杜洛克猪全基因组低密度SNP芯片及其制备方法和应用技术

本发明专利技术公开了一种杜洛克猪全基因组低密度SNP芯片，该SNP芯片包含9731个SNP分子标记，所述9731个SNP分子标记所在染色体上下游序列包含如SEQ ID No.1

【技术实现步骤摘要】
杜洛克猪全基因组低密度SNP芯片及其制备方法和应用


[0001]本专利技术涉及分子生物学及动物育种领域，特别涉及一种杜洛克猪全基因组低密度SNP芯片及其制备方法和应用。

技术介绍

[0002]分子标记(Molecular Markers)，指可遗传并可检测的DNA序列。其中，单核苷酸多态性(SNP)是指基因组上单个核苷酸的变异，包括转换和颠换。与微卫星等重复序列多态性标记相比，SNP在基因组上分布广泛，数量多，遗传稳定性高，更适合用于对复杂性状与疾病的遗传解剖以及基于群体的基因识别等方面的研究。同时，由于SNP具有二态性，且单个SNP位点突变率低，易于通过芯片技术实现自动化和规模化检测。因此，SNP成为继限制性酶切片段长度多态性标记(RFLP)、DNA重复序列的多态性标记(包括小卫星、微卫星DNA重复序列)之后的第三代主流基因遗传标记。
[0003]基于SNP的新型高通量分子标记技术主要有两大类：(1)基于测序技术的高通量分子标记技术，其通量高，能分析个体的全序列，检测发现新的基因信息，但测序数据大、成本高，且分析难度大、周期长；(2)本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种杜洛克猪全基因组低密度SNP芯片，其中，所述SNP芯片包含9731个SNP分子标记，所述9731个SNP分子标记所在染色体上下游序列包含如SEQ ID No.1
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9731所示的序列。2.根据权利要求1所述的SNP芯片，其中，所述芯片的相邻SNP标记位点间的平均距离为267kb。3.根据权利要求1所述的SNP芯片，其中，所述SNP芯片的相邻SNP位点间的连锁不平衡程度r2为0.577。4.根据权利要求1所述的SNP芯片，其中，所述SNP芯片的平均最小等位基因频率MAF为0.31。5.权利要求1
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4任一项所述的SNP芯片在杜洛克猪遗传育种中的应用；优选地，在校正115公斤体重日龄、背膘厚、眼肌面积、瘦肉率、总仔数、产活仔数、有效精子数优势性状中，任一或多个优势性状组合选育上的应用。6.权利要求1
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4任一项所述的SNP芯片在杜洛克猪种质资源遗传改良中的应用。7.权利要求1
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4任一项所述的SNP芯片在杜洛克猪亲缘关系鉴定中的应用。8.权利要求1
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4任一项所述的SNP芯片在杜洛克猪遗传多样性分析中的应用。9.权利要求1
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4任一项所...

【专利技术属性】
技术研发人员：郑伟杰，赵云翔，周玉，李斌，朱琳，夏攀洁，袁仁强，
申请(专利权)人：广西贵港秀博基因科技股份有限公司，
类型：发明
国别省市：