转谷氨酰胺酶介导的缀合制造技术

本公开提供了抗体

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】转谷氨酰胺酶介导的缀合
[0001]相关申请的交叉引用
[0002]本申请要求于2020年2月28日提交的美国临时专利申请号62/983,463以及于2020年11月6日提交的美国临时专利申请63/110,854的优先权和权益，其各自的公开内容通过引用整体并入本文。
[0003]以ASCII文本文件提交序列表
[0004]以下提交的ASCII文本文件的内容通过引用整体并入本文：计算机可读形式(CRF)的序列表(文件名：186492000240SEQLIST.txt，记录日期：2021年2月24日，大小：170KB)。


[0005]本公开总体地涉及用于缀合寡核苷酸和多肽的方法以及相关化合物、组合物和试剂盒。

技术介绍

[0006]病原体相关分子模式(PAMP)是与各种病原体相关的分子，并且被toll样受体(TLR)和激活先天性免疫应答的其它模式识别受体(PRR)识别。PAMP在不存在病原体的情况下募集免疫系统的能力提供了通过使用先天性免疫系统应答来治疗涉及细胞破坏的多种疾病的策略(例如抗癌疗法)。已经针对各种治疗应用研究的一类PAMP是免疫刺激多核苷酸，如含有未甲基化的胞嘧啶
‑
鸟嘌呤二核苷酸(CpG)的寡脱氧核苷酸(CpG ODN)(例如，agatolimod)。据认为CpG ODN介导免疫细胞(例如，B细胞、单核细胞和浆细胞样树突细胞(pDC))中的TLR9二聚化以上调细胞因子(例如，I型干扰素和白介素)，从而激活天然杀伤细胞。
[0007]Toll样受体9(TLR9)，也称为CD289，是在免疫系统细胞中表达的重要受体，所述免疫系统细胞包括树突细胞(DC)、B淋巴细胞、巨噬细胞、天然杀伤细胞和其它抗原呈递细胞。TLR9激活触发细胞内信号级联，导致这些免疫细胞中的激活、成熟、增殖和细胞因子产生，因此桥接先天性免疫和适应性免疫。Martinez
‑
Campos等，Viral Immunol.2016，30，98
‑
105；Notley等，Sci.Rep.2017，7，42204。天然TLR
‑
9激动剂包括含有未甲基化的胞嘧啶
‑
鸟嘌呤二核苷酸(CpG)的寡脱氧核苷酸(CpG ODN)。
[0008]CpG ODN可以包括，例如，具有聚
‑
G尾的寡脱氧核苷酸，其在3
’‑
和5
’‑
末端具有硫代磷酸酯主链，并且在其中心回文序列内具有包括磷酸酯主链和CpG的中心回文序列，或具有完全硫代磷酸酯主链，并且在5
’
端具有用于TLR9激活的序列的寡脱氧核苷酸，或具有完全硫代磷酸酯主链的寡脱氧核苷酸，其具有能够形成双链体的3
’‑
末序列。然而，CpG ODN常常易于在血清中降解，且因此CpG ODN的药代动力学可能是其作为治疗剂开发的限制因素之一。而且，CpG ODN常常在体内表现出不均匀的组织分布，主要积累位点在肝、肾和脾中。这样的分布可以引发与PAMP相关的脱靶活性和局部毒性。
[0009]一种解决方案是将免疫调节多核苷酸(例如CpG ODN)与用于特异性靶向的组织或细胞的靶向部分缀合，以克服不均匀的多核苷酸分布。参见US 2018/0312536。特别地，转谷
氨酰胺酶介导的反应可用于将含有谷氨酰胺残基的多肽靶向部分与含有伯胺基团的CpG ODN缀合。微生物转谷氨酰胺酶(mTG)来自茂原链霉菌(Streptomyces mobaraensis)种。mTG在pH控制的水性条件(包括生理条件)下催化蛋白质的“反应性”谷氨酰胺和“反应性”赖氨酸残基之间的转酰胺反应，而后者也可以是简单的低分子量伯胺，如5
‑
氨基戊基。对于待识别为mTG底物的蛋白质上的内源性谷氨酰胺，两个标准似乎是重要的：1)在与谷氨酰胺残基相邻的肽序列中存在疏水性氨基酸，和2)谷氨酰胺在环上的定位，所述环具有增强对mTG的反应性的局部链柔性。
[0010]尽管这些免疫调节多核苷酸的缀合可导致改善的稳定性和分布，但仍然需要具有改善的稳定性和选择性而具有或没有与靶向部分的缀合的免疫调节多核苷酸，及其制备方法。

技术实现思路

[0011]在一个方面中，本文提供了一种包含抗体或其抗原结合片段和一个或多个免疫调节寡核苷酸(P)的缀合物，其中每个免疫调节寡核苷酸通过酰胺键与抗体或片段的谷氨酰胺残基(Q)和接头(L)连接，如式(A)所示：
[0012][0013]其中表示每个Q与抗体或其抗原结合片段(Ab)的连接点。在一些实施方式中，谷氨酰胺残基是与抗体(例如抗体Fc区的C
‑
末端)连接的Q标签肽的一部分。在一些实施方式中，谷氨酰胺残基是抗体的一部分(例如，Fc区的一部分，如残基Q295)。在一些实施方式中，抗体还包含N297A突变。示例性Q
‑
标签肽序列提供于例如表3中。示例性免疫调节寡核苷酸在本文中描述并提供于例如表2和9
‑
12中。在一些实施方式中，1
‑
4个免疫调节寡核苷酸与抗体缀合。本文描述了示例性接头(L)。在一些实施方式中，接头包含聚乙二醇部分。
[0014]在一个方面中，本文提供了包含抗体或其抗原结合片段和一个或多个免疫调节寡核苷酸(P)的缀合物，其中抗体或抗原结合片段与一个或多个包含氨基酸序列RPQGF(SEQ ID NO:47)的Q
‑
标签肽(Q)连接，其中每个免疫调节寡核苷酸通过与Q
‑
标签肽的谷氨酰胺残基的酰胺键和接头(L)与Q
‑
标签肽连接，如式(A)所示：
[0015][0016]其中表示每个Q与所述抗体或其抗原结合片段(Ab)的连接点。
[0017]在一些实施方式中，抗体与2个Q
‑
标签肽连接，并且Q
‑
标签肽之一与免疫调节寡核苷酸连接。在一些实施方式中，抗体与2个Q
‑
标签肽连接，并且2个Q
‑
标签肽中的每一个与免疫调节寡核苷酸连接。在一些实施方式中，抗体或其片段是单克隆抗体或其片段。在本方面的另外的实施方式中，抗体或其片段是Fab、F(ab')2、Fab'
