慢性阻塞性肺病标志基因及其应用制造技术

本发明专利技术提出了一种慢性阻塞性肺病基因标志物及其应用，该慢性阻塞性肺病基因标志物包括第一基因集，因此，进一步提出了一种试剂盒，包括适于检测第一基因集中的至少一种基因的试剂，所述第一基因集由以下基因组成：GI_0027904、GI_0036168、GI_0034839和GI_0001854，其中，所述第一基因集中的基因与SEQ ID NO：1

【技术实现步骤摘要】
慢性阻塞性肺病标志基因及其应用


[0001]本专利技术涉及生物
，具体的，本专利技术涉及慢性阻塞性肺病标志基因及其应用，更具体的，本专利技术涉及一种试剂盒、试剂在制备试剂盒中的用途、用于预防或者治疗慢性阻塞性肺病的药物组合物或者食品组合物、确定个体是否患有慢性阻塞性肺病的方法、确定个体是否患有慢性阻塞性肺病的装置、一种装置、一种筛选药物的方法。

技术介绍

[0002]慢性阻塞性肺病(Chronic obstructive pulmonary diseCOPDe，COPD)是一种异质性疾病，具有肺部病变，包括慢性支气管炎、气道重塑和损害肺功能的肺气肿。它有许多全身性合并症，例如心血管疾病、结肠炎和骨质疏松症。它是全球第三大死亡原因，主要风险因素是吸入香烟烟雾、空气污染或其他有害颗粒。一些遗传风险因素，包括遗传因素、气道反应性增高、在怀孕期、新生儿期、婴儿期或儿童期由各种原因导致肺发育或生长不良的个体。但炎症和免疫反应等其他因素在发病机制中也很重要。
[0003]当前的COPD治疗方法有限，旨在控制症状和减少恶化。高剂量吸入皮质类固醇被广泛使用，但其功效仅限于减少急性发作频率或与支气管扩张剂联合使用，以改善COPD症状。许多患者对类固醇治疗没有反应，而且这些疗法无法改变引发和推动疾病进展的因素，不能逆转组织病变或提高死亡率，并且容易发生严重的呼吸道感染和肺炎。COPD时常会出现加重症状，呼吸道中的病毒和细菌与疾病恶化有关。
[0004]随着人体基因组测序完成及高通量测序技术的高速发展，基因筛查成为慢性阻塞性肺病诊断的方向，对于发现慢性阻塞性肺病潜在人群很有优势。到目前为止，还没有慢性阻塞性肺病患者基因标记物的相关报道。

