【技术实现步骤摘要】
一种靶向甲基孢囊菌的原位荧光杂交探针和试剂盒及应用与原位荧光杂交鉴定方法
[0001]本专利技术属于微生物
,具体地,涉及一种靶向甲基孢囊菌的原位荧光杂交探针,包含该原位荧光杂交探针的试剂盒,所述原位荧光杂交探针和试剂盒的应用,以及一种甲基孢囊菌的原位荧光杂交鉴定方法。
技术介绍
[0002]甲基孢囊菌,好氧,以氧为末端电子受体的严格呼吸型。甲烷、甲醇和甲醛是仅知的能源和碳源。本申请的专利技术人在富含天然气地区土壤中发现该菌占较大的丰度,该菌具有较为健全的甲烷气降解代谢途径。为了能够快速、准确鉴定甲基孢囊菌,亟需对其典型菌株在混合体系中的检测技术进行开发研究。
[0003]目前,甲基孢囊菌的常见检测鉴定方法有两种:1、生理生化鉴定,需分离出纯菌后,对微生物生理生化进行定性研究,该方法周期长且对培养物纯度要求较高;2、基因提取后进行16S rRNA测序,该方法仍需获取纯培养物进行全基因提取,再通过通用16S rRNA引物获取保守序列进行测序。
[0004]荧光原位杂交技术结合了分子生物学的精确性和显微镜的 ...
【技术保护点】
【技术特征摘要】
1.一种靶向甲基孢囊菌(Methylocystis)的原位荧光杂交探针,其特征在于,该探针具有以下结构:M
‑
F,其中,M为特异性识别甲基孢囊菌的核酸,F为荧光基团。2.根据权利要求1所述的原位荧光杂交探针,其中,所述特异性识别甲基孢囊菌的核酸的序列如SEQ ID NO:1所示:5
’‑
GAGGTGAGTGGAACTGCGAGT
‑3’
(SEQ ID NO:1)。3.根据权利要求1所述的原位荧光杂交探针,其中,所述荧光基团为绿色荧光基团。4.根据权利要求3所述的原位荧光杂交探针,其中,所述荧光基团为FAM。5.根据权利要求2所述的原位荧光杂交探针,其中,所述原位荧光杂交探针为5
’‑
GAGGTGAGTGGAACTGCGAGT
‑
FAM
‑3’
。6.一种原位荧光检测试剂盒,其特征在于,该试剂盒包括:1)权利要求1
‑
5中任意一项所述的原位荧光杂交探针;2)多聚甲醛溶液;3)杂交缓冲液;4)SSC储存液;5)DAPI;以及,...
【专利技术属性】
技术研发人员:顾磊,许科伟,汤玉平,赵克斌,李武,杨帆,
申请(专利权)人:中国石油化工股份有限公司石油勘探开发研究院,
类型:发明
国别省市:
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