熔解曲线重叠峰的分离方法、装置和电子设备制造方法及图纸

技术编号:33204234 阅读:42 留言:0更新日期:2022-04-24 00:46
本发明专利技术提供了一种熔解曲线重叠峰的分离方法、装置和电子设备,涉及PCR检测的技术领域,包括:首先基于常规方法获取PCR反应板各孔熔解曲线的熔点峰位置,利用Savitzky

【技术实现步骤摘要】
熔解曲线重叠峰的分离方法、装置和电子设备


[0001]本专利技术涉及PCR检测的
,尤其是涉及一种熔解曲线重叠峰的分离方法、装置和电子设备。

技术介绍

[0002]在PCR扩增反应完成后,常通过逐渐增加温度、使扩增产物发生降解来获得荧光强度负导数数值,即熔解曲线,以便对扩增产物的特异性进行考察或进行snp分型检测。在升温的过程中,当温度达到解链一半的温度时,荧光染料会大量游离出来,荧光强度会迅速降低,从而在熔解曲线上形成高峰值点,该峰值点对应的温度即为Tm值,而Tm的个数、位置是考察的重点。当熔解曲线各峰值点幅值特征明显时,找到Tm值是不难的。
[0003]一些现有技术中,往往采用聚类分析、连续小波变换等传统方法对熔解曲线进行分析;还有一些技术通过直接搜索算法,提供了一种能够自动分析两个温度范围的至少一个中是否存在峰值的熔解曲线分析方法;或者通过对多条多重熔解曲线目标熔解峰峰高进行聚类分析,并结合标准品,获得了目标基因的类别。但上述方案中都没有涉及比较复杂的熔解曲线,也就是说,当熔解曲线背景干扰较大、具有隐蔽的重叠峰的情况时,常规本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种熔解曲线重叠峰的分离方法,其特征在于,包括:基于预先获取的PCR反应板各孔熔解曲线的熔点峰位置,利用Savitzky

Golay求导方法确定各孔熔解曲线的二阶导数曲线;根据所述二阶导数曲线和所述熔点峰位置,确定原始熔解曲线的初始重叠峰位置;对所述初始重叠峰位置进行叠加拟合,生成两个熔点峰曲线;根据两个所述熔点峰曲线确定满足误差范围的目标熔点峰,并对所述目标熔点峰进行分离。2.根据权利要求1所述的熔解曲线重叠峰的分离方法,其特征在于,所述PCR反应板各孔熔解曲线的熔点峰位置,对应所述熔点峰的温度(Tm)值;利用Savitzky

Golay求导方法确定各孔熔解曲线的二阶导数曲线的步骤,包括:根据Savitzky

Golay求导方法,利用预先设定的第一求导参数计算各孔熔解曲线二阶导数曲线;其中,所述第一求导参数包括:具有最高决定系数的窗口大小和多项式阶次。3.根据权利要求1所述的熔解曲线重叠峰的分离方法,其特征在于,根据所述二阶导数曲线和所述熔点峰位置,确定目标熔解曲线的初始重叠峰位置的步骤,包括:根据预先给定的第一范围,确定各熔点峰对应的第一区域,并进行归一化处理;所述第一区域包括在所述第一范围内选取的所述熔解曲线的二阶导数区域;确定所述第一区域内的所述二阶导数曲线的极小值点;根据所述极小值点的相对幅值,确定满足预先给定的第一阈值的所述极小值点为初始重叠峰位置;预先给定第一阈值的条件包括:在所述第一区域内,所述二阶导数曲线的极大值点幅值相差不超过两倍。4.根据权利要求3所述的熔解曲线重叠峰的分离方法,其特征在于,预先给定第一范围的步骤包括:以所述熔点峰位置对应的所述熔点峰的温度(Tm)值为基点,以标准熔点峰分辨率为间隔,在所述基点的左右两端分别确定所述熔点峰对应的波谷;所述标准熔点峰分辨率为最小熔点峰分辨率的四倍;其中,所述最小熔点峰分辨率为2℃;如果在所述基点的左右两端均不存在所述波谷,则确定所述标准熔点峰分辨率为第一中间值;所述第一范围的最小值为所述熔点峰的温度(Tm)值减去所述第一中间值;所述第一范围的最大值为所述熔点峰的温度(Tm)值加上所述第一中间值;如果在所述基点的左右两端均存在所述波谷,则确定所述基点与左右两端所述波谷的距离分别为T

和T

;比较T

和所述标准熔点峰分辨率的大小,确定最小值为第二中间值;比较T

和所述分辨率的大小,确定...

【专利技术属性】
技术研发人员:杨智李冬余海贺贤汉
申请(专利权)人:杭州博日科技股份有限公司
类型:发明
国别省市:

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