【技术实现步骤摘要】
一种用于鉴别或区分不同海拔人群的模型及其应用
[0001]本专利技术属于生物医药领域,具体涉及一种用于鉴别或区分不同海拔人群的模型及其应用。
技术介绍
[0002]慢性高原反应/慢性高原病(Chronicmountainsickness,CMS)是一种常见的高原疾病,在外界低氧环境的长期刺激下,虽然机体通过不间断地自身调节,却始终未能在新的基础上达到身体机能平衡,而形成的一种高原环境适应不全综合征。高原通常系指海拔2500米以上、产生明显生物学效应(机体反应)的地区,高原环境对人体的健康影响甚大,无论世居者或移居者(尤其移居者)均然,慢性高原病多发生于该地区,外界环境低氧是其最主要的病因。我国的青藏高原具有明显的高原环境特征,近年来,越来越多的内地干部、企事业单位人员被派驻进藏参与该地区建设。由于高海拔与内陆平原间环境差异巨大,内陆进藏工作人员的健康问题日益突出。因此,加强慢性高原反应研究对加速高原建设具有重大指导意义。
[0003]目前对急性期高原反应研究较多,但对慢性期高原反应还缺乏系统深入的研究,以至于许多长期 ...
【技术保护点】
【技术特征摘要】
1.一种鉴别或区分不同海拔地区人群的系统,其特征在于,包括以下单元:1)检测单元:包括微生物检测模块;2)分析单元:将检测单元检测得到的微生物的丰度水平作为输入变量,输入不同海拔地区人群的分类模型进行分析;3)评估单元:输出样本对应的个体为平原人群/高原人群的概率值;所述的微生物选自s_Bacteroides intestinalis CAG_564、s_Bifidobacterium bifidum CAG_234、s_Bifidobacterium longum、s_Bifidobacterium merycicum、s_Bifidobacterium subtile、s_Citrobacter sp.36
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4CPA、s_Citrobacter sp.BIDMC107、s_Coriobacterium glomerans、s_Eggerthella lenta、s_Eggerthella sp.YY7918、s_Enterobacter cloacae complex_Hoffmann cluster IV、s_Enterobacter hormaechei、s_Enterobacter sp.BWH52、s_Enterobacter sp.MGH 25、s_Eubacterium hallii CAG_12、s_Eubacterium sp.14
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2、s_Klebsiella sp.1_1_55、s_Kluyvera ascorbata、s_Kluyvera cryocrescens、s_Lactobacillus sanfranciscensis、s_Ruminococcus sp.SR1_5、s_Succinatimonas sp.CAG_777、s_Sutterella sp.54_7、s_Tepidibacter formicigenes、s_Bacteroidales bacterium Barb6XT、s_Clostridiales bacterium VE202
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15中的一个或多个。2.微生物在构建不同海拔地区人群的分类模型中的应用,其特征在于,所述的微生物选自s_Bacteroides intestinalis CAG_564、s_Bifidobacterium bifidum CAG_234、s_Bifidobacterium longum、s_Bifidobacterium merycicum、s_Bifidobacterium subtile、s_Citrobacter sp.36
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4CPA、s_Citrobacter sp.BIDMC107、s_Coriobacterium glomerans、s_Eggerthella lenta、s_Eggerthella sp.YY7918、s_Enterobacter cloacae complex_Hoffmann cluster IV、s_Enterobacter hormaechei、s_Enterobacter sp.BWH52、s_Enterobacter sp.MGH 25、s_Eubacterium hallii CAG_12、s_Eubacterium sp.14
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2、s_Klebsiella sp.1_1_55、s_Kluyvera ascorbata、s_Kluyvera cryocrescens、s_Lactobacillus sanfranciscensis、s_Ruminococcus sp.SR1_5、s_Succinatimonas sp.CAG_777、s_Sutterella sp.54_7、s_Tepidibacter formicigenes、s_Bacteroidales bacterium Barb6XT、s_Clostridiales bacterium VE202
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15中的一个或多个。3.根据权利要求2所述的应用,其特征在于,所述的分类模型使用选自以下一种或更多种算法来确定:XGBoost(XGB)、随机森林(RF)、glmnet、cforest、机器学习的分类与回归树(CART)、treebag、K
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毗邻(kNN)、神经网络(nnet)、支持向量机径向(SVM
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径向)、支持向量机线性(SVM
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线性)、朴素贝叶斯(NB)或多层感知(mlp)。4.一种用于鉴别或区分不同海拔地区人群的...
【专利技术属性】
技术研发人员:韩洋,何昆仑,姚咏明,田亚平,赵晓静,
申请(专利权)人:中国人民解放军总医院,
类型:发明
国别省市:
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