‑
SH、Fv、scFv、单结构域、单重链或单轻链抗体或抗体片段。在可以与前述任何实施方式组合的该方面的另一个实施方式
中，抗体或其片段是人源化、人或嵌合抗体或其片段。在本方面的其他实施方式中，抗体或其片段特异性结合肿瘤相关抗原。
[0018]在本方面的其它实施方式中，抗体或其片段特异性结合人CD22。在本方面的又一个实施方式中，抗体包含重链可变(VH)结构域和轻链可变(VL)结构域，其中VH结构域包含来自选自下组的VH结构域序列的CDR
‑
H1、CDR
‑
H2和CDR
‑
H3序列：
[0019]EVQLVESGGGLVQPG本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】1.一种缀合物，其包含抗体或其抗原结合片段和一个或多个免疫调节寡核苷酸(P)，其中所述抗体或抗原结合片段与一个或多个包含至少一个谷氨酰胺残基的Q
‑
标签肽(Q)连接，并且其中每个免疫调节寡核苷酸通过与Q
‑
标签肽的谷氨酰胺残基的酰胺键和接头(L)与该Q
‑
标签肽连接，如式(A)所示：其中表示每个Q与所述抗体或其抗原结合片段(Ab)的连接点；其中每个P独立地是具有以下结构的免疫调节寡核苷酸其中和表示所述寡核苷酸内的连接点；和其中表示与所述接头L的连接点；每个T1独立地是O或S；每个T2是S
‑
；
T3是基团其中表示与L的连接点和其中表示与所述寡核苷酸的其余部分的连接点；Z是O或S；U5’
是
‑
H或卤素；R5’
是
‑
H或甲氧基；R
c1
是
‑
H或甲氧基；R
g1
、R
g2
、R
g3
和R
g4
是H；R3’
是甲氧基；R1是
‑
(CH2)3‑
OH；R2是
‑
H或甲基；和n是0至2的整数。2.根据权利要求1所述的缀合物，其中所述抗体或其片段是单克隆抗体或其片段。3.根据权利要求1或权利要求2所述的缀合物，其中所述抗体或其片段是Fab、F(ab')2、Fab'
‑
SH、Fv、scFv、单结构域、单重链或单轻链抗体或抗体片段。4.根据权利要求1至3任一项所述的缀合物，其中所述抗体或其片段是人源化的、人或嵌合抗体或其片段。5.根据权利要求1至4任一项所述的缀合物，其中所述抗体或其片段特异性地结合人CD22。6.根据权利要求1至5任一项所述的缀合物，其中所述抗体包含重链可变(VH)结构域和轻链可变(VL)结构域，其中：(a)所述VH结构域包含来自选自SEQ ID NO:64
‑
67的VH结构域序列的CDR
‑
H1、CDR
‑
H2和CDR
‑
H3序列；(b)所述VH结构域包含含有SEQ ID NO:113的序列的CDR
‑
H1、含有SEQ ID NO:115的序列的CDR
‑
H2和含有SEQ ID NO:116的序列的CDR
‑
H3；或(c)所述VH结构域包含含有SEQ ID NO:114的序列的CDR
‑
H1、含有SEQ ID NO:189的序列的CDR
‑
H2和含有SEQ ID NO:116的序列的CDR
‑
H3。7.根据权利要求1至6任一项所述的缀合物，其中所述抗体包含重链可变(VH)结构域和轻链可变(VL)结构域，并且其中所述VH结构域包含选自SEQ ID NO:64
‑
67的氨基酸序列。8.根据权利要求1至7任一项所述的缀合物，其中所述抗体包含重链可变(VH)结构域和轻链可变(VL)结构域，其中：(a)所述VL结构域包含来自选自SEQ ID NO:68
‑
91的VL结构域序列的CDR
‑
L1、CDR
‑
L2和CDR
‑
L3序列；(b)所述VL结构域包含含有SEQ ID NO:117的序列的CDR
‑
L1、含有SEQ ID NO:119的序列的CDR
‑
L2和含有SEQ ID NO:120的序列的CDR
‑
L3；或(c)所述VL结构域包含含有SEQ ID NO:118的序列的CDR
‑
L1、含有SEQ ID NO:177的序列的CDR
‑
L2和含有SEQ ID NO:120的序列的CDR
‑
L3。
9.根据权利要求8所述的缀合物，其中所述VL结构域还包含残基N92处的氨基酸置换(编号从所述VL结构域序列的N
‑
末端开始)。10.根据权利要求9所述的缀合物，其中所述VL结构域包含选自N92A、N92L和N92S的氨基酸置换。11.根据权利要求1至7任一项所述的缀合物，其中所述抗体包含重链可变(VH)结构域和轻链可变(VL)结构域，并且其中所述VL结构域包含选自SEQ ID NO:68
‑
91的氨基酸序列。12.根据权利要求1至7任一项所述的缀合物，其中所述抗体包含重链可变(VH)结构域和轻链可变(VL)结构域，其中所述VH结构域包含氨基酸序列QVQLLESGGGVVQPGGSLRLSCAASGFAFSIYDMNWVRQAPGKGLEWVSAISSGGGTTYYADSVKGRFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCARHSGYGTHWGVLFAYWGRGTLVTVSS(SEQ ID NO:65)，和其中所述VL结构域包含氨基酸序列DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASQDIHGYLNWYQQKPGKAPKLLIYYTSILHSGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYFCQQGNTLPWTFGQGTKLEIK(SEQ ID NO:68)。13.根据权利要求1至7任一项所述的缀合物，其中所述抗体包含重链可变(VH)结构域和轻链可变(VL)结构域，其中所述VH结构域包含氨基酸序列QVQLLESGGGVVQPGGSLRLSCAASGFAFSIYDMNWVRQAPGKGLEWVSAISSGGGTTYYADSVKGRFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCARHSGYGTHWGVLFAYWGRGTLVTVSS(SEQ ID NO:65)，和其中所述VL结构域包含氨基酸序列DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASQDIHGYLNWYQQKPGKAPKLLIYYTSILHSGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYFCQQGATLPWTFGQGTKLEIK(SEQ ID NO:73)。14.根据权利要求1至7任一项所述的缀合物，其中所述抗体包含重链可变(VH)结构域和轻链可变(VL)结构域，其中所述VH结构域包含含有SEQ ID NO:113的序列的CDR
