用于肺癌筛查的组合物及其应用制造技术

本发明专利技术公开了一种用于肺癌筛查的组合物及其应用。所述的用于肺癌筛查的组合物包括用于检测ZNF728基因的靶序列甲基化的核酸。本发明专利技术获得了一个与肺癌相关的甲基化基因，并确定了肺癌甲基化基因发生甲基化异常的靶序列，并且，通过这个甲基化基因的靶序列，能够灵敏和特异地检测该基因的甲基化的状态，从而可以用于对外周血游离DNA的检测，并且所述的组合物以非侵入性的方式用于无症状人群的筛查，降低了侵入性检测造成的危害，所述的组合物具有更高的灵敏度和准确度，能够实现实时监测。能够实现实时监测。

【技术实现步骤摘要】
用于肺癌筛查的组合物及其应用


[0001]本专利技术涉及生物
，尤其涉及一种用于肺癌筛查的组合物及其应用。

技术介绍

[0002]肺癌是全球发病率最高、死亡率最高的癌症之一。在我国，肺癌发病率、死亡率也居首位。常规的筛查肺癌的手段除了低剂量螺旋CT(LDCT)，还有一些蛋白标志物，例如：癌胚抗原(CEA)、鳞状细胞癌抗原(SCC)、神经元特异性烯醇化酶(NSE)等。但这些手段在灵敏性和特异性方面各参差不齐。目前，DNA甲基化已被证明具有组织特异性,可用于癌症检测，并可根据循环肿瘤DNA(ctDNA)甲基化特征追踪到肿瘤原发部位。

