用于CON-稀有密码子的TREM组合物及相关用途制造技术

本发明专利技术总体上涉及对应于con

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】用于CON
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稀有密码子的TREM组合物及相关用途
[0001]相关申请的交叉引用
[0002]本申请要求2019年11月4日提交的美国临时申请62/930,361的优先权，该申请的全部内容特此通过引用并入。

技术介绍

[0003]转移RNA(tRNA)是具有包括蛋白质的起始和延伸的多种功能的分子。

技术实现思路

[0004]诸位专利技术人已发现，TREM组合物可用于调节RNA或由RNA编码的蛋白质的生产参数，其中RNA具有上下文稀有密码子(contextually
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rare codon)(“con
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稀有密码子”)。在一个方面，本文提供了一种调节靶细胞或组织中的RNA或由RNA编码的蛋白质的生产参数的方法，该方法包括向靶细胞或组织提供(例如，施用)或使靶细胞或组织接触有效量的tRNA效应分子(TREM)(例如，包含TREM的TREM组合物)，该TREM对应于RNA的上下文稀有密码子(“con
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稀有密码子”)，从而调节靶细胞或组织中的RNA或由RNA编码的蛋白质的生产参数。
[0005]在实施例中，从受试者获得该靶细胞或组织。在实施例中，该方法包括向受试者施用该TREM组合物。在实施例中，该方法包括使该TREM组合物与该靶组织或细胞离体接触。在实施例中，该方法包括将该离体接触的靶组织或细胞引入受试者中，例如，同种异体或自体受试者。
[0006]在实施例中，该生产参数包括表达参数或信号传导参数，例如，如本文所述。在实施例中，调节RNA的生产参数，例如，可翻译成多肽的RNA，例如，信使RNA。在实施例中，增加或减少RNA的生产参数。在实施例中，调节由RNA编码的蛋白质的生产参数。在实施例中，增加或减少蛋白质的生产参数。
[0007]在实施例中，该靶细胞或组织包含不希望的特征或选定的特征，或与不希望的特征或选定的特征有关，或与不希望的特征或选定的特征相关(负相关或正相关)。在实施例中，该靶细胞或组织包含疾病或障碍，或与疾病或障碍有关，或与疾病或障碍相关(负相关或正相关)。在实施例中，该疾病或障碍是癌症。在实施例中，该靶细胞或组织的特征在于不希望的增殖，例如良性或恶性增殖。在一些实施例中，该靶细胞或组织是癌细胞。
[0008]在实施例中，该疾病或障碍包含单倍体不足障碍，例如，其中基因的等位基因具有功能丧失病变(例如，功能完全丧失病变)的疾病。示例性单倍体不足障碍包括GLUT1缺乏综合征1、GLUT1缺乏综合征2、由GATA2突变引起的障碍(例如，GATA2缺乏；单核细胞、B和NK淋巴细胞缺乏；恩伯格综合征；单核细胞减少症和鸟分枝杆菌复合体/树突状细胞)、科芬
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西里斯综合征2、腓骨肌萎缩症、Robinow综合征、Takenouchi
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Kosaki综合征、染色体1p35缺失综合征、染色体2p12
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p11.2缺失综合征、WHIM综合征、Mowat
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Wilson综合征和Dravet综合征。
[0009]在实施例中，该靶细胞或组织包含代谢状态或状况。
[0010]在实施例中，该靶细胞或组织包含遗传事件或与遗传事件有关，该遗传事件为例
如突变(例如，点突变)、重排、易位、插入或缺失。在实施例中，遗传事件包括单核苷酸多态性(SNP)或其他标志物。在实施例中，遗传事件与疾病或障碍或者疾病或障碍的易感性有关，或与疾病或障碍或者疾病或障碍的易感性相关(负相关或正相关)。在实施例中，该靶细胞或组织包含基因表达模式(例如，不希望的或不充分的基因表达)，或与基因表达模式(例如，不希望的或不充分的基因表达)有关，或与基因表达模式(例如，不希望的或不充分的基因表达)相关(负相关或正相关)。
[0011]在实施例中，该靶细胞或组织包含表观遗传事件(例如，组蛋白修饰，例如，与疾病或障碍或疾病或障碍的易感性相关(负相关或正相关)的表观遗传事件)，或与表观遗传事件(例如，组蛋白修饰，例如，与疾病或障碍或疾病或障碍的易感性相关(负相关或正相关)的表观遗传事件)有关。
[0012]在实施例中，该靶细胞或组织包含与疾病或障碍有关或与疾病或障碍相关(负相关或正相关)的产物，例如，核酸(例如，RNA)、蛋白质、脂质或糖。在实施例中，该细胞或组织生产产物，例如，核酸(例如，RNA)、蛋白质、脂质或糖，其存在与不希望的状态(例如，疾病或障碍)有关或与不希望的状态(例如，疾病或障碍)相关(负相关或正相关)。
[0013]在实施例中，该细胞或组织未能生产或未能生产足量的产物，例如，核酸(例如，RNA)、蛋白质、脂质或糖，且此类产物的不存在或不足量与不希望的状态(例如，疾病或障碍)有关或与不希望的状态(例如，疾病或障碍)相关(负相关或正相关)。
[0014]在实施例中，该靶细胞或组织包括特定发育阶段，例如，胚胎、胎儿、未成熟、成熟或衰老。在实施例中，该靶细胞或靶组织中的细胞包括细胞周期中的一个阶段，例如，G0、G1、S、G2或M。在实施例中，该靶细胞或组织是非增殖的或静止的。在实施例中，该靶细胞或组织是增殖的。在实施例中，该细胞或组织包括造血细胞或组织，例如，成纤维细胞。在实施例中，该细胞或组织包括肝细胞或组织。在实施例中，该细胞或组织包括肾细胞或组织。在实施例中，该细胞或组织包括神经细胞或组织，例如，神经元。在实施例中，该细胞或组织包括肌肉细胞或组织。在实施例中，该细胞或组织包括皮肤细胞或组织。
[0015]在另一方面，本披露提供了一种确定具有上下文稀有密码子的核酸序列(“con
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稀有密码子核酸序列”)例如DNA或RNA的存在的方法，该方法包括：获取对来自受试者的样品(例如，靶细胞或组织样品)中该con
