hsa_circ_0001137环状RNA及其在癌症诊断、治疗中的应用制造技术

技术编号:33053808 阅读:33 留言:0更新日期:2022-04-15 09:39
本发明专利技术公开了一种hsa_circ_0001137环状RNA及其在癌症诊断、治疗中的应用,属于生物医药领域。该hsa_circ_0001137环状RNA的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示。本发明专利技术得到一个新的hsa_circ_0001137环状RNA基因,该基因在肿瘤组织中表达显著降低,可以作为癌症的的诊断标志物。同时,hsa_circ_0001137过表达后,可显著抑制宫颈癌、肺癌和结肠直肠癌细胞的增殖能力以及侵袭能力,并能强烈诱导肿瘤细胞凋亡,可以作为癌症治疗的潜在方式。以作为癌症治疗的潜在方式。以作为癌症治疗的潜在方式。

【技术实现步骤摘要】
hsa_circ_0001137环状RNA及其在癌症诊断、治疗中的应用


[0001]本专利技术属于生物医药领域,具体涉及一种hsa_circ_0001137环状RNA及其在癌症诊断、治疗中的应用。

技术介绍

[0002]据全国肿瘤登记中心估计,2015年中国癌症总发病约429万例,总死亡约281万例,其中肺癌是最常见的癌种,在我国的发病率和死亡率双居首位。大多数的肺癌患者在确诊时已有转移,五年生存率极低,仅约16%。非小细胞肺癌在肺癌中最为常见,约占总数的80%

85%。结直肠癌是世界范围内最常见的恶性肿瘤之一,其发病率和死亡率均位居恶性肿瘤的前三位。在我国,结直肠癌的发病率呈逐年上升的趋势。近年来,虽然结直肠癌的治疗取得了长足的进步,但是仍有30%~40%结直肠癌患者最终死于复发和转移。宫颈癌是全球女性癌症死亡的第四大原因,在中国每年有近150000例新诊断的病例。
[0003]CircRNA是近年来发现的非编码RNA家族重要成员,其形成没有极性和聚腺苷酸尾的环化结构,由于circRNA分子呈封闭环状结构,具有更高的核酸酶稳定性,不受RNA外切酶影响,不易降解,这使得它们成为临床应用新型生物标记具有很大的优势。高通量测序和生物信息学方法揭示了circRNA在真核生物中广泛表达。研究发现大多数circRNA参与一些肿瘤的发生发展,在病理条件下以组织特异性异常表达。研究发现circRNA在肿瘤发生发展中发挥关键作用,其作用机制上主要包括方面:(1)circRNA作为miRNA的吸附物(sponge),通过吸附miRNA调控其靶基因和下游通路的表达,进而影响胶质瘤的发生发展;(2)circRNA通过翻译成肽段或者蛋白发挥作用;(3)通过结合母基因(host gene)DNA序列介导母基因mRNA的转录调控,这些特性使得circRNA成为肿瘤诊断和治疗的重要靶点和潜在标志物。