技术实现思路

[0003]本专利技术的目的在于提供了一种肺癌筛查的组合物，所述组合物包括用于检测ZNF728基因的靶序列甲基化的核酸，所述组合物以非侵入性的方式用于无症状人群的筛查，以及癌症患者的预后检测，降低了侵入性检测造成的危害，并且具有更高的灵敏度和准确度，能够实现实时监测。
[0004]本专利技术具体技术方案如下：
[0005]本专利技术提供了一种用于肺癌筛查的组合物，所述组合物包括用于检测ZNF728基因的靶序列甲基化的核酸。
[0006]优选的，对于上述所述的组合物，其中，所述ZNF728基因的靶序列的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示。
[0007]优选的，对于上述所述的组合物，其中，所述用于检测ZNF728基因的靶序列甲基化的核酸包括探针组合物，所述探针组合物用于与所述ZNF728基因的靶序列杂交。
[0008]优选的，对于上述所述的组合物，其中，所述探针组合物包含高甲基化的第一探针组合物和低甲基化的第二探针组合物，所述第一探针组合物用于与经重亚硫酸盐转化的CG高甲基化的区域杂交，所述第二探针组合物用于与经重亚硫酸盐转化的CG低甲基化的区域杂交。
[0009]优选的，对于上述所述的组合物，其中，所述第一探针组合物包括n个探针，所述n个探针与经重亚硫酸盐转化的CG高甲基化的区域的正义链和反义链的每个核苷酸杂交。
[0010]优选的，对于上述所述的组合物，其中，所述第二探针组合物包括m个探针，所述m个探针与经重亚硫酸盐转化的CG低甲基化的区域的正义链和反义链的每个核苷酸杂交。
[0011]优选的，对于上述所述的组合物，其中，n和m均是1
‑
10中的任意整数。
[0012]优选的，对于上述所述的组合物，其中，第n
‑
1个探针和第n个探针之间有x1个核苷酸重叠，优选的，x1为0
‑
100中的任意整数；
[0013]优选的，第m
‑
1个探针和第m个探针之间有x2个核苷酸重叠，优选的，x2为0
‑
100中的任意整数。
[0014]优选的，对于上述所述的组合物，其中，所述第一探针组合物包括如SEQ ID NO:2
‑
3所示的核苷酸序列；所述第二探针组合物包括如SEQ ID NO:4
‑
5所示的核苷酸序列。
[0015]优选的，对于上述所述的组合物，其中，所述用于检测ZNF728基因的靶序列甲基化的核酸包括：
[0016]引物，所述引物为所述ZNF728基因的靶序列中的至少9个核苷酸的片段，所述片段包含至少一个CpG二核苷酸序列。
[0017]优选的，对于上述所述的组合物，其中，所述用于检测ZNF728基因的靶序列甲基化的核酸包括：
[0018]探针，所述探针为在中等严紧或严紧条件下与所述ZNF728基因的靶序列中的至少15个核苷酸片段杂交，所述片段包含至少一个CpG二核苷酸序列。
[0019]优选的，对于上述所述的组合物，其中，所述组合物还包括将ZNF728基因的靶序列的5位未甲基化胞嘧啶碱基转化为尿嘧啶的试剂。
[0020]优选的，对于上述所述的组合物，其中，所述用于检测ZNF728基因的靶序列甲基化的核酸还包括：
[0021]优先与处于非甲基化状态的靶序列结合的阻断剂。
[0022]本专利技术提供了ZNF728基因在制备用于肺癌筛查的试剂盒中的用途。
[0023]本专利技术提供了一种试剂盒，其包含上述所述的组合物。
[0024]本专利技术提供了上述所述的组合物在制备用于肺癌筛查的试剂盒中的用途。
[0025]本专利技术提供了一种芯片，其包含上述所述的组合物。
[0026]本专利技术提供了一种肺癌筛查的方法，其包括：
[0027]检测ZNF728基因的靶序列甲基化水平，以及
[0028]基于所述甲基化水平来判断受试者罹患肺癌的风险。
[0029]专利技术的效果
[0030]本专利技术的专利技术人利用表观基因组和生物信息学技术，通过分析肺癌的全基因组甲基化数据，寻找到了一个与肺癌相关的甲基化基因，并确定了肺癌甲基化基因发生甲基化异常的靶序列，并且，通过这个甲基化基因的靶序列，能够灵敏和特异地检测该基因的甲基化的状态，从而可以用于对外周血游离DNA的检测。
[0031]本专利技术所述的组合物以非侵入性的方式用于无症状人群的筛查，降低了侵入性检测造成的危害，所述的组合物具有更高的灵敏度和准确度，能够实现实时监测。
具体实施方式
[0032]下面对本专利技术做以详细说明。虽然显示了本专利技术的具体实施例，然而应当理解，可以以各种形式实现本专利技术而不应被这里阐述的实施例所限制。相反，提供这些实施例是为了能够更透彻地理解本专利技术，并且能够将本专利技术的范围完整的传达给本领域的技术人员。
[0033]需要说明的是，在说明书及权利要求当中使用了某些词汇来指称特定组件。本领域技术人员应可以理解，技术人员可能会用不同名词来称呼同一个组件。本说明书及权利要求并不以名词的差异作为区分组件的方式，而是以组件在功能上的差异作为区分的准则。如在通篇说明书及权利要求当中所提及的“包含”或“包括”为开放式用语，故应解释成“包含但不限定于”。说明书后续描述为实施本专利技术的较佳实施方式，然而所述描述乃以说明书的一般原则为目的，并非用以限定本专利技术的范围。本专利技术的保护范围当视所附权利要
求所界定者为准。
[0034]本专利技术提供了一种用于肺癌筛查的组合物，所述组合物包括用于检测ZNF728基因的靶序列甲基化的核酸。
[0035]所述甲基化指的是发生在CpG二核苷酸中胞嘧啶上第5位碳原子的甲基化过程，作为一种对稳定的修饰状态，在DNA甲基转移酶的作用下，可随DNA的复制过程遗传给新生的子代DNA，是一种重要的表观遗传机制，DNA甲基化时，基因启动子区的甲基化可导致抑癌基因转录沉寂，因此它与肿瘤的发生关系密切。异常甲基化包括抑癌基因和DNA修复基因的高甲基化、重复序列DNA的低甲基化、某些基因的印记丢失，其与多种肿瘤的发生有关。
[0036]本专利技术所述的甲基化可以为甲基化水平、甲基化程度或甲基化状态，当分析这样的靶序列的甲基化时，本领域技术人员可以使用定量测定方法来确定甲基化。
[0037]在一个实施方本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种用于肺癌筛查的组合物，所述组合物包括用于检测ZNF728基因的靶序列甲基化的核酸。2.根据权利要求1所述的组合物，其中，所述ZNF728基因的靶序列的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示。3.根据权利要求1或2所述的组合物，其中，所述用于检测ZNF728基因的靶序列甲基化的核酸包括探针组合物，所述探针组合物用于与所述ZNF728基因的靶序列杂交。4.根据权利要求3所述的组合物，其中，所述探针组合物包含高甲基化的第一探针组合物和低甲基化的第二探针组合物，所述第一探针组合物用于与经重亚硫酸盐转化的CG高甲基化的区域杂交，所述第二探针组合物用于与经重亚硫酸盐转化的CG低甲基化的区域杂交。5.根据权利要求4所述的组合物，其中，所述第一探针组合物包括n个探针，所述n个探针与经重亚硫酸盐转化的CG高甲基化的区域的正义链和反义链的每个核苷酸杂交，优选的，述第二探针组合物包括m个探针，所述m个探针与经重亚硫酸盐转化的CG低甲基化的区域的正义链和反义链的每个核苷酸杂交，进一步优选的，n和m均是1
‑
10中的任意整数。6.根据权利要求5所述的组合物，其中，第n
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1个探针和第n个探针之间有x1个核苷酸重叠，优选的，x1为0
‑
100中的任意整数；优选的，第m
‑
1个探针和第m个探针之间有x2个核苷酸重叠，优选的，x2为0
‑
100中的任意整数；进一步优选的，所述第一探针组合...

【专利技术属性】
技术研发人员：杨亚东，吴宁宁，李永君，刘栓平，王小奇，韩晓亮，王建铭，
申请(专利权)人：博尔诚北京科技有限公司，
类型：发明
国别省市：