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稀有密码子核酸序列的存在的认知，其中响应于获取对该con
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稀有密码子核酸序列的存在的认知：(1)该受试者被分类为接受施用有效量组合物的候选者，该组合物包含对应于该核酸序列的上下文稀有密码子(“con
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稀有密码子”)的tRNA效应分子(TREM)；或(2)该受试者被鉴定为可能对包括该含有TREM的组合物的治疗有反应。
[0016]在又另一方面，本文提供了一种治疗患有与上下文稀有密码子(“con
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稀有密码子”)有关的疾病的受试者的方法，该方法包括：获取对来自该受试者的靶细胞或组织样品中具有该con
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稀有密码子的核酸序列(“con
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稀有密码子核酸序列”)例如DNA或RNA的存在的认知；以及
[0017]向该受试者施用有效量的组合物，该组合物包含对应于该核酸序列的该con
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稀有密码子的tRNA效应分子(TREM)，从而治疗该受试者的该疾病。
[0018]在实施例中，施用包括向靶细胞或组织提供或使靶细胞或组织接触有效量的tRNA效应分子(TREM)(例如，包含TREM的TREM组合物)，该T本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】1.一种调节靶细胞或组织中的RNA或由RNA编码的蛋白质的生产参数的方法，该方法包括：向该靶细胞或组织提供例如施用或使该靶细胞或组织接触有效量的tRNA效应分子(TREM)(例如，包含TREM的TREM组合物)，该TREM对应于该RNA的上下文稀有密码子(“con
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稀有密码子”)，从而调节该靶细胞或组织中该RNA或由该RNA编码的蛋白质的生产参数。2.如权利要求1所述的方法，其中从受试者获得该靶细胞或组织。3.如权利要求1所述的方法，该方法包括向受试者施用该TREM组合物。4.如权利要求1所述的方法，该方法包括使该TREM组合物与该靶组织或细胞离体接触。5.如权利要求4所述的方法，该方法包括将该离体接触的靶组织或细胞引入受试者中，例如，同种异体或自体受试者。6.如前述权利要求中任一项所述的方法，其中该靶细胞或组织是特定的或选定的靶细胞或组织，例如，处于特定发育阶段的细胞或组织类型；处于特定疾病状态的细胞或组织类型；或存在于特定细胞外环境中的细胞。7.如前述权利要求中任一项所述的方法，其中该生产参数包括表达参数或信号传导参数，例如，如本文所述。8.如前述权利要求中任一项所述的方法，其中调节该RNA的生产参数，例如，可翻译成多肽的RNA，例如，信使RNA。9.如权利要求7所述的方法，其中增加或减少该RNA的生产参数。10.如前述权利要求中任一项所述的方法，其中调节由该RNA编码的蛋白质的生产参数。11.如权利要求10所述的方法，其中增加或减少该蛋白质的生产参数。12.一种确定具有上下文稀有密码子的核酸序列(“con
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稀有密码子核酸序列”)例如DNA或RNA的存在的方法，该方法包括：获取对来自受试者的样品(例如，靶细胞或组织样品)中该con
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稀有密码子核酸序列的存在的认知，其中响应于获取对该con
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稀有密码子核酸序列的存在的认知：(1)该受试者被分类为接受施用有效量组合物的候选者，该组合物包含对应于该核酸序列的上下文稀有密码子(“con
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稀有密码子”)的tRNA效应分子(TREM)；或(2)该受试者被鉴定为可能对包括该含有TREM的组合物的治疗有反应。13.一种治疗患有与上下文稀有密码子(“con
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稀有密码子”)有关的疾病的受试者的方法，该方法包括：获取对来自该受试者的靶细胞或组织样品中具有该con
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稀有密码子的核酸序列(“con
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稀有密码子核酸序列”)例如DNA或RNA的存在的认知；以及向该受试者施用有效量的组合物，该组合物包含对应于该核酸序列的该con
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稀有密码子的tRNA效应分子(TREM)，从而治疗该受试者的该疾病。14.一种向受试者提供tRNA效应分子(TREM)的方法，该方法包括：向该受试者提供例如施用有效量的TREM，例如，包含TREM的TREM组合物，该TREM对应于
该受试者中靶细胞或组织中的核酸序列的上下文稀有密码子(“con
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稀有密码子”)，从而向该受试者提供TREM。15.一种制造tRNA效应分子(TREM)组合物的方法，该方法包括：鉴定对应于上下文稀有(con
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稀有)密码子的TREM；将该TREM与组分例如载剂或赋形剂组合；从而制造TREM组合物。16.如前述权利要求中任一项所述的方法，其中该方法包括获取该...

【专利技术属性】
技术研发人员：CE哈杰丁，DA贝里，T阿纳斯塔西亚迪斯，NB阿费扬，
申请(专利权)人：旗舰创业股份有限公司，
类型：发明
国别省市：