【技术实现步骤摘要】
一种基于内镜图像深度卷积网络模型的训练方法,应用及装置
[0001]本专利技术设计图像处理领域,更具体地,涉及一种基于内镜图像深度卷积网络模型的训练方法,应用及装置。
技术介绍
[0002]结直肠癌(Colorectalcancer:CRC)是全球发病率第三高(6.1%)和死亡率第二高(9.2%)的癌症。在中国,结直肠癌是仅次于肺癌和胃癌的第三大高发癌症。根据统计数据显示,每年新发病例42.92万人,死亡病例28.14万人,防控形势严峻。
[0003]结直肠癌患者一般具有dMMR和MSI,dMMR(mismatchrepairdeficiency)是指错配修复功能缺陷,MSI(microsatelliteinstability)是指微卫星不稳定。MMR(mismatchrepair)是指错配修复功能,这是一种DNA修复途径,其缺陷(即dMMR)会导致细胞内大量的基因发生变异,并且无法修复。在结直肠癌患者中15%是错配修复缺陷肿瘤。错配修复缺陷导致人体无法修复某些类别的突变,进而导致变负荷和微卫星不稳定(MSI >‑
H)。本文档来自技高网...
【技术保护点】
【技术特征摘要】
1.一种基于内镜图像深度卷积网络模型的训练方法,用于训练包含MMR内镜分类器的学习模型,其特征在于,包括:S1:收集结直肠癌患者的带有结直肠镜图像的结肠镜检查程序报告,病理报告和IHC测试报告,根据报告给图像标记结直肠癌dMMR或pMMR类型状态;S2:将收集的结肠镜图像,删除黑色背景,裁剪边框以保留中心图像;S3:将中心图像馈送到结直肠肿瘤分类器中进行预分析,提取符合标准的结直肠肿瘤图像;S4:将提取的结直肠肿瘤图像进行预处理;S5:将图像分为dMMR及pMMR平衡的训练数据集,验证数据集和测试数据集,并对其进行数据增强操作;S6:将训练数据集的dMMR和pMMR信息输入到resnet50模型中进行数据增强和模型训练,并使用迁移学习和渐进式调整大小的方式提高训练效率,获得结直肠癌MMR分类器;S7:基于验证数据集和测试数据集验证和测试结直肠癌MMR分类器,并根据结果更新结直肠癌MMR分类器的精度,获取训练好的MMR
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Scopy模型,用于对输入的结直肠癌图像dMMR和pMMR的概率进行预测。2.根据权利要求1所述的一种基于内镜图像深度卷积网络模型的训练方法,其特征在于,所述预处理包括:随机剪裁图像的不同部分,然后采用挤压方法将剪裁出来的图像压缩为460x460像素,剪裁面积占图像面积的65%~80%。3.根据权利要求1所述的一种基于内镜图像深度卷积网络模型的训练方法,其特征在于,所述数据增强的操作包括:将图像转换为大小224
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224的新图像;将图像水平或垂直翻转;将图像进行随机放大,随机放大的倍率为0.9~1;将图像进行随机缩小,随机缩小的倍率1~1.2;将图像进行随机旋转,随机旋转的最大角度为30度;随机调整图像的亮度变化,最大变化为20%,亮度和对比度的调整概率为0.75的随机仿射变换;将图像进行随机翘曲变换。4.根据权利要求1所述的一种基于内镜图像深度卷积网络模型的训练方法,其特征在于,步骤S6中所述对于训练数据集的数据增强包括:基于cutmix策略对训练数据集中的图像进行数据增强,所述cutmix策略的alpha参数介于0.5
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1之间。5.根据权利要求1所述的一种基于内镜图像深度卷积网络模型的训练方法,其特征在于,所述渐进式调整大小训练分为九个阶段,具体为:S601:输入图像的大小调整为64
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64像素,然后在应用随机变换以进行增强后调整为224x224像素,所述resnet50在这个输入集上微调了10个epochs,Cutmix的alpha参数设置为0.5并开始训练,用于重叠区域;S602:输入图像的大小调整为128
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128像素,然后在应用随机变换以进行增强后调整
为224x224像素,上一步的模型在此输入集上微调11个epochs,cutmix的alpha参数设置为0.5;S603:输入图像的大小调整为224
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224像素,然后在应用随机变换以进行增强后调整为224x224像素,上一步的模型在此输入集上微调12个epochs,cutmix的alpha参数设置为0.5;S604:输入图像的大小调整为224
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224像素,然后在应用随机变换进行增强后调整为448x448像素,上一步的模型在这个输入集上微调了13个epochs,cutmix的alph...
【专利技术属性】
技术研发人员:廖刚,韩明,胡健聪,张树人,胡浩,
申请(专利权)人:广州艾普凌智技术有限公司,
类型:发明
国别省市:
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