基于KASP技术开发的用于工业大麻品种鉴定的核心SNP标记集制造技术

基于KASP技术开发的用于工业大麻品种鉴定的核心SNP标记集。本发明专利技术提供了一种检测SNP位点的试剂，所述试剂用于检测SNP位点1～33中的一个或几个。通过对国内外代表性大麻种质资源进行全基因组重测序，获得SNP位点，基于检出率达到100％、最小等位基因频率>0.4和在每条染色体均匀分布这三个筛选标准，最终获得32个核心SNP位点，设计对应引物，对11份工业大麻品种(或种质资源)进行KASP检测。此外，基于CBDAS(大麻二酚酸合成酶)和THCAS(四氢大麻酚酸合成酶)两个等位基因的序列多态性，获得一个用于鉴定低毒型大麻(四氢大麻酚<0.3％)的特异性SNP位点，设计对应引物，对25份工业大麻品种(或种质资源)进行KASP检测。该SNP分子标记集不仅丰富了工业大麻分子标记，还可以广泛的应用于工业大麻品种进行基因分型、分子鉴别、纯度检测、SNP指纹图库构建和分子标记辅助育种等方面的应用。等方面的应用。等方面的应用。

【技术实现步骤摘要】
基于KASP技术开发的用于工业大麻品种鉴定的核心SNP标记集


[0001]本专利技术专利涉及分子生物学
，具体涉及基于KASP技术开发的用于工业大麻品种鉴定的核心SNP标记集。

技术介绍

[0002]大麻(Cannabis sativaL.)又名火麻、线麻、寒麻、汉麻等，是大麻科大麻属一年生草本植物，在世界各地广泛分布。工业大麻是指通过遗传改良后，植物群体花期顶部叶片及花穗干物质中的四氢大麻酚(THC)含量<0.3％，不能作为毒品利用的大麻作物品种类型，工业大麻没有毒品利用价值，但在纺织材料、建筑材料、复合材料、食用、药用、日化用品及土壤修复改良等方面具有广泛应用价值。
[0003]随着近年来工业大麻品种数量快速增长，急需研发工业大麻品种精准鉴定技术，以保护新品种知识产权，助推产业安全、健康发展。
[0004]伴随着基因组学和分子生物学的发展，分子标记技术已经广泛应用于种质资源遗传多样性、品种鉴定以及基因挖掘等应用中，植物基因组中包含着丰富的单碱基插入、缺失转换和颠倒等变，利用这些变异开发的单核苷酸多态性(S本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.基于KASP技术开发的用于工业大麻品种鉴定的核心SNP标记集，其特征在于，所述工业大麻核心SNP分子标记集包括33个SNP标记，所述33个SNP标记的编号为SNP1～33，所述1～32个SNP位点如下：所述SNP位点1标记为碱基T/C，位于大麻基因组序列NC_044371.1的第6624289位；所述SNP位点2标记为碱基A/T，位于大麻基因组序列NC_044371.1的第21262401位；所述SNP位点3标记为碱基G/T，位于大麻基因组序列NC_044371.1的第37500524位；所述SNP位点4标记为碱基G/A，位于大麻基因组序列NC_044371.1的第53677172位；所述SNP位点5标记为碱基T/C，位于大麻基因组序列NC_044371.1的第74696814位；所述SNP位点6标记为碱基C/T，位于大麻基因组序列NC_044371.1的第76426692位；所述SNP位点7标记为碱基T/A，位于大麻基因组序列NC_044371.1的第83675323位；所述SNP位点8标记为碱基G/A，位于大麻基因组序列NC_044371.1的第100945616位；所述SNP位点9标记为碱基G/T，位于大麻基因组序列NC_044375.1的第17100309位；所述SNP位点10标记为碱基A/G，位于大麻基因组序列NC_044375.1的第26654317位；所述SNP位点11标记为碱基T/C，位于大麻基因组序列NC_044375.1的第46646746位；所述SNP位点12标记为碱基G/A，位于大麻基因组序列NC_044375.1的第88901914位；所述SNP位点13标记为碱基A/T，位于大麻基因组序列NC_044375.1的第92822053位；所述SNP位点14标记为碱基A/T，位于大麻基因组序列NC_044372.1的第1880066位；所述SNP位点15标记为碱基G/A，位于大麻基因组序列NC_044372.1的第3603067位；所述SNP位点16标记为碱基C/T，位于大麻基因组序列NC_044372.1的第7557384位；所述SNP位点17标记为碱基G/A，位于大麻基因组序列NC_044372.1的第25156527位；所述SNP位点18标记为碱基C/T，位于大麻基因组序列NC_044372.1的第64540738位；所述SNP位点19标记为碱基C/A，位于大麻基因组序列NC_044373.1的第869764位；所述SNP位点20标记为碱基A/C，位于大麻基因组序列NC_044373.1的第4884699位；所述SNP位点21标记为碱基G/C，位于大麻基因组序列NC_044373.1的第30968365位；所述SNP位点22标记为碱基G/T，位于大麻基因组序列NC_044373.1的第32615917位；所述SNP位点23标记为碱基A/T，位于大麻基因组序列NC_044373.1的第38487893位；所述SNP位点24标记为碱基C/A，位于大麻基因组序列NC_044373.1的第79302742位；所述SNP位点25标记为碱基G/T，位于大麻基因组序列NC_044373.1的第84524179位；所述SNP位点26标记为碱基T/C，位于大麻基因组序列NC_044374.1的第18982824位；所述SNP位点27标记为碱基T/C，位于大麻基因组序列NC_044...

【专利技术属性】
技术研发人员：陈璇，杨明，郭孟璧，许艳萍，吕品，张庆滢，张园，郭蓉，郭鸿彦，周佳，
申请(专利权)人：云南省农业科学院经济作物研究所，
类型：发明
国别省市：