‑
H1、含有SEQ ID NO:115的序列的CDR
‑
H2和含有SEQ ID NO:116的序列的CDR
‑
H3；且所述VL结构域包含含有SEQ ID NO:117的序列的CDR
‑
L1、含有SEQ ID NO:119的序列的CDR
‑
L2和含有SEQ ID NO:120的序列的CDR
‑
L3。15.根据权利要求1至7任一项所述的缀合物，其中所述抗体包含重链可变(VH)结构域和轻链可变(VL)结构域，其中所述VH结构域包含氨基酸序列QVQLLESGGGVVQPGGSLRLSCAASGFAFSIYDMNWVRQAPGKGLEWVSAISSGGGTTYYADSVKGRFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCARHSGYGTHWGVLFAYWGRGTLVTVSS(SEQ ID NO:65)，和其中所述VL结构域包含氨基酸序列DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASQDIHGYLNWYQQKPGKAPKLLIYYTSILHSGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYFCQQGSTLPWTFGQGTKLEIK(SEQ ID NO:87)。16.根据权利要求1至4任一项所述的缀合物，其中所述抗体或其片段特异性地结合人Her2。17.根据权利要求16所述的缀合物，其中所述抗体包含重链可变(VH)结构域和轻链可变(VL)结构域，并且其中所述VH结构域包含来自VH结构域序列EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFNIKDTYIHWVRQAPGKGLEWVARIYPTNGYTRYADSVKGRFTISADTSKNTAYLQMNSLRAEDTAVYYCSRWGGDGFYAMDYWGQGTLVTVSS(SEQ ID NO:168)的CDR
‑
H1、CDR
‑
H2和CDR
‑
H3序列。18.根据权利要求17所述的缀合物，其中所述VH结构域包含序列EVQLVESGGGLVQPGGSL
RLSCAASGFNIKDTYIHWVRQAPGKGLEWVARIYPTNGYTRYADSVKGRFTISADTSKNTAYLQMNSLRAEDTAVYYCSRWGGDGFYAMDYWGQGTLVTVSS(SEQ ID NO:168)。19.根据权利要求17或权利要求18所述的缀合物，其中所述抗体包含重链可变(VH)结构域和轻链可变(VL)结构域，并且其中所述VL结构域包含来自VL结构域序列DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASQDVNTAVAWYQQKPGKAPKLLIYSASFLYSGVPSRFSGSRSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQHYTTPPTFGQGTKVEIK(SEQID NO:169)的CDR
‑
L1、CDR
‑
L2和CDR
‑
L3序列。20.根据权利要求19所述的缀合物，其中所述VL结构域包含序列DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASQDVNTAVAWYQQKPGKAPKLLIYSASFLYSGVPSRFSGSRSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQHYTTPPTFGQGTKVEIK(SEQ ID NO:169)。21.根据权利要求16所述的缀合物，其中所述抗体包含重链可变(VH)结构域和轻链可变(VL)结构域，并且其中所述VH结构域包含来自VH结构域序列EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFTDYTMDWVRQAPGKGLEWVADVNPNSGGSIYNQRFKGRFTLSVDRSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCARNLGPSFYFDYWGQGTLVTVSS(SEQ ID NO:170)的CDR
‑
H1、CDR
‑
H2和CDR
‑
H3序列。22.根据权利要求21所述的缀合物，其中所述VH结构域包含序列EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFTDYTMDWVRQAPGKGLEWVADVNPNSGGSIYNQRFKGRFTLSVDRSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCARNLGPSFYFDYWGQGTLVTVSS(SEQ ID NO:170)。23.根据权利要求21或权利要求22所述的缀合物，其中所述抗体包含重链可变(VH)结构域和轻链可变(VL)结构域，并且其中所述VL结构域包含来自VL结构域序列DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCKASQDVSIGVAWYQQKPGKAPKLLIYSASYRYTGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQYYIYPYTFGQGTKVEIK(SEQID NO:171)的CDR
