【技术实现步骤摘要】
一种用于计算基质上细胞弹性模量的机器主动学习方法
[0001]本专利技术属于细胞力学领域,涉及一种用于计算基质上细胞弹性模量的机器主动学习方法。
技术介绍
[0002]研究证明,细胞弹性模量(E
c
)受基质的弹性模量(E
s
)影响,并与细胞的生长、增殖、分化和迁移相关。例如,卵巢癌细胞的E
c
随着E
s
的增加而增加,E
c
较高的细胞表现出较高的生长和增殖能力,且耐药性较低。小鼠胚胎成纤维细胞的迁移能力显示出与E
c
变化相反的趋势。神经干细胞E
c
在较软的凝胶上较低,并且倾向于分化成神经元;相反,在较硬凝胶上,E
c
较高,并倾向于分化为胶质细胞。因此,E
c
已被用作重要力学指标,用于关联基质刚度与细胞生物学行为。
[0003]从力学角度分析,基质引起细胞弹性模量的变化可能来自两个方面:(1)细胞组成、结构的内在变化。(2)弹性模量E
c
提取方 ...
【技术保护点】
【技术特征摘要】
1.一种用于计算基质上细胞弹性模量的主动学习方法,其特征在于,步骤如下:第一步,设置有限元计算参数;数据通过有限元软件ABAQUS数值计算获得,细胞建模为均质圆柱体;分别设置细胞厚度t,细胞半径R,探针半径r,细胞弹性模量E
c
,基质弹性模量E
s
,探针位移d;设置探针为刚体;第二步,建立有限元计算模型;基质底部设置为固定,侧面为自由;将细胞设置为绑定在基质上;在ABAQUS中创建轴对称模型;单位设置为CAX4RH;进行网格收敛性分析,选择计算精度和效率较高的网格尺寸进行计算,通过ABAQUS参数化建模和计算,提取压缩力P和压痕深度d之间的关系;第三步,建立AL模型,采用委员会查询方法;首先根据需求设置初始委员会个数为N,委员会的每个模型均命名为m
j
(j≤N);委员会查询方法需要先对有n个数据点的初始数据集进行评估,而初始数据集就是AL模型迭代的起始数据集,需要用户通过第一步设置不同有限元计算参数计算获得;使用公式(2)计算误差率σ;其中:f
j
是对应于j成员的神经网络模型;计算结果为X
i
=[x1,x2,x3,x4]
i
表示i数据点;y
target
表示标签;神经网络模型是使用开源框架pytorch构建的;网络结构的输入层有4个神经元,需要四个变量x1,x2,x3,x4作为输入;计算误差率σ是为了对初始委员会的成员进行筛选;初始委员会训练初始数据集,至收敛,并计算误差率σ;误差率σ<10%的委员被认为是合格的;不合格的委员被剔除,剩下的m个模型组成新的委员会;新委员会评估第一...
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