一种皮肤衰老相关基因信息收集及分析系统和方法技术方案

本发明专利技术提供一种皮肤衰老相关基因信息收集及分析系统和方法，通过对现有数据库中所有涉及皮肤衰老的数据进行筛选收集，利用生物信息学方法对收集的皮肤衰老的mRNA、miRNA和LncRNA的表达谱数据进行整合分析，基于大样本大数据处理得到适用于临床应用的皮肤衰老诊断标志物。断标志物。

【技术实现步骤摘要】
一种皮肤衰老相关基因信息收集及分析系统和方法


[0001]本专利技术属于生物
，涉及一种皮肤衰老相关基因信息收集及分析系统和方法。

技术介绍

[0002]皮肤的老化分为内源性老化和外源性老化，内源性老化指由基因程序性变化所引起的老化，外源性老化指由外界影响因素导致的老化，如紫外线照射、吸烟、环境污染等。人体皮肤长年累月不可避免的会受到太阳光照射，太阳光中的紫外线照射是直接引起皮肤老化的最主要因素，这种老化也称为光老化。光老化的皮肤由于反复暴露于紫外线而引起的结构和功能的特征性改变。临床上表现为皱纹、皮肤松弛、粗糙、萎缩、斑点状色素沉着、雀斑、毛细血管扩张、紫癜以及癌变等。由于皮肤的光老化临床表现直观，又是最重要的外源性皮肤老化，因此越来越受到人们的重视。
[0003]皮肤光老化是一种多因素疾病。近些年来，随着医学基础理论的发展和实验技术的创新，对病因及发病机理已经有了比较深入的了解。但是，光老化的机制十分复杂，牵涉到许多酶、受体以及信号转导途径，其中部分机制尚未完全明了。对其具体的分子生物学过程，至今仍存在许多疑问。因此从基因水平上，对光老化机制进行更深入的探索将是我们未来研究的主要方向。对基因的研究，传统的方法有：蛋白质双向电泳法，缺点是很难得到足够量的蛋白质来分析和克隆差异表达的基因，因此，难以深入研究。基因芯片技术在研究基因差异性表达时具有高通量性的特点，即能在一次杂交实验中同时监测数以千计的基因表达，大大提高了效率，因此目前国内外利用基因芯片技术研究基因的差异性表达逐渐成为热点。必将成为光老化机制的研究的主要技术手段。
[0004]随着近年来空气污染所致的臭氧层变薄，紫外线更易通过大气层，从而加重暴露皮肤的光损害；皮肤光老化可与多种皮肤病甚至与皮肤肿瘤的发生有密切关系，因此，预防和治疗皮肤光老化很有必要，探索寻找皮肤光老化相关的生物标志物，已成为皮肤光老化预防、早期诊断和治疗研究中的热点问题。皮肤光老化的早期诊断、预防，能够帮助医生制定合理的早期预防策略，提高治疗衰老效果，具有重要的临床和科学意义。
[0005]基因表达数据库(Gene Expression Omnibus，GEO)是当今最大、最全面的公共基因表达数据资源，包括高通量实验数据的广泛分类，有单通道和双通道以微阵列为基础的对mRNA丰度的测定；基因组DNA和蛋白质分子的实验数据。迄今为止，GEO数据库包含的数据含概10000个杂交实验和来自30种不同生物体。数据库操作简单，数据全面，免费共享，并为后期数据挖掘和信息推广提供了良好的平台。GEO数据库在分子生物学领域中有着广泛的应用前景，为皮肤光老化相关基因的挖掘与筛选提供了最佳平台。