‑
L1、CDR
‑
L2和CDR
‑
L3序列。24.根据权利要求21
‑
23任一项所述的缀合物，其中所述VL结构域包含序列DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCKASQDVSIGVAWYQQKPGKAPKLLIYSASYRYTGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQYYIYPYTFGQGTKVEIK(SEQ ID NO:171)。25.根据权利要求1至24任一项所述的缀合物，其中所述抗体包含Fc区。26.根据权利要求25所述的缀合物，其中所述Fc区是选自IgG1Fc区、IgG2 Fc区和IgG4 Fc区的人Fc区。27.根据权利要求26所述的缀合物，其中所述Fc区是野生型人IgG1、IgG2或IgG4 Fc区。28.根据权利要求26所述的缀合物，其中所述Fc区是包含一个或多个降低与Clq的结合的氨基酸置换的人Fc区。29.根据权利要求26所述的缀合物，其中所述Fc区是包含一个或多个氨基酸置换的人Fc区，与缺乏所述氨基酸置换的人Fc区相比，其降低了效应子功能。30.根据权利要求26所述的缀合物，其中所述Fc区是：(a)包含L234A、L235A和/或G237A置换的人IgG1 Fc区，氨基酸位置编号根据EU索引；(b)包含A330S和/或P331S置换的人IgG2 Fc区，氨基酸位置编号根据EU索引；或(c)包含S228P和/或L235E置换的人IgG4 Fc区，氨基酸位置编号根据EU索引。31.根据权利要求25、26和28
‑
30任一项所述的缀合物，其中所述Fc区还包含N297A置换，氨基酸位置编号根据EU索引。32.根据权利要求31所述的缀合物，其中所述缀合物还包含与所述Fc区的Q295残基连
接的免疫调节寡核苷酸P，如下式所示，其中L是通过酰胺键与所述Fc区的Q295连接的接头部分。33.根据权利要求26和28至32任一项所述的缀合物，其中所述Fc区还包含D265A置换，氨基酸位置编号根据EU索引。34.根据权利要求1至24任一项所述的缀合物，其中所述抗体包含抗体重链恒定结构域，所述抗体重链恒定结构域包含选自SEQ ID NO:92
‑
107和178的氨基酸序列。35.根据权利要求1至34任一项所述的缀合物，其中所述抗体包含人λ轻链。36.根据权利要求1至34任一项所述的缀合物，其中所述抗体包含人κ轻链。37.根据权利要求1至34任一项所述的缀合物，其中所述抗体包含抗体轻链恒定结构域，所述抗体轻链恒定结构域包含选自SEQ ID NO:108
‑
110的氨基酸序列。38.根据权利要求1至37任一项所述的缀合物，其中所述抗体包含两条抗体重链和两条抗体轻链，并且其中一个Q标签连接所述抗体的一条或两条重链。39.根据权利要求38所述的缀合物，其中所述Q标签与所述抗体的重链的C
‑
末端融合。40.根据权利要求1至37任一项所述的缀合物，其中所述抗体包含两条抗体重链和两条抗体轻链，并且其中一个Q标签连接所述抗体的一条或两条轻链。41.根据权利要求38所述的缀合物，其中所述Q
‑
标签在所述Fc结构域内。42.根据权利要求1至15和25至41任一项所述的缀合物，其中所述缀合物与B细胞表面上表达的人CD22结合。43.根据权利要求1至42任一项所述的缀合物，其中所述缀合物诱导TLR9的激活。44.根据权利要求1至43任一项所述的缀合物，其中每个Q
‑
标签独立地包含具有5至15个氨基酸残基的肽序列。45.根据权利要求1至44任一项所述的缀合物，其中所述Q
‑
标签是天然存在的。46.根据权利要求1至42任一项所述的缀合物，其中每个Q
‑
标签的肽序列独立地选自SEQ ID NO:39
‑
55。47.根据权利要求1至42任一项所述的缀合物，其中所述Q
‑
标签包含肽序列RPQGF(SEQ ID NO:47)。48.根据权利要求1至47任一项所述的缀合物，其中每个Q标签独立地包含RPQGF(SEQ ID NO:47)、RPQGFPP(SEQ ID NO:48)或RPQGFGPP(SEQ ID NO:49)。49.根据权利要求1至48任一项所述的缀合物，其中1或2个Q
‑
标签与所述抗体或抗原结合片段连接。50.根据权利要求1至49任一项所述的缀合物，其中所述缀合物的DAR为1或2。51.根据权利要求1至50任一项所述的缀合物，其中所述接头L包含聚乙二醇部分。52.根据权利要求1至51任一项所述的缀合物，其中所述接头L是其中m是范围从约0至约50的整数，并且其中表示与T3的连接点，和表示与所述缀合物的其余部分的连接点。53.根据权利要求1至52任一项所述的缀合物，其中Z是S。
54.根据权利要求1至53任一项所述的缀合物，其中所述寡核苷酸P包含至少一对孪位T1和T2，其中T1是S和T2是S
‑
。55.根据权利要求54所述的缀合物，其中T1是S和T2是S的该至少一对孪位T1和T2位于核苷残基1的3'
‑
位置。56.根据权利要求54所述的缀合物，其中T1是S和T2是S的该至少一对孪位T1和T2位于核苷残基2的3'
‑
位置。57.根据权利要求54所述的缀合物，其中T1是S和T2是S的该至少一对孪位T1和T2位于核苷残基3的3'
‑
位置。58.根据权利要求54所述的缀合物，其中T1是S和T2是S的该至少一对孪位T1和T2位于核苷残基5的3'
‑
位置。59.根据权利要求54所述的缀合物，其中T1是S和T2是S的该至少一对孪位T1和T2位于核苷残基6的3'
