组标记基因的表达与施用所述ADC之前所述受试者中所述一种或多种ADC第I组标记基因的表达相比未增加,则施用第二剂量的所述ADC而不施用所述免疫检查点抑制剂,其中步骤(3)(a)中的所述免疫检查点抑制剂不与所述ADC联合施用,其中所述一种或多种ADC第I组标记基因包括一种或多种MHC特征基因、一种或多种TLR家族基因、一种或多种白细胞介素受体家族基因、一种或多种免疫检查点受体基因、一种或多种受体酪氨酸激酶基因、一种或多种IFN受体家族基因、一种或多种TNF家族受体基因、一种或多种抑制性免疫受体基因和/或一种或多种代谢酶基因。5.一种用于诱导有需要的受试者的癌症中免疫原性细胞死亡(ICD)的方法,其包括:(1)向所述受试者施用包含通过接头与一个或多个单元的细胞毒性剂偶联的抗体或其抗原结合片段的ADC,(2)确定所述受试者中一种或多种ADC第I组标记基因的表达增加,以及(3)(a)如果所述受试者中所述一种或多种ADC第I组标记基因的表达与施用所述ADC之前所述受试者中所述一种或多种ADC第I组标记基因的表达相比增加,则继续施用所述ADC,或者(b)如果所述受试者中所述一种或多种ADC第I组标记基因的表达与施用所述ADC之前所述受试者中所述一种或多种ADC第I组标记基因的表达相比未增加,则停止施用所述ADC,其中所述一种或多种ADC第I组标记基因包括一种或多种MHC特征基因、一种或多种TLR家族基因、一种或多种白细胞介素受体家族基因、一种或多种免疫检查点受体基因、一种或多种受体酪氨酸激酶基因、一种或多种IFN受体家族基因、一种或多种TNF家族受体基因、一种或多种抑制性免疫受体基因和/或一种或多种代谢酶基因。6.一种用于诱导有需要的受试者的癌症中ICD的方法,其包括:(1)向所述受试者施用第一剂量包含通过接头与一个或多个单元的细胞毒性剂偶联的抗体或其抗原结合片段的ADC,(2)确定所述受试者中一种或多种ADC第I组标记基因的表达增加,以及(3)(a)如果所述受试者中所述一种或多种ADC第I组标记基因的表达与施用所述ADC之前所述受试者中所述一种或多种ADC第I组标记基因的表达相比增加,则以与所述第一剂量相同或更低的量施用第二剂量的所述ADC,(b)或者如果所述受试者中所述一种或多种ADC第I组标记基因的表达与施用所述ADC
之前所述受试者中所述一种或多种ADC第I组标记基因的表达相比未增加,则以高于所述第一剂量的量施用第二剂量的所述ADC,其中所述一种或多种ADC第I组标记基因包括一种或多种MHC特征基因、一种或多种TLR家族基因、一种或多种白细胞介素受体家族基因、一种或多种免疫检查点受体基因、一种或多种受体酪氨酸激酶基因、一种或多种IFN受体家族基因、一种或多种TNF家族受体基因、一种或多种抑制性免疫受体基因和/或一种或多种代谢酶基因。7.一种用于诱导有需要的受试者的癌症中ICD的方法,其包括:(1)向所述受试者施用第一剂量包含通过接头与一个或多个单元的细胞毒性剂偶联的抗体或其抗原结合片段的ADC,(2)确定所述受试者中一种或多种ADC第I组标记基因的表达增加,以及(3)(a)如果所述受试者中所述一种或多种ADC第I组标记基因的表达与施用所述ADC之前所述受试者中所述一种或多种ADC第I组标记基因的表达相比增加,则与第二剂量的所述ADC的施用联合施用免疫检查点抑制剂,(b)或者如果所述受试者中所述一种或多种ADC第I组标记基因的表达与施用所述ADC之前所述受试者中所述一种或多种ADC第I组标记基因的表达相比未增加,则施用第二剂量的所述ADC而不施用所述免疫检查点抑制剂,其中所述一种或多种ADC第I组标记基因包括一种或多种MHC特征基因、一种或多种TLR家族基因、一种或多种白细胞介素受体家族基因、一种或多种免疫检查点受体基因、一种或多种受体酪氨酸激酶基因、一种或多种IFN受体家族基因、一种或多种TNF家族受体基因、一种或多种抑制性免疫受体基因和/或一种或多种代谢酶基因。8.