技术实现思路

[0006]本专利技术的主要目的在于提供一种皮肤衰老相关基因信息收集及分析系统和方法。
[0007]为实现上述目的，本专利技术具体技术方案如下：
[0008]本专利技术首先提供了一种皮肤衰老相关基因信息收集及分析系统，包括数据采集模块、数据分析模块和数据显示模块；
[0009]所述数据采集模块收集数据后传送给数据分析模块，所述数据分析模块对数据进行加工分析后通过数据显示模块显示；
[0010]所述数据采集模块包括RNA数据采集模块，所述数据分析模块包括差异表达基因分析模块，其特征在于，所述差异表达基因分析模块分析差异表达基因，所述差异表达基因为下列mRNA:OLFM1、CPNE8、HAAO和/或下列miRNA:hsa-miR-663b、hsa-miR-3141、hsa-miR-5195-3p、hsa-miR-575、hsa-miR-129-5p、hsa-miR-196a-5p、hsa-miR-491-5p、hsa-miR-143-5p、hsa-miR-34a-5p、hsa-miR-31-5p、hsa-miR-140-5p、hsa-miR-132-3p、hsa-miR-93-3p、hsa-miR-324-5p、hsa-miR-30e-3p、hsa-miR-151b和/或下列LncRNA:LINC00491、LINC01525、FGF13-AS1、CPNE8、FTX、LINC00690、PCAT4、XIST、INAFM2、HOTAIRM1、LINC01226、LOC644656、LINC00115、IGF2-AS、NEAT1、LOC100506639、TRIM52-AS1、LINC01355、DNAJC9-AS1、PVT1、RMST、GLIDR、LINC00382、KCNIP4-IT1、LINC00173、SNHG20、LINC01372、SND1-IT1、LINC00346。
[0011]在一些实施例中，所述RNA数据采集模块包括mRNA表达采集模块、miRNA表达采集模块、lncRNA表达采集模块。
[0012]在一些实施例中，所述数据分析模块还包括预测靶点分析模块、生物信息网分析模块、GO分析模块、pathway分析模块、基因与疾病预测分析模块、基因表达验证分析模块。
[0013]在一些实施例中，所述皮肤衰老包括皮肤光老化。
[0014]进一步地，本专利技术提供了一种皮肤衰老相关基因信息收集及分析方法，包括：
[0015](1)从已有数据库中下载皮肤衰老样本测序原始数据及对照样本测序原始数据；
[0016](2)对数据进行分析；
[0017](3)显示分析结果；
[0018]其特征在于，对数据进行分析包括对数据进行差异表达基因分析，差异表达基因是下列mRNA:OLFM1、CPNE8、HAAO和/或下列miRNA:hsa-miR-663b、hsa-miR-3141、hsa-miR-5195-3p、hsa-miR-575、hsa-miR-129-5p、hsa-miR-196a-5p、hsa-miR-491-5p、hsa-miR-143-5p、hsa-miR-34a-5p、hsa-miR-31-5p、hsa-miR-140-5p、hsa-miR-132-3p、hsa-miR-93-3p、hsa-miR-324-5p、hsa-miR-30e-3p、hsa-miR-151b和/或下列LncRNA:LINC00491、LINC01525、FGF13-AS1、CPNE8、FTX、LINC00690、PCAT4、XIST、INAFM2、HOTAIRM1、LINC01226、LOC644656、LINC00115、IGF2-AS、NEAT1、LOC100506639、TRIM52-AS1、LINC01355、DNAJC9-AS1、PVT1、RMST、GLIDR、LINC00382、KCNIP4-IT1、LINC00173、SNHG20、LINC01372、SND1-IT1、LINC00346。
[0019]在一些实施例中，所述步骤(1)中，从GEO数据库中下载皮肤衰老相关的mRNA表达数据、miRNA表达数据、lncRNA表达数据。
[0020]在一些实施例中，所述对数据进行分析包括对数据进行差异表达基因分析、预测本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种皮肤衰老相关基因信息收集及分析系统，包括数据采集模块、数据分析模块和数据显示模块；所述数据采集模块收集数据后传送给数据分析模块，所述数据分析模块对数据进行加工分析后通过数据显示模块显示；所述数据采集模块包括RNA数据采集模块，所述数据分析模块包括差异表达基因分析模块，其特征在于，所述差异表达基因分析模块分析差异表达基因，所述差异表达基因为下列mRNA:OLFM1、CPNE8、HAAO和/或下列miRNA:hsa-miR-663b、hsa-miR-3141、hsa-miR-5195-3p、hsa-miR-575、hsa-miR-129-5p、hsa-miR-196a-5p、hsa-miR-491-5p、hsa-miR-143-5p、hsa-miR-34a-5p、hsa-miR-31-5p、hsa-miR-140-5p、hsa-miR-132-3p、hsa-miR-93-3p、hsa-miR-324-5p、hsa-miR-30e-3p、hsa-miR-151b和/或下列LncRNA:LINC00491、LINC01525、FGF13-AS1、CPNE8、FTX、LINC00690、PCAT4、XIST、INAFM2、HOTAIRM1、LINC01226、LOC644656、LINC00115、IGF2-AS、NEAT1、LOC100506639、TRIM52-AS1、LINC01355、DNAJC9-AS1、PVT1、RMST、GLIDR、LINC00382、KCNIP4-IT1、LINC00173、SNHG20、LINC01372、SND1-IT1、LINC00346。2.根据权利要求1所述的系统，其特征在于，所述RNA数据采集模块包括mRNA表达采集模块、miRNA表达采集模块、lncRNA表达采集模块。3.根据权利要求1所述的系统，其特征在于，所述数据分析模块还包括预测靶点分析模块、生物信息网分析模块、GO分析模块、pathway分析模块、基因与疾病预测分析模块、基因表达验证分析模块。4.一种皮肤衰老相关基因信息收集及分析方法，包括：(1)从已有数据库中下载皮肤衰老样本测序原始数据及对照样本测序原始数据；(2)对数据进行分析；(3)显示分析结果；其特征在于，对数据进行分析包括对数据进行差异表达基因分析，差异表达基因是下列mRNA:OLFM1、CPNE8、H...

【专利技术属性】
技术研发人员：叶伟亮，杨跃梅，李立杰，
申请(专利权)人：北京瑷格干细胞科技有限公司，
类型：发明
国别省市：