‑
位置。60.根据权利要求54所述的缀合物，其中T1是S和T2是S的该至少一对孪位T1和T2位于核苷残基7的3'
‑
位置。61.根据权利要求54所述的缀合物，其中T1是S和T2是S的该至少一对孪位T1和T2位于核苷残基8的3'
‑
位置。62.根据权利要求54所述的缀合物，其中T1是S和T2是S的该至少一对孪位T1和T2位于核苷残基9的3'
‑
位置。63.根据权利要求54所述的缀合物，其中T1是S和T2是S的该至少一对孪位T1和T2位于核苷残基10的3'
‑
位置。64.根据权利要求54所述的缀合物，其中T1是S和T2是S的该至少一对孪位T1和T2位于核苷残基11的3'
‑
位置。65.根据权利要求54所述的缀合物，其中T1是S和T2是S的该至少一对孪位T1和T2位于核苷残基12的3'
‑
位置。66.根据权利要求54所述的缀合物，其中T1是S和T2是S的该至少一对孪位T1和T2位于核苷残基13的3'
‑
位置。67.根据权利要求54所述的缀合物，其中T1是S和T2是S的该至少一对孪位T1和T2位于核苷残基14的3'
‑
位置。68.根据权利要求54所述的缀合物，其中T1是S和T2是S的该至少一对孪位T1和T2位于核苷残基15的3'
‑
位置。69.根据权利要求1至68任一项所述的缀合物，其中所述寡核苷酸P包含至少两对孪位T1和T2，其中T1是S和T2是S
‑
。70.根据权利要求1至69任一项所述的缀合物，其中R5’
是H。71.根据权利要求1至69任一项所述的缀合物，其中R5’
是甲氧基。72.根据权利要求1至71任一项所述的缀合物，其中R
c1
是H。73.根据权利要求1至71任一项所述的缀合物，其中R
c1
是甲氧基。74.根据权利要求1至73任一项所述的缀合物，其中R2是甲基。75.根据权利要求1至73任一项所述的缀合物，其中R2是H。76.根据权利要求1至75任一项所述的缀合物，其中m是20至25的整数。
77.根据权利要求76所述的缀合物，其中m为24。78.根据权利要求1至77任一项所述的缀合物，其中U5’
是溴。79.根据权利要求1至77任一项所述的缀合物，其中U5’
是
‑
H。80.根据权利要求1至53任一项所述的缀合物，其中每个P独立地包含选自表10的寡核苷酸。81.一种缀合物，其包含抗体或其抗原结合片段(Ab)和一个或多个免疫调节寡核苷酸(P)，其中所述抗体或抗原结合片段与一个或多个包含氨基酸序列RPQGF(SEQ ID NO:47)的Q
‑
标签肽(Q)连接，和其中每个免疫调节寡核苷酸(P)通过与Q
‑
标签肽的谷氨酰胺残基的酰胺键和接头(L)与该Q
‑
标签肽连接，如式(A)所示：其中表示每个Q与所述抗体或其抗原结合片段(Ab)的连接点。82.根据权利要求81所述的缀合物，其中所述抗体包含两条重链和两条轻链，其中所述抗体的每条重链与Q
‑
标签肽连接，并且其中所述Q
‑
标签肽中的一个或两个与免疫调节寡核苷酸P连接。83.根据权利要求81所述的缀合物，其中所述抗体或其片段是单克隆抗体或其片段。84.根据权利要求81至83任一项所述的缀合物，其中所述抗体或其片段是Fab、F(ab')2、Fab'
‑
SH、Fv、scFv、单结构域、单重链或单轻链抗体或抗体片段。85.根据权利要求81至84任一项所述的缀合物，其中所述抗体或其片段是人源化的、人或嵌合抗体或其片段。86.根据权利要求81至85任一项所述的缀合物，其中所述抗体或其片段特异性结合人CD22。87.根据权利要求86所述的缀合物，其中所述抗体包含重链可变(VH)结构域和轻链可变(VL)结构域，其中：(a)所述VH结构域包含来自选自SEQ ID NO:64
‑
67的VH结构域序列的CDR
‑
H1、CDR
‑
H2和CDR
‑
H3序列；(b)所述VH结构域包含含有SEQ ID NO:113的序列的CDR
‑
H1、含有SEQ ID NO:115的序列的CDR
‑
H2和含有SEQ ID NO:116的序列的CDR
‑
H3；或(c)所述VH结构域包含含有SEQ ID NO:114的序列的CDR
‑
H1、含有SEQ ID NO:189的序列的CDR
‑
H2和含有SEQ ID NO:116的序列的CDR
‑
H3。88.根据权利要求86或权利要求87所述的缀合物，所述抗体包含重链可变(VH)结构域和轻链可变(VL)结构域，并且其中所述VH结构域包含选自SEQ ID NO:64
‑
67的氨基酸序列。89.根据权利要求81至88任一项所述的缀合物，其中所述抗体包含重链可变(VH)结构域和轻链可变(VL)结构域，并且其中：(a)所述VL结构域包含来自选自SEQ ID NO:68
‑
91的VL结构域序列的CDR
‑
L1、CDR
‑
L2和
CDR
‑
L3序列；(b)所述VL结构域包含含有SEQ ID NO:117的序列的CDR
‑
L1、含有SEQ ID NO:119的序列的CDR
‑
L2和含有SEQ ID NO:120的序列的CDR
‑
L3；或(c)所述VL结构域包含含有SEQ ID NO:118的序列的CDR
‑
L1、含有SEQ ID NO:177的序列的CDR
‑
L2和含有SEQ ID NO:120的序列的CDR
‑
L3。90.根据权利要求89所述的缀合物，其中所述VL结构域还包含残基N92处的氨基酸置换(编号从所述VL结构域序列的N
‑
末端开始)。91.根据权利要求90所述的缀合物，其中所述VL结构域包含选自N92A、N92L和N92S的氨基酸置换。92.根据权利要求81至88任一项所述的缀合物，其中所述抗体包含重链可变(VH)结构域和轻链可变(VL)结构域，并且其中所述VL结构域的氨基酸序列选自SEQ ID NO:68
‑
