本发明专利技术提供一种用于预测妊娠期高血压疾病的DNA甲基化区段组合及应用、妊娠期高血压疾病的预测方法及装置，其中所述方法利用筛选出的外周血DNA甲基化区段，采用逻辑回归方法，构建针对妊娠期高血压疾病的风险预测模型，计算妊娠期高血压疾病的发病风险值，从而能够有效预测妊娠期高血压疾病的发病风险。效预测妊娠期高血压疾病的发病风险。效预测妊娠期高血压疾病的发病风险。
【技术实现步骤摘要】
用于预测妊娠期高血压疾病的DNA甲基化区段组合及应用
[0001]本专利技术涉及生殖生育健康领域，特别是涉及一种用于预测妊娠期高血压疾病的DNA甲基化区段组合及应用、妊娠期高血压疾病的预测方法及装置、计算机设备及计算机可读存储介质。
技术介绍
[0002]妊娠期高血压疾病(Hypertensive disorders of pregnancy,HDP)是妊娠与血压升高并存的一组疾病，其分类包括慢性高血压合并的妊娠(孕前存在高血压或者孕周在20周之前出现的血压升高)、单纯妊娠期高血压(pregnancy
‑
induced hypertension,PIH)和子痫前期(Preeclampsia,PE)。单纯妊娠期高血压(PIH)是指发生于妊娠20周以后，以血压升高(收缩压≥140mmHg和/或舒张压≥90mmHg)、蛋白尿、浮肿为特征的一系列综合性疾病，严重时可伴随抽搐、昏迷、心肾功能衰竭甚至导致母婴死亡。子痫前期是指妊娠20周后发病，以高血压和蛋白尿为主要表现的临床综合征，发病率为2％～3％，可伴有脑、心、肝、肾等重要脏器的功能损害，也是导致母儿围生期死亡的重要原因，子痫前期与子痫占所有孕产妇死亡的10％～15％。
[0003]妊娠期高血压疾病(HDP)严重影响母婴健康，病因和发病机制十分复杂，目前这方面的国内外研究也尚无定论，诊断个体差异大，而且尚无有效治愈方法，临床上通过采取休息、镇静、解痉、降压、有指征的利尿、密切监测母胎情况等措施对症处理以控制病情，而终止妊娠是唯一的治愈手段。这就需要尽早识别可能发生HDP的高危孕妇人群，帮助临床医生提前对高危孕妇和胎儿进行监测，及时地采取有效的干预措施，控制疾病的发展，降低疾病严重程度，从而改善预后。但是目前尚无公认有效的方法可以预测HDP的发生。
技术实现思路
[0004]为解决上述技术问题，本专利技术提出一种用于预测妊娠期高血压疾病的DNA甲基化区段组合及应用、妊娠期高血压疾病的预测方法及装置、计算机设备及计算机可读存储介质，能够有效预测妊娠期高血压疾病的发病风险。
[0005]本专利技术的一个方面提供一种用于预测妊娠期高血压疾病的DNA甲基化区段组合，所述DNA甲基化区段组合为以下6个DNA甲基化区段的组合，该6个DNA甲基化区段的扩增子、对应的基因和染色体上具体位置为：
[0006](1)Amplicon7、HMGB1、Chr13:31040015
‑
31040215；
[0007](2)Amplicon18、JMJD6、Chr17:74722858
‑
74723058；
[0008](3)Amplicon22、CTSA、Chr20:44519758
‑
44519958；
[0009](4)Amplicon36、PTEN、Chr10:89622381
‑
89622581；
[0010](5)Amplicon42、LIN28B、Chr6:105404737
‑
105404937；
[0011](6)Amplicon70、FADS2、Chr11:61583590
‑
61583790。
[0012]优选地，所述6个DNA甲基化区段是通过对妊娠妇女孕早期的空腹血清样本进行甲
基化分析并使用Lasso回归方法筛选对妊娠期高血压疾病影响最大的扩增子而得到的。
[0013]本专利技术的另一个方面提供一种上述的DNA甲基化区段组合在预测妊娠期高血压疾病中的应用。
[0014]本专利技术的又一个方面提供一种妊娠期高血压疾病的预测方法，利用上述的DNA甲基化区段组合，预测妊娠期高血压疾病的发病风险，所述方法包括：
[0015]计算步骤：根据待测样本的所述6个DNA甲基化区段的表达情况，使用以下逻辑回归模型计算待测样本的妊娠期高血压疾病的发病风险值：
[0016][0017]其中，Y为发病风险值，x
i
为第i个DNA甲基化区段的表达水平，n为DNA甲基化区段的个数，n＝6，β
i
为第i个DNA甲基化区段的回归系数；c为常量，取值为
‑
2.00；
[0018]判断步骤：当待测样本的发病风险值Y大于阈值时，则样本判断为妊娠期高血压疾病高危；当待测样本的发病风险值Y小于阈值时，则样本判断为妊娠期高血压疾病低危。