一种用于诱导有需要的受试者的癌症中ICD的方法,其包括:(1)向所述受试者施用第一剂量包含通过接头与一个或多个单元的细胞毒性剂偶联的抗体或其抗原结合片段的ADC,(2)确定所述受试者中一种或多种ADC第I组标记基因的表达增加,以及(3)(a)如果所述受试者中所述一种或多种ADC第I组标记基因的表达与施用所述ADC之前所述受试者中所述一种或多种ADC第I组标记基因的表达相比增加,则向所述受试者施用免疫检查点抑制剂,或者(b)如果所述受试者中所述一种或多种ADC第I组标记基因的表达与施用所述ADC之前所述受试者中所述一种或多种ADC第I组标记基因的表达相比未增加,则施用第二剂量的所述ADC而不施用所述免疫检查点抑制剂,其中步骤(3)(a)中的所述免疫检查点抑制剂不与所述ADC联合施用,其中所述一种或多种ADC第I组标记基因包括一种或多种MHC特征基因、一种或多种TLR家族基因、一种或多种白细胞介素受体家族基因、一种或多种免疫检查点受体基因、一种或多种受体酪氨酸激酶基因、一种或多种IFN受体家族基因、一种或多种TNF家族受体基因、一种或多种抑制性免疫受体基因和/或一种或多种代谢酶基因。9.一种用于诱导有需要的受试者中免疫细胞向癌症迁移的方法,其包括:(1)向所述受试者施用包含通过接头与一个或多个单元的细胞毒性剂偶联的抗体或其抗原结合片段的ADC,(2)确定所述受试者中一种或多种ADC第I组标记基因的表达增加,以及
(3)(a)如果所述受试者中所述一种或多种ADC第I组标记基因的表达与施用所述ADC之前所述受试者中所述一种或多种ADC第I组标记基因的表达相比增加,则继续施用所述ADC,或者(b)如果所述受试者中所述一种或多种ADC第I组标记基因的表达与施用所述ADC之前所述受试者中所述一种或多种ADC第I组标记基因的表达相比未增加,则停止施用所述ADC,其中所述一种或多种ADC第I组标记基因包括一种或多种MHC特征基因、一种或多种TLR家族基因、一种或多种白细胞介素受体家族基因、一种或多种免疫检查点受体基因、一种或多种受体酪氨酸激酶基因、一种或多种IFN受体家族基因、一种或多种TNF家族受体基因、一种或多种抑制性免疫受体基因和/或一种或多种代谢酶基因。10.一种用于诱导有需要的受试者中免疫细胞向癌症迁移的方法,其包括:(1)向所述受试者施用第一剂量包含通过接头与一个或多个单元的细胞毒性剂偶联的抗体或其抗原结合片段的ADC,(2)确定所述受试者中一种或多种ADC第I组标记基因的表达增加,以及(3)(a)如果所述受试者中所述一种或多种ADC第I组标记基因的表达与施用所述ADC之前所述受试者中所述一种或多种ADC第I组标记基因的表达相比增加,则以与所述第一剂量相同或更低的量施用第二剂量的所述ADC,或者(b)如果所述受试者中所述一种或多种ADC第I组标记基因的表达与施用所述ADC之前所述受试者中所述一种或多种ADC第I组标记基因的表达相比未增加,则以高于所述第一剂量的量施用第二剂量的所述ADC,其中所述一种或多种ADC第I组标记基因包括一种或多种MHC特征基因、一种或多种TLR家族基因、一种或多种白细胞介素受体家族基因、一种或多种免疫检查点受体基因、一种或多种受体酪氨酸激酶基因、一种或多种IFN受体家族基因、一种或多种TNF家族受体基因、一种或多种抑制性免疫受体基因和/或一种或多种代谢酶基因。11.一种用于诱导有需要的受试者中免疫细胞向癌症迁移的方法,其包括:(1)向所述受试者施用第一剂量包含通过接头与一个或多个单元的细胞毒性剂偶联的抗体或其抗原结合片段的ADC,(2)确定所述受试者中一种或多种ADC第I组标记基因的表达增加,以及(3)(a)如果所述受试者中所述一种或多种ADC第I组标记基因的表达与施用所述ADC之前所述受试者中所述一种或多种ADC第I组标记基因的表达相比增加,则与第二剂量的所述ADC的施用联合施用免疫检查点抑制剂,或者(b)如果所述受试者中所述一种或多种ADC第I组标记基因的表达与施用所述ADC之前所述受试者中所述一种或多种ADC第I组标记基因的表达相比未增加,则施用第二剂量的所述ADC而不施用所述免疫检查点抑制剂,其中所述一种或多种ADC第I组标记基因包括一种或多种MHC特征基因、一种或多种TLR家族基因、一种或多种白细胞介素受体家族基因、一种或多种免疫检查点受体基因、一种或多种受体酪氨酸激酶基因、一种或多种IFN受体家族基因、一种或多种TNF家族受体基因、一种或多种抑制性免疫受体基因和/或一种或多种代谢酶基因。12.一种用于诱导有需要的受试者中免疫细胞向癌症迁移的方法,其包括:(1)向所述受试者施用第一剂量包含通过接头与一个或多个单元的细胞毒性剂偶联的
