【技术实现步骤摘要】
西伯利亚杏开花基因PsSOC1
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like及其检测方法、过表达载体构建方法和应用
[0001]本专利技术涉及植物开花时间调节
具体地说是西伯利亚杏开花基因PsSOC1
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like及其检测方法、过表达载体构建方法和应用。
技术介绍
[0002]西伯利亚杏(Prunus sibirica),属蔷薇科(Rosaceae)李亚科(Prunoideae)杏属(Armeniaca Mill.)植物,是我国北方地区重要的经济树种,具有较高的经济价值和营养价值。杏仁含有丰富的蛋白质和脂肪,其蛋白质含量可达34%,含油率可达60%,可榨油或加工成食品与饮料。西伯利亚杏苦杏仁苷含量3.5%
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7.6%,主要作为传统中药使用。同时,西伯利亚杏还具水土保持、抗旱、抗寒、耐贫瘠等特点,是干旱、半干旱区生态建设的优选树种。但是西伯利亚杏由于花期早,易受倒春寒影响,导致其产量大幅下降,使西伯利亚杏的发展受到阻碍。
[0003]到目前为止,共发现了5条植物开花调控途径,分别为光周期途径(Photoperiod pathway)、自主途径(Autonomous pathway)、春化途径(Vernalization pathway)、赤霉素途径(Gibberellin pathway,GApathway)和自身年龄途径(Age pathway),这些途径产生的不同信号因子将传递给开花整合因子,经开花整合因子整合信号后,对花器官的发育进行调控,最后诱导开花。在植物开花整合基因中,SU ...
【技术保护点】
【技术特征摘要】
1.西伯利亚杏开花基因PsSOC1
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like,其特征在于,包含如下任意一类核苷酸序列中的任意一种核苷酸序列:(a)类核苷酸序列:包含PsSOC1
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1基因、PsSOC1
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2基因和PsSOC1
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3基因中的至少一种基因序列的核苷酸序列;PsSOC1
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1基因序列如序列表Seq ID NO.1所示,PsSOC1
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2基因序列如序列表Seq ID NO.2所示,PsSOC1
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3基因序列如序列表Seq ID NO.3所示;(b)类核苷酸序列:与(a)类核苷酸序列互补的核苷酸序列;(c)类核苷酸序列:与(a)类核苷酸序列具有同源性,且同源性大于或等于50%的核苷酸序列;(d)类核苷酸序列:与(a)类核苷酸序列编码相同氨基酸序列的蛋白质的核苷酸序列;(e)类核苷酸序列:编码如序列表Seq ID NO.4、Seq ID NO.5和Seq ID NO.6中所示的至少一种氨基酸序列的核苷酸序列;或者由于至少一个氨基酸残基的替代、缺失或插入而导致编码的氨基酸序列与序列表Seq IDNO.4、Seq ID NO.5和Seq ID NO.6所示的氨基酸序列不同的核苷酸序列;或者编码的氨基酸序列与如序列表Seq ID NO.4、Seq ID NO.5和Seq ID NO.6中所示的至少一种氨基酸序列同源性大于或等于50%的核苷酸序列;(f)类核苷酸序列:为(a)类核苷酸序列、(b)类核苷酸序列、(c)类核苷酸序列、(d)类核苷酸序列和(e)类核苷酸序列中,任意一种核苷酸序列的活性片段;(g)类核苷酸序列:为与(c)类核苷酸序列、(d)类核苷酸序列、(e)类核苷酸序列或(f)类核苷酸序列互补的核苷酸序列。2.西伯利亚杏开花基因PsSOC1
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like的检测方法,其特征在于,具体包括以下步骤:步骤(A
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1)、取含有如权利要求1所述的西伯利亚杏开花基因PsSOC1
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like的西伯利亚杏的植物组织至液氮中进行研磨,并通过试剂盒提取总RNA;步骤(A
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2)、根据提取得到的总RNA反转录得到全长cDNA;步骤(A
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3)、以全长cDNA为模板,利用西伯利亚杏开花基因PsSOC1
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like的上游引物和下游引物进行PCR或qRT
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PCR扩增;步骤(A
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4)、扩增结束后,对PCR产物进行定性或定量检测。3.根据权利要求2所述的西伯利亚杏开花基因PsSOC1
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like的检测方法,其特征在于,定性检测时:PsSOC1
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1基因通过序列表Seq ID NO.7中的上游引物和序列表Seq ID NO.8中的下游引物进行PCR反应扩增;PsSOC1
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2通过序列表Seq ID NO.9中的上游引物和序列表Seq ID NO.10中的下游引物进行PCR反应扩增;PsSOC1
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3通过序列表Seq ID NO.11中的上游引物和序列表Seq ID NO.12中的下游引物进行PCR反应扩增;定量检测时:PsSOC1
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1基因通过序列表Seq ID NO.13中的上游引物和序列表Seq ID NO.14中的下游引物进行qRT
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PCR;PsSOC1
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2通过序列表Seq ID NO.15中的上游引物和序列表Seq ID NO.16中的下游引物进行qRT
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PCR;PsSOC1
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3通过序列表Seq ID NO.17中的上游引物和序列表Seq IDNO.18中的下游引物进行qRT
