微生物在调节体重和胆固醇水平中的用途制造技术

本发明专利技术涉及以下发现：用于粪便微生物群移植(FMT)的组合物(包括从FMT供体获得的粪便材料)中的某些微生物物种可以影响FMT治疗的结果，如调节FMT受体的体重和胆固醇水平。因此，提供了用于将对象鉴定为合适的供体以优化FMT结果以及为了优化的FMT结果预处理供体和/或受体的方法。还提供了用于改善FMT结果(包括体重和/或胆固醇降低)的试剂盒和组合物。重和/或胆固醇降低)的试剂盒和组合物。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】微生物在调节体重和胆固醇水平中的用途
相关申请
[0001]本申请要求2020年3月30日提交的美国临时专利申请第63/001,682号的优先权，将所述美国临时专利申请的内容出于所有目的通过引用以其整体并入本文。专利技术背景
[0002]随着全球生活水平的不断提高，患有糖尿病和心血管疾病的个体的数量也在迅速增加。例如，世界卫生组织(WHO)估计到2030年，全世界患有糖尿病的人数将超过3.5亿。由于糖尿病和心血管疾病的发病率上升、其对健康的严重影响及其深远的经济后果，迫切需要新的且有效的手段来治疗高风险个体以降低或消除其随后患有糖尿病和/或心血管疾病的风险，所述个体尤其是已经表现出未来有高的疾病发展可能性的早期迹象的那些个体，如肥胖、高于正常的血液胆固醇或甘油三酯水平，包括高于正常的低密度脂蛋白胆固醇(LDL
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C)血液水平和/或低于正常的高密度脂蛋白胆固醇(HDL
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C)血液水平。本专利技术通过提供能够有效调节患者体重和血液胆固醇水平的新方法和组合物来满足这种需求和其它相关需求。专利技术概述
[0003]本专利技术涉及用于优化粪便微生物群移植(FMT)治疗，也称为肠道微生物群移植(IMT)，尤其是用于使赋予FMT受体的健康益处最大化的新方法和组合物。特别地，本申请的专利技术人发现，当某些微生物物种(例如，细菌物种)存在，尤其是以升高的水平存在于用于FMT受体的移植材料中，随后存在于接受FMT治疗之后的受体的胃肠道(GI，尤其是肠道)中时，可以在FMT受体中实现显著的健康益处，如体重减轻、较高的胰岛素敏感性、血液中较低的总胆固醇(TC)、较低的血液低密度脂蛋白胆固醇(LDL
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C)、较高的血液高密度脂蛋白胆固醇(HDL
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C)和较低的血液甘油三酯(TG)。这些发现允许本申请的专利技术人设计出在这些健康益处方面可以改善FMT功效的方法和组合物。因此，本专利技术提供了用于鉴定FMT的合适供体的新方法，该供体在适当处理之后提供了用于FMT的粪便材料。所述方法包括测定从FMT供体的候选者获得的粪便样品中表2、3、4、5或6示出的一种或多种细菌物种的水平的步骤。
[0004]在第一方面，本专利技术提供了用于鉴定FMT的合适供体的方法，其包括测定从候选者获得的粪便样品中表2
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6示出的一种或多种细菌物种的水平的步骤。在一些实施方案中，一种或多种细菌物种的水平是相对丰度百分比。在一些实施方案中，当发现表2
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6中的一种或多种细菌物种的水平大于它们相应的截止值时，候选者被鉴定为FMT的合适供体。在一些实施方案中，所述方法还包括从合适的候选者获得粪便材料以用于FMT的步骤。在一些实施方案中，所述方法还包括测定粪便样品中的总细菌载量的步骤。
[0005]在一些实施方案中，在从第一候选者获得的第一粪便样品以及从第二候选者获得的第二粪便样品中测定表2
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6中示出的一种或多种细菌物种的水平。在一些实施方案中，第一候选者具有比第二候选者更高水平的表2
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6中示出的一种或多种细菌物种中的每一种，并且被认为是比第二候选者更合适的FMT供体。在一些实施方案中，第一候选者具有比第二候选者高一半以上的表2
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6中示出的一种或多种细菌物种的水平，并且被认为是比第二候选者更合适的FMT供体。
[0006]在一个实例中，当筛选供体作为合适的FMT供体的潜能时，尤其是为了帮助受体减轻体重的目的，在其粪便样品中存在的有益细菌如普通拟杆菌(Bacteroides vulgatus)和绒毛提氏菌(Alistipes onderdonkii)应达到或超过以下相对量的阈值：例如，对于普通拟杆菌，至少约1％或含有至少约0.1％的绒毛提氏菌。另一方面，如果候选供体的粪便样品中具有不足量的有益细菌(例如，对于普通拟杆菌，小于约1％，并且对于绒毛提氏菌，小于约0.1％)，则应排除将其用作供体，尤其是当在所提议的FMT方法中体重减轻是一个目标时。
[0007]在第二方面，提供了用于改善FMT功效的方法，所述方法包括在FMT之前，将有效量的表2
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6中示出的一种或多种细菌物种引入旨在用于移植的组合物中。在一些实施方案中，在引入步骤之后，表2
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6中示出的一种或多种细菌物种中的每一种的水平大于所述组合物中总细菌的某一百分比(例如，大于对应于每种细菌物种的截止值)。在一些实施方案中，所述方法还包括使用所述组合物进行FMT的步骤。在一些实施方案中，所述方法还包括使用所述组合物进行FMT的步骤。
[0008]在第三方面，提供了试剂盒，其包含(1)含有供体粪便的第一组合物；以及(2)含有有效量的表2
