本发明专利技术提供了与鸡腹脂率相关的SNP遗传标记，属于鸡遗传标记和鸡遗传育种技术领域，所述SNP遗传标记包括FR_tag3，所述FR_tag3对应于NCBI中公布的鸡参考基因组bGalGal1.mat.broiler.GRCg7b版本序列信息3号染色体第81057418位，属于基因COL12A1下游序列，此处碱基为G或A。所述SNP遗传标记有助于遗传上改善蛋鸡腹脂过度沉积问题，可用于基因组选择或分子标记辅助选择。本发明专利技术还提供了与鸡腹脂率相关的SNP遗传标记在鸡遗传育种中的应用。应用。应用。
【技术实现步骤摘要】
与鸡腹脂率相关的SNP遗传标记及其应用
[0001]本专利技术属于鸡遗传标记和鸡遗传育种
，特别涉及与鸡腹脂率相关的SNP遗传标记及其应用。
技术介绍
[0002]脂肪，除了提供机械缓冲、隔热功能之外，还承担储存能量的作用。于鸡而言，适量的脂肪沉积是维持正常生理功能必要条件，然而，过量的腹脂沉积则会导致鸡体肥胖、血压升高、脂肪肝等疾病，并且降低产蛋性能、减少养殖收益。腹脂沉积能力受微效多基因调控，是长期进化产物，具有群体特异性。鸡在不同发育时期，调控腹脂沉积的信号通路不尽相同(Leanness in domestic birds:genetic,metabolic and hormonal aspects[M].Elsevier,2014)。所以，蛋鸡选育不能完全套用商品肉鸡腹脂相关遗传标记。
[0003]鸡的腹部脂肪主要由甘油三酯组成，是代谢终端产物，虽然贮存高能量，但化学性质稳定，过度腹脂沉积会消耗大量能量，因为形成单位重量的脂肪比同等重量肌肉多消耗三倍的饲料。鸡的腹脂沉积主要由遗传、营养、饲养管理因素影响，而从经济学角度来看，遗传选育是解决腹脂过度沉积优选手段。然而，蛋鸡腹脂沉积多发生在产蛋后期，难于测量，导致蛋鸡腹脂性状选育进展缓慢。
技术实现思路
[0004]为了解决鸡腹脂沉积的遗传调控问题，本专利技术提供了与鸡腹脂率相关的SNP遗传标记，所述SNP遗传标记有助于遗传上改善蛋鸡腹脂过度沉积问题，可用于产蛋鸡种基因组选择或分子标记辅助选择。
[0005]本专利技术还提供了与鸡腹脂率相关的SNP遗传标记在鸡遗传育种中的应用。
[0006]本专利技术通过以下技术方案实现：
[0007]与鸡腹脂率相关的SNP遗传标记，所述SNP遗传标记包括FR_tag3，所述FR_tag3对应于NCBI中公布的鸡参考基因组bGalGal1.mat.broiler.GRCg7b版本序列信息3号染色体第81057418位，属于基因COL12A1下游序列，此处碱基为G或A。
[0008]基于同一专利技术构思，本申请提供一种与鸡腹脂率相关的SNP遗传标记在鸡遗传育种中的应用。
[0009]基于同一专利技术构思，本申请提供一种鸡腹脂率性状的早期选择方法，所述早期选择方法包括基于SNP遗传标记FR_tag3的基因型对鸡腹脂率性状进行早期选择；
[0010]所述FR_tag3对应于NCBI中公布的鸡参考基因组bGalGal1.mat.broiler.GRCg7b版本序列信息3号染色体第81057418位，属于基因COL12A1下游序列，此处碱基为G或A。
[0011]进一步，所述早期选择方法具体包括：
[0012]检测待测鸡FR_tag3的基因型；
[0013]基于所述FR_tag3的基因型对待测鸡的腹脂率性状进行早期选择；
[0014]其中，所述FR_tag3的GG基因型个体的腹脂率小于GA基因型个体的腹脂率，GA基因
型个体的腹脂率小于AA基因型个体的腹脂率。
[0015]进一步的，所述检测待测鸡FR_tag3的基因型，具体包括：
[0016]以Pr_FR3f和Pr_FR3r为引物，对待测鸡的基因组DNA进行PCR扩增；
[0017]对PCR扩增产物进行测序，获得待测鸡3号染色体第81057418位的基因型；
[0018]其中，所述Pr_FR3f的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示，所述Pr_FR3r的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示。
[0019]基于同一专利技术构思，本申请提供用于检测与鸡腹脂率相关的SNP遗传标记的引物，所述引物包括Pr_FR3f和Pr_FR3r，所述Pr_FR3f的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示，所述Pr_FR3r的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示。
