一种基于神经肽Y5受体NPY5R基因鉴定鸭饲料利用率性状的分子标记及其方法和应用技术

本发明专利技术公开了一种基于神经肽Y5受体NPY5R基因鉴定鸭饲料利用率性状的分子标记及其方法和应用，所述NPY5R基因具有如SEQ ID NO.1所示的核苷酸序列，所述分子标记为T或C，所述分子标记位于所述核苷酸序列的第782位。本发明专利技术利用PCR

A molecular marker based on neuropeptide Y5 receptor npy5r gene to identify duck feed utilization traits and its method and Application

【技术实现步骤摘要】
一种基于神经肽Y5受体NPY5R基因鉴定鸭饲料利用率性状的分子标记及其方法和应用


[0001]本专利技术涉及分子标记
，具体涉及一种基于神经肽Y5受体NPY5R基因鉴定鸭饲料利用率性状的分子标记及其方法和应用。

技术介绍

[0002]饲料效率性状是畜禽生产中的重要经济性状之一，其中饲料转化率(FCR)和剩余采食量(RFI)是评估饲料效率指标之一。饲料转化效率(FCR)是指饲喂单位饲料获得多少产品(Liang S,Guo Z,Tang J,et al.Genomic divergence during artificial selection by feed conversion ratio in Pekin ducks[J].Anim Biotechnol,2021:1
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9)，随着对饲料效率的深入探索研究者将畜禽某一时间段实际采食的饲料量减去其维持生长所需的饲料量所得的差值定义为剩余采食量(RFI)(Koch R M,Swiger L A,ChambersD,et al.Efficiency of feed use in beef cattle[J].Journal of Animal Science,1963,2 2(2):486
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494.)。可以使用RFI和FCR对家禽饲料效率的利用情况进行评估，然而影响饲料效率的因素众多，其中包括采食量以及遗传因素(潘韵致《猪饲料效率分化选择与全基因组关联分析》[D].吉林大学，2016；张小雪《不同剩余采食量羔羊生产性能和瘤胃微生物区系及肝脏转录组研究》[D].兰州大学，2019.)。
[0003]研究发现神经肽Y其5型受体NP5YR介导动物采食行为同时还和能量代谢相关，属于G蛋白偶联受体超家族成员之一(Michel M C,Beck
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Sickinger A,Cox H,et al. XVI.International Union of Pharmacology recommendations for the nomenclature of n europeptide Y,peptide YY,and pancreatic polypeptide receptors[J].Pharmacol Rev,19 98,50(1):143
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150.)。Tang
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Christensen等采用与NPY5R反义的寡核苷酸(ODN) 来研究NPY5R与NPY对食物摄入影响，通过反复中央给药，发现ODN显著减少自发食物摄入，导致体重显著下降(Tang
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Christensen M,Kristensen P,Stidsen C E,et al. Central administration of Y5 receptor antisense decreases spontaneous food intake andattenuates feeding in response to exogenous neuropeptide Y[J].J Endocrinol,1998,15 9(2):307
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12.)。通过在对不同剩余采食量(RFI)个体的鸭研究，科研人员在高RFI个体的下丘脑中检测到NPY和NPY5R的mRNA表达量较高(Zeng T,Chen L,Du X, et al.Association analysis between feed efficiency studies and expression of hypothalamic neuropeptide genes in laying ducks[J].Anim Genet,2016,47(5):606
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609.)。由此我们推定NPY5R参与鸭饲料效率的调节，这为研究鸭饲料效率提供了关于该基因多态性与家禽饲料效率性状相关的一种猜想。
[0004]此外，中国专利文献CN111676295A公开了一种采食量调控相关基因的研究方法，并具体公开了根据NCBI GenBank中已知鸭的CCK、CCKAR、NPY以及NPY5R基因设计多态性检测引物，用于基于上述基因开发与鸭采食量相关的SNPs位点，结果发现 CCKAR基因具有与鸭采食量相关的SNPs位点，对CCK、NPY以及NPY5R基因的S NPs位点未见报道。目前，也没有
其它文献有关于NPY5R与鸭采食量相关的SNPs位点被开发。
[0005]本研究为提高鸭饲料效率，从根本上较少成本的支出，增加养鸭业的收入，早期研究人员常使用常规选育但效率并不高，随着技术发展，分子标记辅助选育映入眼帘，其可以从遗传上根本改良性状，从而加速遗传进展。基于上述内容，提出一种基于神经肽 Y5受体NPY5R基因鉴定鸭饲料利用率性状的分子标记及其方法和应用。