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6中示出的一种或多种细菌物种的第二组合物。在一些实施方案中，第一组合物包含已经被干燥、冷冻并且被放置在用于口服摄入的胶囊中的供体粪便。在一些实施方案中，第一组合物包含供体粪便，其已经被配制成用于经由食道胃十二指肠镜检查(OGD)、乙状结肠镜检查或灌肠直接递送的溶液、悬浮液、半液体或糊剂的形式。在一些实施方案中，所述试剂盒可以包含印刷的说明书以指导使用者正确使用所述试剂盒。
[0009]在一些实施方案中，在上述方法中，通过定量聚合酶链式反应(PCR)测定表2
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6中示出的一种或多种细菌物种的水平。
[0010]另外，提供了用于治疗应用的各种方法：例如，提供了用于阻抑对象中的血液LDL
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C水平的方法，其包括将有效量的表3和5中示出的一种或多种细菌物种引入对象的胃肠道的步骤。在一些情况下，通过FMT(也称为IMT)来进行引入步骤。任选地，在进行如通过FMT/IMT引入有益细菌物种的步骤之前，进行对个体施用有效量的广谱抗菌剂如抗生素的步骤。
[0011]此外，提供了用于阻抑对象中的血液总胆固醇的方法，其包括将有效量的表4中示出的一种或多种细菌物种引入对象的胃肠道的步骤。在一些情况下，通过诸如IMT的FMT来进行引入步骤。任选地，在进行如通过FMT或IMT引入有益细菌物种的步骤之前，进行对个体施用有效量的广谱抗菌剂如抗生素的步骤。
[0012]另外，提供了用于阻抑对象中的血液甘油三酯的方法，其包括将有效量的表6中示出的一种或多种细菌物种引入对象的胃肠道的步骤。任选地，在进行如通过FMT/IMT引入有益细菌物种的步骤之前，进行对个体施用有效量的广谱抗菌剂如抗生素的步骤。
[0013]此外，提供了用于提高对象中的血液HDL
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C水平的方法，其包括例如通过FMT/IMT将有效量的细菌物种阴沟肠杆菌(Enterobacter cloacae)引入对象的胃肠道的步骤。任选地，在进行如通过FMT/IMT的引入步骤之前，进行对个体施用有效量的广谱抗菌剂如抗生素的步骤。
[0014]最后，提供了减轻对象体重的方法，其包括将有效量的表2中示出的一种或多种细菌物种引入对象的胃肠道的步骤。任选地，在进行如通过FMT/IMT引入表2中示出的有益本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】1.用于在对象中减轻体重、降低低密度脂蛋白(LDL)
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胆固醇、降低总胆固醇、降低甘油三酯或增加高密度脂蛋白(HDL)
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胆固醇的方法，其包括将有效量的表2
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6中示出的一种或多种细菌物种引入所述对象的胃肠道中。2.如权利要求1所述的方法，其还包括在所述引入步骤之前测量取自所述对象的粪便样品中的所述一种或多种细菌物种的水平的步骤以及在所述引入步骤之后测量取自所述对象的另一个粪便样品中的所述一种或多种细菌物种的水平的步骤。3.如权利要求2所述的方法，其中与所述引入步骤之前的一种或多种细菌物种的相应水平相比，所述引入步骤之后的一种或多种细菌物种的水平增加。4.如权利要求1所述的方法，其中所述引入步骤包括FMT或者向所述对象施用包含培养的和/或浓缩的所述一种或多种细菌物种的组合物。5.如权利要求1所述的方法，其还包括在所述引入步骤之后测定取自所述对象的粪便样品中的所述一种或多种细菌物种的相对丰度百分比的步骤。6.如权利要求5所述的方法，其中在所述引入步骤之后所述一种或多种细菌物种的相对丰度百分比大于表2
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6中的相应截止值。7.如权利要求1所述的方法，其中将有效量的细菌物种阴沟肠杆菌(Enterobacter cloacae)施用至所述对象，从而增加所述对象胃肠道中的细菌物种阴沟肠杆菌的水平并增加所述对象的高密度脂蛋白(HDL)
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胆固醇。8.如权利要求7所述的方法，其还包括在所述施用步骤之前测量取自所述对象的血液样品中的HDL
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C水平的步骤以及在所述施用步骤之后测量取自所述对象的另一个血液样品中的HDL
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C水平的步骤。9.如权利要求1所述的方法，其中将有效量的表2中示出的一种或两种细菌物种施用至所述对象，从而增加所述对象胃肠道中的所述一种或两种细菌物种的水平并减轻所述对象的体重。10.如权利要求9所述的方法，其还包括在所述施用步骤之前测量所述对象的体重的步骤以及在所述施用步骤之后再次测量所述对象的体重的步骤。11.如权利要求1所述的方法，其中将有效量的表3和5中示出的一种或多种细菌物种施用至所述对象，从而增加所述对象胃肠道中的所述一种或多种细菌物种的水平并降低所述对象中的LDL
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C水平。12.如权利要求11所述的方法，其还包括在所述施用步骤之前测量取自所述对象的血液样品中的LDL
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C水平的步骤以及在所述施用步骤之后测量取自所述对象的另一个血液样品中的LDL
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C水平的步骤。13.如权利要求1所述的方法，其中将有效量的表4中示出的一种或多种细菌物种施用至所述对象，从而增加所述对象胃肠道中的所述一种或多种细菌物种的水平并降低所述对象中的总胆固醇水平。14.如权利要求13所述的方法，其还包括在所述施用步骤之前测量取自所述对象的血液样品中的总胆固醇水平的步骤以及在所述施用步骤之后测量取自所述对...

【专利技术属性】
技术研发人员：黄秀娟，左涛，陈家亮，
申请(专利权)人：香港微生物菌群创新中心有限公司，
类型：发明
国别省市：