靶向冠状病毒基因的基因沉默剂及其用途制造技术

本发明专利技术提供了基因沉默剂，其能够沉默体内外冠状病毒(例如SARS

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】靶向冠状病毒基因的基因沉默剂及其用途
相关申请的交叉引用
[0001]本申请要求于2020年3月18日提交的美国临时申请62/991,580和于2020年10月16日提交的美国临时申请63/092,801的优先权并要求享有该申请的权益，该临时专利申请的完整内容引入本申请当中作为参考。


[0002]本专利技术基本上涉及基因沉默剂领域用于靶向冠状病毒(CoV)基因(例如SARS
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CoV
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2)，以及使用此类基因沉默剂在体内和体外降低冠状病毒蛋白水平或病毒滴度的方法，以及治疗冠状病毒感染(例如COVID
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19)的受试者的方法，或预防冠状病毒感染的方法。专利技术背景
[0003]近年来全球流行的COVID
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19属于数量庞大的单链RNA病毒中的一种，单链RNA病毒曾经导致2012年的中东呼吸综合征(MERS)和2003年的严重急性呼吸道综合征(SARS)，这两种疾病都是由动物传染给人类的，这种严重的呼吸道感染需要紧急医疗解决方案(Zhu,N.,2019)。
[0004]COVID
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19对81％的患者为轻度，总病死率为2
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3％。该病的严重程度似乎与年龄有关，处于危险之中的患者老年人居多；80岁以上患者的病死率(CFR)为15％。CFR在那些患有合并症的患者中提高，合并症包含心血管疾病、糖尿病、慢性呼吸道疾病、高血压和癌症。死亡原因是呼吸衰竭，休克或多器官衰竭(Fisher and Heymann,2020)。
[0005]目前尚无特异性治疗方法可以在大多数患者体内抑制CoVs复制。基因沉默技术被认为是最有希望的药物开发技术之一，包含ASO(单链反义寡核苷酸)和RNAi(双链干扰RNA)。合理设计的aiRNA，siRNA，ASO或其他靶向基因的基因沉默剂可用于治疗冠状病毒感染。
[0006]不对称干扰RNA(aiRNA)是一类双链RNA分子，在RNA干扰(RNAi)通路内发挥作用。aiRNA通过降解转录后的mRNA，阻止翻译，干扰与其具有互补的核苷酸序列的特定基因的表达，(Sun,X,et al2008)。这里强调的是，RNAi可能是一种控制当前COVID
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19爆发的有希望的方法。目前，没有针对晚期COVID
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19患者的特定的治疗方案。虽然新出现的疫苗应该能够限制SARS
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CoV
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2病毒的传播，并最终控制COVID
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19疾病的公共传播。但对于那些已经患上COVID
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19疾病的人来说，防止死亡和降低发病率的迫切的医疗需求尚未得到满足。设计以病毒为靶点的小分子有一个缺点，即需要几年的时间来优化具有能够到达靶点的可接受的生物功能水平的先导分子(Kunisaki,K.M.,2009和Hodgson,J.,2020)。此外，为了开发有效的小分子疗法(如蛋白酶抑制剂/核苷类似物，和疫苗)，研究人员需要了解病毒的结构和功能(Lu,H.,2020)。aiRNAs的使用可以克服上述选项带来的限制，aiRNAs可以针对不可成药靶点(Levanova,A.,2018和Lam,J.K.,2015)，一个额外的优势是我们能够使用先进的生物信息学工具快速、准确地设计基于aiRNA的疗法。因此，迫切地需要一种有效的基因沉默剂(如aiRNAs)，以对抗CoV感染，尤其是对抗SARS
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CoV
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2感染。专利技术概述
ID NO:245)，所述有义链包含5
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UGAUUUCUCCAAACA
‑3’
(SEQ ID NO:455)。本专利技术还提供了基因沉默剂，其包含的有义核苷酸序列和反义核苷酸序列在整个长度上至少90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％或99％与前述有义核苷酸序列和反义核苷酸序列相同。
[0016]在一方面，本专利技术提供了基因沉默剂，其中所述基因沉默剂是双链RNAi剂，其包含形成双链区的反义链和有义链，其中所述反义链包含5
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AAACCAGCUACUUUAUCAUUG
‑3’
(SEQ ID NO:366)，所述有义链包含5
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UGAUAAAGUAGCUGG
‑3’
(SEQ ID NO:576)。本专利技术还提供了基因沉默剂，其包含的有义核苷酸序列和反义核苷酸序列在整个长度上至少90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％或99％与前述有义核苷酸序列和反义核苷酸序列相同。
[0017]在一方面，本专利技术提供了基因沉默剂，其中所述基因沉默剂是双链RNAi剂，其包含形成双链区的反义链和有义链，其中所述反义链包含5
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AAAUGUGUCACAAUUACCUUC
‑3’
(SEQ ID NO:354)，所述有义链包含5
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GGUAAUUGUGACACA
‑3’
(SEQ ID NO:564)。本专利技术还提供了基因沉默剂，其包含的有义核苷酸序列和反义核苷酸序列在整个长度上至少90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％或99％与前述有义核苷酸序列和反义核苷酸序列相同。
[0018]在一方面，本专利技术提供了基因沉默剂，其中所述基因沉默剂是双链RNAi剂，其包含形成双链区的反义链和有义链，其中所述反义链包含5
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AACAGCUGGACAAUCCUUAAG
‑3’
(SEQ ID NO:357)，所述有义链包含5
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AAGGAUUGUCCAGCU
‑3’
(SEQ ID NO:567)。本专利技术还提供了基因沉默剂，其包含的有义核苷酸序列和反义核苷酸序列在整个长度上至少90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％或99％与前述有义核苷酸序列和反义核苷酸序列相同。
[0019]上述任何方面提供的基因沉默剂可用于治疗或预防SARS
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CoV
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2感染，抑制细胞内SARS
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CoV
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2蛋白的表达，沉默细胞内SARS
