一种用于鉴定大豆GmSWEET39基因单倍型的分子标记及应用制造技术

本发明专利技术涉及大豆品种GmSWEET39基因单倍型的分子标记方法，用分子标记Indel

【技术实现步骤摘要】
一种用于鉴定大豆GmSWEET39基因单倍型的分子标记及应用


[0001]本专利技术属于生物
，具体涉及一种用于鉴定大豆GmSWEET39基因单倍型的分子标 记及应用。

技术介绍

[0002]从野生大豆到栽培大豆，大豆籽粒的蛋白质含量减小，油脂含量增大和百粒重增大，研 究表明位于大豆15号染色体上的GmSWEET39基因(Glyma.15G049200)控制了大豆籽粒蛋 白质含量、油脂含量和百粒重，前人研究表明该基因等位变异丰富，主要分为3种单倍型。 但前人的研究都是基于测序的结果，鉴定出的基因内Indel差异在10bp以内，无法有效设计 基于琼脂糖电泳检测的基因内分子标记，本研究通过对南农菜豆5号和南农菜豆5号高蛋白 回交系(导入野生大豆ZYD4219部分片段)进行分析，鉴定出Glyma.15G049200中的大片段 缺失类型，对该大片段缺失设计基因内分子标记用于育种应用。

技术实现思路

[0003]本专利技术的目的提供一种用于鉴定大豆蛋白质含量、油脂含量和百粒重GmSWEET39基因 的单倍型的基因内标记及应用，以在分子标记辅助选择育种中提高选育效率，即本专利技术的目 的在于提供一种用于鉴定大豆蛋白质含量、油脂含量和百粒重GmSWEET39基因的单倍型的 基因标记。
[0004]为实现上述目的，本专利技术采用的技术方案如下：
[0005]本专利技术提供一种大豆GmSWEET39基因的分子标记方法，用分子标记Indel
‑
Chr.15
‑
3875550 引物：SEQ ID NO.1/SEQ ID NO.2或者用分子标记Indel
‑
Chr.15
‑
3884603引物：SEQ IDNO.3/SWQ ID NO.4扩增大豆或育种材料DNA，如果用分子标记Indel
‑
Chr.15
‑
3875550引物能 够扩增出537p的扩增片段，或用分子标记Indel
‑
Chr.15
‑
3884603引物能够扩增出523bp的扩 增片段，则标志着大豆品种中含有GmSWEET39基因野生单倍型，及具有提高籽粒蛋白质含 量、降低油脂含量和百粒重的等位变异的存在。
[0006]本专利技术还提供一种鉴定大豆GmSWEET39基因单倍型的分子标记Indel
‑
Chr.15
‑
3875550引 物：
[0007]正向引物(5
’‑3’
)GCACCATCTGAACTAGCCCC(如SEQ ID NO.1所示)，其在公共物 理图谱Wm82.a2上的位置为Chr15：3875209；
[0008]反向引物(5
’‑3’
)CCTATACGCTATTCGCGGCC(如SEQ ID NO.2所示)，其在公共物 理图谱Wm82.a2上的位置为Chr15：3875819。
[0009]本专利技术还提供一种鉴定大豆SWEET39基因单倍型的分子标记Indel
‑
Chr.15
‑
3884603引物：
[0010]正向引物(5
’‑3’
)TCTCCTGACAAGTGACTTGACA(如SEQ ID NO.3所示)，其在公 共物理图谱Wm82.a2上的位置为Chr15：3884274；
[0011]反向引物(5
’‑3’
)AAAGGAGAGTGGATATTTGCCT(如SEQ ID NO.4所示)，其在公 共物
理图谱Wm82.a2上的位置为Chr15：3884823。
[0012]本专利技术还提供所述鉴定大豆GmSWEET39基因单倍型的分子标记，所述分子标记 Indel
‑
Chr.15
‑
3875550或Indel
‑
Chr.15
‑
3884603在鉴定GmSWEET39基因单倍型在大豆品种或品 系中的应用。