技术实现思路

[0005]本专利技术旨在至少在一定程度上解决上述技术问题之一或至少提供一种商业选择。
[0006]依据本专利技术的第一方面，提供一种试剂盒，包括适于检测第一基因集中至少一种基因的试剂，所述第一基因集由以下基因组成：GI_0027904、GI_0036168、GI_0034839和GI_0001854，其中，所述第一基因集中的基因与SEQ ID NO：1
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4所示的核酸序列一一对应，所述第一基因集中的基因与其对应的SEQID NO：1
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4所示的核酸序列具有不小于90％的同一性。根据本专利技术具体实施例的试剂盒，可以准确的检测生物样品中是否含有所述第一基因集中的至少一种基因，更进一步地，也可以准确区分或诊断慢性阻塞性肺病患者和健康个体。
[0007]在本专利技术的第二方面，本专利技术提出了试剂在制备试剂盒中的用途，所述试剂适于检测第一基因集中的至少一种基因。根据本专利技术的实施例，所述试剂盒用于诊断慢性阻塞性肺病或检测慢性阻塞性肺病的治疗效果，所述第一基因集由以下基因组成：GI_0027904、GI_0036168、GI_0034839和GI_0001854，其中，所述第一基因集中的基因与SEQ ID NO：1
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4所示的核酸序列一一对应，所述第一基因集中的基因与其对应的SEQ ID NO：1
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4所示的核
酸序列具有不小于90％的同一性。根据本专利技术具体实施例的试剂制备的试剂盒，可以准确的检测生物样品中是否包含所述第一基因集中的至少一种基因，更进一步地，也可以极准确的区分慢性阻塞性肺病患者和健康个体，由此，可以有效的在早期进行慢性阻塞性肺病诊断，或用于检测治疗过程中慢性阻塞性肺病的变化。
[0008]在本专利技术的第三方面，本专利技术提出了一种用于预防或者治疗慢性阻塞性肺病的药物组合物或者食品组合物。根据本专利技术的实施例，含有提高所述第二基因集中的至少一种基因丰度的物质，所述第二基因集由以下基因组成：GI_0005030、GI_0011592和GI_0014334，其中，所述第二基因集中的基因与SEQ ID NO：5
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7所示的核酸序列一一对应，所述第二基因集中的基因与其对应的SEQ ID NO：5
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7所示的核酸序列具有不小于90％的同一性。根据本专利技术实施例的慢性阻塞性肺病标志基因中第二基因集的基因可以非侵入性的在早期发现或辅助检测慢性阻塞性肺病，确定个体患有慢性阻塞性肺病的概率高低或者个体处于健康状态的概率高低；同时，提高慢性阻塞性肺病高风险人群或已慢性阻塞性肺病患者肠道内微生物的所述第二基因集中的各种基因的丰度，可以降低患慢性阻塞性肺病的概率或减缓、治愈慢性阻塞性肺病，因此，所述包含提高所述第二基因集中的至少一种基因丰度的药物或者食品组合物能够用于平衡肠道菌群，有效预防或治疗慢性阻塞性肺病。
[0009]在本专利技术的第四方面，本专利技术提出了一种确定个体是否患有慢性阻塞性肺病的方法。根据本专利技术的实施例，包括：(1)确定所述个体的粪便样本中标志基因的丰度，所述标志基因包括第一基因集和第二基因集中的至少一种基因；(2)将步骤(1)中得到的所述丰度与预定的阈值进行比较，以便确定所述个体是否患有慢性阻塞性肺病；其中，所述第一基因集由以下基因组成：GI_0027904、GI_0036168、 GI_0034839和GI_0001854，其中，所述第一基因集中的基因与SEQ ID NO：1
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4所示的核酸序列一一对应，所述第一基因集中的基因与其对应的SEQ ID NO：1
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4所示的核酸序列具有不小于90％的同一性，所述第二基因集由以下基因组成：GI_0005030、GI_0011592和GI_0014334，其中，所述第二基因集中的基因与SEQ ID NO：5
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7所示的核酸序列一一对应，所述第二基因集中的基因与其对应的SEQ ID NO： 5
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7所示的核酸序列具有不小于90％的同一性。根据本专利技术实施例的方法可以依据个体的粪便样本中的所述标志基因的丰度确定个体是否患有慢性阻塞性肺病，所述标志基因是专利技术人对大量已知状态的粪便样本进行验证，通过差异比较分析各种肠道微生物的基因在慢性阻塞性肺病组和健康组粪便样本中的丰度，而确定下来的。
[0010]在本专利技术的第五方面，本专利技术提出了一种确定个体是否患有慢性阻塞性肺病的装置。根据本专利技术的实施例，包括：丰度确定单元，用于确定所述个体的粪便样本中标志基因的丰度，所述标志基因包括第一基因集和第二基因集中的至少一种基因；比较单元，用于将所得到的所述丰度与预定的阈值进行比较，以便确定所述个体是否患有慢性阻塞性肺病；其中，所述第一基因集由以下基因组成：GI_0027904、 GI_0036168、GI_0034839和GI_0001854，其中，所述第一基因集中的基因与SEQ ID NO：1
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4所示的核酸序列一一对应，所述第一基因集中的基因与其对应的SEQ ID NO：1
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4所示的核酸序列具有不小于 90％的同一性，所述第二基因集由以下基因组成：GI_0005030、GI_0011592和GI_0014334，其中，所述第二基因集中的基因与SEQ 本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种试剂盒，其特征在于，包括适于检测第一基因集中的至少一个基因的试剂，所述第一基因集由以下基因组成：GI_0027904、GI_0036168、GI_0034839和GI_0001854，其中，所述第一基因集中的基因与SEQ ID NO：1
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4所示的核酸序列一一对应，所述第一基因集中的基因与其对应的SEQ ID NO：1
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4所示的核酸序列具有不小于90％的同一性。2.根据权利要求1所述的试剂盒，其特征在于，进一步包括适于检测第二基因集中的至少一个基因的试剂，所述第二基因集由以下基因组成：GI_0005030、GI_0011592和GI_0014334，其中，所述第二基因集中的基因与SEQ ID NO：5
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7所示的核酸序列一一对应，所述第二基因集中的基因与其对应的SEQ ID NO：5
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7所示的核酸序列具有不小于90％的同一性。3.根据权利要求1所述的试剂盒，其特征在于，包括适于检测所述第一基因集中全部所述基因的试剂。4.根据权利要求2所述的试剂盒，其特征在于，包括适于检测所述第二基因集中全部所述基因的试剂。5.试剂在制备试剂盒中的用途，所述试剂适于检测第一基因集中的至少一种基因，所述试剂盒用于诊断慢性阻塞性肺病或者检测慢性阻塞性肺病的治疗效果，所述第一基因集由以下基因组成：GI_0027904、GI_0036168、GI_0034839和GI_0001854，其中，所述第一基因集中的基因与SEQ ID NO：1
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4所示的核酸序列一一对应，所述第一基因集中的基因与其对应的SEQ ID NO：1
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4中的序列具有不小于90％的同一性。6.根据权利要求5所述的用途，其特征在于，所述试剂进一步适于检测第二基因集中的至少一种基因，所述第二基因集由以下基因组成：GI_0005030、GI_0011592和GI_0014334，其中，所述第二基因集中的基因与SEQ ID NO：5
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7所示的核酸序列一一对应，所述第二基因集中的基因与其对应的SEQ ID NO：5
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7所示的核酸序列具有不小于90％的同一性。7.一种用于预防或者治疗慢性阻塞性肺病的药物组合物或者食品组合物，其特征在于，含有提高第二基因集中的至少一种基因丰度的物质，所述第二基因集由以下基因组成：GI_0005030、GI_0011592和GI_0014334，其中，所述第二基因集中的基因与SEQ ID NO：5
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7所示的核酸序列一一对应，所述第二基因集中的基因与其对应的SEQ ID NO：5
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7所示的核酸序列具有不小于90％的同一性。8.一种确定个体是否患有慢性阻塞性肺病的方法，其特征在于，包括：(1)确定所述个体的粪便样本中标志基因的丰度，所述标志基因包括第一基因集和第二基因集中的至少一种基因；(2)将步骤(1)中得到的所述丰度与预定的阈值进行比较，以便确定所述个体是否患有慢性阻塞性肺病；其中，所述第一基因集由以下基因组成：GI_0027904、GI_0036168、GI_0034839和GI_0001854，其中，所述第一基因集中的基因与SEQ ID NO：1
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4所示的核酸序列一一对应，所述第一基因集中的基因与其对应的SEQ ID NO：1
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4中的序列具有不小于90％的同...

【专利技术属性】
技术研发人员：王广冬，谢秋瑾，沈秀萍，
申请(专利权)人：上海锐翌医学检验实验室有限公司，
类型：发明
国别省市：