一种基于噪声利用的基因重要性评价方法技术

本发明专利技术公开了一种基于噪声利用的基因重要性评价方法，主要用来解决生物工程中相关基因数据的噪声处理和生物基因的重要性评价。该方法首先对实验数据进行基因差异分析，筛选出差异表达的基因数据；然后利用鲁棒主成分分析将其分解为低秩干净矩阵和稀疏噪声矩阵；接着根据加权基因共表达网络分析的识别模块对基因分群，并将低秩干净矩阵和稀疏噪声矩阵分块；最后分别在低秩干净矩阵和稀疏噪声矩阵上评估基因有效性与可靠性，完成基因的鲁棒重要性评价。本发明专利技术将实验数据中的噪声充分利用起来，构建的基因评价准则具有一定的鲁棒性，且易于操作。此方法可应用于生物基因的重要性评价，对于癌症的预测，新药的筛选具有重要应用价值。价值。价值。

【技术实现步骤摘要】
一种基于噪声利用的基因重要性评价方法


[0001]本专利技术属于生物工程
，具体涉及一种基于噪声利用的基因重要性评价方法。

技术介绍

[0002]生物工程是以生物学、遗传学等学科的理论和技术为基础，结合现代工程技术，对遗传物质进行操纵、改变生物性状，使生物产生对人类有用的代谢产物的一门技术，包括基因工程、细胞工程、微生物工程、酶工程和蛋白质工程。生物工程的应用十分广泛，涉及医药、化工、食品、农业等诸多领域。它为世界面临的资源、环境和人类健康等问题的解决提供美好的前景。
[0003]随着生物技术中先进技术手段与仪器设备的迅速发展，海量的生物学数据不断被生成。例如，由微阵列技术同时对大量基因序列进行检测和分析而得到的基因表达谱数据。这些数据的特性与关系都蕴含着重要的模式信息。基因表达谱数据的出现，使人们可以从分子水平上了解细胞的病变过程，这对于癌症的发病机理及癌症的诊断有着非常重大的意义。因此，如何分析和利用基因表达谱数据，并从中挖掘出与人类疾病相关的基因是当今的研究热点。
[0004]然而，基因表达谱数据的显著特点是小样本、本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种基于噪声利用的基因重要性评价方法，其特征在于，包括如下步骤：步骤1，对生物学数据中的基因进行差异分析，通过设置|log2FoldChange|≥k，筛选出差异表达的基因，其中FoldChange为基因表达值的差异倍数，k为提前指定的阈值参数，是一个大于0的实数；步骤2，将步骤1处理后的数据记为矩阵X，通过鲁棒主成分分析将矩阵X分解为低秩干净矩阵D和稀疏噪声矩阵E；步骤3，利用加权基因共表达网络分析(WGCNA)，在低秩干净矩阵上对基因分群，利用WGCNA识别网络模块，据此将基因分为m个群，进而将低秩干净矩阵D分为m个子矩阵，即对稀疏噪声矩阵E进行相同的分块处理，即步骤4，根据步骤3的矩阵分块结果，在低秩干净矩阵上评估第l个群中第t个基因的个体重要性及第t个基因与其他基因的相关性进而获得第l个群中第t个基因的有效性在稀疏噪声矩阵上，计算第l个群中第t个基因的可靠性步骤5，评估第l个群中第t个...

【专利技术属性】
技术研发人员：高福根，李钧涛，梁聪，王小玉，吴英迪，梁柯，曹福珍，张红梅，崔鲁宾，丁莹，
申请(专利权)人：李钧涛，
类型：发明
国别省市：