本发明专利技术涉及一种检测AGRN基因的CpG岛区域和MSC基因的CpG岛区域的甲基化水平的试剂在制备诊断结直肠癌的产品中的应用。本发明专利技术研究人员研究发现，通过检测AGRN基因的CpG岛区域和MSC基因的CpG岛区域的甲基化水平，能够提高对结直肠癌的检测灵敏度和特异性，从而提高结直肠癌的早期检出率，为患者争取治疗时间，且检测过程对患者造成的痛苦较小。检测过程对患者造成的痛苦较小。
【技术实现步骤摘要】
检测基因甲基化的试剂在制备诊断结直肠癌的产品中的应用
[0001]本专利技术涉及生物
，特别是涉及一种检测基因甲基化的试剂在制备诊断结直肠癌的产品中的应用。
技术介绍
[0002]在世界范围内，结直肠癌是第三大常见的恶性肿瘤，其在癌症相关的死亡统计中排名第二。据统计，2020年全球约有190万的新发病例，虽然结直肠癌进展缓慢，从一个腺瘤发展为恶性癌变需要长达8～10年的时间，但结直肠癌的早期筛查和诊断效果并不理想，大部分患者在首次确诊时已经处于癌症中晚期，错失了最佳的治疗时机。
[0003]据报道，使用粪便潜血检测和肠道内窥镜检查来进行结直肠的筛查可以有效降低结直肠癌的死亡率。然而，无论是直接进行肠镜检查，还是先进行粪便潜血检测随后再进行肠镜复查，其都要进行侵入性操作，患者的痛苦程度较高，依从性很差。但目前尚没有患者依从性较好且灵敏度较高的检测手段。
技术实现思路
[0004]基于此，本专利技术提供一种检测AGRN基因的CpG岛区域和MSC基因的CpG岛区域的甲基化水平的试剂在制备诊断结直肠癌的产品中的应用。此外，还提供了一种诊断结直肠癌的核酸产品及试剂盒，该核酸产品和试剂盒能够实现对结直肠癌高灵敏度的诊断，且对患者创伤小。
[0005]在其中一个实施例中，以GRCh.38p14为参考基因组，所述试剂能够检测Chr1:1033941
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1033829区域和Chr8:71843999
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71843823区域的全长或部分区域的甲基化水平。
[0006]在其中一个实施例中，所述试剂能够检测Chr1:1033914
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1033829区域、Chr1:1033937
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1033844区域和Chr1:1033941
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1033844区域中的至少一个区域的全长或部分区域的甲基化水平，以及Chr8:71843952
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71843823区域、Chr8:71843970
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71843842区域和Chr8:71843999
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71843905区域中的至少一个区域的全长或部分区域的甲基化水平。
[0007]一种诊断结直肠癌的核酸产品，所述核酸产品能够检测AGRN基因的CpG岛区域和MSC基因的CpG岛区域的甲基化水平。
[0008]在其中一个实施例中，所述核酸产品能够检测Chr1:1033941
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1033829区域和Chr8:71843999
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71843823区域的全长或部分区域的甲基化水平。
[0009]在其中一个实施例中，所述核酸产品包括能够检测AGRN基因的CpG岛区域的甲基化水平的引物对和能够检测MSC基因的CpG岛区域的甲基化水平的引物对；其中：
[0010]所述能够检测AGRN基因的CpG岛区域的甲基化水平的引物对包括用于检测Chr1:1033914
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1033829区域的全长或部分区域的甲基化水平的第一引物对，用于检测Chr1:1033937
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1033844区域的全长或部分区域的甲基化水平的第二引物对，和用于检测Chr1:1033941
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1033844区域的全长或部分区域的甲基化水平的第三引物对中的至少一对；及/或，
[0011]所述能够检测MSC基因的CpG岛区域的甲基化水平的引物对包括用于检测Chr8:71843952
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71843823区域的全长或部分区域的甲基化水平的第四引物对，用于检测Chr8:71843970
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71843842区域的全长或部分区域的甲基化水平的第五引物对，和用于检测Chr8:71843999
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71843905区域的全长或部分区域的甲基化水平的第六引物对中的至少一对。
[0012]在其中一个实施例中，所述第一引物对的核苷酸序列如SEQ ID NO:1～2所示；及/或，所述第二引物对的核苷酸序列如SEQ ID NO:4～5所示；及/或，所述第三引物对的核苷酸序列如SEQ ID NO:7～8所示；及/或，所述第四引物对的核苷酸序列如SEQ ID NO:10～11所示；及/或，所述第五引物对的核苷酸序列如SEQ ID NO:13～14所示；及/或，所述第六引物对的核苷酸序列如SEQ ID NO:16～17所示。
[0013]在其中一个实施例中，所述核酸产品还包括与所述引物对对应的检测探针。
