【技术实现步骤摘要】
微生物信息的解读方法及装置、设备及存储介质
[0001]本专利技术涉及微生物检验
,尤其涉及一种微生物信息的解读方法及装置、设备及存储介质。
技术介绍
[0002]利用高通量基因测序技术,对疑难重症的感染患者的各种标本中的全部微生物进行DNA和/或RNA测序,通过微生物专用数据库比对和智能化算法分析,从而得到微生物的种属信息,指导临床更有针对性的开展治疗,有助于实现感染性疾病的精准治疗。
[0003]以宏基因组检测(mNGS)为例,从mNGS的技术原理上讲,生信技术上的数据过滤以及各类数据库的构建在大多数情况下无法解决多种病原体同时检测的问题,也就是说无法区别出检测报告单中的真正致病菌。
[0004]目前mNGS报告单解读准确度仍更多取决于医生经验、且耗时长,临床医生尤其是基层医生结合宏基因检测报告及必要临床信息的综合解读能力不足。
技术实现思路
[0005]本专利技术的主要目的在于提供一种微生物信息的解读方法及装置、设备及存储介质,可以解决现有技术中的医生对微生物的解读能力不足的问题。 ...
【技术保护点】
【技术特征摘要】
1.一种微生物信息的解读方法,其特征在于,所述方法包括:获取用户在客户端输入的微生物信息以及标本信息;利用预设的逻辑分类树、所述微生物信息以及标本信息,确定所述微生物信息中的微生物分类信息,所述微生物分类信息包括微生物信息中的各个微生物与微生物类别的对应关系,所述微生物类别包括致病菌、可能致病菌或背景菌,所述逻辑分类树包括若干基于专家知识及临床经验构建的分类规则;若所述微生物分类信息包括可能致病菌,则根据所述可能致病菌对应的目标微生物确定所述逻辑分类树中与所述目标微生物对应的待询问问题,并将所述待询问问题返回至所述客户端;接收所述客户端返回的所述用户基于所述待询问问题作出的回答,并根据所述回答以及所述逻辑分类树对所述目标微生物进行微生物分类,确定所述目标微生物的目标分类信息;根据所述微生物分类信息以及目标分类信息,确定所述微生物信息中的各个微生物对应的微生物分类结果,并将所述微生物分类结果返回至所述客户端。2.根据权利要求1所述方法,其特征在于,所述待询问问题至少包括检验报告信息,则所述根据所述回答以及所述逻辑分类树对所述目标微生物进行微生物分类,确定所述目标微生物的目标分类信息,包括:对所述回答进行语义分析,提取所述回答中与所述目标微生物对应的目标检验报告信息,所述目标检出信息包括特异序列数、相对丰度及覆盖度中一种或几种;根据所述目标检验报告信息以及所述逻辑分类树对所述目标微生物进行微生物分类,确定所述目标微生物的目标分类信息。3.根据权利要求1所述方法,其特征在于,所述待询问问题至少包括临床检查信息,则所述根据所述回答以及所述逻辑分类树对所述目标微生物进行微生物分类,确定所述目标微生物的目标分类信息,包括:对所述回答进行语义分析,提取所述回答中的目标临床检查信息,所述目标临床检查信息至少包括临床体检项目、仪器体检项目或实验室体检项目中的一种或多种的检查信息;根据所述目标临床检查信息以及所述逻辑分类树对所述目标微生物进行微生物分类,确定所述目标微生物的目标分类信息。4.根据权利要求1所述方法,其特征在于,所述待询问问题至少包括感染源,则所述根据所述回答以及所述逻辑分类树对所述目标微生物进行微生物分类,确定所述目标微生物的目标分类信息,包括:对所述回答进行语义分析,提取所述回答中与所述目标微生物对应的目标感染源,所述目标感染源至少包括院内感染或社区感染;根据所述目标感染源以及所述逻辑分类树对所述目标微生物进行微生物分类,确定所述目标微生物的目标分类信息。5.根据权利要求1所述方法,其特征在于,所述待询问问题至少包括临床表现,则所述根据所述回答以及所述逻辑分类树对所述目标微生物进行微生物分类,确定所述目标微生物的目标分类信息,包括:
对所述回答进行语义分析,提取所述回答中的目标临床表现,所述目标临床表现包...
【专利技术属性】
技术研发人员:卓超,王艳,梁小丹,李映华,吴楠,朱翰伟,梁碧婵,张逸乔,张楠,陈思彤,
申请(专利权)人:成都培华生物科技有限公司,
类型:发明
国别省市:
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