【技术实现步骤摘要】
对脆弱类杆菌特异性的1种以上的引物或探针
[0001]本专利技术涉及对脆弱类杆菌特异性的1种以上的引物或探针等。
技术介绍
[0002]在比较特定的细菌种的组成、其比例时,通常使用以16S rRNA为对象的测序解析和霰弹枪宏基因组解析等全面性解析的数据。但是,全面性解析不仅需要巨大的成本、复杂的信息解析工序,还存在会非特异性地取得来源于检测对象外的生物(例如,近缘种、宿主)的信息的问题。
[0003]此外,由于16S rRNA在细菌基因组中存在多个拷贝,因此存在基于16S rRNA的检测的测定值是细菌量乘以该拷贝数所得的值的问题。
[0004]实际上,已被报道的16S rRNA基因的检测体系被认为会非特异性地检测多种细菌,此外,也有报告称基于以16S rRNA基因为对象的定量性PCR(qPCR)的定量性测定值是实际细菌数的数倍(专利文献1和2、以及非专利文献1)。
[0005]现有技术文献
[0006]专利文献
[0007][专利文献1]日本特开2006
‑
14940 ...
【技术保护点】
【技术特征摘要】
1.一种引物或探针,其为能够检测选自下述1)~49)中的1种以上的基因的、对脆弱类杆菌特异性的1种以上的引物或探针:1)3
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羰基
‑5‑
α
‑
类固醇4
‑
脱氢酶1(KO编号:K12343);2)CRP/FNR家族转录调节因子,多糖利用系转录调节因子(KO编号:K21556);3)软骨素AC裂解酶(KO编号:K19049);4)二肽基
‑
肽酶III(KO编号:K01277);5)α
‑
N
‑
乙酰氨基葡萄糖苷酶(KO编号:K01205);6)(R)
‑
柠苹酸合酶(KO编号:K09011);7)α
‑
淀粉酶(KO编号:K07405);8)4
‑
O
‑
β
‑
D
‑
甘露糖基
‑
D
‑
葡萄糖磷酸化酶(KO编号:K16212);9)N
‑
乙酰氨基葡萄糖2
‑
差向异构酶(KO编号:K01787);10)葡聚糖1,4
‑
α
‑
葡萄糖苷酶(KO编号:K21574);11)β
‑
1,4
‑
甘露寡糖/β
‑
1,4
‑
甘露糖基
‑
N
‑
乙酰氨基葡萄糖磷酸化酶(KO编号:K18785);12)淀粉结合外膜蛋白SusE/F(KO编号:K21571);13)甘露聚糖内切
‑
1,4
‑
β
‑
甘露糖苷酶(KO编号:K19355);14)2,3
‑
二磷酸甘油酸
‑
非依赖性磷酸甘油酸变位酶(KO编号:K15635);15)N
‑
琥珀酰
‑
L
‑
鸟氨酸转氨甲酰酶(KO编号:K13043);16)TonB
‑
依赖性淀粉结合外膜蛋白SusC(KO编号:K21573);17)UDP
‑3‑
O
‑
[3
‑
羟基肉豆蔻酰基]N
‑
乙酰氨基葡萄糖脱乙酰酶/3
‑
羟基酰基
‑
[酰基
‑
载体
‑
蛋白质]脱水酶(KO编号:K16363);18)细胞色素c亚硝酸还原酶小亚基(KO编号:K15876);19)组氨酸脱羧酶(KO编号:K01590);20)未表征的蛋白质(KO编号:K07079);21)二磷酸
‑
依赖性磷酸果糖激酶(KO编号:K00895);22)二氨基二酸脱氢酶(KO编号:K03340);23)未表征的蛋白质(KO编号:K01163);24)唾液酸O
‑
乙酰酯酶(KO编号:K05970);25)天冬氨酸4
‑
脱羧酶(KO编号:K09758);26)透明质酸氨基葡萄糖苷酶(KO编号:K01197);27)三角蛋白酶(...
【专利技术属性】
技术研发人员:汤原悟志,中林武尊,
申请(专利权)人:合同会社予幸集团中央研究所,
类型:发明
国别省市:
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