一种用于鉴别或区分不同海拔人群的模型及其应用制造技术

技术编号:33660387 阅读:48 留言:0更新日期:2022-06-02 20:41
本发明专利技术公开了一种用于鉴别或区分不同海拔人群的模型及其应用,具体的,本发明专利技术提供了微生物在构建不同海拔地区人群的分类模型中的应用。本发明专利技术所述的微生物共26种,本发明专利技术首次公开了这26种微生物在鉴别或区分不同海拔人群中的应用。人群中的应用。人群中的应用。

【技术实现步骤摘要】
一种用于鉴别或区分不同海拔人群的模型及其应用


[0001]本专利技术属于生物医药领域,具体涉及一种用于鉴别或区分不同海拔人群的模型及其应用。

技术介绍

[0002]慢性高原反应/慢性高原病(Chronicmountainsickness,CMS)是一种常见的高原疾病,在外界低氧环境的长期刺激下,虽然机体通过不间断地自身调节,却始终未能在新的基础上达到身体机能平衡,而形成的一种高原环境适应不全综合征。高原通常系指海拔2500米以上、产生明显生物学效应(机体反应)的地区,高原环境对人体的健康影响甚大,无论世居者或移居者(尤其移居者)均然,慢性高原病多发生于该地区,外界环境低氧是其最主要的病因。我国的青藏高原具有明显的高原环境特征,近年来,越来越多的内地干部、企事业单位人员被派驻进藏参与该地区建设。由于高海拔与内陆平原间环境差异巨大,内陆进藏工作人员的健康问题日益突出。因此,加强慢性高原反应研究对加速高原建设具有重大指导意义。
[0003]目前对急性期高原反应研究较多,但对慢性期高原反应还缺乏系统深入的研究,以至于许多长期援藏人员在工作任务完本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种鉴别或区分不同海拔地区人群的系统,其特征在于,包括以下单元:1)检测单元:包括微生物检测模块;2)分析单元:将检测单元检测得到的微生物的丰度水平作为输入变量,输入不同海拔地区人群的分类模型进行分析;3)评估单元:输出样本对应的个体为平原人群/高原人群的概率值;所述的微生物选自s_Bacteroides intestinalis CAG_564、s_Bifidobacterium bifidum CAG_234、s_Bifidobacterium longum、s_Bifidobacterium merycicum、s_Bifidobacterium subtile、s_Citrobacter sp.36

4CPA、s_Citrobacter sp.BIDMC107、s_Coriobacterium glomerans、s_Eggerthella lenta、s_Eggerthella sp.YY7918、s_Enterobacter cloacae complex_Hoffmann cluster IV、s_Enterobacter hormaechei、s_Enterobacter sp.BWH52、s_Enterobacter sp.MGH 25、s_Eubacterium hallii CAG_12、s_Eubacterium sp.14

2、s_Klebsiella sp.1_1_55、s_Kluyvera ascorbata、s_Kluyvera cryocrescens、s_Lactobacillus sanfranciscensis、s_Ruminococcus sp.SR1_5、s_Succinatimonas sp.CAG_777、s_Sutterella sp.54_7、s_Tepidibacter formicigenes、s_Bacteroidales bacterium Barb6XT、s_Clostridiales bacterium VE202

15中的一个或多个。2.微生物在构建不同海拔地区人群的分类模型中的应用,其特征在于,所述的微生物选自s_Bacteroides intestinalis CAG_564、s_Bifidobacterium bifidum CAG_234、s_Bifidobacterium longum、s_Bifidobacterium merycicum、s_Bifidobacterium subtile、s_Citrobacter sp.36

4CPA、s_Citrobacter sp.BIDMC107、s_Coriobacterium glomerans、s_Eggerthella lenta、s_Eggerthella sp.YY7918、s_Enterobacter cloacae complex_Hoffmann cluster IV、s_Enterobacter hormaechei、s_Enterobacter sp.BWH52、s_Enterobacter sp.MGH 25、s_Eubacterium hallii CAG_12、s_Eubacterium sp.14

2、s_Klebsiella sp.1_1_55、s_Kluyvera ascorbata、s_Kluyvera cryocrescens、s_Lactobacillus sanfranciscensis、s_Ruminococcus sp.SR1_5、s_Succinatimonas sp.CAG_777、s_Sutterella sp.54_7、s_Tepidibacter formicigenes、s_Bacteroidales bacterium Barb6XT、s_Clostridiales bacterium VE202

15中的一个或多个。3.根据权利要求2所述的应用,其特征在于,所述的分类模型使用选自以下一种或更多种算法来确定:XGBoost(XGB)、随机森林(RF)、glmnet、cforest、机器学习的分类与回归树(CART)、treebag、K

毗邻(kNN)、神经网络(nnet)、支持向量机径向(SVM

径向)、支持向量机线性(SVM

线性)、朴素贝叶斯(NB)或多层感知(mlp)。4.一种用于鉴别或区分不同海拔地区人群的...

【专利技术属性】
技术研发人员:韩洋何昆仑姚咏明田亚平赵晓静
申请(专利权)人:中国人民解放军总医院
类型:发明
国别省市:

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