[0019]优选地，所述6个DNA甲基化区段的扩增子、对应的基因和回归系数如下：
[0020](1)Amplicon7、HMGB1、51.27；
[0021](2)Amplicon18、JMJD6、5.81；
[0022](3)Amplicon22、CTSA、
‑
10.31；
[0023](4)Amplicon36、PTEN、5.50；
[0024](5)Amplicon42、LIN28B、5.35；
[0025](6)Amplicon70、FADS2、32.93。
[0026]优选地，根据如下公式计算发病风险值Y：logit(Y)＝ln(Y/(1
‑
Y))。
[0027]优选地，所述风险阈值P为0.421。
[0028]本专利技术的又一个方面提供一种妊娠期高血压疾病的预测装置，利用上述的DNA甲基化区段组合，预测妊娠期高血压疾病的发病风险，所述装置包括：
[0029]计算模块，构成为根据待测样本的所述6个DNA甲基化区段的表达情况，使用以下逻辑回归模型计算妊娠期高血压疾病的发病风险值：
[0030][0031]其中，Y为发病风险值，x
i
为第i个DNA甲基化区段的表达水平，n为DNA甲基化区段的个数，n＝6，β
i
为第i个DNA甲基化区段的回归系数；c为常量，取值为
‑
2.00；
[0032]判断模块，构成为当待测样本的发病风险值Y大于阈值时，则样本判断为妊娠期高血压疾病高危；当待测样本的发病风险值Y小于阈值时，则样本判断为妊娠期高血压疾病低危。
[0033]本专利技术的又一个方面提供一种计算机设备，包括存储器和处理器，所述存储器存储有计算机程序，其特征在于，所述处理器执行所述计算机程序时实现上述的方法的步骤。
[0034]本专利技术的又一个方面提供一种计算机可读存储介质，其上存储有计算机程序，其特征在于，所述计算机程序被处理器执行时实现上述的方法的步骤。
[0035]根据本专利技术上述方面的用于预测妊娠期高血压疾病的DNA甲基化区段组合及应用、妊娠期高血压疾病的预测方法及装置、计算机设备及计算机可读存储介质，能够有效预测妊娠期高血压疾病的发病风险。
[0036]参考以下描述，本申请的这些和其他特征、方面和优点将变得更好理解。并入于本说明书中且构成本说明书的一部分的附图说明本申请的实施例，且连同所述描述一起用于解释本申请本文档来自技高网...
【技术保护点】
【技术特征摘要】
1.一种用于预测妊娠期高血压疾病的DNA甲基化区段组合，其特征在于，所述DNA甲基化区段组合为以下6个DNA甲基化区段的组合，该6个DNA甲基化区段的扩增子、对应的基因和染色体上具体位置为：（1）Amplicon7、HMGB1、Chr13:31040015
‑
31040215；（2）Amplicon18、JMJD6、Chr17:74722858
‑
74723058；（3）Amplicon22、CTSA、Chr20:44519758
‑
44519958；（4）Amplicon36、PTEN、Chr10:89622381
‑
89622581；（5）Amplicon42、LIN28B、Chr6:105404737
‑
105404937；（6）Amplicon70、FADS2、Chr11:61583590
‑
61583790。2.如权利要求1所述的DNA甲基化区段组合，其特征在于，所述6个DNA甲基化区段是通过对妊娠妇女孕早期的空腹血清样本进行甲基化分析并使用Lasso回归方法筛选对妊娠期高血压疾病影响最大的扩增子而得到的。3.如权利要求1或2所述的DNA甲基化区段组合在预测妊娠期高血压疾病中的应用。4.一种妊娠期高血压疾病的预测方法，其特征在于，利用权利要求1或2所述的DNA甲基化区段组合，预测妊娠期高血压疾病的发病风险，所述方法包括：计算步骤：根据待测样本的所述6个DNA甲基化区段的表达情况，使用以下逻辑回归模型计算待测样本的妊娠期高血压疾病的发病风险值：其中，Y为发病风险值，为第i个DNA甲基化区段的表达水平，n为DNA甲基化区段的个数，n=6，为第i个DNA甲基化区段的回归系数；c为常量，取值为
‑
2.00；判断步骤：当待测样本的发病风险值Y大于阈值时，则样本判断为妊娠期高血压疾病...
【专利技术属性】
技术研发人员：杨英，雷珏鸣，吴汉彬，邹晓璇，贾佳静，杨海珊，马旭，
申请(专利权)人：国家卫生健康委科学技术研究所，
类型：发明
国别省市：
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