一种检测ALK融合基因的引物和探针组合物、试剂盒及方法技术

本发明专利技术公开了一种检测ALK融合基因的引物和探针组合物、试剂盒及方法。该非诊断目的检测ALK融合基因的方法包括如下步骤：S1、从样品中提取RNA，并进行逆转录，获得cDNA；S2、以所述cDNA为模板，将待测样品cDNA模板、权利要求1或2所述的用于检测ALK融合基因的引物和探针组合物以及ddPCR Supermix混合，制备ddPCR混合液；S3、用所述ddPCR混合液制作PCR微反应液滴，再进行PCR扩增反应；S4、通过数字PCR仪对PCR扩增反应后的产物进行荧光信号的采集，根据荧光信号的类型，从而判断出ALK融合基因类型。本发明专利技术提出了检测ALK融合基因NPM1

Primer and probe composition, kit and method for detecting ALK fusion gene

【技术实现步骤摘要】
一种检测ALK融合基因的引物和探针组合物、试剂盒及方法


[0001]本专利技术属于分子生物学基因检测
，具体涉及一种检测ALK融合基因的引物和探针组合物、试剂盒及方法。

技术介绍

[0002]ALK基因位于染色体2p23位点，正常情况下人源的ALK可转录产生大小6222bp的mRNA，由29个外显子构成，编码由1620个氨基酸序列组成的，大小为200KDa的I型穿膜蛋白ALK，该蛋白为一种受体酪氨酸激酶(receptortyrosinekinase，RTK)，是RTK胰岛素超家族的成员。完整的ALK具有典型的RTK三部分结构，即胞外区、亲脂性穿膜区和胞浆内酪氨酸激酶。据文献报道，ALK蛋白除在极少部分弥漫性大B细胞淋巴瘤中表达外，可在60％～85％的原发性系统性ALCL中表达，是原发性系统性ALCL相对特异的免疫表型特征。
[0003]在大多数ALCL病例中，ALK是通过染色体重排激活的。ALCL是一种T细胞非霍奇金淋巴瘤，ALK基因异常在该病中较为常见。多达50％的成人ALCL患者为ALK阳性，高达90％的ALCL儿科患者为AL本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种检测ALK融合基因的引物和探针组合物，其特征在于，包括用于检测NPM1
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ALK融合基因的引物对和探针、用于检测TPM3
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ALK融合基因的引物对和探针、用于检测TRAF1
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ALK融合基因的引物对和探针和ABL内参基因引物对和探针；所述用于检测NPM1
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ALK融合基因的引物对序列如SEQ ID NO:1
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2所示，所述用于检测TPM3
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ALK融合基因的引物对序列如SEQ ID NO:4
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5所示，所述用于检测TRAF1
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ALK融合基因的引物对序列如SEQ ID NO:7
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8所示，所述用于检测NPM1
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ALK融合基因的探针序列、所述用于检测TPM3
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ALK融合基因的探针序列、所述用于检测TRAF1
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ALK融合基因的探针序列分别如SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:9所示或如SEQ ID NO:13所示；所述ABL内参基因引物对序列如SEQ ID NO:10
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11所示，探针序列如SEQ ID NO:12所示。2.根据权利要求1所述的检测ALK融合基因的引物和探针组合物，其特征在于，所述用于检测NPM1
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ALK融合基因的探针序列、所述用于检测TPM3
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ALK融合基因的探针序列和所述用于检测TRAF1
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ALK融合基因的探针序列5'端标记有FAM报告基团，3'端标记MGB荧光基团；所述ABL内参基因探针序列5'端标记有HEX报告基团，3'端标记有BHQ1荧光淬灭基团。3.一种检测ALK融合基因的试剂盒，其特征在于，所述试剂盒包括权利要求1或2所述的检测ALK融合基因的引物和探针组合物。4.根据权利要求3所述的检测ALK融合基因的试剂盒，其特征在于，所述试剂盒还包括阳性标准品、阴性标准品、ddPCR Supermix和ddH2O。5.一种非诊断目的检测ALK融合基因的方法，其特征在于，包括如下步骤：S1、从样品中...

【专利技术属性】
技术研发人员：彭玲，刘辉超，芮立，黄士栩，
申请(专利权)人：上海信诺佰世医学检验有限公司，
类型：发明
国别省市：