一种靶向肠道菌群基因的TaqMan探针及其应用制造技术

本发明专利技术属于生物医药技术领域，涉及一种靶向肠道总菌群16S rRNA基因的TaqMan探针，其序列如SEQ ID NO 1所示。本发明专利技术还提供了基于TaqMan探针的实时荧光PCR方法，用于肠道总菌群的快速绝对定量方法。该方法具有较高的特异性；标准曲线线性关系良好，决定系数R2>0.998；检测限为2.9

【技术实现步骤摘要】
一种靶向肠道菌群基因的TaqMan探针及其应用


[0001]本专利技术属于生物医药
，涉及肠道菌群检测定量技术，涉及一种用于肠道菌群定量方法。具体的，本专利技术提供了一种靶向肠道总菌群16S rRNA基因的TaqMan探针，以及基于TaqMan探针的实时荧光PCR方法。本专利技术还涉及该用于肠道菌群定量的的方法在菌群定量相关研究中的应用。

技术介绍

[0002]现有技术公开了肠道菌群是生存在肠道中复杂而多样的微生物集合，广泛参与宿主代谢和肠脑轴信息传递等生理过程。此外，肠道是与外界接触的最大器官之一，肠道菌群易受到外界环境的影响，菌群的紊乱与多种疾病的发生发展有关，包括胃肠道、中枢神经系统疾病和代谢相关疾病等。肠道微生态紊乱的最直观的改变是肠道细菌数量的改变，因此对肠道菌群进行精确定量，对于了解疾病机理具有重要的意义。
[0003]迄今，针对肠道菌群定量的技术尚少有报道，由于肠道中细菌数量庞大、种类繁杂，且80％以上不可培养，传统的细菌计数方法尚不适用于肠道菌群的定量。变性梯度凝胶电泳和荧光原位杂交在一定程度上能帮助实现部分细菌的本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种靶向肠道总菌群16S rRNA基因的TaqMan探针，其特征在于，所述的探针的序列如SEQ ID NO 1所示。2.如权利要求1所述的靶向肠道总菌群16S rRNA基因的TaqMan探针，其特征在于，所述的探针的5
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端使用FAM标记，3
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端使用BHQ1标记。3.权利要求1或者2所述的靶向肠道总菌群16S rRNA基因的TaqMan探针在制备检测确定肠道总菌群16S rRNA基因含量试剂盒中的应用。4.一种检测肠道总菌群16S rRNA基因的试剂盒，其特征在于，所述的试剂盒含有：权利要求1所述的靶向肠道总菌群16S rRNA基因的TaqMan探针；和/或扩增引物；所述的扩增引物的序列如SEQ ID NO 2和SEQ ID NO 3所示；或者如SEQ ID NO 4和SEQ ID NO 5所示。5.如权利要求4所述的检测肠道总菌群16S rRNA基因的试剂盒，其特征在于，所述的试剂盒还含有用于聚合酶链反应的试剂。6.权利要求4或者5所述的检测肠道总菌群16S rRNA基因的试剂盒的应用，其特征在于，所述的试剂盒用于肠道总菌群绝对定量。7.一种定量肠道总菌群的方法，其特征在于，所述的方法包括以下步骤：(1)收集含有肠道菌群的待测样本；(2)提取待测样本的基因组；(3)以待测样本的基因组为模板，使用权利...

【专利技术属性】
技术研发人员：赵超，王虹，荣星喻，杨浩，
申请(专利权)人：复旦大学，
类型：发明
国别省市：