抗体或其抗原结合片段的ADC,(2)确定所述受试者中一种或多种ADC第I组标记基因的表达增加,以及(3)(a)如果所述受试者中所述一种或多种ADC第I组标记基因的表达与施用所述ADC之前所述受试者中所述一种或多种ADC第I组标记基因的表达相比增加,则向所述受试者施用免疫检查点抑制剂,或者(b)如果所述受试者中所述一种或多种ADC第I组标记基因的表达与施用所述ADC之前所述受试者中所述一种或多种ADC第I组标记基因的表达相比未增加,则施用第二剂量的所述ADC而不施用所述免疫检查点抑制剂,其中步骤(3)(a)中的所述免疫检查点抑制剂不与所述ADC联合施用,其中所述一种或多种ADC第I组标记基因包括一种或多种MHC特征基因、一种或多种TLR家族基因、一种或多种白细胞介素受体家族基因、一种或多种免疫检查点受体基因、一种或多种受体酪氨酸激酶基因、一种或多种IFN受体家族基因、一种或多种TNF家族受体基因、一种或多种抑制性免疫受体基因和/或一种或多种代谢酶基因。13.一种用于提高有需要的受试者的癌症中一种或多种ADC第I组标记基因表达的方法,其包括:(1)向所述受试者施用包含通过接头与一个或多个单元的细胞毒性剂偶联的抗体或其抗原结合片段的ADC,(2)确定所述受试者中一种或多种ADC第I组标记基因的表达增加,以及(3)(a)如果所述受试者中所述一种或多种ADC第I组标记基因的表达与施用所述ADC之前所述受试者中所述一种或多种ADC第I组标记基因的表达相比增加,则继续施用所述ADC,或者(b)如果所述受试者中所述一种或多种ADC第I组标记基因的表达与施用所述ADC之前所述受试者中所述一种或多种ADC第I组标记基因的表达相比未增加,则停止施用所述ADC,其中所述一种或多种ADC第I组标记基因包括一种或多种MHC特征基因、一种或多种TLR家族基因、一种或多种白细胞介素受体家族基因、一种或多种免疫检查点受体基因、一种或多种受体酪氨酸激酶基因、一种或多种IFN受体家族基因、一种或多种TNF家族受体基因、一种或多种抑制性免疫受体基因和/或一种或多种代谢酶基因。14.一种用于提高有需要的受试者的癌症中一种或多种ADC第I组标记基因表达的方法,其包括:(1)向所述受试者施用第一剂量包含通过接头与一个或多个单元的细胞毒性剂偶联的抗体或其抗原结合片段的ADC,(2)确定所述受试者中一种或多种ADC第I组标记基因的表达增加,以及(3)(a)如果所述受试者中所述一种或多种ADC第I组标记基因的表达与施用所述ADC之前所述受试者中所述一种或多种ADC第I组标记基因的表达相比增加,则以与所述第一剂量相同或更低的量施用第二剂量的所述ADC,或者(b)如果所述受试者中所述一种或多种ADC第I组标记基因的表达与施用所述ADC之前所述受试者中所述一种或多种ADC第I组标记基因的表达相比未增加,则以高于所述第一剂量的量施用第二剂量的所述ADC,其中所述一种或多种ADC第I组标记基因包括一种或多种MHC特征基因、一种或多种TLR
家族基因、一种或多种白细胞介素受体家族基因、一种或多种免疫检查点受体基因、一种或多种受体酪氨酸激酶基因、一种或多种IFN受体家族基因、一种或多种TNF家族受体基因、一种或多种抑制性免疫受体基因和/或一种或多种代谢酶基因。15.一种用于提高有需要的受试者的癌症中一种或多种ADC第I组标记基因表达的方法,其包括:(1)向所述受试者施用第一剂量包含通过接头与一个或多个单元的细胞毒性剂偶联的抗体或其抗原结合片段的ADC,(2)确定所述受试者中一种或多种ADC第I组标记基因的表达增加,以及(3)(a)如果所述受试者中所述一种或多种ADC第I组标记基因的表达与施用所述ADC之前所述受试者中所述一种或多种ADC第I组标记基因的表达相比增加,则与第二剂量的所述ADC的施用联合施用免疫检查点抑制剂,或者(b)如果所述受试者中所述一种或多种ADC第I组标记基因的表达与施用所述ADC之前所述受试者中所述一种或多种ADC第I组标记基因的表达相比未增加,则施用第二剂量的所述ADC而不施用所述免疫检查点抑制剂,其中所述一种或多种ADC第I组标记基因包括一种或多种MHC特征基因、一种或多种TLR家族基因、一种或多种白细胞介素受体家族基因、一种或多种免疫检查点受体基因、一种或多种受体酪氨酸激酶基因、一种或多种IFN受体家族基因、一种或多种TNF家族受体基因、一种或多种抑制性免疫受体基因和/或一种或多种代谢酶基因。