91。93.根据权利要求86所述的缀合物，其中所述抗体包含重链可变(VH)结构域和轻链可变(VL)结构域，其中所述VH结构域包含氨基酸序列QVQLLESGGGVVQPGGSLRLSCAASGFAFSIYDMNWVRQAPGKGLEWVSAISSGGGTTYYADSVKGRFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCARHSGYGTHWGVLFAYWGRGTLVTVSS(SEQ ID NO:65)，和其中所述VL结构域包含氨基酸序列DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASQDIHGYLNWYQQKPGKAPKLLIYYTSILHSGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYFCQQGNTLPWTFGQGTKLEIK(SEQ ID NO:68)。94.根据权利要求86所述的缀合物，其中所述抗体包含重链可变(VH)结构域和轻链可变(VL)结构域，其中所述VH结构域包含氨基酸序列QVQLLESGGGVVQPGGSLRLSCAASGFAFSIYDMNWVRQAPGKGLEWVSAISSGGGTTYYADSVKGRFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCARHSGYGTHWGVLFAYWGRGTLVTVSS(SEQ ID NO:65)，和其中所述VL结构域包含氨基酸序列DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASQDIHGYLNWYQQKPGKAPKLLIYYTSILHSGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYFCQQGATLPWTFGQGTKLEIK(SEQ ID NO:73)。95.根据权利要求86所述的缀合物，其中所述抗体包含重链可变(VH)结构域和轻链可变(VL)结构域，其中所述VH结构域包含含有SEQ ID NO:113的序列的CDR
‑
H1、含有SEQ ID NO:115的序列的CDR
‑
H2和含有SEQ ID NO:116的序列的CDR
‑
H3；且所述VL结构域包含含有SEQ ID NO:117的序列的CDR
‑
L1、含有SEQ IDNO:119的序列的CDR
‑
L2和含有SEQ ID NO:120的序列的CDR
‑
L3。96.根据权利要求86所述的缀合物，其中所述抗体包含重链可变(VH)结构域和轻链可变(VL)结构域，其中所述VH结构域包含氨基酸序列QVQLLESGGGVVQPGGSLRLSCAASGFAFSIYDMNWVRQAPGKGLEWVSAISSGGGTTYYADSVKGRFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCARHSGYGTHWGVLFAYWGRGTLVTVSS(SEQ ID NO:65)，和其中所述VL结构域包含氨基酸序列DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASQDIHGYLNWYQQKPGKAPKLLIYYTSILHSGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYFCQQGSTLPWTFGQGTKLEIK(SEQ ID NO:87)。97.根据权利要求81至85任一项所述的缀合物，其中所述抗体或其片段特异性结合人Her2。
98.根据权利要求97所述的缀合物，其中所述抗体包含重链可变(VH)结构域和轻链可变(VL)结构域，并且其中所述VH结构域包含来自VH结构域序列EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFNIKDTYIHWVRQAPGKGLEWVARIYPTNGYTRYADSVKGRFTISADTSKNTAYLQMNSLRAEDTAVYYCSRWGGDGFYAMDYWGQGTLVTVSS(SEQ ID NO:168)的CDR
‑
H1、CDR
‑
H2和CDR
‑
H3序列。99.根据权利要求98所述的缀合物，其中所述VH结构域包含序列EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFNIKDTYIHWVRQAPGKGLEWVARIYPTNGYTRYADSVKGRFTISADTSKNTAYLQMNSLRAEDTAVYYCSRWGGDGFYAMDYWGQGTLVTVSS(SEQ ID NO:168)。100.根据权利要求98或权利要求99所述的缀合物，其中所述抗体包含重链可变(VH)结构域和轻链可变(VL)结构域，并且其中所述VL结构域包含来自VL结构域序列DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASQDVNTAVAWYQQKPGKAPKLLIYSASFLYSGVPSRFSGSRSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQHYTTPPTFGQGTKVEIK(SEQ ID NO:169)的CDR
‑
L1、CDR
‑
L2和CDR
‑
L3序列。101.根据权利要求99或权利要求100所述的缀合物，其中所述VL结构域包含序列DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASQDVNTAVAWYQQKPGKAPKLLIYSASFLYSGVPSRFSGSRSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQHYTTPPTFGQGTKVEIK(SEQ ID NO:169)。102.根据权利要求97所述的缀合物，其中所述抗体包含重链可变(VH)结构域和轻链可变(VL)结构域，并且其中所述VH结构域包含来自VH结构域序列EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFTDYTMDWVRQAPGKGLEWVADVNPNSGGSIYNQRFKGRFTLSVDRSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCARNLGPSFYFDYWGQGTLVTVSS(SEQ ID NO:170)的CDR
