lncRNAPTPRN2-AS1作为肾透明细胞癌预后标志物的应用制造技术

本发明专利技术涉及lncRNA PTPRN2

【技术实现步骤摘要】
lncRNA PTPRN2
‑
AS1作为肾透明细胞癌预后标志物的应用


[0001]本专利技术属于肾透明细胞癌预后标志物
，具体涉及非编码RNA PTPRN2
‑
AS1作为肾透明细胞癌预后标志物的应用及一种肾透明细胞癌预后检测试剂盒。

技术介绍

[0002]公开该
技术介绍
部分的信息仅仅旨在增加对本专利技术的总体背景的理解，而不必然被视为承认或以任何形式暗示该信息构成已经成为本领域一般技术人员所公知的现有技术。
[0003]肾实质癌是来源于肾小管上皮细胞的腺癌，85％为透明细胞癌，因此肾透明细胞癌(clear cell renal cell carcinoma，ccRCC)是最常见的肾癌，与肿瘤转移高度相关，占肾癌相关死亡比例超过75％。一般采用肾根治手术治疗ccRCC，但其通过血液运输转移率很高，约有60％的病人存在转移可能。大多数死亡是由于肿瘤的进展、迁移和侵袭以及术后的复发。尽管一些治疗方法包括手术治疗、放疗及化疗有很大进展,但是目前对肾透明细胞癌的预后判定没有参考标准，也没有特异性的指标，远远不能适应对人肾透明细胞癌进行预后判定的需求。因此，对人肾透明细胞癌进行预后判定，以便选择最佳治疗方案，显著提高患者生存率，成为泌尿外科领域亟待解决的重要课题。
[0004]长链非编码RNA(long non
‑
coding RNA,lncRNA)是一类长度大于200bp的非编码RNA，其不能翻译成蛋白质，而是以RNA的形式参与调控多种生理过程。LncRNA可以从转录、表观遗传学和可变剪切等多个水平上调控基因的表达。近年来，lncRNA作为调控分子，其在临床诊断、化疗敏感性和预后评价等方面的应用价值，已经逐渐得到研究者的重视。有研究表明HULC在原发性肝癌组织中特异性高表达，并且在肝癌患者血清中也可以检测到较高水平的转录本，因此有可能成为肝癌检验的血清学标志物。HULC的表达水平可以作为肿瘤治疗预后的指标。LncRNA PCA3在前列腺癌中高度表达，其在尿液中可以检测到，这也便于临床检验。LncRNA
‑
LALR1通过激活Wnt/β
‑
catenin信号，加速了细胞周期进程，促进了肝细胞增殖。采用药物靶干预lncRNA
‑
LALR1诱导肝脏再生，有可能有益于肝衰竭和肝移植的治疗。由此可见，lncRNA作为诊断、预后和治疗的分子标志物具有巨大潜力。

