本发明专利技术涉及与湖羊的褪黑素性状相关的SNP标记、特异性扩增SNP标记的引物对、特异性扩增SNP位点的试剂盒、鉴定湖羊的SNP标记的方法、预测湖羊的褪黑素表达的方法、及引物对或试剂盒的应用。盒的应用。
【技术实现步骤摘要】
与湖羊的褪黑素性状相关的SNP标记及其应用
[0001]本专利技术生物工程
，具体地，本专利技术涉及与湖羊的褪黑素性状相关的SNP标记、特异性扩增SNP标记的引物对、特异性扩增SNP标记的试剂盒、鉴定湖羊的SNP标记的方法、预测湖羊的褪黑素表达的方法、及引物对或试剂盒的应用。
技术介绍
[0002]我国是种业大国，却不是种业强国，绵羊品种资源丰富，却缺少当家品种。湖羊（Hu sheep）属绵羊属（Ovis aries），是我国特有的绵羊品种，主要在南方地区饲养，内蒙古自治区也有饲养。湖羊的性成熟较早，四季发情，可终年配种，而且多胎性强，在良好的饲养条件下一胎可产2
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3羔，平均产羔率达256%，高繁殖率选育群可达以上300%，其繁殖力之强是世界绵羊品种中少有的。对湖羊多胎机理的研究，主要是探讨了它们的生殖内分泌、卵泡发育、排卵率、子宫内环境以及其产地的生态环境等对其的影响，尚没有确定多胎的主导因素。目前，从分子遗传机制上探讨我国湖羊多胎机理还比较少，现在证明湖羊存在多胎基因FecB，且为一个高度纯化的高产品种。
[0003]褪黑素（Melatonin，MT）化学名称为N
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乙酰基
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羟色胺，是一种主要由松果体分泌的激素。在动物体内，褪黑素通过下丘脑
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垂体
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性腺轴直接调控繁殖活动。现在研究证明，生殖系统、消化系统、免疫系统等多种组织和器官均能分泌褪黑素。在大多数哺乳动物体内，褪黑素的合成主要分为三个主要步骤：1）色氨酸经过色氨酸羟化酶(tryptophanehydroxylase, TPH)和L
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芳香氨基酸脱羧酶(L
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aromatic amino acid decarboxylase, AAAD)的催化作用后生成5
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羟色胺(5
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hydroxy tryptamine, 血清素)。2）5
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羟色胺在芳烷基胺N
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乙酰转移酶(Arylalkylamine
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N
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Acetyltransferase, AANAT)的作用下产生N
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乙酰
‑5‑
羟色胺(N
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actylserotonin)。3）N
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乙酰
‑5‑
羟色胺(N
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actylserotonin)在羟基吲哚
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氧
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甲基转移酶(hydroxyindole
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O
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methyl transferase，ASMT)的催化作用下发生甲基化生成N
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乙酰基
‑5‑
甲氧基色胺(N
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acetyl
‑5‑