‑
H1、CDR
‑
H2和CDR
‑
H3序列。103.根据权利要求102所述的缀合物，其中所述VH结构域包含序列EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFTDYTMDWVRQAPGKGLEWVADVNPNSGGSIYNQRFKGRFTLSVDRSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCARNLGPSFYFDYWGQGTLVTVSS(SEQ ID NO:170)。104.根据权利要求102或权利要求103所述的缀合物，其中所述抗体包含重链可变(VH)结构域和轻链可变(VL)结构域，并且其中所述VL结构域包含来自VL结构域序列DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCKASQDVSIGVAWYQQKPGKAPKLLIYSASYRYTGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQYYIYPYTFGQGTKVEIK(SEQ ID NO:171)的CDR
‑
L1、CDR
‑
L2和CDR
‑
L3序列。105.根据权利要求102至104任一项所述的缀合物，其中所述VL结构域包含序列DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCKASQDVSIGVAWYQQKPGKAPKLLIYSASYRYTGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQYYIYPYTFGQGTKVEIK(SEQ ID NO:171)。106.根据权利要求81至105任一项所述的缀合物，其中所述抗体包含Fc区。107.根据权利要求106所述的缀合物，其中所述Fc区是选自IgG1Fc区、IgG2 Fc区和IgG4 Fc区的人Fc区。108.根据权利要求107所述的缀合物，其中所述Fc区是野生型人IgG1、IgG2或IgG4 Fc区。109.根据权利要求107所述的缀合物，其中所述Fc区是包含一个或多个氨基酸置换的人Fc区，与缺乏所述氨基酸置换的人Fc区相比，其降低了效应子功能。110.根据权利要求107所述的缀合物，其中所述Fc区是包含一个或多个降低与Clq的结合的氨基酸置换的人Fc区。111.根据权利要求107所述的缀合物，其中所述Fc区是：(a)包含L234A、L235A和/或G237A置换的人IgG1 Fc区，氨基酸位置编号根据EU索引；
(b)包含A330S和/或P331S置换的人IgG2 Fc区，氨基酸位置编号根据EU索引；或(c)包含S228P和/或L235E置换的人IgG4 Fc区，氨基酸位置编号根据EU索引。112.根据权利要求106、107和109
‑
111任一项所述的缀合物，其中所述Fc区还包含N297A置换，氨基酸位置编号根据EU索引。113.根据权利要求112所述的缀合物，其中所述缀合物还包含与所述Fc区的Q295残基连接的免疫调节寡核苷酸P，如下式所示，其中L是通过酰胺键与所述Fc区的Q295连接的接头部分。114.根据权利要求108和110至113任一项所述的缀合物，其中所述Fc区还包含D265A置换，氨基酸位置编号根据EU索引。115.根据权利要求81至105任一项所述的缀合物，其中所述抗体包含抗体重链恒定结构域，所述抗体重链恒定结构域包含选自SEQ ID NO:92
‑
107和178的氨基酸序列。116.根据权利要求81至115任一项所述的缀合物，其中所述抗体包含人λ轻链。117.根据权利要求81至115任一项所述的缀合物，其中所述抗体包含人κ轻链。118.根据权利要求111至115任一项所述的缀合物，其中所述抗体包含抗体轻链恒定结构域，所述抗体轻链恒定结构域包含选自SEQ ID NO:108
‑
110的氨基酸序列。119.根据权利要求81至96和106至118任一项所述的缀合物，其中所述缀合物与B细胞表面上表达的人CD22结合。120.根据权利要求81至119任一项所述的缀合物，其中所述缀合物诱导TLR9的激活。121.根据权利要求81至120任一项所述的缀合物，其中所述抗体包含两条抗体重链和两条抗体轻链，并且其中一个Q标签连接所述抗体的一条或两条重链。122.根据权利要求121所述的缀合物，其中所述Q
‑
标签与所述抗体的重链的C
‑
末端融合。123.根据权利要求121所述的缀合物，其中所述Q
‑
标签在所述抗体的重链的Fc结构域内。124.根据权利要求81至120任一项所述的缀合物，其中所述抗体包含两条抗体重链和两条抗体轻链，并且其中一个Q标签连接所述抗体的一条或两条轻链。125.根据权利要求81至124任一项所述的缀合物，其中每个Q
‑
标签独立地包含序列RPQGF(SEQ ID NO:47)、RPQGFPP(SEQ ID NO:48)或RPQGFGPP(SEQ ID NO:49)。126.根据权利要求81至125任一项所述的缀合物，其中1或2个Q
‑
标签与所述抗体或抗原结合片段连接。127.根据权利要求81至126任一项所述的缀合物，其中所述缀合物的DAR为1或2。128.根据权利要求81至127任一项所述的缀合物，其中每个免疫调节寡核苷酸P独立地是其中