技术实现思路

[0005]在前期研究工作中，申请人通过转录组测序发现了lncRNA PTPRN2
‑
AS1。申请人在肾透明细胞癌组织中提取RNA，经逆转录后进行实时荧光定量PCR分析lncRNA PTPRN2
‑
AS1的表达，结果发现lncRNA PTPRN2
‑
AS1在肾透明细胞癌组织中表达上调，与癌旁组织中的表达差异有统计学意义(P<0.001)(图1)。且lncRNA PTPRN2
‑
AS1不同表达水平的肾透明细胞癌患者预后存在明显差异，经Kaplan
‑
Meier生存分析发现lncRNA PTPRN2
‑
AS1高表达的肾透明细胞癌患者生存率明显低于低表达的患者(p＝0.033)(图2)。多因素Cox比例风险模型的预后分析发现lncRNA PTPRN2
‑
AS1的相对危险度>1，表明lncRNA PTPRN2
‑
AS1高表达的患者预后较低表达的患者预后差，lncRNA PTPRN2
‑
AS1的高表达是肾透明细胞癌患者预后风
险预测的独立危险因素。lncRNA PTPRN2
‑
AS1可作为肾透明细胞癌患者预后的特异性分子标志物。
[0006]基于上述研究成果，本专利技术提供以下技术方案：
[0007]本专利技术第一方面，提供lncRNA PTPRN2
‑
AS1作为肾透明细胞癌预后标志物的应用。
[0008]上述第一方面中所述lncRNA PTPRN2
‑
AS1，定位于染色体7p36.3，GeneBank登录号为NR
‑
038966，其序列如SEQ ID NO:1所示。
[0009]优选的，上述非编码RNA作为肾透明细胞癌预后标志物的应用方式主要包括：
[0010](1)基于肾透明细胞癌患者临床样本中lncRNA PTPRN2
‑
AS1的表达含量对所述患者的预后情况进行评估；
[0011](2)将lncRNA PTPRN2
‑
AS1的检测试剂用于开发肾透明细胞癌预后检测产品；
[0012](3)基于疾病模型中lncRNA PTPRN2
‑
AS1表达含量的变化对具有肾透明细胞癌治疗活性成分进行筛选。
[0013]上述(1)方面的应用方式中，所述临床样本包括但不限于癌症病灶组织、血清、血浆、全血、分泌物、体液中的一种或几种；本专利技术验证的一种实施方式中，所述临床样本为肾透明细胞癌患者的病灶组织。
[0014]上述(3)方面的应用中，所述疾病模型包括但不限于基于动物模型、组织模型或细胞模型。
[0015]上述(2)方面的应用，所述预后检测产品包括但不限于检测试剂盒、检测芯片及预后检测平台等；另外，所述lncRNA PTPRN2
‑
AS1的检测试剂包括能够实现上述标志物检测的各类方法所涉及的试剂，如转录组测序、Northern印迹、实时荧光定量PCR技术、荧光原位杂交、RNA干扰和RNA结合蛋白免疫沉淀，上述检测方法中，荧光定量PCR检测通常作为非编码RNA检测的金标准方法，因此，本专利技术的一个效果较好的实施方式中，提供一种基于荧光PCR方法对肾透明细胞癌患者预后情况进行评估的检测试剂盒。
[0016]本专利技术第三方面，提供一种肾透明细胞癌预后检测试剂盒，所述试剂盒中包括基于荧光PCR方法检测患者机体中lncRNA PTPRN2
‑
AS1表达含量的试剂。
[0017]优选的，所述检测试剂包括RNA抽提试剂、逆转录试剂、cDNA定量PCR所用试剂。
[0018]进一步的，所述RNA抽提试剂包括Trizol试剂、三氯甲烷、异丙醇、无水乙醇及RNase
‑
Free ddH2O。
[0019]进一步的，所述逆转录试剂包括逆转录缓冲溶液、FQ
‑
RT Primer mix、Enzyme mix以及lncRNA PTPRN2
‑
AS1所用随机引物。
[0020]进一步的，所述cDNA定量PCR所用试剂包括lncRNA PTPRN2
‑
AS1实时荧光定量PCR特异性引物、U6snRNA内参PCR特异性引物、实时荧光定量SYBR染料、premix、RNase
‑...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.lncRNA PTPRN2
‑
AS1作为肾透明细胞癌预后标志物的应用。2.如权利要求1所述lncRNA PTPRN2
‑
AS1作为肾透明细胞癌预后标志物的应用，其特征在于，所述lncRNA PTPRN2
‑
AS1的序列如SEQ ID NO:1所示。3.如权利要求1所述lncRNA PTPRN2
‑
AS1作为肾透明细胞癌预后标志物的应用，其特征在于，所述应用方式为：将lncRNA PTPRN2
‑
AS1的检测试剂用于开发肾透明细胞癌预后检测产品。4.如权利要求3所述lncRNA PTPRN2
‑
AS1作为肾透明细胞癌预后标志物的应用，其特征在于，所述预后检测产品包括但不限于检测试剂盒、检测芯片及预后检测平台。5.如权利要求3所述lncRNA PTPRN2
‑
AS1作为肾透明细胞癌预后标志物的应用，其特征在于，所述lncRNA PTPRN2
‑
AS1的检测试剂为基于实时荧光定量PCR检测方法所涉及的试剂。6.一种肾透明细胞癌预后检测试剂盒，其特征在于，所述试剂盒中包括基于荧光PCR方法检测患者机体中lncRNA PTPRN2
‑
AS1表达含量的试剂，包括RNA抽提试剂、逆转录试剂、cDNA定量PCR所用试剂。7.如权利要求6所述肾透明细胞癌预后检测试剂盒，其特征在于，所述RNA抽提试剂包括Trizol试剂、三氯甲烷、异丙醇、无水乙醇及RNase
‑
Free ddH2O；或，所述逆转录试剂包括逆转录缓冲溶液、FQ
‑
RT Primer mix、Enzyme mix以及lncRNA PTPRN2
‑

【专利技术属性】
技术研发人员：王春晴，马建萍，郭建壮，
申请(专利权)人：山东第一医科大学第一附属医院山东省千佛山医院，
类型：发明
国别省市：