一种用于检测HPV的引物与探针组合制造技术

技术编号:37490493 阅读:38 留言:0更新日期:2023-05-07 09:29
本发明专利技术提供了一种用于检测HPV的引物与探针组合。本发明专利技术的通用引物与通用探针组合,通过将特异性引物与探针组合1)至12)中的正向引物增加17)同源重复序列,使得正向特异性引物变成50

【技术实现步骤摘要】
一种用于检测HPV的引物与探针组合


[0001]本专利技术涉及生物检测
,尤其涉及一种用于检测HPV的引物与探针组合。

技术介绍

[0002]人乳头瘤病毒(HPV)是一种DNA病毒,通常感染人类皮肤和粘膜细胞,主要通过性行为传播。
[0003]HPV的基因组可分为三个区域,早期区域(E区)、晚期区域(L区)和非编码区域(NCR)。E区可分为7个开放阅读框(E1~E7),主要编码参与病毒复制、转录、调控和细胞转化的蛋白。L区可分为L1区和L2区,L1区分别编码主要衣壳蛋白和次要衣壳蛋白。总共发现了200多种HPV亚型。根据这些亚型对生殖道相关肿瘤的毒性和致癌风险可将它们分为高危型和低危型。常见的低危型如HPV6、HPV11、HPV42、HPV43等,会引起良性病变,如外部生殖器疣。高危型,如HPV16、HPV18、HPV31、HPV33、HPV35、HPV39、HPV45、HPV51、HPV52、HPV56、HPV58、HPV59、HPV68可以引起宫颈癌和宫颈上皮内瘤病变。
[0004]HPV检测技术包括细胞学方法、HPV DNA检测方法和HPV mRNA检测方法。细胞学检测方法,如巴氏涂片和液基细胞学检测,灵敏度低,对诊断医师的要求较高。mRNA检测方法对CIN2(宫颈上皮内瘤变2期)后宫颈病变的检测具有良好的特异性,但以mRNA作为检测靶点,对临床标本采集、保存、核酸提取等有较高的要求。
[0005]目前人乳头瘤病毒DNA检测技术根据原理可分为以下几种:杂交捕获

化学发光法、测序法、表面等离子谐振法、PCR毛细管电泳法、恒温扩增

荧光法、流式荧光杂交法、基因芯片法、PCR

反向点杂交法、荧光实时定量PCR法;上述检测由于检测流程复杂,成本高昂等原因给HPV检测的发展造成了一定的困难。因此降低HPV检测的成本,对预防女性宫颈癌的发生是具有积极作用的。

技术实现思路

[0006]本专利技术的主要目的是提出一种用于检测HPV的引物与探针组合,旨在解决现有的HPV检测技术检测流程复杂且成本高昂的技术问题。
[0007]为实现上述目的,本专利技术提出的用于检测HPV的引物与探针组合,包括以下引物与探针组合中的一种或多种:1)HPV31型:正向引物HPV31