methoxytryptamine)，即褪黑素。褪黑素发挥其生物学作用，主要通过MT1、MT2途径发挥调控作用。近年来，很多研究证明，应用褪黑素可以提高肉羊生产性能。因此，选育高褪黑素湖羊个体进行品种培育，不仅有利于肉羊产业振兴，更有利于种业振兴战略的开展。
[0004]单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphism，SNP），是指染色体基因组水平上单个核苷酸的变异引起的DNA序列多态性，而其中一种等位基因在群体中的频率不少于1%。其是限制性片段长度多态性、微卫星标记之后的第3代分子标记。随着SNP的迅速发展，SNP巳经成为羊基因组分析的一个重要的研究工具，广泛应用于经济性状QTL位点的定位以及优良性状的选育。目前正广泛应用与羊分子育种领域。
技术实现思路
[0005]本专利技术的目的在于提供了与湖羊的褪黑素性状相关的SNP标记、特异性扩增SNP标记的引物对、特异性扩增SNP标记的试剂盒、鉴定湖羊的SNP标记的方法、预测湖羊的褪黑素
表达的方法、及引物对或试剂盒的应用，为选育湖羊提供技术支持。
[0006]第一方面，本专利技术提供了一种与湖羊的褪黑素性状相关的SNP标记。所述SNP标记包括：所述基因组NC_040262.1的第7981372位和/或第7981866位碱基；基因组NC_040277.1的第17355171位碱基。
[0007]基因组NC_040262.1位于第11号染色体上芳烷基胺
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N
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乙酰基转移酶（AANAT）基因的编码区。
[0008]基因组NC_040277.1位于第26号染色体上褪黑素I型受体（MTNR1A）基因的编码区。
[0009]在一些实施方式中，所述SNP标记包括：所述基因组NC_040262.1的第7981372位碱基是G或C。
[0010]在一些实施方式中，所述SNP标记包括：所述基因组NC_040262.1的第7981866位碱基是G或A。
[0011]在一些实施方式中，所述SNP标记包括：所述基因组NC_040277.1的第17355171位碱基是G或T。
[0012]在一些实施方式中，所述基因组NC_040262.1的第7981372位碱基对应的氨基酸发生突变。
[0013]在一些实施方式中，所述基因组NC_040262.1的所述第7981372位碱基对应的氨基酸由E突变为D。
[0014]在一些实施方式中，所述基因组NC_040262.1的第7981866位碱基对应的氨基酸发生突变。
[0015]在一些实施方式中，所述基因组NC_040262.1的所述第7981866位碱基对应的氨基酸由R突变为Q。
[0016]在一些实施方式中，所述基因组NC_040277.1的第17355171位碱基对应的氨基酸发生突变。
[0017]在一些实施方式中，所述基因组NC_040277.1的所述第17355171位碱基对应的氨基酸由A突变为D。
[0018]第二方面，本专利技术提供了一种特异性扩增本专利技术第一方面提供的SNP标记的引物对。所述引物对包括；如SEQ ID NO:1和SEQ ID NO:2所示的引物对，其用于特异性扩增所述第7981372位的SNP标记和/或所述第7981866位的SNP标记；和/或如SEQ ID NO:9和SEQ ID NO:10所示的引物对，其用于特异性扩增所述第17355171位的SNP标记。
[0019]SEQ ID NO:1所示的核苷酸序列为CATCTCTGTCTCCGGCAACT。
[0020]SEQ ID NO:2所示的核苷酸序列为GAGTCAGCGGTCACTGTTCC。
[0021]SEQ ID NO:9所示的核苷酸序列为CTGACAGCACATTAGCTCAGACAT。
[0022]SEQ ID NO:10所示的核苷酸序列为CCTCTGCTACGTGTTCCTGATCT。
[0023]第三方面，本专利技术提供了一种试剂盒本文档来自技高网...
【技术保护点】
【技术特征摘要】
1.一种与湖羊的褪黑素性状相关的SNP标记，其特征在于，所述SNP标记包括：所述基因组NC_040262.1的第7981372位和/或第7981866位碱基；基因组NC_040277.1的第17355171位碱基。2.根据权利要求1所述的SNP标记，其特征在于，所述SNP标记包括：所述基因组NC_040262.1的所述第7981372位碱基是G或C，和/或所述第7981866位碱基是G或A；和/或所述基因组NC_040277.1的所述第17355171位碱基是G或T。3.一种特异性扩增权利要求1或2所述的SNP标记的引物对，其特征在于，所述引物对包括；如SEQ ID NO:1和SEQ ID NO:2所示的引物对，其用于特异性扩增所述第7981372位的SNP标记和/或所述第7981866位的SNP标记；和/或如SEQ ID NO:9和SEQ ID NO:10所示的引物对，其用于特异性扩增所述第17355171位的SNP标记。4.一种试剂盒，其特征在于，所述试剂盒包括如权利要求3所述的引物对。5.一种鉴定湖羊的SNP标记的方法，其特征在于，所述方法包括以下步骤：提取湖羊的...
【专利技术属性】
技术研发人员：刘国世，吴昊，刘奋泽，姚松阳，马文奎，易琪，张鲁，徐尚，周强，
申请(专利权)人：三亚中国农业大学研究院，
类型：发明
国别省市：
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