鉴定西瓜心室数的分子标记、方法、引物对、试剂盒及其应用技术

鉴定西瓜心室数的分子标记、方法、引物对、试剂盒及其应用，属于分子标记辅助育种技术领域。为了更好地培育不同果实形状的西瓜或鉴定西瓜心室数，本发明专利技术提供了一种与西瓜心室数紧密连锁的分子标记，该分子标记存在一处SNP位点的变化，不存在突变的位点会被限制性内切酶MspⅠ切开。通过引物对对西瓜幼苗基因组DNA进行PCR扩增，利用限制性内切酶MspⅠ对扩增产物进行酶切，最终通过琼脂糖凝胶电泳对酶切产物进行鉴定即可对3心室和5心室西瓜材料进行区分。上述鉴定方法，操作简便，准确度高，为西瓜果实形状分子标记辅助选择育种提供了行之有效的育种工具及技术。效的育种工具及技术。效的育种工具及技术。

Molecular markers, methods, primer pairs, kits and applications for identifying the ventricular number of watermelon

【技术实现步骤摘要】
鉴定西瓜心室数的分子标记、方法、引物对、试剂盒及其应用


[0001]本专利技术涉及鉴定西瓜心室数的分子标记、方法、引物对、试剂盒及其应用，属于分子标记辅助育种


技术介绍

[0002]西瓜(Citrullus lanatus)为葫芦科西瓜属一年蔓生草本植物，在我国及世界范围内广泛栽培，是世界上重要的水果型蔬菜之一。心室数对西瓜果实形状具有很大影响，普通栽培种西瓜多为3心室或者4心室，果实为椭圆形和圆形；饲用西瓜一般为5心室西瓜，果实呈扁圆形。心室数是影响果实形状的关键性状，对西瓜的商品性具有较大影响。在多数园艺作物中，CLV3是影响心室数的主要基因，本专利技术在前期研究中发现，西瓜中CLV3并不是导致其心室数发生变化的主要基因。因此，为了培育相应性状的西瓜或鉴定西瓜心室数，亟需找到影响西瓜心室数的关键基因。
[0003]CAPS分子标记是由于酶切位点处发生单碱基突变，致使酶切后产生片段长度多态性的一种分子标记，该类标记在基因组中分布广泛，操作简便，结果易于观察，在相同物种不同材料中具有普遍适用性。
专利
技术实现思路

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【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种与西瓜心室数紧密连锁的分子标记，其特征在于，所述分子标记为核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示的685bp核苷酸片段或核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示的685bp核苷酸片段；所述SEQ ID NO.1与5心室性状紧密连锁，所述SEQ ID NO.2与3心室性状紧密连锁。2.引物对和限制性内切酶MspⅠ在鉴定西瓜心室数中的应用，其特征在于，所述引物对包括核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示的上游引物和核苷酸序列如SEQ ID NO.4所示的下游引物，所述应用为利用引物对扩增西瓜基因组DNA获得扩增产物，再利用限制性内切酶MspⅠ酶切扩增产物，根据酶切产物来鉴定西瓜心室数。3.根据权利要求2所述的应用，其特征在于，所述西瓜基因组DNA取自幼苗期、抽蔓期或结果期的任一一个时期。4.根据权利要求2所述的应用，其特征在于，所述鉴定西瓜心室数为3心室或5心室。5.一种鉴定西瓜心室数的方法，其特征在于，包括如下步骤：(1)提取待测西瓜的基因组DNA；(2)以步骤(1)获得的基因组DNA为模板，利用引物对进行PCR扩增，获得PCR产物；所述引物对包括核苷酸序列如SEQ I...

【专利技术属性】
技术研发人员：刘树森，栾非时，刘钊，刘识，宋正峰，高鹏，郎丰孝，刘宏宇，冯翠艳，朱子成，马鸿艳，
申请(专利权)人：山东省西甜瓜育种工程技术研究中心有限公司东北农业大学，
类型：发明
国别省市：