一种绝经后骨质疏松症相关基因筛选与功能分析方法技术

本发明专利技术公开了一种绝经后骨质疏松症相关基因筛选与功能分析方法，该方法包括以下步骤：从GEO数据库中寻找绝经后骨质疏松症相关的基因表达芯片，并获得基因表达结果；利用Venn图寻找两个芯片数据集中重叠的差异基因；利用Metascape和DAVID数据库进行基因富集功能分析。本发明专利技术利用多种在线数据库下载表达差异基因，寻找在两种芯片数据集中共同表达的差异基因，以及对共同表达差异基因进行生物信息学分析，为绝经后骨质疏松症相关的标志物筛选、分子发病机制等提供有意义的探索和依据。分子发病机制等提供有意义的探索和依据。

【技术实现步骤摘要】
一种绝经后骨质疏松症相关基因筛选与功能分析方法


[0001]本专利技术属于生物
，涉及一种绝经后骨质疏松症相关基因筛选与功能分析方法。

技术介绍

[0002]骨质疏松症(Osteoporosis,OP)是以骨矿物质密度(BMD)降低、骨骼微结构退化为特征的致使骨的脆性增加以及易于发生骨折的一种全身性骨骼疾病。女性绝经后由于卵巢功能衰退、雌激素水平下降、骨丢失增加而引起的骨质疏松称为绝经后骨质疏松症(postmenopausal osteoporosis,PMOP)。骨质疏松最严重的后果是骨折，全球范围内，每年大约有900万例临床骨质疏松性骨折。在我国60岁以上的女性中，骨质疏松发病率高达40-50％，其中30-50％将经历骨质疏松性骨折，骨质疏松性骨折有较高的发病率和死亡率，显著增加医疗费用。随着人类寿命的延长和老龄化社会的到来，骨质疏松症的发病率正逐年上升，已成为一个世界性的公共卫生问题，作为目前研究最多，同时也是发病率最高的骨质疏松症类型，绝经后骨质疏松症的防治已成为一个重要的保健课题。
[0003]骨质疏松症起源于骨重建系统本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种绝经后骨质疏松症相关基因筛选与功能分析方法，其特征在于，包括以下步骤：1)利用GEO数据库筛选符合条件的研究芯片系列：从GEO数据库http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/中寻找绝经后骨质疏松症相关的基因表达芯片结果，搜索条件限定为：(1)绝经后骨质疏松症；(2)种属人源；(3)研究类型为芯片表达谱检测；(4)标本来源为外周血样本，经筛选，两个芯片系列纳入研究：GSE56116和GSE100609，共纳入绝经后骨质疏松症外周血样本样本14例和正常对照样本7例；2)在基因表达数据库GEO(https：//www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/)下载与绝经后骨质疏松症外周血样本基因表达谱数据集：GSE56116和GSE100609，并根据P值<0.05和∣log2FC∣＞0.5的筛选标准筛选差异基因；3)利用Venn图寻找两个芯片数据集中相同的基因表达结果：选择两个芯片系列中表达差异基因，在GSE56116中发现947个差异基因，在GSE100609中发现413个差异基因；利用在线Venn图制作工具，生成Venn图，两个数据集中有14个重叠的差异基因；4)利用Metascape和DAVID数据库对14个重叠的差异基因进行GO功能富集分析；5)通过检索CTD数据库收集与绝经后骨质疏松症相关的核心基因。2.根据权利要求1所述的绝经后骨质疏松症相关基因筛选与功能分析方法，其特征在于，所述方法还包括利用STRING数据库构建14个重叠差异基因的蛋白质互作网络(PPI)。3.根据权利要求1所述的绝经后骨质疏松症相关基因筛选与功能分析方法，其特征在于，所述步骤4)中DAVID...

【专利技术属性】
技术研发人员：叶伟亮，杨跃梅，李立杰，
申请(专利权)人：北京瑷格干细胞科技有限公司，
类型：发明
国别省市：