【技术实现步骤摘要】
荧光簇的中心定位方法、装置、终端设备及可读存储介质
[0001]本专利技术涉及基因组测序
,尤其涉及一种荧光簇的中心定位方法、装置、终端设备及计算机可读存储介质。
技术介绍
[0002]通过对生物样本进行全基因组测序,挖掘和分析基因组中的变异信息,可以对研究疾病的产生、治疗及预防有着重要的意义。而高通量基因组测序技术(Next Generation Sequencing,NGS,又称下一代基因组测序技术),因其具有高度并行化、高通量、高速度、低成本、高准确性等优点,也被广泛应用于微生物样本、模式生物或人类样本的基因组碱基序列的标定。
[0003]另一方面,荧光簇中心定位与亮度提取是实现碱基正确识别的基础。传统的荧光簇中心定位主要是假设荧光簇近似为圆,然后利用霍夫变换对荧光簇进行圆检测以将圆心坐标认定为簇中心,且提取簇亮度则是通过插值算法计算簇中心的亮度,并将该亮度视为荧光簇的亮度。
[0004]然而,在实际进行荧光簇中心定位与亮度提取时,常常存在多个荧光簇互相黏连或荧光簇圆度较差的情形,如此,传统在假设 ...
【技术保护点】
【技术特征摘要】
1.一种荧光簇的中心定位方法,其特征在于,所述荧光簇的中心定位方法包括:确定荧光图像中的子图像块与预设的各荧光簇模板之间的亮度互相关系数,其中,各所述荧光簇模板各自的亮度分布不同;根据所述亮度互相关系数确定所述子图像块是否存在荧光簇;在确定所述子图像块存在荧光簇时,根据所述荧光簇的亮度分布和所述荧光簇内的亮度最大值点,对所述荧光簇进行中心定位得到簇中心。2.如权利要求1所述的荧光簇的中心定位方法,其特征在于,在对所述荧光簇进行中心定位得到簇中心的步骤之后,所述方法还包括:确定所述簇中心为圆心,并计算所述圆心预设半径范围内的像素点亮度平均值;将所述像素点亮度平均值减去所述所述荧光图像的背景亮度值以得到所述荧光簇的亮度。3.如权利要求1所述的荧光簇的中心定位方法,其特征在于,所述根据所述荧光簇的亮度分布和所述荧光簇内的亮度最大值点,对所述荧光簇进行中心定位得到簇中心的步骤,包括:选择所述荧光簇内的亮度最大值点作为所述荧光簇的待定中心;根据所述荧光簇的亮度分布计算所述待定中心各方向的坐标偏移量;按照所述坐标偏移量进行加权计算以对所述待定中心进行精定位得到所述荧光簇的簇中心。4.如权利要求1所述的荧光簇的中心定位方法,其特征在于,所述确定荧光图像中的子图像块与预设的各荧光簇模板之间的亮度互相关系数的步骤,包括:将所述荧光图像划分为多个小窗口,并逐一检测各所述小窗口中的子图像块;在检测到子图像块时,计算所述子图像块与预设的各荧光簇模板之间的亮度互相关系数。5.如权利要求4所述的荧光簇的中心定位方法,其特征在于,所述在检测到子图像块时,计算所述子图像块与预设的各荧光簇模板之间的亮度互相关系数的步骤,包括:在多个所述窗口中的第一窗口中检测到子图像块时,获取所述第一窗口的窗口尺寸和所述子图像块的图像亮度系数;根据所述窗口尺寸、所述图像亮度系数和各所述荧光簇模板的模...
【专利技术属性】
技术研发人员:唐苏明,
申请(专利权)人:中元汇吉生物技术股份有限公司,
类型:发明
国别省市:
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