[0014]在其中一个实施例中，与所述第一引物对对应的第一检测探针的核苷酸序列如SEQ ID NO:3所示；及/或，与所述第二引物对对应的第二检测探针的核苷酸序列如SEQ ID NO:6所示；及/或，与所述第三引物对对应的第三检测探针的核苷酸序列如SEQ ID NO:9所示；及/或，与所述第四引物对对应的第四检测探针的核苷酸序列如SEQ ID NO:12所示；及/或，与所述第五引物对对应的第五检测探针的核苷酸序列如SEQ ID NO:15所示；及/或，与所述第六引物对对应的第六检测探针的核苷酸序列如SEQ ID NO:18所示。
[0015]一种诊断结直肠癌的试剂盒，所述试剂盒包括用于检测AGRN基因的CpG岛区域和MSC基因的CpG岛区域的甲基化水平的试剂。
[0016]在其中一个实施例中，所述试剂盒通过下述方法中的至少一种检测AGRN基因的CpG岛区域和MSC基因的CpG岛区域的甲基化水平：甲基化特异性PCR法、荧光定量PCR法、亚硫酸氢盐测序法、甲基化特异性微阵列法、全基因组甲基化测序法、焦磷酸测序法、甲基化特异性高效液相层析法、数字PCR法、甲基化特异性高分辨率溶解曲线法和甲基化敏感性限制性内切酶法。
[0017]在其中一个实施例中，所述用于检测AGRN基因的CpG岛区域和MSC基因的CpG岛区域的甲基化水平的试剂包括上述任一实施例所述的核酸产品。
[0018]在其中一个实施例中，所述用于检测AGRN基因的CpG岛区域和MSC基因的CpG岛区域的甲基化水平的试剂还包括核酸提取试剂、甲基化转化试剂、质控试剂、PCR反应试剂和测序试剂中的至少一种。
具体实施方式
[0019]为使本专利技术的上述目的、特征和优点能够更加明显易懂，下面对本专利技术的具体实施方式做详细的说明。在下面的描述中阐述了很多具体细节以便于充分理解本专利技术。但是本专利技术能够以很多不同于在此描述的其它方式来实施，本领域技术人员可以在不违背本专利技术内涵的情况下做类似改进，因此本专利技术不受下面公开的具体实施例的限制。
[0020]除非另有定义，本文所使用的所有的技术和科学术语与属于本专利技术的
的技术人员通常理解的含义相同。本文中在本专利技术的说明书中所使用的术语只是为了描述具体的实施例的目的，不是旨在于限制本专利技术。本文所使用的术语“及/或”或“和/或”包括一个或多个相关的所列项目的任意的和所有的组合。本文所述的“优选”仅为描述效果更好的实施方式或实施例，本文档来自技高网...
【技术保护点】
【技术特征摘要】
1.检测AGRN基因的CpG岛区域和MSC基因的CpG岛区域的甲基化水平的试剂在制备诊断结直肠癌的产品中的应用。2.根据权利要求1所述的应用，其特征在于，以GRCh.38p14为参考基因组，所述试剂能够检测Chr1:1033941
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1033829区域和Chr8:71843999
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71843823区域的全长或部分区域的甲基化水平。3.根据权利要求2所述的应用，其特征在于，所述试剂能够检测Chr1:1033914
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1033829区域、Chr1:1033937
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1033844区域和Chr1:1033941
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1033844区域中的至少一个区域的全长或部分区域的甲基化水平，以及Chr8:71843952
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71843823区域、Chr8:71843970
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71843842区域和Chr8:71843999
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71843905区域中的至少一个区域的全长或部分区域的甲基化水平。4.一种诊断结直肠癌的核酸产品，其特征在于，所述核酸产品能够检测AGRN基因的CpG岛区域和MSC基因的CpG岛区域的甲基化水平。5.根据权利要求4所述的核酸产品，其特征在于，所述核酸产品能够检测Chr1:1033941
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1033829区域和Chr8:71843999
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71843823区域的全长或部分区域的甲基化水平。6.根据权利要求4或5所述的核酸产品，其特征在于，所述核酸产品包括能够检测AGRN基因的CpG岛区域的甲基化水平的引物对和能够检测MSC基因的CpG岛区域的甲基化水平的引物对；其中：所述能够检测AGRN基因的CpG岛区域的甲基化水平的引物对包括用于检测Chr1:1033914
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1033829区域的全长或部分区域的甲基化水平的第一引物对、用于检测Chr1:1033937
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1033844区域的全长或部分区域的甲基化水平的第二引物对、和用于检测Chr1:1033941
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1033844区域的全长或部分区域的甲基化水平的第三引物对中的至少一对；及/或，所述能够检测MSC基因的CpG岛区域的甲基化水平的引物对包括用于检测Chr8:71843952
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71843823区域的全长或部分区域的甲基化水平的第四引物对、用于检测Ch...
【专利技术属性】
技术研发人员：周谛晗，张良禄，董兰兰，梁嘉琳，孙帆，万慧，赵巴丽，
申请(专利权)人：武汉艾米森生命科技有限公司，
类型：发明
国别省市：
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