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PCR。4.根据权利要求2所述的西伯利亚杏开花基因PsSOC1
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like的检测方法,其特征在于,对于PCR扩增:PCR反应总体系的体积为20μL,由cDNA 2μL、上游引物1.0μL、下游引物1.0μL、2
×
Taq Master Mix酶12.5μL和余量的ddH2O组成;PCR扩增程序为:94℃预变性1.5min,94℃变性20s,52℃退火30s,72℃延伸1min,进行30个循环;72℃延伸5min后4℃保存;对于qRT
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PCR:qRT
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PCR内参为西伯利亚杏18s基因和拟南芥TUB2基因;qRT
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PCR的反应
体系的总体积为20μL,由cDNA 1.0μL、上游引物1.0μL、下游引物1.0μL、2
×
SYBR Green qPCR Premix 10μL和余量的ddH2O;PCR的反应程序为:扩增循环:95℃热启动30s,95℃进行10s,60℃进行30s,进行40个循环;熔解程序:扩增循环结束后,60℃升温至95℃,升温5℃/s;每个反应进行4个重复。5.西伯利亚杏开花基因PsSOC1
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like过表达载体的构建方法,其特征在于,具体包括以下步骤:步骤(B
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1)、取含有如权利要求1所述的西伯利亚杏开花基因PsSOC1
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like的西伯利亚杏的幼嫩叶片至液氮中进行研磨,并通过试剂盒提取总RNA;步骤(B
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2)、根据提取得到的总RNA反转录得到全长cDNA;步骤(B
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3)、以全长cDNA为模板,利用西伯利亚杏开花基因PsSOC1
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like的上游引物和下游引物进行PCR扩增;步骤(B
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4)、扩增结束后,对PCR产物进行凝胶电泳并回收,再将回收的PCR产物交换到入门载体中,获得重组入门载体;步骤(B
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5)提取重组入门载体的质粒,并将质粒中的PsSOC1
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like基因片段交换至植物表达载体中,即获取得到西伯利亚杏开花基因PsSOC1
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like过表达载体。6.根据权利要求5所述的西伯利亚杏开花基因PsSOC1
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like过表达载体的构建方法,其特征在于,步骤(B
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3)中,PsSOC1
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1基因的上游引物为序列表Seq ID NO.19中的核苷酸序列,PsSOC1
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1基因的下游引物为序列表Seq ID NO.20中的核苷酸序列;PsSOC1
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2基因的上游引物为序列表Seq ID NO.21中的核苷酸序列,PsSOC1
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2基因的下游引物为序列表Seq ID NO.22中的核苷酸序列;PsSOC1
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3基因的上游引物为序列表Seq ID NO.23中的核苷酸序列,PsSOC1
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3基因的下游引物为序列表Seq ID NO.24中的核苷酸序列。7.根据权利要求5所述的西伯利亚杏开花基因PsSOC1
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like过表达载体的构建方法,其特征在于,步骤(B
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4)中,PCR产物通过Gateway BP Clonase反应交换到Gateway系统的入门载体pDONR207中,获得重组入门载体;步骤(B
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5)中,提取重组入门载体的pDONR207
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PsSOC1
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like质粒,使用Gateway LR Clonase系统将PsSOC1
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like基因片段交换到植物表达载体pMDC32中,构建得到重组质粒pMDC32
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PsSOC1
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like即为西伯利亚杏开花基因PsSOC1
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like过表达载体。8.根据权利要求7所述的西伯利亚杏开花基因PsSOC1
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like过表达载体的构建方法,其特征在于,步骤(B
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3)中,PCR扩增时,PCR反应总体系的体积为...
【专利技术属性】
技术研发人员:王淋,蔺悦,包文泉,敖敦,陈俊兴,乌云塔娜,徐宛玉,陈一潇,
申请(专利权)人:中国林业科学研究院经济林研究所,
类型:发明
国别省市:
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