b和c各自独立地为1至25的整数；条件是b和c之和至少为5；表示所述免疫调节寡核苷酸P与所述缀合物的其余部分的连接点；X5’
是具有结构的5'末端核苷；X3’
是具有结构的3'末端核苷；Y
PTE
是具有结构的核苷间磷酸三酯，其中*表示与所述寡核苷酸的其余部分的连接点，并且表示与所述接头L的连接点，或如果L不存在，则表示在谷氨酰胺残基处通过酰胺键与所述Q标签肽的连接点；Y3’
是具有结构的末端磷酸三酯；每个X
N
独立地是具有结构的核苷；每个Y
N
独立地是具有结构的核苷间接头；其中每个B
N
独立地是修饰的或未修饰的核碱基；每个R
N
独立地为
‑
H或
‑
O
‑
C1‑4‑
烷基，其中所述
‑
O
‑
C1‑4‑
烷基的C1‑4‑
烷基进一步任选被
‑
O
‑
C1‑
C4‑
烷基取代；B5’
和B3’
独立地是修饰的或未修饰的核碱基；R5’
和R3’
独立地为
‑
H或
‑
O
‑
C1‑
C4‑
烷基，其中所述
‑
O
‑
C1‑
C4‑
烷基的C1‑4‑
烷基进一步任选地被
‑
O
‑
C1‑
C4‑
烷基取代；每个T1独立地为O或S；每个T2独立地为O
‑
或S
‑
；和T3是包含低聚乙二醇部分的基团；和R1是C1‑4‑
亚烷基
‑
羟基。
129.根据权利要求128所述的缀合物，其中b为3。130.根据权利要求128或权利要求129所述的缀合物，其中(i)P包含至少一个修饰的核苷X
N
；(ii)P具有至少一个修饰的核苷间接头Y
N
，其中T1或T2中的至少一个是S；或(iii)(i)和(ii)两者。131.根据权利要求128至130任一项所述的缀合物，其中P具有至少一个二硫代磷酸酯或硫代磷酸酯核苷间接头。132.根据权利要求128至131任一项所述的缀合物，其中P包含0、1、2或3个二硫代磷酸酯核苷间接头。133.根据权利要求128至132任一项所述的缀合物，其中P包含选自2
’‑
O
‑
烷基核苷、2
’‑
O
‑
烷氧基烷基核苷、2
’‑
脱氧核苷和核糖核苷的修饰的核苷。134.根据权利要求133所述的缀合物，其中所述修饰的核苷选自5
‑
溴
‑2’‑
O
‑
甲基尿苷、5
‑
溴
‑2’‑
脱氧尿苷、2
’‑
O
‑
甲基尿苷、2
’‑
脱氧尿苷、2
’‑
O
‑
甲基胸苷、2
’‑
O
‑
甲基胞苷、2
’‑
O
‑
(2
‑
甲氧基乙基)胸苷和8
‑
氧代
‑
7,8
‑
二氢
‑2’‑
脱氧鸟苷。135.根据权利要求128至134任一项所述的缀合物，其中X5’
是5
‑
溴
‑
2'
‑
O
‑
甲基尿苷、5
‑
溴
‑
2'
‑
脱氧尿苷、2'
‑
O
‑
甲基尿苷或2'
‑
脱氧尿苷。136.根据权利要求128至135任一项所述的缀合物，其中Y3’
或在X5’
的3'位置处的Y
N
包含未取代或取代的硫代磷酸酯。137.根据权利要求128至136任一项所述的缀合物，其中Y
PTE
是：其中Z是O或S；d是0至95的整数；结构右侧的两个表示与所述寡核苷酸P中相邻核苷X
N
的连接点，并且所述结构左侧的表示与所述接头L的连接点。138.根据权利要求128至136任一项所述的缀合物，其中Y
PTE
是：是：其中Z是O或S；d是0至95的整数；结构右侧的两个表示与所述寡核苷酸P中相邻核苷
X
N
的连接点，并且所述结构左侧的一个表示与所述接头L的连接点。139.根据权利要求137或138所述的缀合物，其中Z是S。140.根据权利要求137至139任一项所述的缀合物，其中d为1至25的整数。141.根据权利要求81至140任一项所述的缀合物，其中所述接头L包含聚乙二醇部分。142.根据权利要求81至141任一项所述的缀合物，其中所述接头L为其中m是范围从约0至约50的整数，并且其中表示与Y
PTE
的连接点，和表示与所述缀合物的其余部分的连接点。143.根据权利要求81至142任一项所述的缀合物，其中P包含一个或多个CpG位点。144.根据权利要求81至143任一项所述的缀合物，其中P包含至少3个CpG位点。145.根据权利要求81至144任一项所述的缀合物，其中每个P独立地包含选自表9或表10的寡核苷酸。146.根据权利要求81至145任一项所述的缀合物，其中所述抗体包含两条抗体轻链、两条抗体重链和两个Q
‑
标签肽；其中所述Q
‑
标签肽中的每一个与所述抗体重链之一的C
‑
末端连接；并且其中所述Q
‑
标签肽之一通过与该Q
‑
标签肽的谷氨酰胺残基的酰胺键和接头(L)与免疫调节寡核苷酸(P)连接。147.一种缀合物，其包含抗体或其抗原结合片段(Ab)和一个或多个免疫调节寡核苷酸(P)，其中所述抗体或抗原结合片段与一个或多个Q
‑
标签肽(Q)连接，并且其中每个免疫调节寡核苷酸通过与Q
‑
标签肽的谷氨酰胺残基的酰胺键和接头(L)与该Q
‑
标签肽连接，如式(A)所示其中：表示每个Q与所述抗体或其抗原结合片段(Ab)的连接点；每个Q独立地包含Q
‑
标签肽序列RPQGF(SEQ ID NO:47)；每个L独立地是键或接头部分其中m是范围从约0至约50的整数，并且其中表示与P的连接点，和表示与所述缀合物的其余部分的连接点，所述缀合物的其余部分通过与谷氨酰胺残基的酰胺键与Q连接；和每个P独立地是具有以下结构的免疫调节寡核苷酸：
其中和表示所述寡核苷酸内的连接点，并且其中表示与所述接头L的连接点；其中Ab包含重链可变(VH)结构域和轻链可变(VL)结构域。148.根据权利要求147所述的缀合物，其中每个Q标签独立地包含RPQGF(SEQ ID NO:47)、RPQGFPP(SEQ ID NO:48)或RPQGFGPP(SEQ ID NO:49)。149.根据权利要求148所述的缀合物，其中每个Q标签是RPQGFGPP(SEQ ID NO:49)。150.根据权利要求147
‑
149任一项所述的缀合物，其中1或2个Q
‑
标签与所述抗体或抗原结合片段连...

【专利技术属性】
技术研发人员：J，
申请(专利权)人：塔拉克治疗公司，
类型：发明
国别省市：