免疫组库健康评估系统和方法技术方案

本公开内容涉及用于评估个体的免疫组库和健康的系统和方法。本公开内容设想个体提交：(a)身份信息(例如家族病史、年龄、性别和其他身份信息)至服务器上的数据库或服务器可访问的数据库，通过将设备(例如智能手机)连接至网络应用程序；和(b)用于免疫组库处理的血液样品并将得到的数据提交至数据库。数据由访问数据库的服务器处理。然后，个体可以使用智能手机或其他互联网连接设备可访问的网络应用程序访问自定义报告。自定义报告显示个体的免疫组库指标。本文公开的三个免疫组库指标包括：(1)克隆型指标；(2)基本指标；和(3)多样性指标。在某些实施方案中，自定义报告包括个体免疫组库的图示，其中独特克隆型大小与这种克隆型的频率相对应。隆型的频率相对应。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】免疫组库健康评估系统和方法

技术介绍

[0001]诊断检测目前可用并定期进行，以检测个体是否存在正常状态。然而，这些检测并未提供对个体免疫组库的明确评估，也未深入了解此类个体的免疫组库如何指示存在或不存在健康。因此，需要以有助于评估此类个体健康的方式为个体提供评估和展示其免疫组库的手段的系统和方法。

技术实现思路

[0002]在一些实施方案中，本公开内容涉及一种向用户呈现用户的免疫组库概况(profile)的方法，包括以下步骤：从所述用户获取血液样品；确定选自由克隆型指标、基本指标和多样性指标组成的组中的至少一个指标以产生所述用户的血液样品的免疫组库概况；和向所述用户输出关于所述用户的免疫组库概况的信息。在一些实施方案中，所述方法进一步包括获取与所述用户相关的一组特征数据的步骤，其中与所述用户相关的特征数据包括所述用户的年龄和性别。在一些实施方案中，所述特征数据进一步包括存在任何疾病。在一些实施方案中，所述血液样品包括全血。在一些实施方案中，所述血液样品包括干血斑(dried blood spot)。在一些实施方案中，所述方法包括以下另外的步骤：向所述用户提供包括采血卡的试剂盒，其中所述采血卡包括至少一个采血区和QR码；和所述用户扫描所述QR码以将所述血液样品与所述用户在软件应用程序上的账户相关联。在一些实施方案中，使用软件应用程序执行向所述用户输出信息的步骤。
[0003]在一些实施方案中，本公开内容涉及一种向用户呈现用户的免疫组库概况的方法，包括以下步骤：向所述用户提供包括采血卡的试剂盒，其中所述采血卡包括至少一个采血区和QR码；所述用户扫描QR码以将所述血液样品与所述用户在软件应用程序上的账户相关联；获取与所述用户相关的一组特征数据，其中与所述用户相关的特征数据包括所述用户的年龄、性别以及存在或不存在任何疾病；从所述用户获取血液样品；确定选自由克隆型指标、基本指标和多样性指标组成的组中的至少一个指标以产生所述用户的血液样品的免疫组库概况；和使用软件应用程序向所述用户输出关于所述用户的免疫组库概况的信息。
附图说明
[0004]图1是描绘用户提交以下项的过程的流程图：(a)身份信息(identifying information)至数据库，通过将设备连接至网络应用程序；和(b)用于免疫组库处理的血液样品并将结果数据提交至数据库。
[0005]图2是描绘服务器处理用户身份信息和免疫组库数据的过程的流程图，参照数据库并将得到的信息纳入数据库，得到的克隆型指标、多样性指标和基本指标报告可以向用户展示。
[0006]图3是描绘用户可以通过使用设备经由网络应用程序连接至数据库来访问他们的克隆型指标、多样性指标和基本指标报告的过程的流程图。
具体实施方式
[0007]本公开内容涉及用于评估个体的免疫组库和健康的系统和方法。如图1所示，本公开内容设想个体提交：(a)身份信息(例如家族病史、年龄、性别和其他身份信息)至服务器上的数据库或服务器可访问的数据库，通过将设备(例如智能手机)连接至网络应用程序；和(b)用于免疫组库处理的血液样品并将得到的数据提交至数据库。数据由访问数据库的服务器处理，如图2所示，为用户创建自定义报告。然后，个体可以使用智能手机或其他互联网连接设备可访问的网络应用程序访问自定义报告，如图3所示。自定义报告显示个体的免疫组库指标。本文公开的三个免疫组库指标包括：(1)克隆型指标；(2)基本指标；和(3)多样性指标。在某些实施方案中，自定义报告包括个体免疫组库的图示，其中独特克隆型大小与这种克隆型的频率相对应。