技术实现思路

[0004]本专利技术的目的在于提供一种用于癌症诊断和治疗的新靶标,即hsa_circ_0001137环状RNA基因,并提供该靶标的新应用,特别是在其检测试剂、癌症诊断和治疗中的应用。
[0005]本专利技术通过以下技术方案实现:
[0006]第一方面,本专利技术提供一种hsa_circ_0001137环状RNA基因,其核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示。
[0007]hsa_circ_0001137是由DNMT3B基因的第7和9外显子首位相接连接而成的环状RNA分子,全长为412个碱基,全长序列为:
[0008]GATGGGAAGGAGTTTGGAATAGGGGACCTCGTGTGGGGAAAGATCAAGGGCTTCTCCTGGTGGCCCGCCATGGTGGTGTCTTGGAAGGCCACCTCCAAGCGACAGGCTATGTCTGGCATGCGGTGGGTCCAGTGGTTTGGCGATGGCAAGTTCTCCGAGGTCTCTGCAGACAAACTGGTGGCACTGGGGCTGTTCAGCCAGCACTTTAATTTGGCCACCTTCAATAAGCTCGTCTCCTATCGAAAAGCCATGTACCATGCTCTGGAGAAAGCTAGGGTGCGAGCTGGCAAGACCTTCCCCAGCAGCCCTGGAGACTCATTGGAGGACCAGCTGAAGCCCATGTTGGAGTGGGCCCACGGGGGCTTCAAGCCCACTGGGATCGAGGGCCTCAAACCCAACAACACGCAACCAG(SEQ ID NO.1)。
[0009]第二方面,本专利技术提供一种用于检测hsa_circ_0001137环状RNA基因的检测引物,其特征在于,所述检测引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.2~3所示,所述检测引物可用于制备癌症诊断、治疗试剂盒。
[0010]正向引物(Primer F)的核苷酸序列为GGCCACCTTCAATAAGCTCG(SEQ ID NO.2);
[0011]反向引物(Primer R)的核苷酸序列为CCAAACTCCTTCCCATCCTG(SEQ ID NO.3)。
[0012]在具体的应用中,还包括内参GAPDH的正向引物和反向引物:
[0013]内参GAPDH Primer F:GGAGCGAGATCCCTCCAAAAT(SEQ ID NO.4);
[0014]内参GAPDH Primer R:GGCTGTTGTCATACTTCTCATGG(SEQ ID NO.5)。
[0015]第三方面,本专利技术提供一种hsa_circ_0001137环状RNA基因作为分子标志物在制备用于诊断癌症的试剂盒中的应用。
[0016]第四方面,本专利技术提供一种用于检测hsa_circ_0001137环状RNA基因的试剂在制备用于诊断癌症的试剂盒中的应用。
[0017]优选地,所述检测hsa_circ_0001137环状RNA基因的试剂选自:对hsa_circ_0001137环状RNA基因具有检测特异性的探针、基因芯片或检测引物,其中检测引物的序列分别如SEQ ID NO.2~3所示。
[0018]优选地,所述试剂盒还包括RNA提取试剂、逆转录反应体系和荧光定量PCR试剂。
[0019]其中,RNA提取试剂为trizol试剂;
[0020]将RNA逆转录成cDNA的逆转录反应体系如下:
[0021]总RNA2μg随机引物0.5μL2X RT Mix5μLRT Enzyme Mix1μLRNA free ddH2O补足至10μL
[0022]逆转录反应体系的反应条件为:37℃、10min,42℃、20min,85℃、5min,4℃、2min。
[0023]所述荧光定量PCR试剂包括:
[0024]cDNA1μL上游引物(10μM)0.2μL下游引物(10μM)0.2μL2X PCR Master Mix10μLRNA free ddH2O补足至20μL
[0025]优选地,荧光定量PCR反应条件为:95℃5分钟变性;95℃10秒,60℃35秒;40个循环。
[0026]第五方面,本专利技术提供一种用于癌症诊断或治疗的试剂盒,所述试剂盒包括上述检测引物。
[0027]优选地,还包括荧光定量PCR试剂。
[0028]第六方面,本专利技术提供一种hsa_circ_0001137环状RNA在制备癌症的治疗药物中的应用。
[0029]第七方面,本专利技术提供一种hsa_circ_0001137环状RNA的表达促进剂在制备治疗癌症的药物中的应用。
[0030]优选地,所述hsa_circ_0001137环状RNA的表达促进剂至少包括以下任一:hsa_circ_0001137环状RNA基因;含有hsa_circ_0001137环状RNA基因的重组载体;含有hsa_circ_0001137环状RNA基因的重组病毒。
[0031]进一步本文档来自技高网
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【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种hsa_circ_0001137环状RNA基因,其核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示。2.一种用于检测hsa_circ_0001137环状RNA基因的检测引物,其特征在于,所述检测引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.2~3所示,所述检测引物可用于制备癌症诊断、治疗试剂盒。3.一种hsa_circ_0001137环状RNA基因作为分子标志物在制备用于诊断癌症的试剂盒中的应用。4.一种用于检测hsa_circ_0001137环状RNA基因的试剂在制备用于诊断癌症的试剂盒中的应用;优选地,所述检测hsa_circ_0001137环状RNA基因的试剂选自:对hsa_circ_0001137环状RNA基因具有检测特异性的探针、基因芯片或如权利要求2所示的检测引物;优选地,所述试剂盒还包括RNA提取试剂、逆转录反应体系和荧光定量PCR试剂;优选地,所述癌症包括宫颈癌...

【专利技术属性】
技术研发人员:张倩
申请(专利权)人:上海卡序生物医药科技有限公司
类型:发明
国别省市:

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