一种蛋白分子与DNA结合位置定位方法及设备技术

本发明专利技术公开了一种蛋白分子与DNA结合位置定位方法，通过在待检测DNA两端分别修饰固定素及结合引导素，得到待固定DNA分子；利用所述固定素将所述待固定DNA分子种植在玻片上；利用所述结合引导素与纳米孔芯片的腐蚀窗内的超顺磁性小球相连，控制磁场使所述超顺磁性小球将种植在所述玻片上的待固定DNA分子拉直并穿过所述腐蚀窗；所述纳米孔芯片从预设的起始位置以第一速度匀速下降，扫描拉直后的待检测DNA，得到蛋白电学信息；根据所述蛋白电学信息、所述第一速度及所述起始位置，确定蛋白定位信息。本发明专利技术显著提升定位的精度及定位的效率。本发明专利技术同时还提供了一种具有上述有益效果的DNA结合位置定位。的DNA结合位置定位。的DNA结合位置定位。

【技术实现步骤摘要】
一种蛋白分子与DNA结合位置定位方法及设备


[0001]本专利技术涉及基因检测领域，特别是涉及一种蛋白分子与DNA结合位置定位方法及设备。

技术介绍

[0002]基因测序技术作为人类探索生命秘密的重要手段之一，对生物、生命科学、医学等领域的技术发展起到了巨大的推动作用。而固态纳米孔测序技术具有低成本、高读长、易集成等优势，因此已成为基因测序领域公认的下一代技术。目前的固态纳米孔基因测序技术，是通过在固态氮化硅薄膜芯片上制作出纳米级孔径，使DNA链条穿过固态纳米孔以获得DNA碱基序列。
[0003]而这种技术也能更应用到检测蛋白分子与DNA结合位置定位的领域，通过检测蛋白质分子穿过纳米孔时引发的但目前的固态纳米孔测序技术，不能保证DNA在过孔后的形态，DNA分子可能会出现卷曲、折叠、多个碱基对同时经过纳米孔的情况，甚至可能会卡在纳米孔上，造成检测效率低下，检测准确率低的问题。
[0004]因此，如何保证待检测DNA分子在检测过程中的处于拉直状态，就成了本领域技术人员亟待解决的问题。