技术实现思路

[0006]本专利技术的目的在于克服现有技术的不足，提供了一种基于神经肽Y5受体NPY5R 基因鉴定鸭饲料利用率性状的分子标记及其方法和应用，针对与鸭的饲料利用率性状相关的候选基因的SNP(单核苷酸多态性)分子标记，以解决常规表型育种选育进展缓慢，实现早期鉴定饲料利用率性状这一难题。
[0007]本专利技术通过以下技术方案来实现上述目的：
[0008]本专利技术提供了一种基于神经肽Y5受体NPY5R基因鸭饲料利用率性状的分子标记，所述NPY5R基因具有如SEQ ID NO.1所示的核苷酸序列，所述分子标记为T或C，所述分子标记位于所述核苷酸序列的第782位。
[0009]本专利技术还提供了一种上述基于神经肽Y5受体NPY5R基因鸭饲料利用率性状的分子标记在鉴定鸭饲料利用率性状中的应用。
[0010]本专利技术还提供了一种利用上述分子标记鉴定鸭饲料利用率性状的方法，包括以下步骤：
[0011](1)提取鸭翅静脉血液总DNA；
[0012](2)以所述分子标记所在位点及其上下游碱基组成的序列为目标序列设计特异性扩增引物，以所述总DNA为模板，利用特异性扩增引物进行PCR扩增，获得扩增产物；
[0013](3)对扩增产物进行基因分型检测和测序，获得待测鸭的分子标记类型；
[0014](4)根据分子标记类型判断鸭饲料利用率性状性状。
[0015]进一步改进在于，所述分子标记所在位点的上下游扩增产物长度介于200～250bp 之间。
[0016]进一步改进在于，所述特异性扩增引物序列为：
[0017]SEQ ID NO.2:Forward primer：ATTCTTCTTT GAGTTAGGCA；
[0018]SEQ ID NO.3:Reverse primer：GCAGACAGAC AGGGTCCGAG。
[0019]进一步改进在于，所述基因分型检测方法为将PCR扩增产物进行非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳和银染获得图像，根据图像进行基因分型：
[0020](1)包含2条条带间距较近的条带，则为CC本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种基于神经肽Y5受体NPY5R基因鉴定鸭饲料利用率性状的分子标记，其特征在于，所述NPY5R基因具有如SEQ ID NO.1所示的核苷酸序列，所述分子标记为T或C，所述分子标记位于所述核苷酸序列的第782位。2.一种如权利要求1所述的分子标记在鉴定鸭饲料利用率性状中的应用。3.一种利用如权利要求1所述的分子标记鉴定鸭饲料利用率性状的方法，其特征在于，包括以下步骤：(1)提取鸭翅静脉血液总DNA；(2)以所述分子标记所在位点及其上下游碱基组成的序列为目标序列设计特异性扩增引物，以所述总DNA为模板，利用特异性扩增引物进行PCR扩增，获得扩增产物；(3)对扩增产物进行基因分型检测和测序，获得待测鸭的分子标记类型；(4)根据分子标记类型判断鸭饲料利用率性状。4.根据权利要求3所述的一种利用分子标记鉴定鸭饲料利用率性状的方法，其特征在于，所述分子标记所在位点的上下游扩增产物长度介于200～250bp之间。5.根据权利要求3所述的一种利用分子标记鉴定鸭饲料利用率性状的方...

【专利技术属性】
技术研发人员：金四华，江洪峰，耿照玉，夏晶晶，贾羽晴，税斐，张泰康，曹程程，丁元飞，姜丽君，
申请(专利权)人：安徽农业大学，
类型：发明
国别省市：