16.一种用于提高有需要的受试者的癌症中一种或多种ADC第I组标记基因表达的方法,其包括:(1)向所述受试者施用第一剂量包含通过接头与一个或多个单元的细胞毒性剂偶联的抗体或其抗原结合片段的ADC,(2)确定所述受试者中一种或多种ADC第I组标记基因的表达增加,以及(3)(a)如果所述受试者中所述一种或多种ADC第I组标记基因的表达与施用所述ADC之前所述受试者中所述一种或多种ADC第I组标记基因的表达相比增加,则向所述受试者施用免疫检查点抑制剂,或者(b)如果所述受试者中所述一种或多种ADC第I组标记基因的表达与施用所述ADC之前所述受试者中所述一种或多种ADC第I组标记基因的表达相比未增加,则施用第二剂量的所述ADC而不施用所述免疫检查点抑制剂,其中步骤(3)(a)中的所述免疫检查点抑制剂不与所述ADC联合施用,其中所述一种或多种ADC第I组标记基因包括一种或多种MHC特征基因、一种或多种TLR家族基因、一种或多种白细胞介素受体家族基因、一种或多种免疫检查点受体基因、一种或多种受体酪氨酸激酶基因、一种或多种IFN受体家族基因、一种或多种TNF家族受体基因、一种或多种抑制性免疫受体基因和/或一种或多种代谢酶基因。17.如权利要求1至16中任一项所述的方法,其中所述抗体或其抗原结合片段是抗柄蛋白
‑
4抗体或其抗原结合片段。18.如权利要求1至17中任一项所述的方法,其中所述细胞毒性剂是微管蛋白破坏剂。19.如权利要求18所述的方法,其中所述微管蛋白破坏剂选自由以下组成的组:多拉司他汀、奥瑞他汀、哈米特林、长春花生物碱、类美登素、艾日布林、秋水仙碱、普罗布林、拟茎
点霉毒素、埃坡霉素、隐藻素和紫杉烷。20.如权利要求18或19所述的方法,其中所述微管蛋白破坏剂是奥瑞他汀。21.如权利要求19或20所述的方法,其中所述奥瑞他汀是单甲基奥瑞他汀E(MMAE)、单甲基奥瑞他汀F(MMAF)、AFP或奥瑞他汀T。22.如权利要求19至21中任一项所述的方法,其中所述奥瑞他汀是MMAE。23.如权利要求1至22中任一项所述的方法,其中所述抗体或其抗原结合片段包含重链可变区和轻链可变区,所述重链可变区包含互补决定区1(CDR
‑
H1)、CDR
‑
H2和CDR
‑
H3,其包含SEQ ID NO:22中列出的所述重链可变区序列中相应的CDR
‑
H1、CDR
‑
H2和CDR
‑
H3的氨基酸序列,并且所述轻链可变区包含CDR
‑
L1、CDR
‑
L2和CDR
‑
L3,其包含SEQ ID NO:23中列出的所述轻链可变区序列中相应的CDR
‑
L1、CDR
‑
L2和CDR
‑
L3的氨基酸序列,并且其中所述抗体或其抗原结合片段通过接头与1至20个单元的MMAE偶联。24.如权利要求1至23中任一项所述的方法,其中所述一种或多种ADC第I组标记基因包括一种或多种MHC特征基因。25.如权利要求1至23中任一项所述的方法,其中所述一种或多种ADC第I组标记基因由一种或多种MHC特征基因组成。26.如权利要求1至25中任一项所述的方法,其中所述一种或多种MHC第特征基因包括一种或多种MHC类基因。27.如权利要求26所述的方法,其中所述一种或多种MHC类基因包括一种或多种MHC I类基因。28.如权利要求27所述的方法,其中所述一种或多种MHC I类基因包括一种或多种选自由以下组成的组的基因:人白细胞抗原
‑
A(HLA
‑
A)、HLA
‑
B、HLA
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C、HLA
‑
E、HLA
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F和转运蛋白2、ATP结合盒亚家族B成员(TAP2)。29.如权利要求26至28中任一项所述的方法,其中所述一种或多种MHC类基因包括一种或多种MHC II类基因。30.如权利要求29所述的方法,其中所述一种或多种MHC II类基因包括一种或多种选自由以下组成的组的基因:HLA
‑
DMA、HLA
‑
DMB、HLA
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DRB1、HLA
‑
DRA和HLA
