一种适于ONT测序平台的、用于感染样本中疱疹病毒检测的引物组及应用制造技术

本申请涉及生物信息学技术领域，具体提供一种适于ONT测序平台的、用于感染样本中疱疹病毒检测的靶向富集引物组及其应用。本申请根据CMV，EBV，HSV1、HSV2、VZV人源疱疹病毒的基因组序列，基于生信算法设计引物和靶向区段，本发明专利技术引物兼备种属间特异性和种属内兼容性，能快速、高效、全面的从呼吸道感染体征和症状的患者中识别并鉴别各类疱疹病毒，具有高上靶率、灵敏度和准确性。灵敏度和准确性。灵敏度和准确性。

【技术实现步骤摘要】
一种适于ONT测序平台的、用于感染样本中疱疹病毒检测的引物组及应用


[0001]本专利技术属于生物信息学分析
，涉及用于一种检测人疱疹病毒的引物组及应用，特别是针对人疱疹病毒的扩增引物及其应用。

技术介绍

[0002]疱疹病毒(herpesviruses)是在世界范围内广泛传播的一大类双链DNA病毒，包含病毒的种类众多，能够感染包括人类在内的多种哺乳动物。疱疹病毒在感染人体后能够引发多种疾病，包括口腔和生殖器疱疹、水痘、带状疱疹，严重的甚至包括多种免疫系统疾病、脑炎以及癌症等。疱疹病毒在世界范围内广泛传播。
[0003]疱疹病毒有着独特的潜伏
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再活化机制，它可以关闭其大部分活动状态的基因，只在特定的潜伏阶段打开特定的少数基因，并在合适的条件下恢复活性，重新进入增殖过程。这种潜伏
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再活化机制使得疱疹病毒感染产生的疾病难以完全治愈，通常患者会终生携带病毒。因此，疱疹病毒感染的鉴别诊断显然具有极其重要的生物学和医学意义。
[0004]能感染的人疱疹病毒主要有8种，其中HSV1、HSV2，V本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种适于ONT测序平台的、用于感染样本中疱疹病毒检测的引物组合，其特征在于，所述引物组合包括如下引物：(1)EBV引物:正向引物：CCGTGAGATGGATCAGGCTC(SEQ ID NO.1)反向引物：CAGCAACAACCTGTGCAGAC(SEQ ID NO.2)(2)CMV引物:正向引物：CCTCCACCCACTACAACACAC(SEQ ID NO.3)反向引物：GTGATGTCCCTCGCAGAACCT(SEQ ID NO.4)(3)HSV1、HSV2、VZV引物:正向引物：GGTTGGAATTGRTTRCGAAAGTT(SEQ ID NO.5)反向引物：CTCCCCSCYGACATTACGTWCACG(SEQ ID NO.6)其中引物中R,S,Y,W为简并碱基，遵从简并碱基密码表：R(A/G),S(G/C),Y(C/T),W(A/T)。2.权利要求1所述的引物组合，其特征在于，所述(3)HSV1、HSV2、VZV引物的序列具体如下：正向引物F.1GGTTGGAATTGATTACGAAAGTT(SEQ ID NO.7)；正向引物F.2GGTTGGAATTGGTTACGAAAGTT(SEQ ID NO.8)；正向引物F.3GGTTGGAATTGATTGCGAAAGTT(SEQ ID NO.9)；正向引物F.4GGTTGGAATTGGTTGCGAAAGTT(SEQ ID NO.10)；反向引物R.1CTCCCCGCCGACATTACGTACACG(SEQ ID NO.11)；反向引物R.2CTCCCCCCCGACATTACGTACACG(SEQ ID NO.12)；反向引物R.3CTCCCCGCTGACATTACGTACACG(SEQ ID NO.13)；反向引物R.4CTCCCCCCTGACATTACGTACACG(SEQ ID NO.14)；反向引物R.5CTCCCCGCCGACATTACGTTCACG...

【专利技术属性】
技术研发人员：顾菊，李振中，周水莲，潘吾思，程彪，戴岩，李诗濛，任用，
申请(专利权)人：南京先声医学检验实验室有限公司北京先声医学检验实验室有限公司，
类型：发明
国别省市：