一种基于高通量测序的RhD基因型检测方法技术

技术编号:33402200 阅读:27 留言:0更新日期:2022-05-11 23:24
本发明专利技术公开了一种基于高通量测序的RhD基因型检测方法,其中:提取外周血游离DNA样本,利用2对保守性引物同时从外周血游离DNA中扩增出RhD基因和RHCE基因第9外显子及上下游基因盒,进行高通量测序,区分RhD基因全缺失型、RhD基因部分转换型、RhD突变型以及RhD野生型四种基因型。本发明专利技术可以一次性同时有效区分RhD基因全缺失型(RHD*01N.01)、RhD基因部分转换型(RHD*01N.03)、RhD1227A突变型(RHD*01EL.01)以及RhD野生型(RHD*01)四种基因型,为RhD基因型检测提供了一种全新的方法。为RhD基因型检测提供了一种全新的方法。

【技术实现步骤摘要】
一种基于高通量测序的RhD基因型检测方法


[0001]本专利技术涉及基因检测的
,尤其涉及一种基于高通量测序的RhD基因型检测方法。

技术介绍

[0002]高加索人群中96.6%的RH阴性血型是由RhD等位基因纯合缺失导致,仅3.4%的RH阴性血型者携带突变RhD基因,因此欧美国家目前采用的RhD基因产前筛查方法主要针对RhD基因缺失及个别高频突变别位点进行。然而,中国汉族RhD血型阴性人群等位基因频率与欧美人群存在差异,20~30%中国汉族RhD阴性者携带完整的RhD基因,主要由RhD1227A突变等位基因(RHD*01EL.01)导致RhD阴性表型,因此,目前高加索人群的RhD基因型检测方法并不适用于中国汉族人群。
[0003]目前,急需一种新的检测方法,可以在检测RhD基因缺失的同时,还能检测RhD基因突变,从而为中国汉族人群的血型检测提供理论支持。

技术实现思路

[0004]本专利技术的目的是为了解决
技术介绍
中提及的问题,提供一种基于高通量测序的RhD基因型检测方法。
[0005]为实现上述技术目的本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种基于高通量测序的RhD基因型检测方法,其特征是:提取外周血游离DNA样本,利用2对保守性引物同时从外周血游离DNA中扩增出RhD基因和RHCE基因第9外显子及上下游基因盒,进行高通量测序,区分RhD基因全缺失型(RHD*01N.01)、RhD基因部分转换型(RHD*01N.03)、RhD1227A突变型(RHD*01EL.01)以及RhD野生型(RHD*01)四种基因型,引物序列如下:Exon9F 5' TCACGTTAATAGGTGAAAAATCTTAC 3',Exon9R 5' TGCATTTAAACAGGTTTGCTC 3',BoxF 5' GTGGCTGGCTTTTGCTATTTC 3',BoxR 5' ATACATGCTTAATTTGTCATTC 3'。2.根据权利要求1所述的一种基于高通量测序的RhD基因型检测方法,其特征是:引物序列基于NC_000001.11(GRCh38)为模板设计引物,扩增产物分别为113bp和103bp,扩增体系为25
µ
L,包括:1U/
µ
l KAPAHiFi DNA Polymerase,0.5
µ
l;DNA模板,0.5
µ
l;10
µ
M 正向和反向引物,各0.75
µ
l;10mM dNTP Mix,包含dATP、dCTP和dGTP,0.75
µ
l;5x KAPAHiFi Fidelity buffer,含MgCl2,5
µ
l;25mM KAPA MgCl
2 2
µ
l;1U/
µ
l Uracil

DNA Glycosylase 1
µ
l;20mM dUTP 0.75
µ
l;灭菌去离子水 11.5
µ
l;PCR反应条件为:25℃,10min;95℃ 2min...

【专利技术属性】
技术研发人员:段红蕾李洁李志民韩乃坚姜子晗
申请(专利权)人:南京鼓楼医院
类型:发明
国别省市:

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