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CoV
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2基因，抑制细胞内SARS
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CoV
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2的复制，或在体外或体内降低SARS
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CoV
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2的滴度。
[0020]在另一方面，本专利技术提供了用于治疗与CoV感染(例如COVID
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19)相关的病症的药物组合物，其包含本专利技术提供的任何方面的基因沉默剂和至少一种药学上可接受的赋形剂或载体。在一些实施方案中，该基因沉默剂是双链RNAi剂，其包含反义链和有义链；其中该反义链包含与图1、2和3提供的核苷酸序列(SEQ 本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】1.一种用于治疗COVID
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19的基因沉默剂，其中所述基因沉默剂包含反义链，所述反义链具有至少15个或更多个连续的核苷酸与选自SEQ ID Nos:1至210组成的组的至少一个靶基因基本上互补。2.一种用于治疗COVID
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19的基因沉默剂，其中所述基因沉默剂包含反义链，所述反义链具有与选自由SEQ ID NO:211至420组成的组的一个核苷酸序列相差不超过3个核苷酸的至少15个或更多个连续的核苷酸。3.一种用于治疗COVID
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19的基因沉默剂，其中所述基因沉默剂是小干扰RNA双链体，包含反义链，所述反义链具有选自由SEQ ID NO:211至420组成的组的至少15个或更多个连续的核苷酸，和与所述反义链基本上互补的有义链，所述有义链和所述反义链形成双链区。4.权利要求3所述的基因沉默剂，其中所述反义链的长度为15至30个核苷酸，所述有义链的长度为9
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29个核苷酸，两个端点值都包括在其中。5.权利要求3所述的基因沉默剂，其中所述反义链的长度为23个核苷酸，所述有义链的长度为12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22或23个核苷酸。6.权利要求3所述的基因沉默剂，其中所述反义链的长度为21个核苷酸，所述有义链的长度为10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20或21个核苷酸。7.权利要求3所述的基因沉默剂，其中所述反义链的长度为19个核苷酸，所述有义链的长度为10、11、12、13、14、15、16、17、18或19个核苷酸。8.权利要求3至7所述的基因沉默剂，其中所述反义链的3'和/或5'末端具有突出端，其中3'和/或5'末端的所述突出端的长度为1、2、3、4、5或6个核苷酸。9.权利要求3至7所述的基因沉默剂，其中所述反义链的3'末端具有突出端，并且具有5'平末端，其中3'末端的所述突出端的长度为2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12或13个核苷酸。10.一种用于治疗COVID
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19的基因沉默剂，其中所述基因沉默剂是小干扰RNA双链体，包含反义链和有义链，所述反义链具有与选自由SEQ ID NO:211至420组成的组的序列基本上相同的核苷酸；所述有义链具有与SEQ ID NO:421至630组成的组中列出的相应序列基本上相同的核苷酸；所述有义链和反义链形成双链区。11.一种用于治疗COVID
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19的基因沉默剂，其中所述基因沉默剂包含形成双链区的反义链和有义链，其中所述反义链包含5
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AACGAUUGCAGCAUUGUUAGC
‑3’
(SEQ ID NO:253)，并且所述有义链包含5
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AACAAUGCUGCAAUC
‑3’
(SEQ ID NO:463)。12.一种用于治疗COVID
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19的基因沉默剂，其中所述基因沉默剂包含形成双链区的反义链和有义链，其中所述反义链包含5
’‑
AACUUUAUCAUUGUAGAUGUC
‑3’
(SEQ ID NO:365)，并且所述有义链包含5
’‑
AUCUACAAUGAUAAA
‑3’
(SEQ ID NO:575)。13.一种用于治疗COVID
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19的基因沉默剂，其中所述基因沉默剂包含形成双链区的反义链和有义链，其中所述反义链包含5
’‑
AAGCAUUGUUAGCAGGAUUGC
‑3’
(SEQ ID NO:224)，并且所述有义链包含5
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AUCCUGCUAACAAUG
‑3’
(SEQ ID NO:434)。14.一种用于治疗COVID
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19的基因沉默剂，其中所述基因沉默剂包含形成双链区的反义链和有义链，其中所述反义链包含5
’‑
AACAAUUUGCGGCCAAUGUUU
‑3’
(SEQ ID NO:240)，并且所述有义链包含5
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CAUUGGCCGCAAAUU
‑3’
(SEQ ID NO:450)。15.一种用于治疗COVID
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19的基因沉默剂，其中所述基因沉默剂包含形成双链区的反义链和有义链，其中所述反义链包含5
’‑
AAUUGUUUGGAGAAAUCAUCC
‑3’
(SEQ ID NO:245)，并
且所述有义链包含5
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UGAUUUCUCCAAACA
‑3’
(SEQ ID NO:455)。16.一种用于治疗COVID
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19的基因沉默剂，其中所述基因沉默剂包含形成双链区的反义链和有义链，其中所述反义链包含5
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AAACCAGCUACUUUAUCAUUG
‑3’
(SEQ ID NO:366)，并且所述有义链包含5
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UGAUAAAGUAGCUGG
‑3’
(SEQ ID NO:576)。17.一种用于治疗COVID
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19的基因沉默剂，其中所述基因沉默剂包含形成双链区的反义链和有义链，其中所述反义链包含5
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AAAUGUGUCACAAUUACCUUC
‑3’
(SEQ ID NO:354)，并且所述有义链包...

【专利技术属性】
技术研发人员：李嘉强，孙宪高，李查尔斯，邝平平，
申请(专利权)人：南京强新生物医药有限公司，
类型：发明
国别省市：