F:寡核苷酸序列如SEQ ID NO1,反向引物HPV31

R:寡核苷酸序列如SEQ ID NO2;2)HPV33型:正向引物HPV33

F:寡核苷酸序列如SEQ ID NO3,反向引物HPV33

R:寡核苷酸序列如SEQ ID NO4;3)HPV35型:正向引物HPV35

F:寡核苷酸序列如SEQ ID NO5,
反向引物HPV35

R:寡核苷酸序列如SEQ ID NO6;4)HPV39型:正向引物HPV39

F:寡核苷酸序列如SEQ ID NO7,反向引物HPV39

R:寡核苷酸序列如SEQ ID NO8;5)HPV45型:正向引物HPV45

F:寡核苷酸序列如SEQ ID NO9,反向引物HPV45

R:寡核苷酸序列如SEQ ID NO10;6)HPV51型:正向引物HPV51

F:寡核苷酸序列如SEQ ID NO11,反向引物HPV51

R:寡核苷酸序列如SEQ ID NO12;7)HPV52型:正向引物HPV52

F:寡核苷酸序列如SEQ ID NO13,反向引物HPV52

R:寡核苷酸序列如SEQ ID NO14;8)HPV56型:正向引物HPV56

F:寡核苷酸序列如SEQ ID NO15,反向引物HPV56

R:寡核苷酸序列如SEQ ID NO16;9)HPV58型:正向引物HPV58

F:寡核苷酸序列如SEQ ID NO17,反向引物HPV58

R:寡核苷酸序列如SEQ ID NO18;10)HPV59型:正向引物HPV59

F:寡核苷酸序列如SEQ ID NO19,反向引物HPV59

R:寡核苷酸序列如SEQ ID NO20;11)HPV66型:正向引物HPV66

F:寡核苷酸序列如SEQ ID NO21,反向引物HPV66

R:寡核苷酸序列如SEQ ID NO22;12)HPV68型:正向引物HPV68

F:寡核苷酸序列如SEQ ID NO23,反向引物HPV68

R:寡核苷酸序列如SEQ ID NO24;13)HPV16型:正向引物HPV16

F:寡核苷酸序列如SEQ ID NO25,反向引物HPV16

R:寡核苷酸序列如SEQ ID NO26,探针HPV16

P:寡核苷酸序列如SEQ ID NO31;14)HPV18型:正向引物HPV18

F:寡核苷酸序列如SEQ ID NO27,反向引物HPV18

R:寡核苷酸序列如SEQ ID NO28,探针HPV18

P:寡核苷酸序列如SEQ ID NO32;15)β

actin型:正向引物β

actin

F:寡核苷酸序列如SEQ ID NO29,反向引物β

actin

R:寡核苷酸序列如SEQ ID NO30,
探针β

actin

P:寡核苷酸序列如SEQ ID NO33;其中,所述组合1)至组合12)中的正向引物均需要在其5

端加上17)同源重复序列,并与组合16)中的通用引物和通用探针一同使用,所述组合16)包括通用探针UP

P:寡核苷酸序列如SEQ ID NO34,通用引物UP

F:寡核苷酸序列如SEQ ID NO36;所述17)同源重复区的寡核苷酸序列如SEQ ID NO35。
[0008]可选地,所述组合13)至组合16)中的每个探针的5

端均附有荧光染料;所述组合13)至组合16)中的每个探针的3

端均附有荧光猝灭基团。
[0009]可选地,所述荧光染料包括FAM、FITC、TET、HEX、VIC、TAMRA、ROX、Cy3、Cy3.5、Cy5、Cy5.5、Texas Red、LCRed610。
[0010]可选地,所述荧光猝灭基团包括Dabcyl、BBQ

650、Eclipse、BHQ

1、BHQ

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【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种用于检测HPV的引物与探针组合,其特征在于,包括以下引物与探针组合中的一种或多种:1)HPV31型:正向引物HPV31

F:寡核苷酸序列如SEQ ID NO1,反向引物HPV31

R:寡核苷酸序列如SEQ ID NO2;2)HPV33型:正向引物HPV33

F:寡核苷酸序列如SEQ ID NO3,反向引物HPV33

R:寡核苷酸序列如SEQ ID NO4;3)HPV35型:正向引物HPV35

F:寡核苷酸序列如SEQ ID NO5,反向引物HPV35

R:寡核苷酸序列如SEQ ID NO6;4)HPV39型:正向引物HPV39

F:寡核苷酸序列如SEQ ID NO7,反向引物HPV39

R:寡核苷酸序列如SEQ ID NO8;5)HPV45型:正向引物HPV45

F:寡核苷酸序列如SEQ ID NO9,反向引物HPV45

R:寡核苷酸序列如SEQ ID NO10;6)HPV51型:正向引物HPV51

F:寡核苷酸序列如SEQ ID NO11,反向引物HPV51

R:寡核苷酸序列如SEQ ID NO12;7)HPV52型:正向引物HPV52

F:寡核苷酸序列如SEQ ID NO13,反向引物HPV52

R:寡核苷酸序列如SEQ ID NO14;8)HPV56型:正向引物HPV56

F:寡核苷酸序列如SEQ ID NO15,反向引物HPV56

R:寡核苷酸序列如SEQ ID NO16;9)HPV58型:正向引物HPV58

F:寡核苷酸序列如SEQ ID NO17,反向引物HPV58

R:寡核苷酸序列如SEQ ID NO18;10)HPV59型:正向引物HPV59

F:寡核苷酸序列如SEQ ID NO19,反向引物HPV59

R:寡核苷酸序列如SEQ ID NO20;11)HPV66型:正向引物HPV66

F:寡核苷酸序列如SEQ ID NO21,反向引物HPV66

R:寡核苷酸序列如SEQ ID NO22;12)HPV68型:正向引物HPV68

F:寡核苷酸序列如SEQ ID NO23,反向引物HPV68

R:寡核苷酸序列如SEQ ID NO24;13)HPV16型:
正向引物HPV16

F:寡核苷酸序列如SEQ ID NO25,反向引物HPV16

R:寡核苷酸序列如SEQ ID NO26,探针HPV16

P:寡核苷酸序列如SEQ ID NO31;14)HPV18型:正向引物HPV18

F:寡核苷酸序列如SEQ...

【专利技术属性】
技术研发人员:杨林叶伦汪玉洲
申请(专利权)人:杭州迪英加科技有限公司
类型:发明
国别省市:

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