[0008]在一些实施方案中，用户可以通过使用包括刺血针和无菌采血卡的试剂盒来采集血液样品。采血卡可以包括适合吸血的材料，包括但不限于纸和卡片材料。用户可以使用刺血针抽血，例如从用户的一个指尖抽血。采血卡包括一个或多个采血区，用户可以在其上放置血液样品并且该血液可以在该采血区干燥。采血卡可以进一步包括QR码，用户可以使用智能手机或其他设备扫描QR码以将QR码和血液样品与用户在软件应用程序上的账户相关联。然后，用户可以发送采血卡用于再水化、处理和确定用户的克隆型指标、基本指标和/或多样性指标以生成存储在数据库中的用户报告。然后，用户可以使用软件应用程序经由互联网连接的设备访问存储在数据库中的他或她的用户报告。
[0009]克隆型指标
[0010]本文公开的第一指标称为克隆型指标。个体的克隆型指标通过测量含有淋巴细胞的个体样品(例如血液样品)中独特克隆型的总数获得，并将独特克隆型的数量除以此类样品的单位读数数量。如本文所用，“血液样品”意指外周血、干血斑、脐带血或其他含有血液的样品。
[0011]基本指标
[0012]本文公开的第二指标被称为基本指标。在一个实施方案中，基本指标是个体的100,000个读数中前1000个公共CDR3(pCDR3)的数量。pCDR3是存在于多于一个个体中的CDR3。为了确定前1000个pCDR3，确定并排序一队列个体的pCDR3(指标池)。在其他实施方案中，评估少于前1000个pCDR。在其他实施方案中，评估多于前1000个pCDR3。在其他实施方案中，获取个体的少于100,000个读数。在其他实施方案中，获取个体的多于100,000个读数。
[0013]在本公开内容的一方面，如果个体的基本指标达到或超过最小百分比，则个体的免疫组库被认为正常，而个体的正常指标低于该最小百分比，则个体的免疫组库被认为异常。在一个实施方案中，该最小百分比为35％。
[0014]个体表达的CDR3表现出巨大的多样性，可能高达10
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个独特CDR3。因此，CDR3可用作免疫系统多样性的基础。基于对7500万个CDR3的抽样，专利技术人已确定随机选择的CDR3中约81％对给定个体是独特的，并且不在多个个体之间共享。
[0015]本公开内容的方法可以使用以下步骤进行以识别个体的正常免疫状态或异常免疫状态，该方法包括以下步骤：(a)在包含靶标特异性嵌套引物的反应混合物中从来自个体的白细胞群扩增多核苷酸以产生一组第一扩增子，靶标特异性嵌套引物的至少一部分包含另外的核苷酸，在扩增过程中，该另外的核苷酸作为模板用于将至少一个共同引物的结合
位点掺入第一扩增子；(b)将含有第一扩增子的第一反应混合物的一部分转移至包含至少一个共同引物的第二反应混合物；(c)使用至少一个共同引物扩增第一扩增子以产生一组第二扩增子；(d)对第二扩增子进行测序以鉴别白细胞亚群中的CDR3序列，以及(e)鉴别构成pCDR3的CDR3序列；(f)基于个体的pCDR3计算基本指标；以及(g)识别基本指标是否正常或异常，其中正常状态的特征在于存在最小百分比的pCDR3，并且异常状态的特征在于不存在最小百分比的pCDR3。
[0016]在某些实施方案中，测序包括每个样品获取的约100,000个读数。在某些实施方案中，使用随机选择进行多次读数，例如约10至100次。参考池的前1000个pCDR3中个体pCDR3的数量提供了百分比，称为“基本本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】1.一种向用户呈现用户的免疫组库概况的方法，包括以下步骤：从所述用户获取血液样品；确定选自由克隆型指标、基本指标和多样性指标组成的组中的至少一个指标以产生所述用户的血液样品的免疫组库概况；和向所述用户输出关于所述用户的免疫组库概况的信息。2.根据权利要求1所述的方法，进一步包括获取与所述用户相关的一组特征数据的步骤，其中与所述用户相关的特征数据包括所述用户的年龄和性别。3.根据权利要求2所述的方法，其中所述特征数据进一步包括任何疾病的存在。4.根据权利要求1所述的方法，其中所述血液样品包括全血。5.根据权利要求1所述的方法，其中所述血液样品包括干血斑。6.根据权利要求5所述的方法，包括以下另外的步骤：向所述用户提供包括采血卡的试剂盒，其中所述采血卡包括至少一个采血区和QR码；和所...

【专利技术属性】
技术研发人员：韩建，
申请(专利权)人：艾瑞普特公司，
类型：发明
国别省市：