[0020]基于同一专利技术构思，本申请提供引物Pr_FR3f和Pr_FR3r在鸡遗传育种中的应用。
[0021]基于同一专利技术构思，本申请提供一种试剂盒，所述试剂盒包含引物Pr_FR3f和Pr_FR3r。
[0022]基于同一专利技术构思，本申请提供上述一种试剂盒在鸡遗传育种中的应用。
[0023]本专利技术实施例中的一个或多个技术方案，至少具有如下技术效果或优点：
[0024]1.本专利技术与鸡腹脂率相关的SNP遗传标记，涉及的SNP遗传标记为FR_tag3，可用于降低蛋鸡的腹脂沉积能力，从而实现从遗传上改善鸡腹脂率，可用于基因组选择或分子标记辅助选择。
[0025]2.本专利技术与鸡腹脂率相关的SNP遗传标记在鸡遗传育种中的应用，将SNP遗传标记FR_tag3应用于鸡的遗传育种中，能够辅助筛选出腹脂沉积能力低的蛋鸡，从遗传上减少蛋鸡在产蛋后期出现的鸡体肥胖、血压升高和脂肪肝等疾病，避免产蛋后期产蛋性能降低、造成养殖收益受损。
[0026]3.本专利技术用于检测与鸡腹脂率相关的SNP遗传标记的引物，针对SNP遗传标记设计的Pr_FR3f和Pr_FR3r中的任意一种或两种引物，用于对待测鸡遗传位点的扩增、鉴定，特异性强，准确率高，为鸡育种提供坚实基础。
附图说明
[0027]为了更清楚地说明本专利技术实施例中的技术方案，下面将对实施例描述中所需要使用的附图作一简单地介绍，显而易见地，下面描述中的附图是本专利技术的一些实施例，对于本领域普通技术人员来讲，在不付出创造性劳动的前提下，还可以根据这些附图获得其它的附图。
[0028]图1为本专利技术实施例1资源群体腹脂率GWAS分析曼哈顿图；
[0029]图2为本专利技术实施例1资源群体腹脂率GWAS分析QQ图；
[0030]图3为本专利技术实施例2不同基因型腹脂率比较图。
具体实施方式
[0031]下文将结合具体实施方式和实施例，具体阐述本专利技术，本专利技术的优点和各种效果将由此更加清楚地呈现。本领域技术人员应理解，这些具体实施方式和实施例是用于说明本专利技术，而非限制本专利技术。
[0032]在整个说明书中，除非另有特别说明，本文使用的术语应理解为如本领域中通常
所使用的含义。因此，除非另有定义，本文使用的所有技术和科学术语具有与本专利技术所属领域技术人员的一般理解相同的含义。若存在矛盾，本说明书优先。
[0033]除非另有特别说明，本专利技术中用到的各种原材料、试剂、仪器和设备等，均可通过市场购买得到或者可通过现有方法制备得到。
[0034]下面将结合实施例及实验数据对本申请与鸡腹脂率相关的SNP遗传标记进行详细说明。
[0035]实施例1
[0036]资源群体构建与GWAS分析
[0037]以F2设计构建蛋鸡资源群体。即：以东乡绿壳蛋鸡、白来航鸡为亲本，经正反交获得F1代、F2代。试验鸡单笼饲养，机械化喂料、清粪。按着江苏省家禽研究所制定的免疫程序进行常规免疫。于72周龄(产蛋后期)进行屠宰，屠宰前夜断料不断水。共有1534只母鸡进行宰前称重，以一次性注射器从试验鸡翅静脉采集血样2ml左右，置入BD本文档来自技高网...
【技术保护点】
【技术特征摘要】
1.与鸡腹脂率相关的SNP遗传标记，其特征在于，所述SNP遗传标记包括FR_tag3，所述FR_tag3对应于NCBI中公布的鸡参考基因组bGalGal 1.mat.broiler.GRCg7b版本序列信息3号染色体第81057418位，属于基因COL12A1下游序列，此处碱基为G或A。2.一种如权利要求1所述的与鸡腹脂率相关的SNP遗传标记在鸡遗传育种中的应用。3.一种鸡腹脂率性状的早期选择方法，其特征在于，所述早期选择方法包括基于SNP遗传标记FR_tag3的基因型对鸡腹脂率性状进行早期选择；所述FR_tag3对应于NCBI中公布的鸡参考基因组bGalGal 1.mat.broiler.GRCg7b版本序列信息3号染色体第81057418位，属于基因COL12A1下游序列，此处碱基为G或A。4.根据权利要求3所述的一种鸡腹脂率性状的早期选择方法，其特征在于，所述早期选择方法具体包括：检测待测鸡FR_tag3的基因型；基于所述FR_tag3的基因型对待测鸡的腹脂率性状进行早期选择；其中，所述FR_tag3的...
【专利技术属性】
技术研发人员：童海兵，郭军，邵丹，王强，李永峰，窦套存，曲亮，王克华，
申请(专利权)人：云南恒于科技有限公司，
类型：发明
国别省市：
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