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DPA1。31.如权利要求26至30中任一项所述的方法,其中所述一种或多种MHC类基因或所述一种或多种MHC II类基因不包括HLA
‑
DP B1。32.如权利要求26至30中任一项所述的方法,其中所述MHC特征基因、所述MHC类基因或所述MHC II类基因不是HLA
‑
DPB1。33.如权利要求26至32中任一项所述的方法,其中所述一种或多种MHC类基因包括一种或多种MHC III类基因。34.如权利要求33述的方法,其中所述一种或多种MHCIII类基因包括一种或多种选自由以下组成的组的基因:LST1、LTB、AIF1和TNF。35.如权利要求1至34任一项所述的方法,其中所述一种或多种MHC特征基因包括一种或多种MHC调节基因。36.如权利要求35所述的方法,其中所述一种或多种MHC调节基因包括一种或多种选自由以下组成的组的基因:干扰素调节因子(IRF)基因、活化B细胞的核因子κ
‑
轻链增强子(NF
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κB)家族基因、信号转导及转录激活蛋白(STAT)家族基因、CTCF、CIITA、RFX转录因子家
族基因、SPI1和核转录因子Y(NFY)基因。37.如权利要求36所述的方法,其中所述NF
‑
κB家族基因包括一种或多种选自由以下组成的组的基因:核因子κB亚基1(NFKB1)、NFKB2、RELA、RELB和REL。38.如权利要求36或37所述的方法,其中所述NF
‑
κB家族基因包括NFKB2、RELA或NFKB2和RELA两者。39.如权利要求36至38中任一项所述的方法,其中所述STAT家族基因包括一种或多种选自由以下组成的组的基因:STAT1、STAT2、STAT3、STAT4、STAT5和STAT6。40.如权利要求36至39中任一项所述的方法,其中所述STAT家族基因是STAT2。41.如权利要求36至40中任一项所述的方法,其中所述RFX转录因子家族基因包括一种或多种选自由以下组成的组的基因:RFX1、RFX5、RFX7、RFXAP和RFXANK。42.如权利要求36至41中任一项所述的方法,其中所述IRF基因包括IRF7、IRF8或IRF7和IRF8两者。43.如权利要求35至42中任一项所述的方法,其中所述一种或多种MHC调节基因包括CTCF。44.如权利要求35至43中任一项所述的方法,其中所述一种或多种MHC调节基因包括CIITA。45.如权利要求35至44中任一项所述的方法,其中所述一种或多种MHC调节基因包括SPI1。46.如权利要求36至45中任一项所述的方法,其中所述NFY基因包括NFYA、NFYC或NFYA和NFYC两者。47.如权利要求1至46中任一项所述的方法,其中所述一种或多种ADC第I组标记基因包括一种或多种TLR家族基因。48.如权利要求1至47中任一项所述的方法,其中所述一种或多种TLR家族基因包括一种或多种选自由以下组成的组的基因:TLR9、TLR8和TLR7。49.如权利要求1至48中任一项所述的方法,其中所述一种或多种TLR家族基因不包括TLR3。50.如权利要求1至49中任一项所述的方法,其中所述一种或多种ADC第I组标记基因包括一种或多种白细胞介素受体家族基因。51.如权利要求1至50中任一项所述的方法,其中所述一种或多种白细胞介素受体家族基因包括一种或多种选自由以下组成的组的基因:IL2RA、IL2RB、IL2RG、IL21R、IL27R、IL1RN、IL17RA、IL3RA、IL1R1、IL17RC、IL20RA和IL22RA1。52.如权利要求1至51中任一项所述的方法,其中所述一种或多种白细胞介素受体家族基因包括IL2RA。53.如权利要求1至52中任一项所述的方法,其中所述一种或多种白细胞介素受体家族基因由IL2RA组成。54.如权利要求1至53中任一项所述的方法,其中所述一种或多种ADC第I组标记基因包括一种或多种免疫检查点受体基因。55.如权利要求1至54中任一项所述的方法,其中所述...
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