技术实现思路

[0005]本专利技术的目的是提供一种蛋白分子与DNA结合位置定位方法及设备，以解决现有技术中的蛋白分子与DNA结合后DNA难以保持伸直状态，造成检测效率底下，检测精度不高的问题。
[0006]为解决上述技术问题，本专利技术提供一种蛋白分子与DNA结合位置定位方法，包括：
[0007]在待检测DNA两端分别修饰固定素及结合引导素，得到待固定DNA分子；
[0008]利用所述固定素将所述待固定DNA分子种植在玻片上；
[0009]利用所述结合引导素与纳米孔芯片的腐蚀窗内的超顺磁性小球相连，控制磁场使所述超顺磁性小球将种植在所述玻片上的待固定DNA分子拉直并穿过所述腐蚀窗；
[0010]利用所述纳米孔芯片从预设的起始位置以第一速度扫描拉直后的待检测DNA，得到蛋白电学信息；
[0011]根据所述蛋白电学信息、所述第一速度及所述起始位置，确定蛋白定位信息。
[0012]可选地，在所述的蛋白分子与DNA结合位置定位方法中，在待检测DNA两端分别修饰固定素及结合引导素之前，还包括：
[0013]在待检测DNA上间隔设置多个标记探针；
[0014]相应地，所述利用所述纳米孔芯片从预设的起始位置以第一速度扫描拉直后的待检测DNA，得到蛋白电学信息包括：
[0015]利用所述纳米孔芯片从预设的起始位置以第一速度扫描拉直后的待检测DNA，得到蛋白电学信息及探针反应时间信息；
[0016]相应地，所述根据所述蛋白电学信息、所述第一速度及所述起始位置，确定蛋白定位信息包括：
[0017]根据所述蛋白电学信息、所述探针反应时间信息、所述第一速度及所述起始位置，确定蛋白定位信息。
[0018]可选地，在所述的蛋白分子与DNA结合位置定位方法中，所述在待检测DNA上间隔设置多个标记探针包括：
[0019]在待检测DNA上间隔设置多种标记探针。
[0020]可选地，在所述的蛋白分子与DNA结合位置定位方法中，在待检测DNA两端分别修饰固定素及结合引导素之前，还包括：
[0021]通过清洗剂清洗所述纳米孔芯片。
[0022]可选地，在所述的蛋白分子与DNA结合位置定位方法中，所述清洗剂为食人鱼溶液。
[0023]可选地，在所述的蛋白分子与DNA结合位置定位方法中，所述固定素为氨基、马来酰胺、羧基、炔基及抗地高辛中至少一种。
[0024]可选地，在所述的蛋白分子与DNA结合位置定位方法中，所述结合引导素为生物素。
[0025]可选地，在所述的蛋白分子与DNA结合位置定位方法中，所述第一速度的范围为0.025微米每秒至2.5微米每秒，包括端点值。
[0026]一种蛋白分子与DNA结合位置定位设备，所述DNA测序设备用于执行如权利要求1至8中任一项所述的蛋白分子与DNA结合位置定位方法。
[0027]可选地，在所述的蛋白分子与DNA结合位置定位设备中，所述DNA序列检测设备的纳米孔芯片的厚度的范围为12纳米至30纳米，包括端点值。
[0028]本专利技术所提供的蛋白分子与DNA结合位置定位方法，通过在待检测DNA两端分别修饰固定素及结合引导素，得到待固定DNA分子；利用所述固定素将所述待固定DNA分子种植在玻片上；利用所述结合引导素与纳米孔芯片的腐蚀窗内的超顺磁性小球相连，控制磁场使所述超顺磁性小球将种植在所述玻片上的待固定DNA分子拉直并穿过所述腐蚀窗；所述纳米孔芯片从预设的起始位置以第一速度匀速下降，扫描拉直后的待检测DNA，得到蛋白电学信息；根据所述蛋白电学信息、所述第一速度及所述起始位置，确定蛋白定位信息。
[0029]本专利技术通过所述固定素将所述待检测DNA的一端与玻片相连，另一端通过所述结合引导素与所述超顺磁性小球相连当检测开始时，通过调整环境内磁场对所述超顺磁性小球施力，使所述超顺磁性小球拉直所述待检测DNA，而由于所述待测试DNA在定位过程中始终处于拉直状态，因此避免了待测试DNA分子卷曲、折叠的情况，显著提升定位的精度及定位的效率。本专利技术同时还提供了一种具有上述有益效果的DNA结合位置定位。
附图说明
[0030]为了更清楚的说明本专利技术实施例或现有技术的技术方案，下面将对实施例或现有技术描述中所需要使用的附图作简单的介绍，显而易见地，下面描述中的附图仅仅是本专利技术的一些实施例，对于本领域普通技术人员来讲，在不付出创造性劳动的前提下，还可以根据这些附图获得其他的附图。
[0031]图1为本专利技术提供的蛋白分子与DNA结合位置定位方法的一种具体实施方式的流程示意图；
[0032]图2为本专利技术提供的蛋白分子与DNA结合位置定位方法的另一种具体实施方式的流程示意图；
[0033]图3为本专利技术提供的蛋白分子与DNA结合位置定位方法的又一种具体实施方式的流程示意图；
[0034]图4至图5为本专利技术提供的蛋白分子与DNA结合位置定位方法的一种具体实施方式的工艺流程图。
具体实施方式
[0035]为了使本
的人员更好地理解本专利技术方案，下面结合附图和具体实施方式对本专利技术作进一步的详细说明。显然，所描述的实施例仅仅是本专利技术一部分实施例，而不是全部的实施例。基于本专利技术中的实施例，本领域普通技术人员在没有做出创造性劳动前提下所获得的所有其他实施例，都属于本专利技术保护的范围。
[0036]本专利技术的核心是提供一种蛋白分子与DNA结合位置定位方法，其一种具体实施方式的流程示意图如图1所示，称其为具体实施方式一，包括：
[0037]S101：在待检测DNA两端分别修饰固定素及结合引导素，得到待固定DNA分子。
[0038]所述固定素为氨基、马来酰胺、羧基、炔基及抗地高辛中至少一种；上述固定素举例所对应的的设置于玻片上的接受受体依次为醛基、巯基、环氧化物、叠氮、地高辛，当然，也可根据实际需要选择其他固定素。
[00本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种蛋白分子与DNA结合位置定位方法，其特征在于，包括：在待检测DNA两端分别修饰固定素及结合引导素，得到待固定DNA分子；利用所述固定素将所述待固定DNA分子种植在玻片上；利用所述结合引导素与纳米孔芯片的腐蚀窗内的超顺磁性小球相连，控制磁场使所述超顺磁性小球将种植在所述玻片上的待固定DNA分子拉直并穿过所述腐蚀窗；利用所述纳米孔芯片从预设的起始位置以第一速度扫描拉直后的待检测DNA，得到蛋白电学信息；根据所述蛋白电学信息、所述第一速度及所述起始位置，确定蛋白定位信息。2.如权利要求1所述的蛋白分子与DNA结合位置定位方法，其特征在于，在待检测DNA两端分别修饰固定素及结合引导素之前，还包括：在待检测DNA上间隔设置多个标记探针；相应地，所述利用所述纳米孔芯片从预设的起始位置以第一速度扫描拉直后的待检测DNA，得到蛋白电学信息包括：利用所述纳米孔芯片从预设的起始位置以第一速度扫描拉直后的待检测DNA，得到蛋白电学信息及探针反应时间信息；相应地，所述根据所述蛋白电学信息、所述第一速度及所述起始位置，确定蛋白定位信息包括：根据所述蛋白电学信息、所述探针反应时间信息、所述第一速度及所述起始位置，确定蛋白定位信息。3.如权利要求2所述的蛋...

【专利技术属性】
技术研发人员：胡岚，凌新生，王若聆，
申请(专利权)人：苏州罗岛纳米科技有限公司，
类型：发明
国别省市：