对脆弱类杆菌特异性的1种以上的引物或探针制造技术

技术编号:35287248 阅读:25 留言:0更新日期:2022-10-22 12:32
[问题]通过避免非特异性地取得来源于脆弱类杆菌以外的生物(例如,其他的近缘的拟杆菌属细菌、人类等宿主)的信息,而特异性地检测脆弱类杆菌。[解决手段]能够检测3

【技术实现步骤摘要】
对脆弱类杆菌特异性的1种以上的引物或探针


[0001]本专利技术涉及对脆弱类杆菌特异性的1种以上的引物或探针等。

技术介绍

[0002]在比较特定的细菌种的组成、其比例时,通常使用以16S rRNA为对象的测序解析和霰弹枪宏基因组解析等全面性解析的数据。但是,全面性解析不仅需要巨大的成本、复杂的信息解析工序,还存在会非特异性地取得来源于检测对象外的生物(例如,近缘种、宿主)的信息的问题。
[0003]此外,由于16S rRNA在细菌基因组中存在多个拷贝,因此存在基于16S rRNA的检测的测定值是细菌量乘以该拷贝数所得的值的问题。
[0004]实际上,已被报道的16S rRNA基因的检测体系被认为会非特异性地检测多种细菌,此外,也有报告称基于以16S rRNA基因为对象的定量性PCR(qPCR)的定量性测定值是实际细菌数的数倍(专利文献1和2、以及非专利文献1)。
[0005]现有技术文献
[0006]专利文献
[0007][专利文献1]日本特开2006

149400号公报
[本文档来自技高网
...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种引物或探针,其为能够检测选自下述1)~49)中的1种以上的基因的、对脆弱类杆菌特异性的1种以上的引物或探针:1)3

羰基
‑5‑
α

类固醇4

脱氢酶1(KO编号:K12343);2)CRP/FNR家族转录调节因子,多糖利用系转录调节因子(KO编号:K21556);3)软骨素AC裂解酶(KO编号:K19049);4)二肽基

肽酶III(KO编号:K01277);5)α

N

乙酰氨基葡萄糖苷酶(KO编号:K01205);6)(R)

柠苹酸合酶(KO编号:K09011);7)α

淀粉酶(KO编号:K07405);8)4

O

β

D

甘露糖基

D

葡萄糖磷酸化酶(KO编号:K16212);9)N

乙酰氨基葡萄糖2

差向异构酶(KO编号:K01787);10)葡聚糖1,4

α

葡萄糖苷酶(KO编号:K21574);11)β

1,4

甘露寡糖/β

1,4

甘露糖基

N

乙酰氨基葡萄糖磷酸化酶(KO编号:K18785);12)淀粉结合外膜蛋白SusE/F(KO编号:K21571);13)甘露聚糖内切

1,4

β

甘露糖苷酶(KO编号:K19355);14)2,3

二磷酸甘油酸

非依赖性磷酸甘油酸变位酶(KO编号:K15635);15)N

琥珀酰

L

鸟氨酸转氨甲酰酶(KO编号:K13043);16)TonB

依赖性淀粉结合外膜蛋白SusC(KO编号:K21573);17)UDP
‑3‑
O

[3

羟基肉豆蔻酰基]N

乙酰氨基葡萄糖脱乙酰酶/3

羟基酰基

[酰基

载体

蛋白质]脱水酶(KO编号:K16363);18)细胞色素c亚硝酸还原酶小亚基(KO编号:K15876);19)组氨酸脱羧酶(KO编号:K01590);20)未表征的蛋白质(KO编号:K07079);21)二磷酸

依赖性磷酸果糖激酶(KO编号:K00895);22)二氨基二酸脱氢酶(KO编号:K03340);23)未表征的蛋白质(KO编号:K01163);24)唾液酸O

乙酰酯酶(KO编号:K05970);25)天冬氨酸4

脱羧酶(KO编号:K09758);26)透明质酸氨基葡萄糖苷酶(KO编号:K01197);27)三角蛋白酶(...

【专利技术属性】
技术研发人员:汤原悟志中林武尊
申请(专利权)人:合同会社予幸集团中央研究所
类型:发明
国别省市:

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