[0013]本专利技术所述的鉴定GmSWEET39基因单倍型在大豆品种或品系中的应用，具体为用分子 标记Indel
‑
Chr.15
‑
3875550引物：SEQ ID NO.1/SEQ ID NO.2或者用分子标记 Indel
‑
Chr.15
‑
3884603引物：SEQ ID NO.3/SEQ ID NO.4扩增大豆材料DNA，分子标记 Indel
‑
Chr.15
‑
3875550引物能够扩增出537p的扩增片段，或用分子标记Indel
‑
Chr.15
‑
3884603 引物能够扩增出523bp的扩增片段，则标志着大豆品种中含有GmSWEET39基因野生单倍型， 及具有提高籽粒蛋白质含量、降低油脂含量和百粒重的等位变异的存在。
[0014]本专利技术所提供的鉴定大豆GmSWEET39基因单倍型的分子标记及其应用可以适用于所有 大豆种质HPCD5的后代品系。
[0015]本专利技术具有如下有益效果：
[0016](1)本专利技术的大豆高蛋白、低油脂和小粒等位变异来自野生大豆，具有提高栽培大豆籽 粒蛋白质含量的效应；
[0017](2)本专利技术的的大豆籽粒蛋白质含量、油脂含量和百粒重GmSWEET39基因的单倍型的 基因标记间差异明显，检测要求小，只要分子标记扩增产物采用本专利技术，经过多轮的基因型 和表型选择后能显著选育高蛋白大豆新种质；
[0018](3)采用本专利技术，选育的高蛋白大豆新种质，籽粒蛋白质含量比轮回亲本蛋白质含量提 高5％以上；
[0019](4)采用本专利技术，选育的高蛋白大豆新种质，籽粒蛋白质含量能达到50％以上。
附图说明
[0020]图1.Indel
‑
Chr.15
‑
3875550、Indel
‑
Chr.15
‑
3884603等4个Indel在GmSWEET39上的位置 及差异序列。
[0021]图2.Indel
‑
Chr.15
‑
3875550和Indel
‑
Chr.15
‑
3884603分子标记引物扩增产物。图中M为 DNAMarker I，从左到右材料分别为中黄39、南农99
‑
6、徐豆14、南农菜豆5号(CD5) 和高蛋白南农菜豆5号回交系(HPCD5)
具体实施方式
[0022]根据下述实施例，可以更好地理解本专利技术。然而，实施例所描述的仅用于说明本专利技术， 而不应当也不会限制权利要求书中所详细描述的本专利技术。
[0023]以下实施例中的试验方法，如无特别说明，均为常规方法。以下实施例中所用的试验材 料及试剂，如无特别说明，均购自常规生化试剂公司。
[00本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种用于鉴定大豆GmSWEET39基因单倍型的分子标记及应用，其特征在于用分子标记Indel
‑
Chr.15
‑
3875550引物：SEQ ID NO.1/SEQ ID NO.2或者用分子标记Indel
‑
Chr.15
‑
3884603引物：SEQ ID NO.3/SEQ ID NO.4扩增大豆DNA，如果用分子标记Indel
‑
Chr.15
‑
3875550引物能扩增出536bp片段，或者分子标记Indel
‑
Chr.15
‑
3884603引物能扩增出522bp片段，则标志着大豆品种含有GmSWEET39野生单倍型，及具有提高大豆籽粒蛋白质含量，降低籽粒油脂含量和百粒重的效应。2.一种鉴定GmSWEET39基因的单倍型的Indel分子标记Indel
‑
Chr.15
‑
3875550引物：SEQ ID NO.1/SEQ ID NO.2，其扩增差异片段为序列SEQ ID NO.5。3.一种鉴定GmSWEET39基因的单倍型的Indel分子标记Indel
‑
Chr.15
‑
3884603引物：SEQ ID NO...

【专利技术属性】
技术研发人员：张英虎，沈会权，杨红燕，
申请(专利权)人：江苏沿海地区农业科学研究所，
类型：发明
国别省市：